代谢能力 体外 系统是药物和毒物生物转化与处置的关键要求。在本方案中,我们描述了应用参考代谢探针评估细胞培养中Ⅰ相代谢的方法。
代谢能力 体外 系统是药物和毒物生物转化与处置的关键要求。在本方案中,我们描述了应用参考代谢探针评估细胞培养中Ⅰ相代谢的方法。
外源性物质代谢酶在药物和毒物的生物转化过程中发挥关键作用,通过添加功能基团增加其溶解度,从而促进排泄。在某些情况下,这些结构修饰可能导致生成新的有毒产物。为了减少动物实验,可利用具有代谢活性的细胞来评估化学物质的风险。然而,许多细胞中代谢酶的表达随时间推移并不稳定 体外 原代培养系统中常见,但在细胞系中往往不完全或缺失。因此,对药物、添加剂以及环境污染物代谢的研究 体外 理想情况下,应在已表征代谢活性的细胞体系中进行。本文介绍一种利用化学探针及其可被超高效液相色谱-质谱法(UPLC-MS)和发光检测法定量的代谢产物,来测定二维细胞系和原代三维培养物中一类代谢酶(人I相代谢酶)活性的方法。该方法可用于检测来源于多种组织的细胞系和原代细胞中的代谢活性。
异源物代谢是通过向体内外来化学物质添加亲水基团并形成结合物,以促进其排泄的生化过程1通常,异源物质的代谢是一个两步过程,其中第一阶段主要为氧化反应,加入一个或多个羟基基团1,2在II相反应中,羟基作为受体用于结合亲水性基团,例如葡萄糖醛酸或硫酸基团1,2如果分子上已存在受体基团,则偶联反应可独立于Ⅰ相代谢进行。每种反应均由特定的酶组催化完成。 例如,细胞色素P450酶(CYPs),催化羟基化反应(图1) 和化学底物的脱烷基化反应3. 结合反应由磺基转移酶和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UDP-glucuronosyltransferases,图1谷胱甘肽-S-转移酶和N-乙酰转移酶4每种组织和器官都具有特定的代谢酶表达谱,其中肝脏表达的此类蛋白质最多。

图1:香豆素的I相和II相代谢示例。 CYP2A6/CYP2A13 催化香豆素的7-羟基化反应。7-羟基香豆素由II相酶UGT(UGT1A6和UGT1A9活性最高)与葡萄糖醛酸基团结合。
理解外源性物质的代谢对于药物安全性评价和化学物风险评估至关重要,原因有两点:反应动力学决定了药物或化学物在排出体外前以活性或非活性形式在体内存留的时间;此外,代谢酶可将原形化合物转化为更具反应性、不稳定且有毒的物质。此类反应也称为“生物活化”,主要由I相CYP酶驱动,但有时也由II相结合反应介导5。
基于此,一种 体外 准确预测药物或化学物质相关风险的模型在很大程度上依赖于细胞系统的代谢能力。源自病变组织或由正常细胞转化而来的细胞系,往往部分甚至完全丧失了其原始组织所具有的代谢酶谱。6正常代谢酶谱的维持在原代细胞培养中表现更佳(至少在短期培养中如此),若将组织培养于可保持其三维结构的基质中,其效果会进一步改善。1因此,对代谢能力的表征 体外 细胞系统是指导判断何种细胞模型适用于开展化学品安全性评价的重要初步步骤。
本文中,我们介绍了一种用于分析I相CYP酶活性与表达的实验方案 体外 以肝细胞系为例说明其应用7 和三维原代肺细胞培养物8CYP 特异性底物、其代谢产物和抑制剂对照,以及基于质谱法和发光法的定量方法均有描述。由于某些 CYP 具有可诱导性,而另一些则为组成型表达,因此也将给出这两种情况的示例。
注意: 代谢活性检测的一般工作流程概述如下 图2. 本工作流程的每一步骤将在下文各段中逐一详述。试剂与仪器的详细列表见下文表格。 材料表.

