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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
提出了一种使用 MALDI 成像质谱法将 DAN 基质升华到大鼠脑组织上以检测神经节苷铛苷的方案。
样品制备为最佳检测和基质辅助激光解吸/电离(MALDI)成像质谱(IMS)的实验分析物的可视键。确定适当的协议遵循整个试样制备过程中可能是困难的,因为每个步骤必须进行优化以符合与所关注分析物的独特的特点。这一过程不仅涉及发现能解吸和有效地电离感兴趣的分子相容的基质,而且选择合适的基质沉积技术。例如,一个湿基质沉积技术,这需要在溶剂中的基体溶解,优于大多数蛋白质和肽的解吸,而干燥基质沉积技术对于脂质的电离特别有效。升华已被报告为干燥基质沉积用于检测通过MALDI IMS在组织脂类的一种高效的方法,因为该homogenei相比于许多湿沉降方法1,2基质晶体沉积和最小的离域分析的TY。广泛地说,它包括将一个样品和粉状基质与按压冷的表面的采样的真空密封室中。然后该装置被降低到加热浴(砂或油),结果在粉状基质的升华到冷却组织样品表面。在这里,我们描述了使用1,5-二氨基萘(DAN)矩阵为使用MALDI IMS在大鼠脑神经节苷脂的检测和可视化升华协议。
基质辅助激光解吸/电离(MALDI)成像质谱(IMS)正在成为一种高度寻求技术为脂质,肽和蛋白质穿过完好样品表面的空间分布的可视化之后。 MALDI IMS的以前被称为预纯化的分析物的分析技术,但在最近几年中,已经在因为具有高分辨率视觉/解剖参考点,而质谱的精确度结合的能力许多其他学科提请注意需要任何外部标记。作为利用这种技术的研究的科学池继续增长,所需要增加的标准化,易于后续的协议,以协助IMS实验开发和优化。神经节苷脂,一组膜脂质在中枢神经系统高度丰富的,是理想的MALDI IMS实验作为它们的位置,嵌入在膜中,使某些特定上课不可能使用常规的免疫标记以检测。此外,我们已经表明,使用MALDI IMS中,这些脂质,其充当细胞信号的调节剂,除其他事项外,有在被脑损伤3,4,5后改变了健康啮齿动物脑独特的解剖分布模式。神经节苷脂位于较高质量范围相比,大多数脂质种类,并因此最适合于MALDI成像平台。

图1:MALDI IMS实验的工作流程。使用升华在MALDI IMS实验的一般流程的图。组织在-80℃冷冻于低温恒温器被分段和10微米的部分是安装在导电的ITO载玻片解冻。然后将载玻片置于干燥器直到升华。 SLIDES插入升华装置和偶数层矩阵施加到组织样本表面。样品在-20℃冷冻然后置于干燥器中10分钟,冷冻过夜。一旦标准被应用,将样品插入到其中激光跨越引起解吸分子在基质中以电离所述组织指示MALDI仪器。离子行进向下根据它们的质量(时间飞行/ TOF)直到它们到达了检测器的飞行管和分离。上一个预定的质量 - 电荷(M / Z)范围内的离子丰度分析物的信息显示为两个分子图像和质谱。这个数据可以用来既可视化和量化的成像组织内感兴趣的分析物的离子丰度。 请点击此处查看该图的放大版本。
样品制备用于MALDI IMS是高度可变的过程的每个步骤必须进行定制,以所关注的分析物。基于MALDI-实验限定特征是使用沉积到分析前的样品表面上的基质的涂层。除了吸收和在消融过程中从激光转印辐射能量的作用,该基质也用于各种分析物从样品中分离,从而有利于感兴趣6,7化合物的分析。基质样品表面的均匀的应用是在样品制备过程中最关键的步骤。不正确的基质沉积可导致大量异构基质晶体形态和文物的发展,低离子信号,重复性差7。
由于某些矩阵的亲和力来分离特定的分析物,被选择用于实验矩阵的类型可以显著改变的结果。用于蛋白质和肽的成像矩阵常常不同于用于成像脂质不同,此过程是通过需要额外的方法,如为了从组织成功地检测信号的洗涤和再水合步骤进一步复杂化。虽然脂质信号8的增强存在洗涤步骤,它们不是用于检测最脂质种类的一个先决条件。当选择的脂成像实验的矩阵,它考虑的兴趣,因为这脂质的极性将缩小合适矩阵的范围是重要的。例如,神经节苷脂含有唾液酸残基这给他们一个整体的负极性。有许多的矩阵,可以有效地解吸和电离来自组织神经节苷脂;然而,因素,如在频谱并在真空下基质的稳定性基质衍生的峰必须在考虑服用。 1,5-diaminonapthalene(DAN)矩阵是仪器的真空条件对于大多数成像应用下足够稳定,并表现出高度的脂质解吸灵敏度和可用于在正和负离子模式2脂质的分析。 DAN基质,相对于其他负脂质亲和基质如二羟基苯甲酸(DHB),9-氨基吖啶(9-AA)和5-氯-2-巯基苯并(CMBT)时,能够最有效地解吸从大鼠脑神经节苷脂组织在负离子模式(手稿准备中)。
