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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
在这里, 我们提供了一种方法, 以识别和隔离大量的 GM-脑脊液驱动髓细胞使用高速细胞排序。根据 Ly6C 和 CD115 的表达, 可以确定五种不同的种群 (常见髓样祖细胞、粒/巨噬细胞祖、单核细胞、单核细胞衍生巨噬细胞和单核细胞衍生的 DCs)。
细胞-巨噬细胞集落刺激因子 (GM-CSF) 在小鼠骨髓中产生的单核细胞来源的树突状体细胞 (moDC) 的培养最近被认为比以前所赞赏的多异质性。这些文化通常包含 moDC 和单核细胞衍生巨噬细胞 (moMac), 甚至一些较不发达的细胞, 如单核。本议定书的目标是提供一种一致的方法来识别和分离这些文化中存在的许多细胞类型, 以便它们的具体功能可以进一步研究。这里提出的分类策略将细胞先分为四种, Ly6C 和 CD115 的表达, 它们在转基因-脑脊液驱动的文化中发展的时候, 都是由细胞瞬时表达的。这四个种群包括普通髓样祖细胞或 CMP (Ly6C、CD115)、粒细胞/巨噬细胞祖或 GMP (Ly6C+、CD115)、单核细胞 (Ly6C+、CD115+) 和单核细胞衍生的巨噬菌或 moMac (Ly6C、CD115+)。CD11c 还添加到排序策略中, 以区分 Ly6C 中的两个种群, CD115-人口: CMP (CD11c) 和 moDC (CD11c+)。最后, 根据 MHC II. 类表达的水平, 在 Ly6C、CD115+ 人群中可以进一步区分两个种群。MoMacs 表达较低水平的 mhc ii 类, 而单核细胞衍生的 DC 前体 (moDP) 表达较高的 mhc ii. 类。这种方法可以可靠地隔离几个发育不同的种群, 这些数字足以用于各种功能和发展分析。我们强调一个这样的功能读数, 这些细胞类型的差异反应的刺激与病原体相关的分子模式 (PAMPs)。
细胞因子-巨噬细胞集落刺激因子 (GM-CSF) 培养小鼠骨髓细胞的方法广泛应用于大数1的单核细胞衍生树突状细胞 (moDC; 也称为炎症 DC) , 2,3,4,5。这些细胞在树突状细胞 (DC) 功能6,7,8的各种研究中非常有用。通常, 这些小鼠骨髓细胞培养6-8 天, 然后用于研究树突状细胞功能5。这些文化长期被认为主要是同源的, 包括多数被区分的 moDC。最近, 很明显, 在这个6–8的天文化时期结束时, 确实有许多 moDC, 以及分化的单核细胞衍生巨噬细胞 (moMacs) 9,10,11的大子集。我们自己的研究进一步扩展了这些发现, 证明其他不发达细胞的子集, 如 moDC 前体 (moDP) 和单核, 在7天10的时间内仍然保持在低频率的文化中。因此, 利用这个系统产生的细胞来研究树突状细胞 (DC) 功能, 可以反映出比以前更广泛的细胞类型的反应。
我们从研究 GM-CSF 生成的 moDC 与这些细胞在分化的最后阶段12,13,14的功能上学到了很多。然而, 我们对这些细胞2、15、16的发展途径以及它们如何和何时表现出特定功能, 如: 对病原体相关分子的反应能力的了解明显较少。模式 (PAMPs), 吞噬功能, 抗原处理和表现13, 和抗菌活性。17报告了一项隔离大量常规 Flt3L-driven DC 祖和前体的议定书。利用羧基琥珀酰亚胺酯 (CFSE) 染色的骨髓细胞 (在 Flt3L 中跟踪分裂细胞) 和培养3天, 实现了这些不同种群的分离。细胞被耗尽的宗族阳性细胞, 并排序为祖和前体群体的基础上 CD11c 表达17。Leenen 组在 GM-脑脊液驱动培养中识别 DC 早期祖细胞的另一种方法是根据 CD31 和 Ly6C 18对单元进行分类。最初的目标是建立一个类似的方法来获得 GM-脑脊液驱动 moDC 的祖和前体。由于由 GM-CSF 产生的特定细胞类型, 我们根据在早期和后期的发展阶段所表达的分子表达方式, 调整了方法和排序策略。我们最终确定 Ly6C、CD115 (CSF-1 受体) 和 CD11c 是区分这些细胞类型10的最佳标记。
