描述了一种用于鉴定聚合物的高通量微阵列方法,这些聚合物可减少医疗器械上的细菌表面结合。
方法文章
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描述了一种用于鉴定聚合物的高通量微阵列方法,这些聚合物可减少医疗器械上的细菌表面结合。
医疗器械通常与医院获得性感染有关,这会给患者和医疗保健系统带来巨大压力,并导致抗菌素耐药性。减少器械相关感染的一种可能途径是识别这些器械的抗菌聚合物涂层,这将防止细菌在初始连接步骤中的结合。这里描述了一种基于使用微阵列平行筛选数百种聚合物来识别此类排斥聚合物的方法。这种高通量方法导致鉴定出一系列有前途的聚合物,这些聚合物可以单独抵抗各种临床相关细菌物种的结合,也可以抵抗多物种群落的结合。一种聚合物 PA13 (聚(甲基丙烯酸甲酯-co-二甲基丙烯酰胺)) 在涂覆到两个市售中心静脉导管上时,显示许多医院分离株的附着显着减少。所描述的方法可用于识别用于细菌附着修饰很重要的广泛应用的聚合物。
聚合物微阵列是小型化,其中高达7,000聚合物1被印刷到载玻片于原核或真核细胞2平行分析的高通量平台。这里介绍的方法基础上,与我们于2010年首次3所述。这种筛选系统已被应用于许多类型的细胞,包括人肝细胞4,干细胞5,肾小管上皮细胞2,细菌3,6和原生动物病原体7。在每一种情况下,促进或所研究的细胞的抗蚀剂结合性聚合物被确定8。用合成的聚阳离子聚合物的DNA的复合物也已在基因转染的候选9的高通量筛选的微阵列形式使用。以及筛选细胞-基底相互作用,聚合物微阵列也被用于评估材料特性10。
">合成聚合物的调节细菌附着于表面的能力是公认的3,6,11。许多因素,包括电荷,疏水性和聚合物表面的表面粗糙度是已知的影响发现生物材料细菌结合。该常规方法该抗蚀剂的细菌通过依次或结合凭经验设计和一次测试一个材料是劳动密集型的,昂贵的和耗时的过程。聚合物微阵列提供规避这种限制一个有吸引力的替代方案。表面相关的细菌成长为一个复杂的人口称为生物膜 - 这种生物膜对许多环境压力和抗生素高度耐药。这部分是由于它们的稠密细胞外基质(蛋白质,多糖和核酸组成)12,部分由于健壮"persistor"细胞的生物膜13增加的存在。本书虽然是啊表面关联和随后的生物膜形成的确切机制是难以表征,它一般认为有表面生长14的三个不同阶段- 16。最初,可逆附着后跟细胞更强的粘附性,由生产的胞外蛋白和多糖基质和细胞增殖建立生物膜。最后,成熟的生物膜释放自由生活的浮游细胞,它可以在其他地方引发新的感染。菌驱蚊防止细菌的初始附着,从而防止生物膜形成的早期阶段的聚合物,可能代表用于最小化感染的最佳解决方案。给予抗生素抗性的上升(也表面相关的细菌12的内在阻力较大),减少了感染的无抗生素的装置是特别有意义的。在医院环境中,细菌驱蚊聚合物涂层可以在医院内感染,这通常形成围绕植入设备17的减少有直接的医疗应用。
这里,描述了用于381聚合物为针对一系列与院内感染相关的病原性细菌的驱避活性的筛选的高通量方法,随后命中的验证和随后的涂覆和中心静脉导管的材料的测定中,( 图1)。简要地说,将聚合物点样到由接触印刷琼脂糖包被的载玻片上,干燥和消毒后,小型化的阵列,用临床上重要的细菌培养物温育。孵育后,将微阵列轻轻洗涤和粘附的细菌细胞染色,并通过荧光可视化。接着,其抑制细菌结合聚合物是通过涂覆到玻璃盖玻片上的较大规模研究和利用电子显微镜观察。所选击退然后借给聚合物涂覆到商业导管和示出了近100倍,以减少细菌的附着。
1.琼脂糖包膜幻灯片的制备
注:制造聚合物微阵列之前,氨基烷基硅烷涂覆的玻璃载片涂覆有琼脂糖的IB以减少非特异性背景结合,并允许结合或排斥菌6的聚合物的评价。硅烷涂层有利于琼脂糖以幻灯片的结合。
2.印刷聚合物溶液的制备
3.印刷聚合物微阵列使用接触打印机
注:使用接触打印机进行芯片的打印。关于聚合物微阵列打印具体说明如下。有关使用打印机和安全建议的一般准则,遵循从制造商的用户手册。虽然我们使用一个接触打印机,合适的手动冲压设备也可使用。
4.聚合物微阵列接种细菌
注:确保良好的无菌技术。培养物的所有处理应该在无菌环境中进行的:要么使用本生灯或在流罩。培养物应当用氧的可用性,生长培养基,和温度调节到每个物种的要求来生长。
5.芯片成像和分析
6.涂层盖玻片为"重灾区"验证
7.附件和盖玻片利用扫描电镜分析(SEM)
8.一种溶剂为涂料导管的选择
9.激光共聚焦显微镜上的导管细菌吸附分析
通过SEM导管上细菌附着10.分析
图2示出了细菌附着(归一化的荧光强度)与数如通过微阵列分析测定的聚合物。印刷没有聚合物斑点(NMP只)是阴性对照,如琼脂糖强烈抵抗细菌结合6 -记录荧光很低。显示的聚合物是所有低结合虽然在大多数情况下,聚合物的拒水拒油性测试细菌物种之间显著而变化。这反映了在不同种类的附件机制之间的巨大差异。适当聚合物的选择是因此依赖于应用,但低结合性聚合物容易被琼脂糖比较鉴定。高粘合聚合物有可能在一个阵列被识别,并且可以用作用于随后的实验中的阳性对照。为不显示自发荧光的DAPI通道的聚合物,定性共光斑图像的mparison可以视觉进行( 如图3,突出一个代表性的高结合性聚合物和三个示例低结合性聚合物)。这样的比较,同时提供比统计分析少的信息,可以是计算出的强度值的有用的视觉验证。
使用微阵列鉴定22适当的聚合物,扩大进行了实验用于涂覆大表面时,以确认其细菌排斥性。显示的是表现最好的例子,用于涂层的玻璃盖玻片(用扫描电镜分析( 图4和图 5))和导管片(共聚焦显微镜( 图6)和SEM分析( 图7))。这两种显微方法具有允许在表面上的直接细胞计数,提供明确的数据的好处;减少细胞附着是容易visibl即其中最好保持在按比例放大的驱避性能,以及作为适合于大规模的涂布技术的那些涂层,进行进一步的研究。所示结果表明,从每个阶段表现最好的聚合物。

