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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该方案描述了从非贴壁/间充质乳腺上皮细胞中纯化,定量和表征细胞外囊泡(EVs)/外来体的方法,并使用它们将乳腺形成能力转移到乳腺上皮细胞。衍生自茎状乳腺上皮细胞的EVs /外来体可以将该细胞特性转移到摄入EV /外来体的细胞中。
细胞可以通过外来体,含有蛋白质,脂质和核酸的〜100-nm胞外囊泡(EVs)进行通信。非贴壁/间充质乳腺上皮细胞(NAMEC)衍生的细胞外囊泡可以通过差异超速离心从NAMEC培养基中分离。基于它们的密度,EV可以通过110,000×g的超速离心纯化。可以使用连续密度梯度进一步分离来自超速离心的EV制剂,以防止可溶性蛋白质的污染。然后可以使用纳米颗粒跟踪分析进一步评估纯化的EV,其测量制剂中囊泡的大小和数量。尺寸范围为50至150nm的细胞外囊泡是外来体。 NAMEC衍生的EVs /外来体可以通过乳腺上皮细胞摄取,可以通过流式细胞术和共焦显微镜检测。一些乳腺干细胞性质( 如乳腺形成能力)可以通过来自NAMEC的EVs /外来体从茎状NAMEC转移到乳腺上皮细胞。分离的原代EpCAM hi / CD49f细胞乳腺上皮细胞在移植到小鼠脂肪垫后不能形成乳腺,而EpCAM lo / CD49f基底乳腺上皮细胞在移植后形成乳腺。通过EpCAM hi / CD49f细胞乳腺上皮细胞摄取NAMEC衍生的EVs /外来体允许它们在移植到脂肪垫中之后产生乳腺。衍生自干样乳腺上皮细胞的EVs /外来体转移到EpCAM hi / CD49f细胞乳腺上皮细胞的乳腺形成能力。
外来体可以通过在细胞之间转移膜和细胞质蛋白,脂质和RNA来介导细胞交流1 。已经证明外来体介导的通信涉及许多生理和病理过程( 即抗原呈递,耐受性发展2和肿瘤进展3 )。外来体通常具有与释放它们的源细胞相似的内容。因此,外来体可以从源细胞携带特定的细胞特性,并将这些性质转移到摄取它们的细胞中。
外来体是50至150纳米的双层膜囊泡,并呈现特异性标记( 例如 CD9,CD81,CD63,HSP70,Alix和TSG101)。因此,外来体必须通过不同方面的各种方法来表征。透射电子显微镜可用于观察膜囊泡如外来体4,5 。纳米粒子跟踪分析(NTA)和动态光散射分析(DLS)用于测量纯化外来体的大小和数量4 。可以通过密度梯度验证外来体的脂质膜含量。染色体标志物,例如CD9,CD81,CD63,HSP70,Alix和TSG101,6,7可以通过Western印迹法测定。
乳腺基底细胞在植入脂肪垫时具有产生乳腺的能力,而腔细胞不能8,9,10 。因此,乳腺基底细胞也称为乳腺再生单位。通过使用乳腺基底细胞和腔细胞模型,可以检测EVs /外来体在不同细胞群体之间转运细胞特征的能力。这个工作证明了通过使用源自乳腺基底上皮细胞的EVs /外来体将腺体形成能力从乳腺基底上皮细胞转移到乳腺腔上皮细胞的方法。乳腺上皮细胞摄取基底细胞分泌的EV /外来体后获得基础细胞特性,然后形成乳腺。
所有涉及动物的研究均符合动物保护机构委员会批准的方案。
细胞外囊泡/外来体分离和鉴定
2.使用密度梯度的外来体纯化
细胞外囊泡/外来体标签
细胞外囊泡/外来体摄取测定
5.分离原代小鼠乳腺上皮细胞
原代小鼠基底/乳腺上皮细胞分离
细胞外囊泡/外来体治疗
8.脂肪垫注射乳腺上皮细胞
乳腺全身
