本文描述了一种高通量微阵列方法,用于鉴定可减少细菌在医疗器械表面黏附的聚合物。
本文描述了一种高通量微阵列方法,用于鉴定可减少细菌在医疗器械表面黏附的聚合物。
医疗器械常与医院获得性感染相关,这不仅给患者和医疗系统带来巨大负担,还加剧了抗菌素耐药性问题。减少器械相关感染的一个可行途径是为这些器械开发具有抗细菌黏附性能的聚合物涂层,从而在初始附着阶段阻止细菌的结合。本文介绍了一种基于微阵列并行筛选数百种聚合物的方法,用于识别此类抗黏附聚合物。该高通量方法成功鉴定出一系列具有潜力的聚合物,能够有效抵抗多种临床相关细菌单独以及多物种群落状态下的黏附。其中一种聚合物PA13(聚甲基丙烯酸甲酯-共-二甲基丙烯酰胺)在涂覆于两种市售中心静脉导管表面后,显著降低了多种医院分离菌株的附着率。所描述的方法可广泛应用于需要调控细菌附着性能的各类聚合物筛选场景。
聚合物微阵列是一种微型化的高通量平台,可将多达7,000种聚合物1打印在玻璃载片上,用于与原核或真核细胞进行平行分析2。本文所述方法基于我们于2010年首次报道的技术3。该筛选系统已应用于多种细胞类型,包括人肝细胞4、干细胞5、肾小管上皮细胞2、细菌3,6以及原生动物病原体7。在每种情况下,均鉴定出促进或抑制研究对象细胞黏附的聚合物材料8。此外,DNA与合成阳离子聚合物形成的复合物也已被用于微阵列形式,以高通量筛选基因转染候选材料9。除了用于细胞-基底相互作用的筛选外,聚合物微阵列还被用于评估材料性能10。
合成聚合物调控细菌在表面黏附能力的研究已有充分依据3,6,11。已知多种因素,包括聚合物表面的电荷、疏水性及表面粗糙度,均会影响细菌的结合。传统方法通过逐个或经验性地设计和测试单一材料来发现抗细菌结合的生物材料,这类方法耗时耗力、成本高昂且效率低下。聚合物微阵列为此类局限性提供了一种理想的替代方案。
附着在表面的细菌以一种称为生物膜的复杂群体形式生长——这类生物膜对多种环境胁迫和抗生素具有高度抗性。这在一定程度上归因于其致密的胞外基质(由蛋白质、多糖和核酸组成)12,另一方面则归因于生物膜中大量存在的耐受性强的"持留细胞"13。尽管表面附着及随后生物膜形成的精确机制难以表征,但普遍认为表面生长可分为三个不同阶段14-16。最初是可逆性附着,随后细菌发生更强的黏附,并通过产生胞外蛋白和多糖基质形成生物膜,同时细胞开始增殖。最终,成熟的生物膜释放出自由生活的浮游细胞,这些细胞可在其他部位引发新的感染。能够阻止细菌初始附着、从而抑制生物膜形成早期阶段的抗细菌聚合物,可能为减少感染提供一种极佳的解决方案。鉴于抗生素耐药性的上升(以及表面附着细菌本身具有的更高耐药性12),非抗生素方式的感染控制手段尤其受到关注。在医院环境中,抗细菌聚合物涂层可直接用于医疗领域,以减少通常在植入器械周围形成的医院获得性感染17。
本文描述了一种高通量筛选方法,用于检测381种聚合物对多种与医院内感染相关的致病菌的抗黏附活性,随后进行阳性结果验证,并对中心静脉导管材料进行涂覆和检测(图1)。简言之,通过接触式点样将聚合物点在琼脂糖包被的玻璃载片上,干燥并灭菌后,将微型阵列与临床上重要的细菌培养物共同孵育。孵育结束后,轻轻洗涤微阵列,并对黏附的细菌细胞进行荧光染色和可视化检测。随后,对能够抑制细菌黏附的聚合物进一步在更大尺度上进行研究,将其涂覆于玻璃盖玻片上,并通过电子显微镜观察。最终,筛选出的具有抗黏附性能的聚合物被涂覆于商用导管表面,结果显示其可使细菌附着减少近100倍。
1. 琼脂糖包被载玻片的制备
注意:在制备聚合物微阵列之前,需先用琼脂糖 I-B 涂覆氨基烷基硅烷修饰的玻片,以尽量减少非特异性背景结合,并实现对结合或排斥细菌的聚合物进行评估6。硅烷涂层有助于琼脂糖与玻片的结合。
2. 打印用聚合物溶液的制备
3. 使用接触式打印机打印聚合物微阵列
注意:微阵列的打印使用接触式打印机完成。有关聚合物微阵列打印的具体说明如下。关于打印机的使用方法和安全建议的一般性指导,请遵循制造商提供的用户手册。尽管我们使用的是接触式打印机,但也可使用合适的手动 stamping 装置。
4. 细菌接种至聚合物微阵列
注意:确保良好的无菌操作技术。所有培养物操作均应在无菌环境中进行,可使用本生灯或在超净工作台中操作。培养物的培养需根据各物种的具体要求,调节氧气供应、培养基和温度。
5. 芯片成像与分析
6. 用于“命中”验证的盖玻片包被
7. 使用扫描电子显微镜(SEM)进行盖玻片的贴附与分析
8. 导管涂层溶剂的选择
9. 通过共聚焦显微镜分析导管上的细菌黏附
10. 通过扫描电镜分析细菌在导管上的附着
图2显示了通过微阵列分析测定的细菌在多种聚合物表面的附着情况(归一化荧光强度)。未打印聚合物的点样区域(仅含NMP)作为阴性对照,因为琼脂糖强烈抵抗细菌结合6,记录到的荧光信号非常低。所展示的聚合物均表现为低结合性,但在大多数情况下,不同测试菌种之间聚合物的抗粘附性能存在显著差异。这反映了不同菌种间附着机制的广泛差异。因此,合适聚合物的选择取决于具体应用,但通过与琼脂糖比较,可轻松识别出低结合性聚合物。高结合性聚合物通常可在阵列中被识别,并可用于后续实验的阳性对照。对于在DAPI通道中不产生自发荧光的聚合物,可通过肉眼直观比较点样图像(如图3所示,突出显示一种代表性高结合性聚合物和三种低结合性聚合物示例)。尽管这种比较提供的信息少于统计分析,但可作为所计算强度值的有效视觉验证。
通过微阵列筛选出22种合适的聚合物后,进行放大实验,以验证其在较大表面涂层应用中的抗细菌黏附性能。图中展示了表现最优的示例,用于涂覆玻璃盖玻片(通过扫描电子显微镜分析(图4 和 图5))和导管切片(通过共聚焦显微镜分析(图6)和扫描电子显微镜分析(图7))。这两种显微技术均能实现表面直接细胞计数,提供明确的数据;细胞黏附的减少情况清晰可见。在放大实验中能最好地保持抗黏附性能,且适用于大规模涂层技术的涂层被进一步深入研究。所展示的结果代表了各阶段中表现最佳的聚合物。