图 1: 通过聚合物微阵列生物医学应用参与细菌斥聚合物的鉴定步骤 SEM =扫描电子显微镜。

图 2: 细菌在一系列的聚合物,通过微阵列分析测定的结合低细菌结合被认为在许多聚丙烯酸酯/丙烯酰胺(PA)和聚氨酯(PU)的。从聚合物微阵列探测的结果与一些细菌小号 pecies( 空肠弯曲杆菌 , 艰难梭菌 , 产气荚膜梭菌 , 变形链球菌和两个财团; BacMix-1和BacMix-2)被示出。细菌结合表示为背景校正的平均DAPI荧光强度(归一化)。误差棒代表标准偏差。从参考6改编。 请点击此处查看该图的放大版本。

图 3:BacMix-2的聚合物点的实施例的图像荧光吲哚(DAPI)和明显微镜图像示出了有代表性的聚合物细菌附着。一个强结合聚合物是包括比较几个非结合性聚合物(PU-20,PA-336和PU-179)。比例尺= 100微米。从参考6改编。://www.jove.com/files/ftp_upload/54382/54382fig3large.jpg"目标="_空白">点击此处查看该图的放大版本。

图4: 规模化的实验用玻璃盖片的SEM图像显示在无涂层的玻璃及玻璃涂有"重灾区"聚合物(从表1中挑选的例子)细菌附着。比例尺= 20微米。

图 5: 细菌结合由细胞计数从SEM图像量化每涂覆有最好的"击中"聚合物表面的单位面积附着的细胞的比较。琼脂糖用作对照"非约束'的表面上,玻璃作为对照结合表面。误差棒表示标准偏差。