选择基质沉积的适当的方法是同等重要选择矩阵本身。湿基质沉积方法,其中所述固体基质溶解在有机溶剂中,并通过气动沉积或自动喷雾器或检举,作为液体渗透的样品,以允许额外的用于蛋白质和肽的解吸特别有效化合物和共结晶与基质的ction。尽管这些技术也可用于脂质应用,分析物离域和不均匀的基质晶体地层是屡见不鲜由于脂质的在溶剂中的高丰度和溶解度,特别是在组织2,9。因为脂质易于从组织电离,干燥基质沉积技术,如升华,提供一种简单的,成本效益的替代喷雾器而绕过许多这些技术的缺点的。升华的MALDI IMS实验的成功归功于功能,如微晶矩阵的形态这增加了矩阵分析物结合的表面面积,增加基质纯度和均匀的基质的沉积,从而增加可重复性比较潮湿的矩阵技术1,10。
升华invoLVES正下方产生的固体,粉状基质随后沉积在组织样品表面的气相过渡冷却的样品表面加热真空下粉状基质。期间升华,基质沉积可通过改变因素例如时间,温度和压力,以提供高度可重复的结果来控制。单个升华试验可以在任何地方需要5至20分钟取决于矩阵的选择的类型,处理前可重复使用数次。该装置可商购于自动喷雾器的价格的几分之一处购买,并且很容易被拆开进行清洁和维护。成本低,这种基质沉积技术相对简单使其非常适用于开始后,或MALDI IMS脂质成像应用拓展的研究人员。虽然详细说明了组织对IMS的升华协议的信息已报告11,少数标准化协议存在W¯¯HICH重点涉及进行升华实验在负离子模式成像高质量脂质,使得难以建立的技术中没有广泛的试验和错误的基本工作流程。下面是一个试验性协议旨在填补DAN矩阵的升华到大鼠脑切片用于高分辨率成像和神经节苷脂的检测该间隙。

图2:升华设备。照片(A)和升华装置的示意图( 二 )。真空泵由橡胶管连接到冷阱充满300毫升乙醇。冷阱,然后由橡胶管的升华装置相连。该装置是由两个独立的玻璃器皿的件所用的金属U形接头密封在一起。升华器的上半部分包含填充有冰凌冷凝器。该样品板贴到所述冷凝器的底部,所述密封的玻璃装置内。升华设备的下半部分包含DAN矩阵,摊开均匀面临的样板。期间升华,玻璃装置被放置在砂浴中加热至140℃用热板正下方。温度探头有助于维持整个升华试验通过沙浴温度的反馈相比为实验的预设温度稳定的温度。 请点击此处查看该图的放大版本。
坚持以下描述西方安大略省的动物护理委员会(2016-014)的大学所有的动物处理程序。
1.组织准备和剖分
2.升华器设备建立
注:在通风橱中执行这些步骤。
3.升华
4.组织存储/补液
5.成像和Analysis
经升华实验结束后,将玻璃仪器的两半在通风柜和滑动分离,贴在冷凝器,可以去除( 图3A)。此时,滑动应检查在沙浴中的装置的不均匀矩阵分布和时间,温度,或位置可能必须调整为下一幻灯片。一个成功的DAN升华实验将导致甚至涂层沿着那里的组织的解剖特征可以清楚地显现在滑动和载玻片上基质的量的表面灰色/褐色矩阵的类似于量在组织上( 图3B)。例如,如果过多基质已经升华在组织上,基质的厚度将覆盖组织和唯一的一般形状的特征将是可以辨认的。然而,如果太少矩阵升华,组织将哈已经比滑动( 图3C)的其余部分更暗的外观。既过多和过少的矩阵将导致在MALDI仪器差信号。对于质量控制的目的,托马斯等人。称量附着在滑动基质的量和由滑动表面面积除以重量。他们报告基质沉积的最佳量为几个矩阵包括DAN(110微克/平方厘米)2。虽然大多数余额缺乏复制这样的结果所需的精度,我们试图QC这种方法;然而,由于高度的变异性,我们只能建议要关联发现基质沉积的一个合适的范围与成功与丹矩阵不成功的升华实验,通过仪器信号检测来确定。低于100微克/平方厘米的基质测定用"太少"矩阵的条件有关,而高于140微克/平方厘米的测量是与"太多"有关。 100和140微克/平方厘米之间基质沉积被认为是用于与DAN矩阵成像的最佳量。校准标准应在组织样本周围的载玻片被应用,以确保检测到的IMS信号的质量准确度( 图3D)