由于已经显示阻断PGE 2 / EP 4信号传导从乳腺基底样干细胞4引发EV /外来体释放,这项工作提出了从乳腺上皮基底细胞(NAMEC)培养物中分离诱导的EVs /外来体的方法。由于NAMECs在无血清培养基中培养,所以不存在来自血清13的预先存在的EV /外来体。对于在含有血清的培养基中培养的细胞,培养基中预先存在的外来体必须通过超速离心在110,000 xg进行预清洗,然后使用培养基培养源细胞以收集EV /外来体5 。来自4天诱导的NAMEC条件培养基的EVs /外来体可以通过差速超速离心从110,000xg沉淀中分离, 如图1所示 。隔离泡囊的数量和大小在110,000 xg皮尔可以使用纳米粒子跟踪分析(NTA)来测量。通过差速超速离心分离的110,000g沉淀级分主要含有〜100nm囊泡( 图4A );这对应于文献中报道的外来体(50-150nm)的大小。此外,TEM分析显示,110,000g NAMEC条件培养基的级分含有丰富的膜囊泡( 图4B )。虽然微分超速离心可以产生合理的纯外来体,但使用密度梯度的以下纯化步骤进一步消除污染物( 如蛋白聚集体) 5 。在密度梯度中,外来体由于囊泡中的脂质含量而漂浮在梯度中,而蛋白质聚集体(如果有的话)停留在梯度的底部。收集梯度的每一部分用于检测外来体生产者( 例如, CD81,CD63,CD9和TSG101 图5 )。可以用PBS稀释含有外来体的级分,并进行200,000×g超速离心以分离外来体。将分离的外来体沉淀物在PBS中洗涤一次,然后重悬浮于PBS中并储存在-20℃进行进一步分析。
在测量乳腺上皮细胞HMLE细胞的非茎对应物的NAMEC衍生的EVs /外来体摄取之前,EVs /外来体必须用荧光染料( 例如羧基荧光素琥珀酰亚胺酯(CFSE))标记。在同一标签程序中处理仅含有CFSE但不含EV /外来体的平行样品。该样品是用于以下EV /外来物吸收测定中的阴性对照,以反映微量残留游离CFS的作用E染料。将HMLE细胞用CFSE标记的NAMEC衍生的EVs /外来体或阴性对照培养2-6小时,然后进行流式细胞术。与未处理的HMLE细胞相比,用阴性对照培养的HMLE细胞表达略高于CFSE信号的水平( 图6A ,红线对橙线),其反映了残留的残留游离CFSE引起的CFSE信号的背景水平EV /外来体标记过程。此外,与阴性对照处理的HMLE细胞相比,用CFSE标记的NAMEC衍生的外来体培养的HMLE细胞表达10倍高的CFSE信号( 图6A ,蓝线对红线),其由特异性摄取的CFSE标记的EV /外来体。通过共聚焦显微镜观察也可以通过HMLE细胞摄取CFSE标记的NAMEC衍生的EVs /外来体。虽然阴性对照处理的HMLE细胞不显示CFSE信号,但NA的摄取在CFSE标记的EV /外来体处理的细胞中,在共聚焦显微镜下,用CFSE信号可以观察到由HMLE细胞产生的MEC衍生的EVs /外来体( 图6B )。
为了评估NAMEC衍生的EVs /外来体是否可以将乳腺基质细胞的乳腺形成能力转移到乳腺腔细胞,首先分离小鼠乳腺腔细胞,以便分析小鼠中的乳腺形成。从12周龄小鼠分离小鼠乳腺上皮细胞。将乳腺切成小块,并用胶原酶和胰蛋白酶进一步解离。分离的上皮组织和成纤维细胞可以通过差速离心分离,如步骤5.7和5.8所述。在每次离心过程中,管底部的沉淀物应主要含有上皮组织,成纤维细胞和单细胞应漂浮于上清液吨。与在差速离心之前含有上皮组织和成纤维细胞的混合物相比( 图3 ,上图),六轮离心清除了混合物中大多数成纤维细胞和单细胞( 图3 ,下图)。
使用具有蛋白水解和胶原分解酶活性和分散酶的天然酶混合物进一步解离上皮组织的乳腺上皮细胞( 图7 )以产生悬浮液中的单细胞。通过细胞表面CD49f和EpCAM的表达分选单细胞悬液可以分离乳腺腔细胞(EpCAM hi / CD49f lo ),乳腺基底细胞(EpCAM lo / CD49f hi )和非上皮细胞(EpCAM - )( 图8 )。
hi / CD49f细胞乳腺上皮细胞与来自NAMEC的EVs /外来体培养10天,并且每两天更换新鲜的EV /外来体和培养基。在EV /外来体处理后,将乳腺腔细胞植入小鼠的第 4乳腺脂肪垫( 图2 )。 8周后,分离脂肪垫并染色以分析乳腺形成( 图9 )。用诱导的NAMEC衍生的EVs /外来体的治疗允许腔细胞获得乳腺形成能力4 。 NAMEC衍生的,EV /外来体处理的乳腺腔细胞在小鼠脂肪垫中形成乳腺( 图9 )。

