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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
野生动物通常被各种各样的蠕虫寄生。四种主要类型的蠕虫是"蛔虫"(线虫)、"刺头虫"(棘头虫)、"吸虫"(吸虫)和"绦虫"(绦虫)。在这里,我们描述了如何从脊椎动物中收集蠕虫,以及如何保存和分类识别它们。
野生动物通常寄生在各种各样的蠕虫中。蠕虫的四种主要类型是"蛔虫"(线虫)、"刺头虫"(棘头虫)、"吸虫"(吸虫)和"绦虫"(绦虫)。收集蠕虫的最佳方法是检查不到 4-6 小时就死亡的宿主,因为大多数蠕虫仍然活着。应进行彻底的尸检并检查所有主要器官。在流水下用 106 μm 筛子洗涤器官,并在立体显微镜下检查内容物。对所有蠕虫进行计数并固定代表性数字(在 70% 乙醇、10% 缓冲福尔马林或醇 - 福尔马林 - 乙酸中)。对于物种鉴定,蠕虫要么用乳酚(线虫和小棘头虫)清除,要么用 Harris 苏木精或 Semichon 胭脂红染色(吸虫、绦虫和大棘头虫)。蠕虫通过检查不同的结构(例如线虫中的雄性针状体或绦虫中的喙)来与物种进行关键识别。此处概述的协议可应用于任何脊椎动物。他们需要一些专业知识来识别不同的器官,并能够将蠕虫与其他组织碎片或肠道内容物区分开来。采集、保存和染色是简单的技术,需要最少的设备和试剂。分类鉴定,尤其是物种鉴定,可能非常耗时,并且可能需要将标本提交给专家或 DNA 分析。
脊椎动物被四大类蠕虫(蠕虫)寄生。其中两组,吸虫或吸虫,以及绦虫或绦虫,属于扁形蠕虫门。另外两组是线虫或蛔虫 (Nematoda) 和棘头虫或棘头虫 (Acanthocephala)。其中许多寄生虫已被记录为野生鸟类和哺乳动物发病和死亡的原因1,2。
大多数蠕虫的生命周期很复杂,涉及不止一个宿主1,2 。例如,吸虫有一个或两个中间宿主(通常是无脊椎动物)和一个最终宿主。所有宿主都需要可用才能完成周期,因此成年蠕虫才能出现在最终宿主中(这是本手稿的主题)。因此,重要的是要记住,某些蠕虫物种的流行率和强度可能会出现季节性波动,需要长期监测以捕捉特定宿主的完整蠕虫。
收集蠕虫的最佳方法是检查已被安乐死的宿主。这允许在蠕虫还活着时收集它们,并让它们得到适当的放松和固定。来自已死亡超过 24 小时或已冷冻和解冻以供检查的宿主的材料通常较差且难以识别。来自冷冻或正式化宿主的吸虫和绦虫通常严重收缩,并且丢失了对鉴定至关重要的结构,如吸虫上的口腔棘或绦虫头节上的钩子。然而,现实情况是,如今脊椎动物宿主提供的大多数材料都是冷冻或保存的。
包含蠕虫 DNA 序列信息的数据库正在迅速增长,因此许多物种的分类学鉴定已经成为可能。因此,应尽可能保留蠕虫以进行潜在的 DNA 分析。然而,如果标本固定在福尔马林中,就不可能获得高质量的 DNA。此处概述的收集和杀死蠕虫的方法将产生适合 DNA 提取和遗传分析的材料。
下面,我们详细介绍了如何对脊椎动物(两栖动物、爬行动物、鸟类和哺乳动物;不包括鱼类的单基因吸虫)进行尸检以收集蠕虫的方法,然后是如何保存和处理它们以进行分类鉴定的程序。
以下实验中使用的动物被发现死于道路杀戮。
1. 动物尸检和蠕虫采集主要器官的筛选
2. 蠕虫的保存
3. 蠕虫的分类学鉴定
4. 美国国家寄生虫收藏中的蠕虫存放处
使用上述方法,于 2007 年至 2011 年在蒙大拿州米苏拉县对蒙面鼩鼩 Sorex cinereus 的蠕虫进行了调查。共有 56 只鼩鼱从陷阱中收集,并在死后 2 小时内进行检查。感染的总体患病率为 96%;只有 2 只鼩鼱没有寄生虫。共鉴定出 15 种蠕虫,包括 9 种绦虫和 6 种线虫。绦虫属 Staphylocystoides 的一个物种以前没有描述过。发现感染的器官包括小肠(9 个绦虫、3 个线虫)、胃(1 个线虫)、肺(1 个线虫)和膀胱(1 个线虫)。每个受感染宿主的总感染强度为 7-234 条蠕虫。物种丰富度(每个受感染宿主的蠕虫物种数量)范围为 1-8,平均值为 4.1(图 2)。

