治疗性化合物通常首先被研究 体外 通过活力检测进行评估。由人工观察者进行的盲法细胞计数虽对细胞数量的微小变化高度敏感,但无法评估细胞功能。本文所述的计算机化活力检测方法能够以客观的方式同时评估细胞结构与功能。
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治疗性化合物通常首先被研究 体外 通过活力检测进行评估。由人工观察者进行的盲法细胞计数虽对细胞数量的微小变化高度敏感,但无法评估细胞功能。本文所述的计算机化活力检测方法能够以客观的方式同时评估细胞结构与功能。
在显微镜下进行人工细胞计数是评估细胞活力的一种敏感方法,但耗时较长,因此成本较高。计算机化的活力检测方法在设备上投入较高,但相比人工细胞计数更快且更具客观性。本报告介绍了三种此类活力检测方法的应用。其中两种为红外检测法,一种为发光检测法。两种红外检测法均依赖于16 位的Odyssey成像仪。第一种红外检测法使用DRAQ5染料标记细胞核,Sapphire染料标记细胞质,并在700 nm通道中成像。另一种红外检测法为细胞内Western(In-Cell Western),利用针对细胞骨架蛋白(α-微管蛋白或微管相关蛋白2)的抗体,并在800 nm通道中进行标记检测。第三种活力检测法是一种常用的ATP发光检测法,但我们仅使用推荐体积的四分之一以降低成本。这三种检测方法的信号均呈线性,且与接种的细胞数量相关,但敏感度有所不同。三种方法均可避免耗时的显微镜观察,并对整个孔板进行采样,从而减少取样误差。最后,所有检测均可在实验结束后的当天内完成,有利于在短时间内开展更多实验。然而,这些方法均基于一个前提:处理后细胞数量与信号强度保持比例关系,而这一假设并不总是成立,尤其是对于细胞内ATP水平而言。此外,若细胞在处理后体积增大或缩小,可能在不影响细胞数量的情况下影响信号强度。我们总结认为,所有活力检测方法(包括人工计数)均存在若干局限性,但计算机化活力检测方法值得初期投入。联合使用这三种检测方法可全面评估细胞的结构与功能状态。
在生命科学领域,最常见的活力检测方法是细胞计数。这一结论得到了文献分析的支持:对2013年4月29日和4月30日PubMed数据库中以“in vitro”或“culture”为关键词发表的最新200篇文献进行统计发现,其中23.5%的研究使用了细胞计数检测方法,包括手动细胞计数、利用成像软件进行的自动细胞计数以及台盼蓝排斥法。仅有1%的文献使用了活/死细胞染色法(Live/Dead assay)。使用MTT(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四氮唑溴盐)检测细胞代谢活力的文献占比为11%。该文献调研还显示,同时结合细胞计数与MTT等检测方法的研究仅占3.5%。尽管目前存在单独使用一种活力检测方法的趋势,但将细胞功能评估与细胞数量测定相结合,似乎是评价细胞完整性的最佳策略。仅依靠细胞计数并不充分,因为即使细胞仍存在于孔板中,这些残留细胞也可能不具备正常功能或处于非健康状态1,2。相反,某些功能性指标(如ATP水平)可能在细胞数量未发生相应变化的情况下升高或降低。代谢读数与细胞数量之间的解耦现象表明,ATP和MTT检测绝不能作为唯一的活力检测手段。本报告中描述了三种同时评估细胞结构和代谢功能的活力检测方法,以提供比单一检测更为全面的细胞完整性评估视角。