图1:外分泌图示r通过微分超离心从细胞培养培养基中的囊泡/外来体纯化方法。指示每次离心的速度和长度。在第一次离心分离后,将上清液保留下一步。离心110,000×g后,保留颗粒,弃去上清液。 请点击此处查看此图的较大版本。

图2:小鼠乳腺解剖学。小鼠有五对乳腺,数字1-5表示,位于皮肤下面的脂肪垫(红色)中。 请点击这里查看更大的版本是数字

图3:差异离心之前和之后的上皮组织和脂肪垫细胞的混合物的图像。从血细胞计数器取离子离心之前和之后,分离的脂肪垫细胞混合物的明亮图像。箭头:上皮组织。箭头:成纤维细胞和单细胞。刻度棒= 0.5 mm。 请点击此处查看此图的较大版本。

图4:NAMEC110,000 xg颗粒组分的囊泡尺寸和浓度分析。 NAMEC培养基的110,000g颗粒级分为col选择并进行( A )纳米粒子跟踪分析(NTA)和( B )透射电子显微镜(TEM)。比例尺= 1μm。 请点击此处查看此图的较大版本。

图5:检测密度梯度分数中的外来体。外来体标志物CD81,CD9,CD63和Tsg101和持家基因GAPDH的Western印迹分析显示含有外来体的20%碘克沙醇馏分。 请点击此处查看此图的较大版本。
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图6:通过流式细胞术和共聚焦显微镜检测细胞外囊泡/外来体摄取。在HMLE细胞中测量EV /外来体摄取。将CFSE标记的,NAMEC衍生的EVs /外来体和阴性对照加入指定的培养物中6小时。孵育后,对细胞进行处理 ( A )流式细胞术和( B )共聚焦显微镜。 CFSE(绿色;激发/发射(nm):492/517;显微镜激光线:488)荧光强度反映EV /外来体摄取。细胞核用DAPI(蓝色;激发/发射(nm):358/461;显微镜激光线:405)染色,质膜用质膜染色(红色;激发/发射(nm):649/666)染色;显微镜激光线:633;参见表格材料 )。共焦物镜:HCX PL APO 63x / 1.40-0.60油。刻度棒=20μm。ad / 55736 / 55736fig6large.jpg"target ="_ blank">请点击此处查看此图的较大版本。

图7:附着上皮组织的图像。由细胞形成的乳腺上皮细胞的明亮图像从附着的上皮组织中迁移和生长。刻度棒=100μm。 请点击此处查看此图的较大版本。

图8:通过表面EpCAM和CD49f对原代小鼠乳腺上皮细胞进行分选。将从12周龄小鼠的脂肪垫分离的小鼠乳腺上皮细胞进行细胞分类ING。小鼠乳腺腔细胞富集在EpCAM hi / CD49f lo群体中,用蓝色圆圈标记; EpCAM lo / CD49f hi群体中富含基底细胞,标有红色圆圈。非上皮细胞用图中黑盒标记。 请点击此处查看此图的较大版本。

