本文描述了一种进行滴定ELISA的详细实验方案。此外,还提出了一种新颖的算法,用于评估滴定ELISA结果,并获得可溶性配体与微孔板固定化受体结合的解离常数。
方法文章
本文描述了一种进行滴定ELISA的详细实验方案。此外,还提出了一种新颖的算法,用于评估滴定ELISA结果,并获得可溶性配体与微孔板固定化受体结合的解离常数。
解离常数描述了结合平衡中两个结合伙伴之间的相互作用,是衡量它们亲和力的指标。它是比较不同配体的关键参数, 例如,竞争性抑制剂、蛋白质亚型及突变体与其结合伴侣的结合强度。通过绘制结合浓度曲线来确定解离常数 与 游离配体的结合曲线。相比之下,滴定曲线更容易记录,该曲线以与结合配体浓度成正比的信号对所加入配体的总浓度作图。该信号可通过光谱学方法和酶联免疫吸附测定(ELISA)进行检测。本文以一项滴定ELISA方案为例,用于检测蛇毒来源的rhodocetin与其固定化的α2β1整合素靶结构域之间的结合。滴定ELISA具有高度通用性且被广泛应用。只要两种相互作用的蛋白质均为纯品且浓度已知,即可将其分别作为固定化受体和可溶性配体使用。迄今为止的难点在于如何从滴定曲线中确定解离常数。本研究引入了描述滴定曲线的数学函数,该算法无需依赖易产生误差的饱和信号图解估算,可直接通过非线性回归对原始数据(在不同配体浓度下的信号强度)进行数学分析。因此,可同时记录多条滴定曲线,并将其转化为一组特征参数,包括解离常数和具有结合活性的受体浓度,并可进行统计学评估。结合该算法后,滴定ELISA具备了直接提供解离常数的优势,未来可更高效地被应用。
解离常数 K 是描述受体(R)与其配体(L)之间亲和力的关键参数。根据质量作用定律,K 定义为受体-配体复合物 RL 解离为受体 R 和配体 L 的平衡状态:
公式 1
其中下标 f 表示受体和配体的游离/未结合状态。受体-配体复合物 RL 的浓度与受体结合的配体浓度 Lb 相同。由于受体的总浓度 Rt 等于游离受体 Rf 与配体结合受体 Rb = Lb 之和,解离常数也可表示为:
公式 2
因此,饱和产率 Y 定义为结合配体 Lb 占受体总浓度 Rt 的分数,
方程 3
取决于游离配体 Lf 的浓度:
方程 4
这种双曲线关系描述了受体-配体相互作用的结合曲线,其图像显示了结合配体Lb的浓度随游离配体Lf浓度变化的关系。从结合曲线中可推导出解离常数K,即在达到半最大饱和结合量时对应的游离配体浓度。此外,已有多种将结合曲线线性化的算法被建立,例如Klotz提出的双倒数作图法1,2,或Scatchard及Hanes转换法(由Bisswanger综述3)。然而,所有这些算法都存在一个共同问题:在结合曲线中,饱和结合量的最大值是当游离配体浓度很高时渐近趋近的,该值必须通过图形预评估进行估计,因此容易引入误差。
此外,确定结合曲线需要在结合平衡期间对游离配体和结合配体进行定量。为此,必须将游离配体与受体结合的配体分离并分别定量。因此,配体与受体必须在性质上有所区别,例如非蛋白质配体与蛋白质受体的组合。如果两个结合分子均为蛋白质,则它们必须在大小、电荷或其他分子特征上可区分。然而,在小规模结合实验中对配体浓度进行定量是一项困难的任务。通常需要对配体进行放射性标记,以检测低浓度的结合配体,尤其是在受体用量较大且难以获得或成本过高时。此外,受体结合的配体在分离过程中及之后可能发生不可忽略的解离。因此,需要采用复杂的方法,如平衡凝胶过滤4、毛细管电泳5和脉冲蛋白酶解6,以定量受体结合的配体并将其与游离配体分离。
与这些结合实验不同,滴定实验不需要对结合态和游离态配体进行定量分离。在此方法中,保持受体浓度恒定,逐步加入不同浓度的配体。配体与受体结合后,其结合态具有可与游离态配体区分并可被检测的生物物理特性,该特性可通过以下方式测量: 例如,光度法、荧光法或抗体检测。因此,信号S与饱和产率Y成正比,因而也与受体结合配体(Lb),随所添加配体(L)的总浓度变化而被检测t)。信号S和添加配体的总浓度均可直接且更简便地定量,相较于结合态与游离态配体浓度的测定更为容易。特别是通过酶联免疫吸附测定(ELISA)检测受体结合的配体,可将样品体积减少至100 µL以下,并可在多孔微孔板中同时平行测定多个配体浓度。在滴定ELISA中,受体以相同浓度物理吸附于微孔板上,并用可溶性配体进行滴定。受体主要通过疏水吸附作用固定在塑料表面。固定化受体的表面浓度与受体包被浓度呈非线性关系,可能符合Langmuir吸附等温线。7除了吸附的受体分子总数外,其活性状态是滴定测定中的另一个重要参数。只有那些保持了配体结合活性的固定化受体才与滴定测定相关,并最终贡献于活性受体总数 Rt 滴定测定法中的该参数无法直接确定。