图1:通过聚合物微阵列鉴定用于生物医学应用的抗细菌黏附聚合物的步骤。 SEM = 扫描电子显微镜。

图2:通过微阵列分析测定一系列聚合物上的细菌结合情况。 多种聚丙烯酸酯/丙烯酰胺(PA)和聚氨酯(PU)材料上观察到较低的细菌结合。结果显示了多种细菌物种(C. jejuni、C. difficile、C. perfringens、S. mutans)以及两个菌群(BacMix-1 和 BacMix-2)在聚合物微阵列上的结合情况。细菌结合以背景校正后的平均DAPI荧光强度(归一化)表示。误差条代表标准偏差。改编自参考文献6。 请点击此处查看该图的放大版本。

图3:聚合物斑点的示例图像。 显示BacMix-2在代表性聚合物上细菌附着情况的荧光(DAPI)和明场显微镜图像。图中包含一种强结合性聚合物,用于与几种非结合性聚合物(PU-20、PA-336和PU-179)进行对比。比例尺 = 100 µm。改编自参考文献6。 请点击此处查看该图的放大版本。

图4:使用玻璃盖玻片的放大实验。 扫描电镜(SEM)图像显示细菌在未涂层玻璃和涂有“命中”聚合物的玻璃表面的附着情况(选自表1)。比例尺 = 20 µm。

图 5:通过扫描电镜图像的细胞计数定量细菌结合能力。 比较在最佳“命中”聚合物涂层表面单位面积上附着的细胞数量。以琼脂糖作为“非结合”表面的对照,玻璃作为结合表面的对照。误差线表示标准偏差。