图2:代谢探针检测的工作流程。将细胞接种并培养至适当的密度。根据所检测的酶活性,可能需要进行CYP诱导步骤。将探针底物和抑制剂加入细胞培养体系中。经过一段时间的孵育后,收集培养基用于分析,同时裂解细胞以进行蛋白定量。随后对培养基进行处理,通过质谱法或发光法分析探针底物的代谢产物。请点击此处查看该图的放大版本。
1. 细胞培养

图3:肝细胞系培养物的透射光显微图像 本方案中所述的细胞系5 通常在培养中以约50%的比例分别分化为胆管细胞和肝细胞(100倍放大)。比例尺 = 100 μm. 请点击此处以查看此图的放大版本。

图4:在气液界面培养的经阿利新蓝染色气道细胞的横切面8。
纤毛细胞、黏液分泌细胞和基底细胞清晰可见。比例尺 = 250 μm。
2. 细胞培养中 CYP 活性的定量
注意: 作为一般原则,可使用 DMSO 和甲醇等溶剂配制本文所述各种代谢探针和抑制剂的储备液。然而,建议将培养基中的终浓度 DMSO 降至最低(1% 或更低),因为高浓度可能抑制代谢酶活性。在使用代谢探针孵育时,如条件允许,建议采用不含酚红和血清的培养基,因为酚红可能干扰细胞色素 P450 酶(CYPs)和 II 相代谢酶的活性,而血清中的成分(如白蛋白)可能降低探针的可利用性。在某些情况下,可能无法严格遵循这些指导原则。例如,气道细胞培养基为专有配方,含有酚红。专有的肝细胞系代谢培养基7 已含有超过1%的DMSO,因为细胞向肝细胞样表型转化需要该浓度的DMSO。
注意: 最后,本文中使用了“特异性探针/抑制剂”这一术语,但对此术语需谨慎对待。实际上,代谢探针极少是某种酶的专一性底物。然而,此处描述的探针对其靶酶具有高亲和力,因此被视为酶活性的可靠标志物。

表 1:代谢探针、产物及抑制剂及其对应酶的列表。与气道细胞和肝细胞联合使用的分子量及推荐浓度也一并列出。请点击此处查看此图的放大版本。

图5:进行CYP检测的建议24孔板布局。 (A) 建议的CYPs组成型表达实验布局包括一系列用于空白培养基、代谢探针以及代谢探针加抑制剂的孔。该布局可根据所测试的时间点数量进行相应倍增。B) 诱导型CYPs的示例布局包括一系列培养孔,分别用于培养基空白、仅含代谢探针的对照、诱导后的细胞(例如,与探针共同孵育,并与探针及抑制剂共同孵育。

表 2:用于标准曲线绘制的合成标准品稀释梯度及其相应的检出限(LOD)与定量限(LOQ)。可采用的稀释范围可能因质谱平台及灵敏度而异。本研究中采用的是与超高效液相色谱(UPLC)联用的三重四级杆/线性离子阱混合质谱仪。请点击此处查看该图的放大版本。

表 3:CYP1A1/1B1 检测中的发光探针、诱导剂与抑制剂。请点击此处查看此图的放大版本。
在三个不同供体(气道 M360、M370、M417)的气道细胞培养物和肝细胞系(Hep line)中测得的两对细胞色素 P450 酶(CYP1A1/1B1 和 CYP2A6/2A13)代谢活性的示例见图620。
通过发光测定法测量的CYP活性
图6A展示了在气道细胞(3名供体)和肝细胞中,使用或不使用TCDD诱导时,由CYP1A1/1B1介导的Luc-CEE(Luciferin 6'-氯乙基醚)O-去烷基化活性所产生的相对发光量。CYP1A1/1B1是高度可诱导的酶,通常在大多数组织中不以组成型方式表达。如图6A所示,在未诱导的细胞中未检测到发光信号。当两种细胞类型均预先与强效CYP1A1/1B1诱导剂TCDD共孵育后,与对照组相比,可检测到显著的发光信号(图6A)。这表明Luc-CEE探针已被代谢,从而释放出荧光素部分,进而被定量检测。总体而言,经TCDD处理的肝细胞系的活性低于气道细胞,即使在总蛋白归一化后仍如此。这种情况并不罕见,因为细胞系通常比原代细胞代谢活性更低。加入α-萘黄酮后,在所有细胞类型中均对CYP1A1/1B1活性产生明显的抑制作用,进一步证实了Luc-CEE代谢依赖于CYP酶。
使用超高效液相色谱-质谱法(UPLC-MS)定量CYP450代谢产物
图6B展示了在存在或不存在抑制剂8-甲氧基补骨脂素的条件下,3名供体(气道M343、M345、M347)的气道细胞和肝细胞(Hep细胞系)中CYP2A6/2A13活性的定量结果。数据已根据总蛋白量进行归一化处理。在0分钟香豆素孵育对照组中,未检测到7-羟基香豆素(图6B)。CYP2A6/2A13在某些组织中组成性表达,因此在与香豆素孵育16小时后,即使未经诱导,也在所测试的不同细胞类型中检测到7-羟基香豆素的生成。当加入CYP2A抑制剂8-甲氧基补骨脂素后(图6B),7-羟基香豆素的生成显著减少。
需要注意的是,在存在CYP抑制剂的情况下,仍检测到一定残留活性是正常的,因为抑制作用很少能完全彻底,而且其他CYP酶也可能识别该底物,尽管其催化效率要低得多。此外,使用原代细胞时可观察到不同供体之间的代谢活性存在差异,例如在气道细胞中CYP2A6的表现(图6B)。这是预期之中的现象,因为CYP酶的活性受每个供体的基因型和多态性影响。

