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方法文章

放射性标记及通过高效液相色谱-流式闪烁法定量细胞内磷脂酰肌醇磷酸酯水平

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DOI:

10.3791/53529

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2016年1月6日

* These authors contributed equally

本文内容

摘要

磷脂酰肌醇是一类信号脂质,其相对丰度会因各种刺激而迅速发生变化。本文介绍了一种通过代谢标记法使用3H-myo-肌醇标记细胞,随后进行提取和去酰化,以测定磷脂酰肌醇丰度的方法。提取的甘油-肌醇脂质随后通过高效液相色谱分离,并通过流动闪烁法进行定量。

摘要

磷脂酰肌醇(PtdInsPs)是一类重要的信号脂质,能够招募特定的效应分子,并赋予细胞器分子特异性和功能。七种不同的PtdInsPs在分布和丰度上各不相同,其水平由特定的激酶和磷酸酶严格调控。PtdInsPs的含量可在多种信号事件发生或调控机制受到干扰时迅速发生变化。为了理解这些事件如何引起PtdInsPs含量的变化及其后续影响,量化信号事件前后或正常与异常条件之间PtdInsPs的水平显得尤为重要。然而,由于PtdInsPs含量极低且结构相似,准确测定每种PtdInsPs的相对含量具有挑战性。本文介绍了一种通过代谢标记法量化PtdInsPs水平的方法:利用3H-myo-肌醇对细胞进行标记,该同位素可被整合入PtdInsPs中。随后沉淀磷脂并进行去酰化处理,生成可溶性的3H-甘油-肌醇衍生物,进一步提取后通过高效液相色谱法(HPLC)分离,并利用流动闪烁检测法进行检测。文中详细描述了酵母样品的标记与处理流程,以及HPLC和流动闪烁检测仪的仪器设置。尽管该方法会丢失有关酰基链组成的信息,但其灵敏度高,且可优化以同时定量细胞中全部七种PtdInsPs。

引言

磷脂酰肌醇磷酸盐(PtdInsPs)是一类重要的信号传导磷脂,可调控多种细胞功能,包括信号转导、膜运输和基因表达,从而进一步调节细胞分裂、细胞器特性及代谢活性等高级细胞行为1-3。PtdInsPs共有七种,均由母体磷脂磷脂酰肌醇(PtdIns)的肌醇头部基团在3、4和/或5位点发生磷酸化而生成。重要的是,这七种PtdInsPs在细胞内的分布并不均匀,每种PtdInsP的局部浓度可在特定亚细胞位点动态升高或降低,并与一组特定的效应蛋白结合,共同决定其所在膜结构的身份与功能3,4。此外,每种PtdInsP的水平必须受到严格调控,因为其浓度变化会显著影响PtdInsP所产生的信号强度。每种PtdInsP的定位和水平取决于多种脂质激酶、磷酸酶和磷脂酶的靶向定位与活性,这些酶共同介导了各PtdInsP的合成与降解3,4。因此,PtdInsP调控机制的失调可能干扰细胞正常功能,导致癌症和退行性疾病等疾病的发生2,5,6。为了全面理解PtdInsPs及其调控机制的功能与作用,研究人员已开发出基于显微镜和生物化学的技术,用于追踪和定量检测PtdInsPs。

在许多情况下,磷脂酰肌醇磷酸盐(PtdInsPs)通过特定的蛋白质结构域与其效应蛋白结合7-9。这些蛋白质模块在与完整蛋白质分离表达时,通常仍能保持其正确的折叠构象和脂质识别特性。这一特性促使研究人员将特定的PtdInsP结合蛋白....

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方案

注意:以下内容详细描述了一种在酵母中测定磷脂酰肌醇磷酸(PtdInsPs)的方法。该方法提供了用3H-myo-肌醇标记酵母细胞、提取并去酰化脂质,以及通过高效液相色谱(HPLC)洗脱程序分离和定量去酰化PtdInsPs的实验细节。请注意,在哺乳动物细胞中对PtdInsPs进行标记、去酰化、分离和定量需要优化条件,并采用更长的HPLC洗脱梯度。这些细节可参见其他文献,尽管我们将在讨论部分简要介绍其中一些方面。总体而言,本文给出了从酵母中提取脂质、去酰化并提取水溶性甘油肌醇磷酸(Gro-InsPs)的方法,并在图1中进行了图示说明。

1. 酵母中PtdInsPs的标记与分析方案

  1. 细胞培养与放射性标记
    1. 在完全合成培养基中,于30 °C恒定振荡条件下培养20 ml酵母菌株SEY6210的液体培养物,至对数中期,即在600 nm处的光密度(OD600)约为0.6–0.7。
      注意:请勿使用YPD培养基,因其可能影响3H-myo-肌醇的掺入。此培养体积应足以支持2–3次HPLC运行。
    2. 通过在12 ml圆底管中以800 × g离心5分钟,收集总计10–14 OD的酵母细胞(注意:1 ml OD600 = 1的培养液约含....

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结果

采用该方法,利用3H-myo-肌醇对酵母磷脂酰肌醇磷酸酯(PtdInsPs)进行代谢标记。标记完成后,用高氯酸沉淀磷酸脂,随后进行磷酸脂去酰基化,并提取水溶性的甘油肌醇磷酸酯(Gro-InsPs)(图1)。在此阶段,必须通过液体闪烁计数对提取出的Gro-InsPs所携带的总放射性信号进行定量,以确保极低丰度的PtdInsPs(如PtdIns(3,5)P2)具有足够的信噪比;总放射性计数应为500万至1000万CPM,方可进样。由于酵母细胞中仅存在四种PtdInsPs,因此采用1小时洗脱法即可实现有效分离(图2)。

本研究中标记并处理了野生型、atg18Δ 和 vac14Δ 酵母突变体,以分析 PtdIns(3,5)P2 的变化情况,后者是酵母中含量最少的磷脂酰肌醇磷酸.......