图6:涂层与未涂层导管切片上细菌结合能力的比较。 共聚焦图像对比了与BacMix-2共孵育后的未经处理导管(cath-1)(A)和经PA13涂层处理的导管(B)。图像使用40倍物镜拍摄(比例尺 = 20 µm)。改编自参考文献6。

图7: 涂层与未涂层导管切片上细菌结合的比较 扫描电镜图像显示未经处理的导管(cath-1)的对比A)以及涂有PA13的导管(B孵育于由BacMix-2组成的细菌混合液后). 比例尺 = 10 µm改编自参考文献6.
| 聚合物 | 单体 1 | 单体 2 | 单体 3 | 单体比例 | ||
| PA465 | MEMA | DEAEMA | HEA | 8 | 1 | 1 |
| PA475 | MEMA | DEAEA | HEMA | 6 | 1 | 3 |
| PA513 | MEMA | DEAEMA | MMA | 8 | 1 | 1 |
| PA515 | MEMA | DEAEA | MMA | 6 | 1 | 3 |
| PA13 | MMA | DMAA | - | 9 | 1 | - |
| PU1 | PEG2000 | HDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU16 | PEG2000 | MDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU161 | PEG2000 | MDI | BD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU7 | PEG900 | BICH | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU83 | PEG900 | HMDI | BD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU227 | PPG-PEG-1900 | HDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU129 | PPG425 | BICH | DMAPD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU10 | PTMG2000 | BICH | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU179 | PTMG2000 | HDI | NMAPD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU20 | PTMG2000 | MDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU5 | PTMG2000 | HDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
表1:图2中细菌非结合“命中”聚合物的组成。
细菌附着于表面是一个复杂的过程,受多种因素影响,包括细菌种类、表面特性、周围介质以及物理环境。尽管已知某些化学基团会影响细菌的结合(例如聚乙二醇通常具有抗附着性11),但将聚合物的生物学效应与其化学结构相关联仍十分困难,这使得针对特定功能的聚合物理性设计充满挑战。在缺乏详细附着机制的情况下,其他研究尝试模拟天然存在的抗污表面,但往往需要漫长且复杂的优化过程21。本文所介绍的微型化高通量方法通过并行筛选数百种聚合物,能够高效发现值得进一步研究的候选材料,从而克服了上述难题。
微阵列方法的结果主要用于鉴定可能的候选先导物质。图2展示了22种候选物质,其中至少有一种物种的结合率较低,而图3则显示了结合能力的显著降低。在图2中所示的22种低结合聚合物均被进一步用于放大实验,其中性能最优的(在抗污性和涂层特性方面)被确定为PU83、PA13和PA515(图4和图5)。聚丙烯酸酯类聚合物在聚合方法上具有更高的灵活性,因此选择其中结合率最低的聚丙烯酸酯PA13用于导管涂层研究(图6和图7)。对其他候选物质的更深入研究也已开展,并已在其他文献中报道6。
经过多次实验迭代,我们发现一些细微步骤对实验成功和可重复性至关重要。使用琼脂糖底层包被不仅有助于聚合物在玻片上的黏附,还能提供洁净的背景,因为琼脂糖对细菌定植具有高度抗性。同样,聚合物点样的一致性(无论在同一芯片内还是不同芯片之间)也极为关键,因此芯片的打印过程必须严格控制。为确保点样均匀,需仔细调节打印头针头的位置,并保证384孔板中各孔加样均匀。由于我们使用的部分聚合物具有一定程度的自发荧光,因此在细菌孵育前获取每张玻片的背景荧光数据至关重要。为消除变异并获得可靠的数据,建议进行微阵列的重复实验。