图6: 光面铜版纸和胶版导管片细菌结合的比较比较孵育后未经处理的导管(导管-1)(A)和导管涂上PA13(B)与BacMix-2共聚焦图像。用40X的目标(比例尺= 20微米)拍摄的图像。从参考6改编。

图 7: 细菌结合对涂覆和未涂覆导管切片比较 SEM图像显示孵育后涂覆有PA13(B)的用细菌鸡尾酒组成BacMix-2的未经处理的导管(导管-1)(A)和导管的比较量表。酒吧= 101,M。从参考6改编。
| 聚合物 | 单体1 | 单体2 | 单体3 | 单体的比率 | ||
| PA465 | MEMA | DEAEMA | HEA | 8 | 1 | 1 |
| PA475 | MEMA | DEAEA | HEMA | 6 | 1 | 3 |
| PA513 | MEMA | DEAEMA | MMA | 8 | 1 | 1 |
| PA515 | MEMA | DEAEA | MMA | 6 | 1 | 3 |
| PA13 | DMAA | - | 9 | 1 | - | |
| PU1 | PEG2000 | HDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU16 | PEG2000 | MDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU161 | PEG2000 | MDI | BD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU7 | PEG900 | BICH | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU83 | PEG900 | HMDI | BD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU227 | PPG-PEG-1900 | HDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU129 | PPG425 | BICH | DMAPD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU10 | PTMG2000 | BICH | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU179 | PTMG2000 | HDI | NMAPD | 2.5 | 5.2 | 2.3 |
| PU20 | PTMG2000 | MDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
| PU5 | PTMG2000 | HDI | - | 4.9 | 5.2 | - |
表1: 细菌的组成非约束在图2中"命中"的聚合物。
细菌附着到一个表面是由依赖于细菌种类广泛的因素决定的一个复杂的过程,从表面上看,周围介质和物理环境的属性。虽然某些化学基团是已知的影响细菌的结合(聚乙二醇,例如,典型地抗蚀附件11),关联的聚合物与它们的化学结构的生物影响是困难的,使聚合物的合理设计为具有挑战性的特定功能。在没有详细的附件机制,其他研究都试图模仿天然驱蚊表面,具有长期和广泛的优化处理21。这里介绍的小型化高通量方法克服了便利数百聚合物的平行筛选,以确定进一步研究的线索这些挑战。
从微阵列方法结果主要用于IDEntify有可能导致的候选者。 图2示出22名候选人与低结合的至少一个品种,而图3说明了在结合能力的明显减少。在图2中所示的全部22个低结合性聚合物被带到正向成比例增加的实验中,在此期间,最好(以排斥和涂层性质方面)被确定为PU83,PA13,和PA515( 图4和5)。聚丙烯酸酯提供在聚合方法方面具有更大的灵活性,因此将结合最低聚丙烯酸酯,PA13,被选定为导管涂层的研究( 图6和7)。对其他候选人更详细的进一步开展这项工作,并已在别处6日报道。
通过一些实验性的迭代,我们发现了一些小的步骤是成功的关键和可重复性。以及促进的粘附聚合物的玻璃载玻片,使用琼脂糖下涂层提供了一个干净的背景,如琼脂糖是细菌定植高度抵抗性。同样在聚合物中的一致性掩护本身,都在同一阵列中与阵列之间,是至关重要的,因此,阵列的打印,必须仔细控制。需要在打印头销与384孔板中也均匀填充仔细调整,以确保均匀的斑点。如一些我们所使用的聚合物的表现出一定程度的自体荧光的,取背景荧光数据对每个幻灯片之前孵育细菌是至关重要的。为了说明变化和取得的芯片强大的数据重复建议。