塑料表面未被固定受体覆盖的位点容易吸附其他蛋白质,例如配体。配体通过物理吸附结合到这些塑料表面位点时,会产生与受体结合配体相似的信号,但属于非特异性结合。为降低这种非特异性信号,需使用牛血清白蛋白(BSA)封闭尚未包被蛋白质的微孔板塑料表面位点。然而,在某些受体-配体滴定实验中,仍可能观察到非特异性背景信号,此时建议采用其他封闭剂,如0.2%明胶溶液或0.04%吐温20(Tween 20)溶液。
配体与受体结合后,通过两次洗涤步骤去除未结合的游离配体。结合态的配体仍与固定在微孔板塑料表面的受体保持结合,并可选择性地通过化学固定加以强化。为了后续使用戊二醛对结合配体与固定化受体进行共价交联,需将缓冲液TRIS替换为HEPES,此替换不影响配体结合。与TRIS不同,HEPES不会使戊二醛失活。戊二醛的共价交联可将结合的配体与其受体共价固定,防止其在后续的洗涤和孵育步骤中解离。因此,受体-配体相互作用被化学“冻结”,从而确保滴定曲线不受后续洗涤和孵育步骤的影响。然而,戊二醛固定可能会以某种方式化学修饰配体和受体,导致其相互作用减弱或完全消失。此外,配体内部表位的修饰可能改变检测抗体的结合亲和力,尤其是在使用单克隆抗体定量结合配体时。尽管在此滴定ELISA中未出现戊二醛固定的上述不良影响,但在进行滴定实验前,必须针对每一种受体-配体相互作用测试该检测方法对戊二醛的敏感性。固定完成后,通过含TRIS缓冲液的三次洗涤步骤去除多余的戊二醛。TRIS可灭活残留的醛基,避免其在后续步骤中非特异性地与检测抗体发生反应。
结合配体的量通过酶联抗体进行定量,从而产生光度ELISA信号S。该信号被绘制为每孔中加入的总配体浓度Lt的函数。尽管滴定曲线更容易获得,但它并不像结合曲线那样呈双曲线函数。此外,如何从滴定曲线计算解离常数K仍不明确。虽然Stockell8和Heyn与Weischet9已分别报道了用于线性化光谱测定滴定曲线的算法,但由于这些方法在估计高配体浓度下饱和状态所趋近的最大信号值时存在不确定性,因而存在不足。
本文描述了一种滴定ELISA方法和非线性回归算法,用于从滴定曲线中推导受体与配体相互作用的解离常数K。该方案以整合素α2β1的胶原结合A结构域与一种蛇毒来源抑制剂之间的相互作用为例进行说明。整合素是一类细胞黏附分子,介导细胞与周围细胞外基质或基底膜的锚定10,11。此外,整合素通过募集额外的信号分子并在细胞-基质相互作用时形成新的细胞器——黏着复合体(adhesomes),在细胞与细胞外基质之间传递重要信号12,13,14。胶原是α2β1整合素的配体,是人体中最丰富的蛋白质,也是结缔组织中关键的支架成分15。α2β1整合素与胶原的相互作用由整合素α2亚基的A结构域介导。整合素α2A结构域含有一个二价阳离子,该离子对胶原结合至关重要,并可稳定其结构。野生型以及α2A结构域的突变体(例如将表面暴露的Y216残基替换为甘氨酸的突变体)均可在原核表达系统中重组表达,并通过其寡组氨酸标签(oligo-His-tag)使用NiNTA superflow柱进行纯化,随后在含2 mM MgCl2的TRIS缓冲盐水(TBS;50 mM TRIS/HCl,pH 7.4,150 mM NaCl)中透析16。蛋白浓度通过双辛可宁酸法(BCA)测定,纯度通过常规SDS-PAGE电泳并用考马斯亮蓝R250(Coomassie-Brilliant Blue R250)染色进行检测。
α2β1整合素与胶原蛋白之间的相互作用可被马来亚腹蛇(Malayan pit viper)蛇毒组分rhodocetin的结合所阻断Calloselasma rhodostoma)16,17在该滴定ELISA中用作可溶性配体的锯鳞蛇毒蛋白rhodocetin,按照先前所述方法从粗毒中纯化获得16溶于HEPES缓冲盐水(HBS;10 mM HEPES/NaOH,pH 7.4,150 mM NaCl)中,于-20 °C冷冻保存。其浓度通过BCA法测定,纯度经SDS-PAGE验证。作为拮抗剂,rhodocetin不仅可阻断胶原与整合素α2β1 A结构域的结合,还能稳定整合素的非活性构象,从而阻止胶原向细胞或血小板传递任何信号。18测定豆蔻素与其受体靶标的解离常数在生物医学上具有重要意义,有助于揭示其分子作用机制及药物开发潜力 例如,作为一种抗血栓剂。为此,本文描述了一种滴定ELISA方法及其评估,该方法适用于几乎所有具有1:1相互作用化学计量的受体-配体相互作用。
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1. 储备溶液
2. 准备缓冲液和工作溶液
3. 将受体(整合素α2A结构域)固定到微量滴定板上
4. 用 TBS(pH 7.4,2 mM MgCl2)将平板的包被孔洗涤两次
5. 封闭非特异性结合位点
6. 配体蛇毒素的系列稀释制备
7. 配体(Rhodocetin)在不同浓度下与固定化受体(整合素 α2A 结构域)的结合
8. 用 HBS 缓冲液(pH 7.4,含 2 mM MgCl2)洗涤平板孔两次
9. 使用含 2.5% 戊二醛的 HBS 缓冲液(pH 7.4,含 2 mM MgCl2)固定受体结合的配体