在这里, 我们提出了一个方法, 在几个不同的发展阶段的细胞分离的途径, 由 GM-脑脊液: 普通髓样祖 (CMP), 粒细胞巨噬祖 (GMP), 单核细胞源性巨噬细胞(MoMac) 和单核细胞衍生 DC (MoDC)。moMac 种群可以根据 MHC II 类表达的水平进一步隔离, 揭示了 moDC 前体种群 (moDP) 10。我们利用一种高速荧光活化细胞分选 (Ly6C) 策略来隔离这5种群, 并以表达 CD115 和 CD11c 为基础。然后, 我们展示了这些细胞在功能检测中的检查, 揭示了它们对玉兰刺激的反应。
所有动物工作都是由奥本大学机构动物保育和使用委员会根据《国家卫生研究院实验室动物护理和使用指南》中概述的建议批准的。
1. 骨髓收集的准备工作
2. 小鼠骨髓细胞的收集
3. 选择日排序
4. 染色策略
5. 根据控制样本设置闸门
注意: 为了防止由于高速流流的压力而导致细胞中断, 请使用100–130µm 喷嘴进行细胞分类。
6. 孤立人口的收集
为了尽可能多地进行分析, 可以根据前向和侧向散射来常规地选择可行的细胞, 不包括非常小和非常粒状的事件 (在图 1A中的所有点地块上都应用一个典型的门)。为了确定这种门控策略是否可靠地排除了死细胞, 我们染色了7氨基放线菌 D (7) (图 1B)。7AAD. 由于细胞膜通透性, 在死亡和死亡细胞中染色 DNA, 并被存活细胞排除。分析了转基因-脑脊液培养骨髓细胞的生存能力, 立即进行了收获后 (ph 值) 和1、3和 5 ph 值细胞分析, 当一个典型的 FSC/SSC 门被应用到从骨骼中分离出来的新鲜细胞时, ph 值有大约 10% 7 反正细胞。骨髓 (图 1, 收获后)。同样比例的死亡细胞也出现在1天 (~ 12%) 和3天 (~ 11%) 的文化 (图 1, 1 天 ph 值和3天 ph 值)。到了5天, 门内死细胞的数量减少到了 5% (图 1, 5 天的 PH 值)。因此, 使用这样的生存能力门通常适合在5天和之后排序。因此, 如果用户的可用参数有限, FSC/SSC 门通常是适当的。然而, 对于更敏感的化验 (特别是如果他们依赖于精确的细胞数), 纳入一个生存能力染色 (建议)。
许多树突状细胞的传播协议建议在培养11、17之前从骨髓中耗尽血统阳性细胞, 特别是淋巴细胞。这一过程被认为是提高细胞纯度的恢复后, 由 GM-脑脊液介导的分化。通常, 用磁性珠子或细胞分选11,17,18来表示 T 细胞 (CD3)、B 细胞 (CD45R 或 CD19) 和 NK 细胞 (NK1.1) 的标记物可能耗尽。然而, 根据培养系统, 淋巴细胞很少恢复或检测到这些化验。因此, 我们试图评估在 Ly6C-CD115-脑脊液驱动细胞中维持的淋巴细胞的寿命 (图 2A)。GM-脑脊液培养的骨髓细胞 (没有血统耗尽) 被染色的抗体 CD3, CD45R 和 NK1.1 (在同一荧光) 和每日测量流式细胞术 (图 2B)。在 Ly6C-CD115 人群中, CD3/CD45R 阳性细胞持续0–3天 (图 2B)。在4天, 只有少数 CD3/CD45R 阳性细胞保持, 并在5天和 6, 没有 CD3/CD45R 表达细胞存在。因此, 在 GM-CSF 的4天的文化中, 血统阳性细胞基本上是缺席的, 并没有发现在所有的天5和6的文化。
随着细胞的发育和分化 (表 1 , 基因型脑脊液驱动细胞培养的组成在这个系统中每天变化;图 3)。在早期的时间点, 最丰富的细胞是祖和前体, 并在晚些时候大多数细胞被区分10。为了确定不同文化天的排序如何影响后续的发展路径或动力学, 排序执行3、5和7天的 PH 值 (图 3A)。MoMac 人口 (Ly6C-CD115+) 的发展然后被追踪了在2–3进一步天在文化 (图 3B-3D)。