在一个电离的IMS实验中,分子图像允许所关注的分析物的任何未知物种可能存在于一个给定的质量范围沿空间分布的可视化。神经节苷脂在该实验的分子图像使用ImageJ软件,以显示几种神经节苷脂物种横跨鼠脑( 图4A)的皮质和皮质下区域的解剖分布重叠。在大脑中最丰富的神经节苷脂是A系列品种神经节苷脂GD1a和GM1而且还含有可以全部之间找到GM2神经节苷脂GM3和1000-2000 M / Z质量范围,更高的质量范围比最常见的脑脂质,使得这些神经节苷脂易于沿谱( 图4B)确定。各神经节苷脂物种的离子丰度可用于半定量同一图像内神经节苷脂物种差异或变化。因为变异性的样品制备一定量的无法避免在IMS中,间扫描的比较被认为是半定量的。

图3. DAN升华。对大鼠脑组织DAN矩阵的升华的代表性结果。 (A)在升华后,该装置的两半分开,并在滑动从冷凝器除去。 (B)的DAN矩阵跨越多个大鼠脑组织切片均匀地分布在滑动的表面上,以允许高度再版oducible结果(100之间 - 150微克/平方厘米)。 (C)的,其中太少矩阵(左- <90微克/平方厘米)或过多矩阵(右- >失败升华实验实施例150微克/平方厘米)沉积。太少矩阵将导致分析物的解吸不充分,而太大矩阵将不允许激光采集期间穿透到组织,导致低离子检测。 (D)含有与施加DAN矩阵和校准标准升华大鼠脑组织切片幻灯片是准备用于插入到用于成像的MALDI仪器。 请点击此处查看该图的放大版本。

图神经节苷脂对大鼠脑4. MALDI IMS。代表SourceÈMALDI IMS分子图像和DAN矩阵升华后在大鼠脑神经节苷脂的质谱。分子图像是重叠的频谱的多个神经节苷脂物种的复合物,并使用的Image J软件来显示整个大脑神经节苷脂物种的独特解剖学分布伪彩色。种GM1d18:1(红色,大众〜1547道尔顿),GM1d20:1(绿色,大众〜1573道尔顿),GM3d18:1(蓝,大规模〜1178道尔顿),以及GM3d20:1(水鸭,大众〜1207道尔顿)是表示。分析物的质谱显示离子丰度1000内 - 2000质量范围。主要的A系列神经节苷脂沿频谱标记。 请点击此处查看该图的放大版本。
作者没有什么可透露的。
提出了一种使用 MALDI 成像质谱法将 DAN 基质升华到大鼠脑组织上以检测神经节苷铛苷的方案。
我们要感谢西安大略大学 MALDI MS 设施的 Kristina Jurcic 的技术援助,以及美国国家科学与工程委员会 (NSERC) 为这项工作提供资金。作者还要感谢 Caprioli 小组(田纳西州范德堡大学)和 Chaurand 小组(魁北克省蒙特利尔大学)在优化本手稿中介绍的升华技术方面的建议。
| 升华剂 | Chemglass Life Sciences | CG3038-01 | |
| 1,5-二氨基萘 (DAN) 基质 | Sigma-Aldrich | D21200 | 100 克 |
| 低温恒温器 | Thermo-Fisher Scientific | CryoStar NX50 | |
| 带温度反馈的加热板 | Thermo-Fisher Scientific | HP88857290 | Isotemp ADVD 7x7 HP 100 - 120 V |
| 不锈钢插孔 | Thermo-Fisher Scientific | 2216479 | 10x10 |
| 冷阱 | 定制现场 | ||
| 真空泵 | Franklin Electric | 1102180403 | Savant VP100 两级 |
| 铟锡氧化物 (ITO) 滑轨 | Hudson Surface Technology | PSI 1111000 | 类型 II,每个 1.1 毫米/25 |
| 个 MALDI TOF/TOF 5800 仪器 | AB Sciex | ||
| 干燥器 | Sigma-Aldrich | D2797 | 台式干燥器 |