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Research Article
Antonio J. Tito1, Shebna Cheema2, Mian Jiang2, Sheng Zhang1,3
1Center for Metabolic and Degenerative Diseases, The Brown Foundation Institute of Molecular Medicine, Programs in Human and Molecular Genetics and Neuroscience, The Graduate School of Biomedical Sciences at Houston,The University of Texas Health Science Center at Houston, 2Department of Natural Sciences,University of Houston - Downtown, 3Department of Neurobiology and Anatomy, McGovern Medical School,The University of Texas Health Science Center at Houston
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
成年果蝇大脑是研究神经回路,大脑高级功能和复杂性疾病的宝贵制度。一种有效的方法来剖析来自小苍蝇头全脑组织将促进脑为基础的研究。在这里,我们描述了一个简单的一步解剖成人的大脑保存完好的形态协议。
有在使用果蝇到人脑退行性疾病的模型,在成人大脑映射神经设计电路,和研究的高级脑功能的分子和细胞基础的兴趣日益增加。成人大脑的整体卡口制剂保存完好的形态是这样的全脑为基础的研究关键的,但也可以是技术挑战性和耗时。这个协议描述了成年果蝇头部在不到10秒的一个易于了解,一步法解剖的方法,同时保持附连到身体的其他部分的完整的脑,以方便后续处理步骤。该过程有助于消除最通常与可以与稍后成像步骤干涉大脑相关的眼睛和气管组织的,并且也对所述解剖钳的质量需求较少。此外,我们描述一个简单的方法,可用于在盖玻片安装的脑样品的方便翻转,这是用于成像的B的两侧重要降雨具有类似信号强度和质量。作为协议的一个例子,我们在野生成年大脑多巴胺能呈现(DA)神经元的分析( 附1118)苍蝇。解剖方法的疗效高,使其成为在果蝇中大型为主脑的成人研究特别有用。
模式生物果蝇 ,俗称实蝇,长期以来一直重视其优雅的基因工具,短生育时间和高度保守的分子和细胞通路。果蝇已成功地用于解剖基本信号通路,多细胞生物体的图案化的机制,以及神经元发育,功能的基本机制,和疾病1,2-。在细胞标记和成像技术的最新进展,果蝇大脑已经成为神经回路的精细定位,并在解剖的高级脑功能,例如学习,记忆,和昼夜节律1,3的分子和细胞基础特别强大, 4,5,6,7,8。
果蝇系统的一个特别的优点是它的相对小的尺寸,允许使用常规化合物或共焦显微镜的大脑整个安装制备和检查。氏取值特征使神经元电路的详细解剖和功能分析,或甚至一个单一的神经元,在细胞和亚细胞水平,在全脑组织的范围内,从而在整个内提供所研究的受试者的两个整体视图及其精确几何脑。然而,考虑到大脑的相当小尺寸,它也呈现在一个成年果蝇有效解剖一个完整的脑组织从保护外骨骼头壳体的技术挑战。各种有效和相对简单的解剖的方法已详细描述,其通常涉及仔细和分步除去头部壳体的和相关的组织,包括眼睛,气管,和脂肪从大脑适当9,10,这些显微解剖的方法经常放置在解剖钳的质量相当严格的要求,依托细以及对齐提示,可以很容易损坏钳。此外,作为解剖大脑往往分隔符从身体的其余编,大脑可以容易地期间,因为它们的小尺寸和它们在处理缓冲器透明度的后续染色和洗涤过程丢失。在这里,我们描述了,保持连接到躯干的解剖大脑成人大脑相对简单和容易学习,一步夹层协议。解剖过程中往往容易清除了大部分脑相关组织如眼睛和气管,并减少了质量好的解剖钳的需求。
此外,荧光化合物显微镜或共焦显微镜下成像大脑时,大脑的一侧即来自荧光光源远经常产生一个较弱的信号和较少的清晰图像,由于整个贴装脑的厚度。在这里,我们还描述了一个简单的安装方法,其允许大脑样品容易翻转,使大脑两侧方便成像相似的信号的IntensiTY和质量。
作为证明的概念对于本方法的应用,研究成人脑,我们进一步研究多巴胺神经元的用w 1118蝇脑中的存在;被经常用作用于产生转基因苍蝇,在许多果蝇研究野生型对照的亲本系基因型。