当3天的 PH 值排序时, 只有40% 的 Ly6C-CD115+ 细胞在 24 h 后排序 (PS) 中减少 CD115 表达 (图 3B)。由 48 h PS, 下调节 CD115 的分数为 66%, 72 h, 70% 的细胞有这种表型。这个表型构成被维护了 (~ 70-72% Ly6C-CD115-) 甚而在进一步天以后文化 (数据没有显示)。当5天的 PH 值, 75% 的细胞被 Ly6C-CD115-, 在24小时内迅速下调 CD115, 80% 是 CD115-仅次于48小时。这个发行在 72 h 以后被维护了 (图 3C)。最后, 当7天的 PH 值排序时, CD115 的下调节也相当迅速。在24小时内, ~ 75% 的细胞有下调 CD115 表达, 这一趋势保持在 48 h (图 3D)。有趣的是, 在7天排序时, CD115 表达的整体水平在 CD115+ 人群中的细胞中较低。
因此, 这些发现表明, 在早期排序时, 发育的动力学速度有些慢, 如3天排序的细胞相比, 在5或7天排序后观察到的更快的发展和差异。根据这些结果, 寻求更大数量 moDC 的用户在5或7天可能会排序。
DC 的成熟响应建立在6、7、12、14之间。当处理与各种病原体相关的分子模式 (PAMPs), 未成熟的 DC 上调的表达 MHC, 刺激分子和促炎性细胞因子, 提高其 T 细胞活化能力6。然而, 当发育中的细胞获得对玉兰刺激反应的能力以及它们可能呈现的 DC 成熟的特征时, 就不那么清楚了。为了确定哪些排序的人口将响应成熟刺激, 每一个人口在排序后不久, PAMPs 的鸡尾酒, 包括聚 I: C, 脂多糖 (LPS), 和 CpG DNA, 以触发类似收费受体 (TLR) 3 (TLR3),TLR4 和 TLR9 分别。用流式细胞仪 (图 4A-4B) 对细胞进行24小时的治疗 (或未治疗), CD86 和 MHCII 的表达。此外, 上清液细胞因子阵列 ELISA 法测定了 IL-12p40/70 和 IL-6 的产量 (图 4C-4D)。
中医和 GMPs 在静态状态下表达了很低的 MHC II 类和 CD86 的水平, 这些表达模式在接触 PAMPs 的鸡尾酒时没有显著改变 (图 4A和4B)。同样, 由单核细胞的 MHC II 类的表达也很低, 在玉兰暴露后变化不大 (图 4A)。然而, CD86 在单核细胞中的表达在24小时后, 在24小时的刺激下进一步增加。观察 MoMacs 和 MoDCs 中 MHC II. 类和 CD86 的较高基底表达, 两个种群在玉兰刺激时均表现出强烈的诱导作用。从 MHC II. 类表达后的刺激, 没有统计学差异的中医, GMPs 和单核细胞, 而 MoMacs 和 MoDCs 形成了一个不同的组。然而, 在 CD86 表达方面, 中医和 GMPs 细胞在统计学上不同于 MoMacs 和 MoDCs。然而, 单核细胞与 MoMacs 或 MoDCs 不同。
我们接下来想评估五人口中每一个人的相对能力, 以产生细胞因子的反应 TLR 刺激。因此, 我们在 TLR 激动剂鸡尾酒的存在或缺乏的情况下, 对已排序的人群进行了细胞因子检测。细胞的培养与刺激24小时, 然后上清液收集。我们观察到很少 IL-12p40/70 或 IL-6 生产的中医在 TLR 刺激 (图 4C-4D)。第二个人口 GMPs 无法生产 IL-12p40/70 (图 4C), 但这些细胞在 PAMPs 刺激下产生了少量的 IL-6 (图 4D)。在后三个人群中观察到细胞因子的最高水平。单核细胞和 MoMacs 有非常相似的模式和大小的细胞因子的生产。两者都大大增加了 IL-12p40/70 和适度增加 IL-6 增产刺激 (图 4C-4D)。有趣的是, 在存在 PAMPs MoDCs 没有增加 IL-12p40/70 分泌;然而, 这一人口大大增加了 IL-6 产量 (图 4C-4D)。这些发现表明, 被排序的人群在隔离后维持其免疫功能。

图 1: 前方与侧散射门之间可行的细胞.在转基因脑脊液中培养小鼠骨髓, 利用 7-7-氨基-放线菌 D) 染色后采收后 (PH 值) 和1、3和5天的采收后测定其生存能力。(A) 通过应用门 (可行的) 来选择可行的细胞, 省略了基于 FSC 和 SSC 的小型和高粒度事件。(B) 在可行的 (FSC/SSC) 门内发生的事件产生的 7-反色直方图。阳性的 7-反的事件表明细胞正在凋亡。箭头表示可行的细胞门控。请单击此处查看此图的较大版本.