吲哚(DAPI)此处所用的染色剂具有用于细菌种类,结合非特异性DNA的无选择性。因此,一旦细菌培养被引入污染物可能会被忽视,混淆了interpre良好的无菌技术是必不可少的结果的塔季翁。同样是使用扫描电子显微镜,它是仅能够区分杆和球菌但不属或种以后的实验事实。
基因芯片筛选后,有前途的聚合物应选择进一步验证。在这里介绍的实施例中,感兴趣7聚合物进行可以通过明显减少在荧光确定在微阵列和它们附着的抑制通过在较大的表面上涂敷他们证实。 图4和5示出在上玻璃盖玻片上,一个结合所取得的还原实用装置来测试聚合物作为散装涂料,而不是作为微阵列点的行为。随后,这些聚合物被涂覆在医疗器械的完全量化在细菌附着减少。重要的是,该溶剂选择(见协议部分8),用于这些涂料的研究是良性到所需的基板(在此,导管),同时保留ING溶解感兴趣的聚合物,以便允许涂层的能力。这里,我们用丙酮其中,以及属性所提到的,具有低的沸点,并迅速蒸发,留下一个均匀的涂层。
正在研究的选择将取决于具体应用的验证的装置。正如电子和荧光显微镜细胞观察允许单个细胞附着的直接量化,我们选择了这些技术作为补充大量染色芯片分析。结果示于图6和7,其展示的免费验证方法的重要性。 图6中的共焦图象提供各个单元的非常清晰的图像,而扫描电镜具有允许该聚合物,这是这里平滑和均匀的表面的评估的附加益处。这些方法是由视所使用的显微镜的领域的限制,因此,它是性重要NT采取一系列快照有结果的可信度。上述方法不能定量细菌粘附在整个表面上,只有从多个小区域的推断覆盖。我们相信,这是足以为所描述的应用程序。减少细菌的结合可以通过使用其他地方22所描述的方法,整个涂层和非涂层的导管件列举表面细菌附着进行评估。然而,这样的方法需要筛选有均匀的表面面积,这是困难的,当分析用的医疗器械,这往往具有复杂的几何形状进行保持生物材料的表面。
显然,用于临床使用的任何设备都必须经过大量的进一步的测试,以确保在人类中的安全性和有效性。这里介绍的方法代表此过程和进一步的工作的开始必须包括在体内活性的确认。在这种情况下,学习静脉Çatheters,初始工作可以调查血液成分和全细胞与聚合物的结合。对细菌结合的血液成分的效果,也应考虑,可能通过在灭活血清或解fibrinated血液23的存在重复结合测定。该技术的明确的测试将在体内模型中,诸如皮下植入感染模型24。
我们表现出表面改变聚合物的筛分聚合物微阵列的方法的潜力。这种聚合物(包括抵制和促进细菌的结合)有医药,食品行业和生物技术应用了大量的,这意味着这种方法可能会在研究许多领域是有用的。虽然工作在这里使用的细菌中,该方法可以适用于其他类型的细胞,同样其它化学微阵列。
提交人没有需要声明的竞争性经济利益。
作者感谢 EASTBIO(由 BBSRC 资助的苏格兰东部生物科学博士培训伙伴关系)(SV)和医学研究委员会 (PJG) 的资助。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 琼脂糖 | Sigma | 05066 | |
| 硅烷制备玻片 | Sigma | S4651 | |
| 聚合物 | 内部合成 | 不适用 | |
| NMP | Sigma | 494496 | |
| LB 肉汤 | Oxoid | CM1018 | |
| DAPIThermo Fisher | D1306 | ||
| 四氢呋喃 | Sigma | 401757 | |
| (3-氨丙基) 三乙氧基硅烷涂层载玻片 | Sigma | 硅烷制备 | |
| 甲胂酸盐缓冲液 | Sigma | 97068 | |
| 导管 1 | Arrow International | CS12123E | |
| 导管 2 | Baxter Healthcare | ECS1320 | |
| 四氧化锇 | Sigma | 201030 | |
| 设备 | |||
| 接触式打印机 | Genetix | Qarraymini | |
| 微阵列芯片显微镜 | IMSTAR | Pathfinder | |
| 旋涂机 | Speedline Technologies | 6708D | |
| 共聚焦显微镜 | Leica | SP5 | |
| 图像分析软件 | Media Cybernetics | Image-Pro Plus | |
| 扫描电子显微镜 | Philips | XL30CP | |
| 溅射镀膜机 | Bal-Tec | SCD050 |
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