此处使用的染色剂(DAPI)对细菌种类无选择性,可非特异性地结合DNA。因此,在引入细菌培养物后,良好的无菌操作技术至关重要,因为污染可能不易被察觉,从而干扰实验结果的解读。后续使用扫描电子显微镜的实验也是如此,在这些实验中仅能区分杆菌和球菌,而无法分辨其属或种。
在微阵列筛选之后,应选择有前景的聚合物进行进一步验证。在本示例中,通过微阵列上荧光信号的明显降低,初步筛选出七种感兴趣的聚合物,并通过将其涂覆于较大表面积表面,确认了其对细菌黏附的抑制作用。图4和图5展示了在玻璃盖玻片上实现的结合量减少情况,这是一种用于检测聚合物作为整体涂层(而非微阵列点)行为的有效方法。随后,将这些聚合物涂覆于医疗器械表面,以全面量化其对细菌黏附的抑制效果。在这些涂覆实验中,所选溶剂(见方案第8部分)必须对目标基底(此处为导管)无损害,同时仍具备溶解目标聚合物的能力,以实现有效涂覆。本研究中使用了丙酮,除具备上述特性外,丙酮还具有低沸点,可快速蒸发,从而形成均匀的涂层。
所选择的验证方法将取决于具体研究的应用。由于电子显微镜和荧光显微镜能够直接对单个细胞的附着情况进行定量分析,我们选用这些技术作为整体染色微阵列检测的补充。结果如图6和图7所示,体现了互补性验证方法的重要性。图6中的共聚焦图像清晰地展示了单个细胞的形态,而扫描电镜(SEM)则额外提供了对聚合物表面形貌的评估,此处显示其表面光滑且均匀。这些方法受限于所用显微镜的视野范围,因此必须拍摄一系列图像,以确保结果的可靠性。上述方法无法对整个表面的细菌黏附进行定量,仅能通过若干小区域的结果推断整体覆盖情况。我们认为这对于所描述的应用已足够充分。可通过计数整个涂层与未涂层导管片段表面黏附的细菌数量来评估细菌结合的减少程度,相关方法已在其他文献中描述22。然而,此类方法要求被筛选的生物材料表面具有统一的表面积,而在使用具有复杂几何结构的医疗器械进行实验时,这一点往往难以维持。
显然,任何拟用于临床的设备都必须经过大量进一步测试,以确保其在人体中的安全性和有效性。本文所介绍的方法仅代表这一过程的起点,后续工作必须包括对结果的验证 体内 活性。在这种情况下,研究静脉导管时,初步工作可探究血液成分和完整细胞与聚合物的结合情况。还应考虑血液成分对细菌结合的影响,可通过在灭活血清或去纤维化血液存在下重复结合实验来实现。23. 该技术的最终测试将在一个 在体 例如皮下植入物感染模型24.
我们展示了聚合物微阵列方法在筛选表面改性聚合物方面的潜力。这类聚合物(既包括抑制也包括促进细菌结合的聚合物)在医学、食品工业和生物技术领域具有广泛的应用,因此该方法可能在多个研究领域中具有重要价值。尽管本研究中使用了细菌,但该方法也可适用于其他细胞类型,同样可借鉴用于其他化学微阵列。
作者声明无竞争性财务利益。
作者感谢EASTBIO(由英国生物技术和生物科学研究理事会资助的苏格兰东部生物科学博士培训合作伙伴关系)(S. V.)以及医学研究理事会(P.J.G)提供的经费支持。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 琼脂糖 | Sigma | 05066 | |
| 硅烷化处理载玻片 | Sigma | S4651 | |
| 聚合物 | 本实验室合成 | 不适用 | |
| NMP | Sigma | 494496 | |
| LB 培养基 | Oxoid | CM1018 | |
| DAPI | Thermo Fisher | D1306 | |
| 四氢呋喃 | Sigma | 401757 | |
| (3-氨基丙基)三乙氧基硅烷包被的玻片 | Sigma | Silane-prep | |
| 卡可基酸缓冲液 | Sigma | 97068 | |
| 导管 1 | Arrow International | CS12123E | |
| 导管 2 | Baxter Healthcare | ECS1320 | |
| 四氧化锇 | Sigma | 201030 | |
| 仪器设备 | |||
| 接触式点样仪 | Genetix | Qarraymini | |
| 微阵列显微镜 | IMSTAR | Pathfinder | |
| 旋涂仪 | Speedline Technologies | 6708D | |
| 共聚焦显微镜 | Leica | SP5 | |
| 图像分析软件 | Media Cybernetics | Image-Pro Plus | |
| 扫描电子显微镜 | Philips | XL30CP | |
| 溅射镀膜仪 | Bal-Tec | SCD050 |