1.解决方案用于脑解剖和免疫荧光染色
2.成年果蝇首脑显微解剖
注意:解剖过程在图1中示出。
3.大脑的免疫荧光染色
图1示出了用于成人脑解剖主程序中,如上所述图2和3是3日龄WT代表性图像(基因型:W 1118)成人飞大脑,其被costained用抗酪氨酸羟化酶的抗体(TH ,用红色的图2和白色图3),一个标记通常用于标记多巴胺神经元11中,除了将DNA染料DAPI标记所有所有分化的神经元细胞的细胞核和针对ELAV蛋白的抗体,标记物在飞(着色为绿色),它们一起显示了大脑的整体结构。
对于在图2和3中的第一抗体,我们使用兔抗TH抗体以1:200的稀释和大鼠抗ELAV抗体以1:100稀释,WHI通道分别在1×PBT制备含5%正常山羊血清阻断非特异性结合。对于二级抗体,我们使用的Alexa Fluor 488缀合的山羊抗大鼠抗体和AlexaFluor596缀合的山羊抗兔抗体以1:500稀释在1×PBT。
到图像的大脑中,我们使用配备有apotome函数来获取脑切片覆盖在大脑中的感兴趣的区域的整个深度的Z堆叠图像的直立化合物荧光显微镜。例如,为了获得多巴胺神经元在整个大脑的一般分布的清晰的可视化,我们使用20X物镜分开图像中相同的大脑的前部和后部侧面( 图2)。大脑的每一侧的深度成像,可以覆盖所有的多巴胺神经元为约20 - 总共25微米。为了可靠地可视化和量化的PAM簇区DA能神经元,它们具有更小的单元尺寸和较弱TH SIgnals(见下文),我们使用40X物镜。此外,在从商用软件的Z系列获取功能,我们选择了0.5的部分厚度- 1微米每个成象片之间,这确保最佳图像质量的3D重建的PAM簇区( 图3c)的。 PAM群集在覆盖所有的多巴胺神经元的大脑的厚度为约10 - 总共10微米。在我们的经验,apotome函数可以显著减少在成像厚的样品具有高的背景下,噪声信号,如一个全脑或在PAM簇区域。
图2A-E示出了大脑的前视图,而图2F-J显示相同的脑的后部视图翻转持有的脑样品,这对于大脑的两侧之间显示信号强度的类似水平的盖玻片后所有三个成像通道。该DA neur组件被分为以下早期指定11个不同的群集,尽管这里我们使用配对后内侧(PPM)的名称,以包括PPM1,PPM2,并且在大脑的前侧PPM3群集和配对后外侧的名称(PPL )以覆盖从大脑的后侧的PPL1和PPL2簇,如在白色显示前和在高倍率同一脑的后部观点图2E和2J。 图2E和2J中所示,揭示DA的不同群集对大脑的两侧的神经元。白色虚线突出显示在脑中( 图2E)以及PPL和大脑( 图2J)的后侧的PPM簇的前侧的突出PAM和配对前外侧(PAL)的簇。
图3A和3B一个重新量化结果对一些单位为W 1118苍蝇DA集群的摘要。我们数DA神经元薄片切片,也从三维重建图像,应尽量减少不准确计数。我们估计,3日龄W¯¯1118苍蝇有27 DA能神经元的整体平均每大脑中的PPM集群,16 DA能神经元每半球PPL集群中,5 DA神经元每半球PAL集群( 图3A),并在每个PAM集群( 图3B)97 DA能神经元。 图3C是在PAL和PAM集群DA能神经元,从高放大倍率的图像覆盖所有的DA能神经元在这一地区的片投射的代表三维重建。显而易见的是相对于其它簇如PAL制式,在PAM集群中的多巴胺神经元具有相对较小的细胞尺寸和较弱TH染色信号。
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图1:在解剖议定书成人果蝇脑的图形示意图 (A)的蝇被定位与腹侧向上,并且通过使用非优势手胸廓保持。力轻轻地施加(红色箭头)的钳子以诱导飞头和吸管的轻微向外延伸的向后倾斜,露出下面的白色透明区。 (B)中从优势手钳插在长鼻下方的透明区域,形成一个浅切口(红色箭头)。注意,我们使用镊子没有很细的尖端。 (C)的钳被允许通过其自身的力来分开,由红色箭头所示。通过打开钳产生的势头消除眼睛和骨骼,露出一个相对干净的果蝇大脑。大多数气管是在过程中除去。 ( 请点击此处查看该图的放大版本。

图2:DA神经元揭示用抗酪氨酸羟化酶(TH)抗体在成年男性果蝇乙雨(具有20X目的收购)该图包括解剖成人大脑的代表性图像,使用的大脑区域中的Z堆叠图像重建与化合物荧光显微镜获得利益。 (AE)和前(FJ)同成人大脑的后部意见; (A&F)细胞核被DAPI染色(白色)和(C&H)神经元W¯¯成像ERE由泛神经元标记的抗抗体ELAV(绿色)标记的; (B&G)多巴胺神经元被抗TH抗体(红色)显示。 (D&I)为DAPI,TH和治疗ELAV图像的叠加。 (E&J),以白色示出与多巴胺神经元的大脑区域的放大图。虚线突出显示在脑和PPL和PPM簇在脑的后部的前部的PAL制式和PAM簇。比例尺代表所有的面板为50微米。 请点击此处查看该图的放大版本。

