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方法文章

喂食实验装置(FED):一种用于测量啮齿类动物食物摄入量的开源装置的构建与验证

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DOI:

10.3791/55098

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2017年2月21日

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本文内容

摘要

进食实验装置(Feeding Experimentation Device,FED)是一种用于测量小鼠摄食量的开源设备。FED 还可通过实时数字输出,将摄食量测量与其他技术同步。本文提供了 FED 装置的构建、验证和使用的逐步教程。

摘要

摄食量测量对于许多研究至关重要。本文详细介绍了一种用于测量小鼠摄食量的新型装置:摄食实验装置(Feeding Experimentation Device, FED)。FED 是一个开源系统,旨在提高摄食研究中的灵活性。由于其紧凑且由电池供电的设计,FED 可放置于标准饲养笼或其他实验设备内。摄食测量数据还可通过 FED 的晶体管-晶体管逻辑(TTL)数字输出与其它设备进行实时同步,或在数据采集后通过 FED 内置实时时钟记录的每个事件时间戳进行处理。使用过程中,饲料颗粒置于 FED 的食物槽内,并通过红外光束进行监测。当小鼠取走颗粒时,FED 会将该事件的时间戳记录至其内部的安全数字(SD)卡,并自动释放下一粒饲料。在需要充电电池和补充饲料颗粒之前,FED 可持续运行长达 5 天,从而最大限度地减少人为干预对数据采集的影响。FED 的组装无需复杂的工程背景,其构建优先采用市售材料和电子元件。我们还提供了用于分析摄食量和进食模式的脚本程序。最后,FED 为开源系统,所有设计与构建文件均已在线公开,以便其他研究人员进行修改与改进。

引言

随着20世纪后半叶全球肥胖率的上升th 世纪,人们对摄食行为背后的机制重新给予了关注1,2,3,4通常,食物摄入量需手动称重5,或使用市售的喂养系统。市售系统性能优良,但在修改其设计或代码方面灵活性有限。本文中,我们介绍喂养实验装置(Feeding Experimentation Device, FED):一种开源的喂养系统,可高时间分辨率地测量食物摄入量,并最大限度减少人为干预6FED 由电池供电,整体封装于一个3D打印外壳中,可放入标准动物饲养笼架或其他科学设备内。

在稳态下,FED 以低功耗模式运行,食物颗粒静置于其食物井中。颗粒的存在通过红外光束进行监测。当小鼠取走颗粒时,光电中断传感器会向微控制器发送信号,并将时间戳记录在板载安全数字(SD)卡上。同时,晶体管-晶体管逻辑(TTL)输出提供颗粒取回的实时信号输出。在此事件发生后,电机立即旋转以分发下一个颗粒,系统随之返回低功耗模式。由于其开源特性,FED 可根据特定研究需求进行修改和改进。例如,可轻松修改代码以限制每日特定时间段内的喂食,或在达到预....

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方案

注意:本实验方案是针对材料表中明确列出的组件编写的。虽然使用其他硬件也可实现类似功能,但FED系统是为Arduino Pro微控制器(下文简称:微控制器)及所列配件进行编程的。其他微控制器可能同样适用,但需要用户自行修改代码以支持相应设备。离线数据分析采用Python编程语言编写。

1. 准备工作与软件安装

  1. 获取构建FED所需的电子元件(参见 表1 以及 Fed Github BoM.xlsx 文件位于:https://github.com/KravitzLab/FED/tree/master/doc
    注意:只要规格相同,本表中许多部件均可使用其他供应商的产品。
  2. 打印所有3D设计的组件图1,可在 https://github.com/KravitzLab/FED/wiki/3D-Printed-Components 获取。分辨率为 200 微米的 3D 打印机应能够打印 FED。
  3. 下载并安装集成开发环境(IDE)平台以对微控制器进行编程。
  4. 下载并安装附加库以启用电机驱动板和数据记录器的功能(可从以下网址获取:https://github.com/KravitzLab/fed/tree/master/fed-arduino)。
  5. 准备组装所需的工具(例如 电烙铁、热风枪、焊锡、剥线钳、尖嘴钳、一字螺丝刀和十字螺丝刀。

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结果

涉及动物使用的验证试验已通过国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所动物护理与使用委员会的审查和批准。为演示使用FED测量家笼内进食情况,采用成年雌性C57BL/6小鼠(n = 4)的个体分别单独饲养,并配有 随意摄取 在12/12小时明暗循环(光照开启时间为05:00)条件下,自由获取水和标准实验室饲料。经过一周的适应期后,移除食槽并更换为FED,进行为期五天的验证测试。测试期结束后,从笼具中移除FED,使用自定义的免费脚本和电子表格程序分析每张SD卡中的摄食数据。如图所示 图 4A,单个小鼠的颗粒摄取情况(上图;点阵图表示单次颗粒摄取事件)以及所有小鼠在每30分钟时间窗内的平均颗粒摄取量(下图;线条表示均值 ± 标准误)显示,在验证测试期间摄食行为持续存在,并呈现出清晰可见的昼夜节律性。为量化FED系统数据记录功能的准确性,每个FED系统在验证测试期间均装入1000颗颗粒,随后通过人工计数剩余颗粒,并与SD卡中记录的数据进行比较。FED系统记录到的已分配颗粒数据占实际分发颗粒总数的95.35 ± 1.25%.......