我们的两项检测需要使用能够测量700 nm和800 nm通道荧光的红外成像仪。红外波长范围内的背景噪声较低,因而具有更高的信噪比3。我们使用的Odyssey成像仪具有4.5个对数级的动态范围和16位的位深度,相当于216即65,536种红外灰度等级。相比之下,8位彩色成像每个波长仅能提供28即256种颜色等级。因此,16位成像具有更高的分辨率。需要注意的是,在已发表的报告中,原始红外图像通常以伪彩色形式呈现,其中800 nm通道显示为绿色,700 nm通道显示为红色。Odyssey成像仪广泛应用于Western印迹和细胞内Western(In-Cell Western)检测4-7。针对甲醛固定细胞的细胞内Western检测,使用针对目标蛋白的一抗,并通过红外荧光标记的二抗进行检测。该技术特别适用于磷酸化水平的检测6。在我们的细胞内Western实验中,我们在800 nm通道对固定细胞中的细胞骨架蛋白α-微管蛋白或神经元微管相关蛋白2(MAP2)进行染色。这些蛋白表达量较高,可获得良好的信噪比。同时,我们在700 nm通道使用DRAQ5染料对细胞核染色,并使用Sapphire染料对细胞质染色。因此,细胞骨架蛋白以及DRAQ5与Sapphire染色共同反映了细胞结构的形态。
第三种活力检测方法用于测量细胞代谢功能,称为“Cell Titer Glo”。该检测基于荧光素酶反应,其发光值与ATP水平成正比。ATP检测通常用于定量活细胞数量8-12。然而,将“titer”一词用于该检测名称中在一定程度上具有误导性,因为每个细胞的ATP产量可能随毒素处理而变化,因此并不总是与细胞数量成正比8。ATP水平还可能受到昼夜节律13、细胞分裂14和细胞分化15的影响。尽管如此,本文所示的ATP检测操作简便且具有实用价值,因为ATP是衡量代谢活力的一个可靠指标16-21,尽管其并不直接等同于细胞数量per se。将该检测与红外In-Cell Western检测联合使用,可比单独使用任一检测更全面地反映细胞完整性。
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各实验方案的示意图见图1。
1. 细胞接种
在96孔板中以不同的接种密度接种细胞(图2)。对N2a神经母细胞瘤细胞系进行线性检测时,每孔分别接种2.5k、5k、10k和15k个细胞,每组设3或6个复孔。对大鼠原代皮层神经元进行线性检测时,每孔分别接种25k、50k、100k和200k个细胞,每组设3或6个复孔。如果目标细胞系或原代细胞在不同接种密度下形态健康,应选择该细胞类型的最佳接种密度及其附近密度进行接种。
注意:在本研究中,N2a 细胞以 100 μl 培养基接种,原代皮层神经元以 200 μl 培养基接种于设计用于减少蒸发的培养板中。有关细胞处理、培养基、血清、抗生素及毒素处理的详细信息,请参见 Unnithan et al. 关于 N2a 细胞的研究8 和 Posimo et al. 关于原代皮层培养物的研究22。
2. 发光法ATP检测
3. 红外检测
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这些实验中的限速步骤是红外染色,因为ATP检测的持续时间相对较短。对于红外检测,我们预计通过分两批、每批四块板的方式,可在一天内完成八块96孔板的染色和扫描(见图1)。该估算基于以下步骤:20分钟固定,30分钟洗涤,30分钟封闭,2小时一抗孵育后进行30分钟洗涤,1小时二抗孵育后进行30分钟洗涤,30分钟DRAQ5与Sapphire染色后再进行30分钟洗涤,以及每四块板34分钟的扫描时间。为考虑四块独立板的错时加样操作,图1中额外增加了15分钟的洗涤时间。本估算未包含数据分析所需时间。如果每块红外检测板同时平行进行ATP检测,则一天内可完成十二块板的检测——其中六块用于红外染色,六块用于ATP水平测定。
回归分析中数据合格的标准(如“实验方案”部分所述,参见图3)包括铺板密度与信号强度之间存在显著相关性(双尾p ≤ 0.05)。发光或红外信号的变化幅度也应与细胞数量的变化成比例。理想情况下,5k个细胞的发光值或ATP水平应约为10k个细胞的一半,而15k个细胞的数...