图6:肝细胞系及三位气道细胞供体(M360、M370、M417)中CYP1A1/1B1活性(A)与CYP2A6/2A13活性(B)的检测结果。(A)显示在有或无TCDD诱导CYP1A1/1B1条件下的Luc-CEE脱烷基化活性。使用α-萘黄酮作为CYP1A1/1B1抑制剂。活性以相对发光单位(RLU)表示,并根据孵育时间(分钟,min)和总蛋白量(mg)进行标准化。(B)CYP2A6/2A13无需诱导,因其为组成型表达。在不同时间点测定香豆素7-羟基化活性(单位为pmol/min/mg蛋白),并分别在有或无抑制剂8-甲氧基补骨脂素存在下进行比较。所有结果均表示为三次独立实验的平均值及其标准差。该图改编自Baxter20。
补充表1:超高效液相色谱和质谱仪设置。请点击此处下载该文件。
目前,许多标准化的毒理学测试系统使用经过基因改造的细菌、细胞系或胚胎细胞,这些细胞并不能代表正常的人类代谢1。这可能导致对化学物质或药物潜在毒性作用的预测不准确。为了更真实地模拟人体组织的正常形态和代谢活性,研究人员正在开发创新的体外(in vitro)模型,例如三维(3D)细胞培养和器官芯片技术21,22,23。代谢能力是可用于判断哪些模型最适合进行毒理学评估和药物生物转化研究的一个关键标准。
本文所述方案旨在利用活细胞测定CYP酶的活性。该方法具有灵活性,适用于二维或三维培养条件下的不同细胞体系,并可选择基于发光探针或质谱分析的方法。两种方法均具有足够灵敏度,可检测纳克级物质,仅需在多孔板中培养的少量细胞即可完成检测。此外,这些方法也可应用于球状体或在复杂基质中培养的细胞。探针底物的选择显然是本方案中的关键环节。检测的特异性依赖于探针对于CYP酶的选择性,而通过使用特异性CYP抑制剂可进一步提高检测的可靠性。本文列出的底物和抑制剂仅为部分示例,更多选择可参考相关文献。
在使用新的细胞类型时,应考虑设置多个孵育时间,因为细胞色素P450(CYP)活性呈阴性结果可能是由于该酶表达水平较低所致。建议同时加入可用作阳性对照的细胞类型,以确保阴性结果并非由技术问题引起,并有助于后续的问题排查。原代肝细胞具有代谢功能,可作为对照使用,例如悬浮状态的原代肝细胞使用简便,但其活力随时间迅速下降。肝细胞系是另一种可行的替代方案,如本实验方案所述,其操作相对简便,但在代谢活性方面,不同细胞系之间存在差异6,21。
由于该检测方法具有非破坏性,除非测定总蛋白含量,否则可以在纵向研究中持续监测CYP活性20。这一点非常重要,因为某些细胞在培养过程中CYP活性会随时间发生波动。阴性结果可能与细胞未达到融合、分化进程不足或体外去分化有关。in vitro。在这种情况下,该方法为半定量,因为数据未根据每份细胞培养物中的总蛋白量进行归一化处理。在测定CYP活性后,并不总是可以或建议重复使用组织,因为探针、抑制剂或诱导剂的暴露可能对组织产生毒性作用,TCDD即为一例。
诸如微粒体等细胞组分也可用于表征特定细胞类型的细胞色素P450(CYP)活性。然而,微粒体制备需要大量细胞材料,并需添加适当的辅因子和缓冲液,以确保酶保持活性。使用活细胞可省去复杂的微粒体制备步骤,同时避免筛选最佳缓冲液和辅因子组合的过程。
通常建议进一步表征细胞培养物中细胞色素P450(CYP)的表达谱,以验证其与酶活性相匹配。由于代谢探针并非完全特异性地针对单一CYP,因此建议进行这一额外的验证步骤,以增强所测得的代谢活性与相应酶表达水平一致性的可信度。由于CYP为膜蛋白,制备其用于Western印迹相对困难,因此定量RT-PCR一直是表征这些酶的首选方法20。
需要注意的是,本方案描述的是一种检测CYP酶活性的方法,仅代表代谢酶的一个家族,尽管这是一个重要的家族。质谱分析方法的灵活性允许针对探针底物的其他代谢转化开发相应的检测方法。然而,这些方法必须逐一开发,目前针对其他代谢酶家族的特异性探针和选择性抑制剂相对较少。这一空白亟待填补,以实现对代谢能力的全面评估 体外 细胞系统
A.B. 和 E.M. 在撰写本手稿时为英美烟草公司员工。本手稿所述工作由英美烟草公司资助,本视频文章的出版费用亦由英美烟草公司支付。