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讨论

进食实验装置(Feeding Experimentation Device,FED)是一种灵活的食物摄入监测系统。本文提供了该装置的制作与故障排查的详细说明,包括3D打印硬件的组装、电子元件的焊接,以及将程序上传至微控制器的操作步骤。尽管遵循本方案中所述所有步骤至关重要,但在每个环节中均有一些关键步骤需要特别关注,以确保最终产品的成功。3D打印的旋转盘应紧密地安装在步进电机轴上,并能够顺畅旋转,尽量减少来自邻近部件的阻力。焊接引脚连接时,应确保焊点牢固,且无过多焊料残留。在将程序上传至微控制器之前,必须确认所有额外安装的程序库均已放置在正确的目录中。FED的组装过程所涉及的操作均较为简单,即使没有3D打印或电子方面的先前经验,也可顺利完成。

FED 存在一些局限性。首先,每个 FED 均使用内置 SD 卡来记录和存储数据。当需要从多个 FED 设备中追踪和存储数据时,SD 卡可能带来操作上的不便。我们正在探索无线数据传输方案以缓解这一问题,但当前版本的 FED 仍依赖 SD 卡进行本地存储。其次,约有 5% 的情况下,FED 会释放两粒饲料丸而非一粒。尽管在我们的使用过程中,饲料丸.......

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披露

作者声明不存在任何经济或其他方面的利益冲突。

致谢

本工作由美国国立卫生研究院(NIH)糖尿病与消化及肾脏疾病研究所(NIDDK)院内研究计划资助。我们感谢 NIH 仪器设备科和 NIH 图书馆在 3D 打印方面的协助。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
电子元件
适用于 Arduino v2 的 Adafruit 电机/步进/伺服扩展板套件 - v2.3Adafruit1438其他电机扩展板未经测试,若使用需修改代码
适用于 Arduino 的 Adafruit 组装式数据记录扩展板Adafruit1141其他数据记录扩展板未经测试,若使用需修改代码
PowerBoost 500 充电器Adafruit1944其他电压调节板未经测试,但若规格相似应可正常工作
FTDI Friend + 配件 - v1.0Adafruit284任何 FTDI-USB 连接均可使用
小型减速步进电机 - 5V直流,32步,1/16减速比Adafruit858其他步进电机未经测试
Arduino Pro 328 - 5V/16MHzSparkFunDEV-10915其他 Arduino 开发板也可使用,但可能需要修改代码
光电中断器 - GP1A57HRJ00FSparkFunSEN-09299其他光电中断器也可使用,但可能需要修改3D设计
SparkFun 光电中断器分线板 - GP1A57HRJ00FSparkFunBOB-09322其他光电中断器也可使用,但可能需要修改3D设计
连接器、螺丝及其他杂项
适用于 Arduino(R3 兼容)的堆叠式扩展板接头Adafruit85任何标注为 Arduino R3 兼容的堆叠接头均可使用
多色热缩管套装 - 3/32" + 1/8" + 3/16"Adafruit1649任何热缩管均可使用
导线卷套装 - 22AWG 单芯线 - 6×25英尺Adafruit1311任何导线均可使用
锂离子电池组 - 3.7V 4400 mAhAdafruit354任何带 JST 接头的 3.7 V 锂电池均可使用 
SD/ MicroSD 存储卡(8GB SDHC)Adafruit1294任何 SD 卡均可使用
50 欧姆 BNC 面板安装插座(3/8" D型孔)L-comBAC70A任何 BNC 面板安装插座均可使用
316 型不锈钢盘头十字自攻螺钉,No.6 规格,1/4" 长度McMaster-Carr90184A120符合此规格的任何螺钉均可使用
316 型不锈钢盘头十字自攻螺钉,No.2 规格,1/4" 长度McMaster-Carr91735A102符合此规格的任何螺钉均可使用
尼龙 100 度平头开槽机螺钉,4-40 螺纹,1" 长度McMaster-Carr90241A253符合此规格的任何螺钉均可使用
尼龙六角螺母,4-40 螺纹规格McMaster-Carr94812A200符合此规格的任何螺母均可使用
2 针 JST M-F 连接器,200 mm 长,22AWG 电线电缆NewEgg9SIA27C3FY2876任何 2 针连接器均可用于此连接
金属按钮开关 - 自锁型(16 mm,红色)SparkFunCOM-11971任何按钮或开关均可使用
电阻器套件 - 1/4 WSparkFunCOM-10969任何 1/4 W 电阻器均可使用

参考文献

  1. Ellacott, K. L., Morton, G. J., Woods, S. C., Tso, P., Schwartz, M. W. Assessment of feeding behavior in laboratory mice. Cell Metab. 12 (1), 10-17 (2010).
  2. Betley, J. N., et al. Neurons for hunger and thirst transmit a negative-valence teaching signal. Nature. 521....

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