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我们发现,所有三种活力检测方法的信号强度均与铺板密度呈线性关系且相互关联。然而,并非所有检测方法对铺板密度的2倍或1.5倍变化均具有相同的敏感性。对于N2a细胞,红外检测法的敏感性低于ATP检测法,尤其是在较低的铺板密度下。尽管红外检测法的敏感性低于ATP检测法,但DRAQ5 + Sapphire检测法与α-微管蛋白检测法结果一致,均显示出N-乙酰半胱氨酸具有显著的保护作用。在这两种检测方法中,红外信号均呈剂量依赖性下降,且三种活力曲线在加入N-乙酰半胱氨酸后均向右偏移。这种一致性并非在所有N2a细胞处理条件下都能观察到,因为α-微管蛋白检测法和ATP检测法对氯化铵等化合物的敏感性似乎高于DRAQ5 + Sapphire检测法(参见Unnithan et al.8中的图4)。因此,三种检测方法并不总能同等程度地反映细胞活力表型。尽管ATP检测法的信号强度与铺板的N2a细胞数量之间的比例关系优于α-微管蛋白检测法和DRAQ5 + Sapphire检测法,但在毒素处理后,信号强度反映细胞数量这一假设并不总是成立。在某些未引起红外检测信号类似升高的毒素浓度下,ATP水平却出现上升。这些数据揭示了N2a细...
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所有作者均无任何利益冲突需要披露。
我们感谢Juliann Jaumotte提出在ATP检测中节约试剂用量的想法。我们深切感谢Mary Caruso、Deb Willson和Jackie Farrer提供的出色行政支持,同时感谢Mylan药学院为本研究提供的经费支持。此外,我们还要感谢Hunkele疑难疾病基金会以及帕金森病与运动障碍基金会对原代神经元研究提供的经费支持。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| Cell Titer Glo | Promega | G7572 | 购买100 ml规格并分装,比购买更昂贵的10 ml规格更经济。重悬后未使用的试剂可在-20 °C下重新冷冻,至少可稳定保存21周 |
| 18% 甲醛 | Thermo-Shandon | 9990244 | 购买此固定液可避免称量甲醛粉末及煮沸溶液的过程,从而最大限度减少蒸气暴露 |
| 蔗糖 | Sigma-Aldrich | S0389 | 在甲醛溶液中添加蔗糖并非必需,但可改善固定后细胞的形态外观 |
| Odyssey 封闭液 | LI-COR | 927-40003 | 该鱼血清可批量购买,并于-20 °C长期冻存使用 |
| Triton-X 100 | Sigma-Aldrich | 21568 | 我们将10% Triton-X 100的储存液溶于无菌水中,于4 °C保存 |
| 磷酸二氢钠 | Fisher | S468 | 也可购买PBS片剂或10倍浓缩PBS溶液,但成本更高 |
| 磷酸氢二钠 | Fisher | S373 | 同上 |
| 叠氮化钠(250倍) | Ricca Chemical Company | 7144.8-16 | 切勿购买粉末状叠氮化钠,因其毒性极强。我们将所有使用过的抗体储存于含1倍浓度叠氮化钠的溶液中,于4 °C保存,直至出现杂质污染 |
| 小鼠抗-α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T5168 | 该抗体价格昂贵,但可高度稀释使用,且具有高度特异性 |
| 小鼠抗-MAP2 抗体 | Sigma-Aldrich | M9942 | 该抗体价格昂贵,但特异性极高(是进行细胞内Western检测的前提条件) |
| 800 nm 山羊抗小鼠IgG | LI-COR | 926-32210 | 其他公司也销售红外荧光二抗。请确保购买经过高度交叉吸附处理的抗体,并注意不同来源的IgG浓度可能存在差异 |
| DRAQ5 | Biostatus | DR50200 | 该化合物曾由LI-COR以1 mM浓度销售 |
| 蓝宝石染料(Sapphire) | LI-COR | 928-40022 | |
| 发光仪 | PerkinElmer | VICTOR3 1420 多功能微孔板检测仪 | |
| Odyssey 成像仪 | LI-COR | 9201-01 | |
| 摇床/混合器 | Research Products International | 248555 |
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