图 1.蠕虫类群的代表性图画和照片,显示了每个门的主要解剖特征。A) 吸虫;B) 切斯托达;C) 棘头纲;和 D) 线虫。对于照片,包括有关学名、器官和宿主的信息。吸虫和绦虫是雌雄同体的。图纸的比例不一定相同。点击这里查看大图。

图 2.2007 年至 2011 年间从蒙大拿州米苏拉县收集的蒙面鼩 Sorex cinereus 的初步蠕虫数据摘要。
单击此处查看大图。
我们没有什么可透露的
野生动物通常被各种各样的蠕虫寄生。四种主要类型的蠕虫是"蛔虫"(线虫)、"刺头虫"(棘头虫)、"吸虫"(吸虫)和"绦虫"(绦虫)。在这里,我们描述了如何从脊椎动物中收集蠕虫,以及如何保存和分类识别它们。
作者要感谢普渡大学印第安纳州美国农业部动植物检疫局野生动物服务项目的疾病生物学家 Joe N. Caudell 博士为本视频的制作提供了用于收集蠕虫的标本。詹妮弗·塞拉芬 (Jennifer Serafin) 准备了所有的化学溶液。
| <强>固定强> | |||
| 醇-福尔马林-乙酸 (AFA) | Fisher Scientific | A407-1(乙醇) F75F-1GAL(甲醛) BP2401500(冰醋酸) | 乙醇 85%(85 毫升)+ 甲醛 37%(10 毫升)+ 冰醋酸(5 毫升) |
| 用于杀灭和长期保存的乙醇 | Fisher Scientific | A407-1 | 乙醇 100% (70 ml) + 蒸馏水 (30 ml) |
| 用于固定和 DNA 研究的乙醇 | Fisher Scientific | AC61511-0010 | 乙醇 80-90% (80-90 ml) + 蒸馏水 (20-10 ml) 福 |
| 尔马林缓冲 | Fisher Scientific | SF100-4 | 福尔马林 10% (10 ml) + 蒸馏水 (90 ml) |
| 甘油-酒精 | Fisher Scientific | A407-1(乙醇) AC15365-1000 (甘油) | 乙醇 70% (95 ml) + 甘油 (5 ml) |
| <强>清除、染色和封片强> | |||
| 乙醇,用于染色过程中的脱水 | Fisher Scientific | A407-1 | 乙醇 80%、95%、100%(80 ml、95 ml、100 ml)+ 蒸馏水(20 ml、5 ml、0 ml) |
| 乳酚 | Fisher Scientific | R400-27 | - |
| 苯酚 | Fisher Scientific | A931I-1(苯酚) A407-1(乙醇) | 苯酚 100% (80 ml) + 乙醇 100% (20 ml) |
| 哈里斯'苏木精 | Fisher Scientific | S25347(苏木精) A407-1(乙醇) A567-500(硫酸铝铵)S25553(碘酸钠) | 苏木精 (5 g) + 乙醇 100% (50 ml) + 硫酸铝铵 (100 g) + 碘酸钠 (0.37 g) + 蒸馏水 (1,000 ml) |
| Semichon's 醋酸胭脂 | 红Fisher Scientific | BP2401500(冰醋酸) S25236(胭脂红) A407-1(乙醇) | 冰醋酸(100 毫升)+ 胭脂红(1.5 克)+ 蒸馏水(100 毫升)。在沸水浴中加热 15 分钟并冷却。过滤制成储备液。与 70% 酒精以 1:2 的比例混合进行染色。 |
| 二甲苯 | 费舍尔科学 | X4-4 | 仅在化学通风橱下使用。 |
| 杨酸甲酯 | Fisher Scientific | S25437 | - |
| 乙醇碱性 | Fisher Scientific | A407-1(乙醇) S25159A(浓氢氧化铵) | 乙醇 70% (100 ml) + 氢氧化铵 (0.1 ml) |
| 乙醇酸 | Fisher Scientific | A407-1(乙醇) SA9233-100(盐酸) | 乙醇 70% (99.5 ml) + 盐酸 (0.5 ml) |
| 加拿大香脂 | Fisher Scientific | B10-100 | - |