作者感谢 Epithelix Sarl 和 Biopredic International 提供气道细胞和肝细胞显微图像,以及 Neil Smith 提供的实验流程示意图。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| <强>试剂 &和细胞 | |||
| 2 μm 注射器滤器 | Whatman | UN203NPEORG | |
| 24孔板 | 康宁 | 3524 | |
| 4-甲基伞形酮 | Sigma Aldrich | M1381 | |
| 5-苯基戊炔 | Sigma Aldrich | CD5001437 | |
| 6-羟基布普品 | Sigma Aldrich | H3167 | |
| 6-羟基氯唑沙宗 | Sigma Aldrich | UC148 | |
| 7-乙氧基香豆素 | Sigma Aldrich | 195642 | |
| 7-羟基香豆素 | Sigma Aldrich | H24003 | |
| 8-甲氧基补骨脂素 | Sigma Aldrich | M3501 | |
| 乙酸 | Sigma Aldrich | 695092 | |
| 乙腈 | Fisher | A/0626/17 | |
| αα-萘黄酮 | Sigma Aldrich | N5757 | |
| BCA 试剂盒 | 赛默飞世尔科技 | 23227 | |
| β-葡萄糖醛酸酶/芳基硫酸酯酶 | Sigma Aldrich | G0876 | |
| 安非他酮 | Sigma Aldrich | B102 | |
| 卡马西平 | Sigma Aldrich | C4024 | |
| 氯唑沙宗 | Sigma Aldrich | C4397 | |
| 胶原蛋白 | 细胞系统 | 5005-B | |
| 香豆素 | Sigma Aldrich | C4261 | |
| 双硫仑 | Sigma Aldrich | 86720 | |
| 氟伏沙明 | Sigma Aldrich | F2802 | |
| 谷氨酰胺补充剂(Glutamax) | Fisher | 35050061 | |
| HepaRG 代谢补充剂 | 默克 | MMAD621 | |
| HepaRG 复苏培养基添加剂 | 默克 | MMADD671 | |
| HepaRG | 默克 | MMHPR116 | |
| 荧光素-CEE | Promega | V8751 | |
| 甲醇 | Fisher | M/4056/17 | |
| MucilAir 气道细胞 | 上皮层 | EP01 | |
| MucilAir 气道细胞培养维持培养基 | 上皮层 | EP04MM | |
| Phenomenex Kinetex 2.6 μm,PFP 100A | Phenomenex | 00B-4477-AN | |
| TCDD | Sigma Aldrich | 48599 | |
| thioTEPA | Sigma Aldrich | T6069 | |
| Waters Acquity UPLC HSS T3 1.8 µ2.1 × 50 mm | 沃特斯 | 86003538 | |
| Williams’ E 培养基 | Fisher | 17704-024 | |
| <强>名称 | <强>公司 | <强>货号 | <强>评论 |
| <强>仪器设备 | |||
| 超高效液相色谱 | Waters | Acquity | |
| QTRAP 质谱仪 | Sciex | ABI Sciex 4000 | |
| QTRAP 质谱软件 | Sciex | Analyst 1.4.2 | |
| 光度计 | Molecular Devices | SpectraMax M3 | |
| 分光光度计 | Molecular Devices | SpectraMax M3 | |
| 细胞计数仪 | 贝克曼库尔特 | Vi-Cell XR | |
| 旋转蒸发仪 | Eppendorf | Eppendorf-5301 |
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