10. 用 50 µL/孔的 TBS 缓冲液(pH 7.4,含 2 mM MgCl2)洗涤板孔三次
11. 通过ELISA定量受体结合的配体
12. 滴定信号的评估
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ELISA 反应完成后,碱性磷酸酶底物转化为黄色的对硝基酚盐(para-nitrophenolate),其颜色深浅表明:随着第 1 至第 11 列中加入的 rhodocetin 浓度降低,结合的 rhodocetin 配体量也随之减少(图 1)。第 12 列未添加 rhodocetin 的孔中溶液无色,显示背景信号较低。
在 405 nm 处进行光度定量可获得数据,这些数据可直接输入分析软件,通过非线性回归和公式 9对每条滴定曲线的原始数据进行拟合,并计算信号 S(即 OD405nm)作为加入的 rhodocetin 配体总浓度 Lt 的函数(图 2)。每种受体形式(野生型和突变型)的四条滴定曲线高度可重复,几乎完全重叠。与组内变异较小形成对比...
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滴定ELISA是一种多功能的检测系统,用于测定受体-配体相互作用的解离情况。由于滴定ELISA无需有效分离游离与结合的配体,也无需对其浓度进行定量分析,因此相比绘制结合曲线的方法,已有大量研究和文献采用了滴定ELISA。此外,滴定ELISA操作简便,且对受体和配体的用量要求相对较低。为了准确分析解离常数,必须使用高纯度的受体和配体样品。受体样品中若存在污染蛋白,会与受体竞争微孔板塑料表面的吸附位点。这些杂质虽不结合配体,但会减少可结合配体的受体数量,从而降低滴定ELISA的信号强度。如果受体样品的纯度无法进一步提高,可将针对该受体的抗体固定在微孔板上,通过封闭孔板后,从含有杂质的样品中捕获受体。然而,必须注意避免捕获抗体因抗体间的种属交叉反应而干扰后续使用一抗和二抗对结合配体的检测,或阻碍配体与受体的结合。
为了获得全面的数据集,建议以相互对应的方式进行滴定 ELISA 实验,即在一个实验中用作可溶性配体的分子,在另一个实验中作为受体固定在微孔板上,并用前一个实验中的受体(此时作为可溶性配体)进行滴定。这种方法通常效果良好,除非固定过程使其中一方的结合活性失活,或缺乏可用的检测工具...
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作者无任何利益冲突需要披露。
本方案和算法是在德国研究基金会(DFG 资助项目 SFB1009 A09 和 EB177/13-1)资助的项目中开发的。作者感谢 Barbara Schedding 和 Felix Schmalbein 提供的技术支持,以及 Niland 博士对稿件的审阅。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| TRIS | neoFrox | 1125KG001 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H4034 | |
| NaCl | Applichem | 1,316,591,214 | |
| MgCl2 | Merck | 172571 | |
| 整合素 a2A,野生型与突变型,重组蛋白 | 由作者实验室分离 | ||
| NiNTA superflow 柱 | Qiagen,德国 | 30821 | |
| 考马斯亮蓝 R250 | Serva | 35050 | |
| 双辛可宁酸法(BCA)蛋白浓度测定试剂盒 | Fisher Scientific | 23225 | |
| 牛血清白蛋白(BSA),第 V 组分 | Applichem | A1391 | |
| 25% 戊二醛溶液 | Merck | 354400 | |
| 山羊抗兔免疫球蛋白抗体,碱性磷酸酶标记 | Sigma-Aldrich | A9919 | |
| 甘氨酸 | Applichem | A1377 | |
| 乙酸锌(Zn(II)) | Applichem | A4324 | |
| NaOH | Applichem | A1551 | |
| 碱性磷酸酶底物片剂(5 mg) | Sigma-Aldrich | S0942 | |
| Costar 半面积微孔板 | Thermo Scientific | Corning 3690 | |
| 微量反应管 | Eppendorf | 30120086 | |
| 酶标仪(微孔板 ELISA 读板仪) | BioTek | Synergy HT |
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