图3. DA能神经元的定量在成年男性的大脑W¯¯1118苍蝇(有40X目的收购)。(A&B)DA为n的量化每日3男euronsW¯¯1118苍蝇,抗TH染色显示。数据由晶须箱形图表示的最大值和最小值作为异常值表示;以及第一(Q1),第二(Q 2)和第三(Q3)四分位。第二四分位被表示为平均值。 (A)PPM {(N = 28)最小:21,1:24,平均:27,Q2:30,最大:32},PPL {(N = 26)最小:10,1:12,平均:16, Q2:18,最大:25}和{PAL(N = 24),最小:2,1:4,平均:5,Q2:5,最大:10}集群; (B)PAM集群{(N = 20)最小:86,1:94,平均:97,Q2:97,最大:99}。显示了在3天的雄性W¯¯1118苍蝇的PAM和PAL集群DA能神经元(C)代表的投影图像。比例尺代表20微米。 请点击此处查看该图的放大版本。
作者没有什么可透露的。
成年果蝇大脑是研究神经回路,大脑高级功能和复杂性疾病的宝贵制度。一种有效的方法来剖析来自小苍蝇头全脑组织将促进脑为基础的研究。在这里,我们描述了一个简单的一步解剖成人的大脑保存完好的形态协议。
我们承认埃内斯穆罕默德先生,伽罗安德拉德女士,Pilar Rodriguez女士,克里斯国和丹娜Ghafir女士对项目的巨大支持。
| w*; 公园Δ21/TM3, P{GAL4-Kr.C}DC2, P{UAS-GFP.S65T}DC10, Sb1 | 布卢明顿果蝇库存中心 | 51652 | 平衡器已切换到 TM6B |
| PBac{WH}parkf01950 | Exelixis 哈佛医学院 | f01950 | 平衡器已切换到 TM6C |
| NaCl Fisher Scientific | S640-500 | ||
| 碳酸氢钠 (NaHCO3) | Fisher Scientific | 02-003-990 | |
| 氯化钾 (KCl) | Fisher Scientific | BP366-500 | |
| 磷酸钠,一氢二氢物 (NaHCO3) | Fisher Scientific | 02-004-198 | |
| 氯化镁 (MgCl2) | Fisher Scientific | 02-003-265 | |
| D-山梨糖醇 | Sigma-Aldrich | S1876-500G | 替代葡萄糖 |
| 二水氯化钙 (CaCl2) | Sigma-Aldrich | C5670-500G | |
| EMD Millipore Durapore PVDF 膜过滤器:亲水性:0.22 µm 孔径 | Fisher Scientific | GVWP14250 | |
| 福尔马林溶液,10%(组织学) | Fisher Scientific | SF98-20 | |
| 磷酸钾,氢二元,粉末,超纯生物试剂 | Fisher Scientific | 02-003-823 | |
| 吐温-20 | Fisher Scientific | BP337-500 | |
| Excelta 精密镊子,带非常细的点 | Fisher Scientific | 17-456-055 | 协议不需要非常精细的要点。 |
| 抗酪氨酸羟化酶抗体 | Pel-Freez Biologicals | P40101 | |
| 大鼠-Elav-7E8A10 抗 elav | 发育研究杂交瘤细胞库 | 克隆 7E8A10 | |
| 山羊抗大鼠 IgG (H+L) 二抗,Alexa Fluor 647 偶联物 ThermoFisher | Scientific | A-21247 | |
| 山羊抗兔 IgG (H+L) 二抗,Alexa Fluor 594 偶联物 | ThermoFisher科学 | A-11037 | |
| DAPI 溶液 (1 mg/mL) | ThermoFisher Scientific | 62248 | |
| 没食子酸丙酯粉末 | Sigma-Aldrich | P3130-100G | |
| 甘油 ACS 试剂,≥99.5% | Sigma-Aldrich | G7893-500ML | |
| 蔡司 Axioimager Z1 | 蔡司 | 报价 | |
| 蔡司 Apotome.2 | 蔡司 | 报价 | |
| Zen lite 软件 | 报价 |