图9:原代小鼠乳腺细胞乳腺形成。用PBS或来自NAMEC的EVs /外来体在细胞培养物中处理初级小鼠EpCAM hi / CD49f细胞,持续10天,并植入3周龄小鼠的清除脂肪垫中。 8周后将小鼠安乐死并进行尸检,以分析乳腺形态通货膨胀。比例尺= 0.75厘米。 请点击此处查看此图的较大版本。
| 百分比 | EpCAM的小额信贷机构 | CD49f的MFI | |
| 乳腺腔细胞 | 0.437 | 4.57 x 10 4 | 8183 |
| (EpCAM hi / CD49f lo ) | |||
| 乳腺基底细胞 | 0.09 | 5452 | 2.23 x 10 4 |
| (EpCAM lo / CD49f hi ) | |||
| 非上皮细胞(EpCAM - ) | 0.309 | 53 | 4619 |
表1:图8中描述的人群的百分比和平均荧光强度(MFI)。
作者没有什么可以披露的。
该方案描述了从非贴壁/间充质乳腺上皮细胞中纯化,定量和表征细胞外囊泡(EVs)/外来体的方法,并使用它们将乳腺形成能力转移到乳腺上皮细胞。衍生自茎状乳腺上皮细胞的EVs /外来体可以将该细胞特性转移到摄入EV /外来体的细胞中。
这项工作得到了国家卫生研究机构(05A1-CSPP16-014,HJL)和科技部(MOST 103-2320-B-400-015-MY3,HJL)的资助。
| MCDB 170 | USBiological | M2162 | |
| DMEM/F12 | Thermo | 1250062 | |
| Optima L-100K 超速离心机 | 贝克曼 | 393253 | |
| SW28 Ti 转子 | 贝克曼 | 342204 | |
| SW41 转子 | 贝克曼 | 331306 | |
| NANOSIGHT LM10 | 用于纳米粒子跟踪分析 (NTA) | 的Malvern | NANOSIGHT LM10 |
| Optiprep | Sigma-Aldrich | D1556 | 60% (w/v) 碘克沙醇水溶液(无菌)。 |
| CD81 抗体 | GeneTex | GTX101766 | 1:1,000 溶于 5% w/v 脱脂奶粉、1x TBS、0.1% 吐温 20 4 度;C、过夜 |
| CD9 抗体 | GeneTex | GTX100912 | 1:1,000 溶于 5% w/v 脱脂奶粉、1x TBS、0.1% 吐温 20 在 4 °C 中;C、过夜 |
| CD63 抗体 | Abcam | Ab59479 1 | :1,000 溶于 5% w/v 脱脂奶粉、1x TBS、0.1% 吐温 20,4 °C、过夜 |
| TSG101 抗体 | GeneTex | GTX118736 | 1:1,000 溶于 5% w/v 脱脂奶粉、1x TBS、0.1% 吐温 20,浓度为 4 °C、过夜 |
| GAPDH | GeneTex | GTX100118 | 1:6,000 溶于 5% w/v 脱脂奶粉、1x TBS、0.1% 吐温 20 中,4 °C;C、过夜 |
| CFSE(羧基荧光素琥珀酰亚胺二乙酸酯) | Thermo | V12883 | |
| FACSCalibur | BD Biosciences | 荧光细胞分析仪 | |
| IV型胶原酶 | Thermo | 17104019 | |
| 胰蛋白酶 | Thermo | 27250018 | |
| ITS | Sigma-Aldrich | I3146 | 一种重组人胰岛素、人转铁蛋白和亚硒酸钠 |
| 的混合物 accutase | ebioscience | 00-4555-56 | 一种具有蛋白水解和胶原水解酶活性分散酶的天然酶混合物 |
| STEMCELL | 7913 | 5 mg/mL = 5 U/mL | |
| 抗 CD49f 抗体 | Biolegend | 313611 | 1:50 |
| 抗 EpCAM 抗体 | Biolegend | 118213 | 1:200 |
| FACSAria | BD Biosciences | 细胞分选仪 | |
| 胭脂红校友 | Sigma-Aldrich | C1022 | |
| 人乳腺上皮细胞(HMLE 细胞,NAMEC) | 来自 Robert Weinberg 博士的礼物 | ||
| permount | Thermo Fisher Scientific | SP15-500 | |
| 碳酸氢钠 | Zymeset | BSB101 | |
| EGF | Peprotech | AF-100-015 | |
| 水皮质炎 | Sigma-Aldrich | SI-H0888 | |
| 胰岛素 | Sigma-Aldrich | SI-I9278 | |
| BPE(牛垂体提取物) | Hammod Cell Tech | 1078-NZ | |
| GW627368X | 开曼 | 10009162 | |
| 15 cm 培养皿 | Falcon | 353025 | |
| 台式离心机 | Eppendrof | 离心机 3415R | |
| 超速离心管 | Beckman | 344058 | |
| PBS(磷酸盐缓冲盐水) | 康宁 | 46-013-CM | |
| BCA 蛋白检测 | Thermo Fisher Scientific | 23228 | |
| 透射电子显微镜 | Hitachi | HT7700 | |
| 明胶 | STEMCELL | 7903 | |
| 10 cm 培养皿 | Falcon | 353003 | |
| 6 孔培养皿 | 康宁 | 3516 | |
| 雌性 C57BL/6 小鼠 | NLAC(国家实验动物中心 | ||
| FBS(胎牛血清) | BioWest | S01520 | |
| 庆大霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15710072 | |
| Pen/Strep | Corning | 30-002-Cl | |
| DNase I | 5PRIMER | 2500120 | |
| 氟烷 | 卤烃 | NPC12164-002-25 | |
| 甲醛 | MACRON | H121-08 | |
| 乙醇(乙醇) | J.T. Baker | 800605 | |
| 冰醋酸 | Panreac | 131008.1611 | |
| 硫酸铝钾 | Sigma-Aldrich | 12625 | |
| 二甲苯 | 徕卡 | 3803665 | |
| 0.22 μm 膜 | Merck Millipore | Millex-GP | |
| AUTOCLIP 伤口夹,9 mm | BD Biosciences | 427631 | |
| AUTOCLIP 伤口夹应用器 | BD Biosciences | 427630 | |
| CellMask™深红 | 赛默飞世尔科技 | C10046 | 质膜染色 |