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讨论

本文详细介绍了利用高效液相色谱-流动闪烁计数法测定酵母细胞中磷脂酰肌醇多磷酸(PtdInsPs)水平的实验方案。该方法通过用3H-myo-肌醇对PtdInsPs进行代谢标记,随后进行脂质处理,提取水溶性的3H-甘油肌醇磷酸(Gro-InsPs),再经高效液相色谱(HPLC)分离和分析。利用该方法可定量测定不同条件下细胞中PtdInsPs的相对水平,文中以野生型、vac14D和atg18D酵母细胞中PtdIns(3,5)P2的检测为例进行了展示(图4)。

为优化结果和/或进行故障排除,可采取若干关键步骤和改进措施。实现PtdInsPs可靠定量的最重要参数之一是总放射性信号水平。通常,向高效液相色谱(HPLC)中注入300万至500万计数通常足以可靠地定量较高丰度的PtdInsP种类,例如PtdIns(4,5)P2。然而,对于较低丰度的种类如PtdIns(3,5)P2的定量,可能需要注入高达.......

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披露

作者声明不存在任何竞争性经济利益。

致谢

C.Y.H. 获得了安大略省政府安大略研究生奖学金的资助。本文的研究工作由 R.J.B. 获得加拿大自然科学与工程研究理事会、加拿大研究主席计划以及怀雅逊大学的资助支持。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
1-丁醇BiobasicBC1800试剂级
磷酸氢二铵BioshopAPD001ACS级
硫酸铵BiobasicADB0060超纯级
自动进样器AgilentG1329BAgilent 1260 infinity系列
生物素SigmaB4501
硼酸BiobasicBB0044分子生物学级
氯化钙BiobasicCT1330无水,工业级
泛酸钙SigmaC8731
硫酸铜(II)Sigma451657无水
D-葡萄糖BiobasicGB0219无水,生物技术级
杜尔贝科改良伊格尔培养基Life11995-065含4.5 g/L葡萄糖、110 mg/L丙酮酸钠、L-谷氨酰胺
杜尔贝科改良伊格尔培养基MP biomedicals0916429 含4.5 g/L葡萄糖,不含L-谷氨酰胺,不含肌醇
EDTABiobasicEB0107无酸,超纯级
乙醚Caledon labs1/10/4700无水,试剂级
甲酸乙酯Sigma112682试剂级
胎牛血清Wisent080-450美国来源,优质,热灭活
透析胎牛血清Life26400044美国来源
FlowLogic ULabLogic Systems LtdSG-BXX-05用于流式闪烁计数的闪烁液 
叶酸BiobasicFB0466USP级
HEPES缓冲液Life156300801 M溶液
肌醇, Myo-[2-3H(N)]Perkin ElmerNET114005MC乙醇与水比例为9:1
胰岛素-转铁蛋白-硒-乙醇胺Life51500056100倍浓缩液
氯化铁(III)Sigma157740试剂级
Laura - 色谱数据采集与分析软件LabLogic Systems Ltd版本 4.2.1.18流式闪烁计数软件
L-谷氨酰胺SigmaG7513200 mM溶液,经无菌过滤,BioXtra,适用于细胞培养
氯化镁SigmaM8266无水
硫酸锰BiobasicMB0334一水合物,ACS级
甲醇Caledon labs6701-7-40HPLC级
甲胺溶液Sigma42646640% (v/v)
磷酸二氢钾BiobasicPB0445无水,ACS级
烟酸BiobasicNB0660试剂级
OpenLAB CSD ChemStation Agilent版本 C.01.03 HPLC软件
对氨基苯甲酸 (PABA)BioshopPAB001.100游离酸
青霉素-链霉素SigmaP4333100倍浓缩液,液体,稳定化处理,经无菌过滤,细胞培养测试合格
高氯酸Sigma244252ACS试剂,70%
PhenoSpher SAX色谱柱Phenomenex00G-315-E05 µm, 80 Å, 250 x 4.6 mm
磷酸Caledon labs1/29/8425试剂级
氯化钾BiobasicPB0440ACS级
碘化钾BiobasicPB0443ACS级
盐酸吡哆辛SigmaP9755
四元泵AgilentG1311CAgilent 1260 infinity系列
核黄素BioshopRIB333.100USP级
氯化钠BiobasicDB0483生物技术级
钼酸钠Sigma243655
温控柱温箱AgilentG1316AAgilent 1260 infinity系列
盐酸硫胺素SigmaT4625试剂级;配制成0.02% (w/v)溶液,形成悬浮液,混合后分装并冷冻
Ultima GoldPerkin Elmer6013321用于液体闪烁计数的闪烁液
硫酸锌BiobasicZB2906七水合物,试剂级
β-RAM 4IN/US systems型号 4流式闪烁计数器 - 500 µl流通池;可选Perkin Elmer的Radiomatic流式闪烁分析仪 

参考文献

  1. Di Paolo, G., De Camilli, P. Phosphoinositides in cell regulation and membrane dynamics. Nature. 443 (7112), 651-657 (2006).
  2. Bridges, D., Saltiel, A. R. Phosphoinositides and Disease. Curr. Top. Microbiol. Immuno. 362, 61-85 (2012).
  3. Botelho, R. J.

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