图 2: Ly6C-CD115 人群中的淋巴细胞.采用流式细胞仪对小鼠骨髓进行了 CD3 和淋巴细胞标记 (CD145R、NK1.1) 的培养。(A) 细胞被 Ly6C-PE 和 CD115-APC 染色, 以识别 Ly6C-CD115 细胞。基于单色控制的象限门应用。假彩色0天 (B) CD3、CD45R 和 NK1.1 Ly6C-CD115 细胞的表达, 在收获日 (0 天) 上分析, 直到6天。用流式细胞仪分析软件将细胞计数规范化为模式。箭头指示 Ly6C-CD115 门。请单击此处查看此图的较大版本.

图 3: 不同日分选后 Ly6C-CD115+ 细胞的发育动力学.(A) 小鼠骨髓在转基因脑脊液中收获和培养。整除数 1 x 107细胞被收获 (B) 3, (C) 5, 或 (D) 收获后7天 (PH 值)。在指示的天 PH 值, Ly6C-CD115+ 细胞排序从混合的培养 (预先排序) 并且立刻分析后排序 (PS)。用流式细胞仪对细胞进行重组, 对 Ly6C/CD115 表达的变化进行了分析。框和箭头表示排序门。请单击此处查看此图的较大版本.

图 4: TLR 刺激后的成熟和细胞因子表达.在 GM-CSF 的3天, 细胞被分类为5个种群。然后他们用 PAMPs 的鸡尾酒治疗 (LPS, 聚 I: C, 和 CpG DNA) 为 24 h. (a) MHC II. 类和 (B) CD86 的平均荧光强度 (), 用流式细胞仪对 PAMPs 进行了后排序 (PS) 和 24 h 的分析。误差条表示3-5 复制实验的标准偏差。(C) IL-12p40/70 和 (D) 从3个共用样品中 IL-6, 用细胞因子阵列斑点印迹酶联免疫吸附法测定了24小时后的上清液和无 PAMPs。RLU相对光单位;++ 表示指定人口的细胞表面标记的存在。请单击此处查看此图的较大版本.
| 3天 | 5天 | 7天 | |||||
| 表 | 单元格类型 | 分钟 | 麦克斯 | 分钟 | 麦克斯 | 分钟 | 麦克斯 |
| Ly6C-CD115-CD11c- | Cmp | 3 x 106 | 4 x 106 | 5 x 105 | 1 x 106 | N/a | N/a |
| Ly6C+CD115- | Gmp | 2 x 106 | 3 x 106 | 2 x 106 | 3 x 106 | N/a | N/a |
| Ly6C+CD115+ | 单 | 2 x 106 | 3 x 106 | 2 x 106 | 3 x 106 | 5 x 105 | 1 x 106 |
| Ly6C-CD115+ | MoMac | 5 x 105 | 1 x 106 | 3 x 106 | 4 x 106 | 3 x 106 | 4 x 106 |
| Ly6C-CD115-CD11c+ | MoDC | N/a | N/a | 5 x 105 | 1 x 106 | 3 x 106 | 4 x 106 |
表 1: 每 1 x 107个单元格中恢复的最小和最大单元数.CMP (普通髓样祖);GMP (粒细胞/巨噬细胞祖) 单核细胞;MoMac (单核细胞衍生巨噬细胞);MoDC (单核细胞衍生树突状细胞);N/a (不可用);Min (最小细胞产率为 1 x 107细胞);最大 (最大细胞产量从 1 x 107细胞)。
作者没有冲突要公开。
在这里, 我们提供了一种方法, 以识别和隔离大量的 GM-脑脊液驱动髓细胞使用高速细胞排序。根据 Ly6C 和 CD115 的表达, 可以确定五种不同的种群 (常见髓样祖细胞、粒/巨噬细胞祖、单核细胞、单核细胞衍生巨噬细胞和单核细胞衍生的 DCs)。
我们感谢在奥本大学兽医医学流式细胞仪设施的艾莉森教堂鸟的技术援助, 从 NIH 到 EHS R15 R15 AI107773, 以及在奥本大学的细胞和分子生物学项目的资助为夏季研究基金提供资金。
| RPMI 1640 | 康宁 | 15-040-CV | |
| 胎牛血清 (FCS) | HyClone | SV30014.04 | 补充完全培养基和 FWB |
| GlutaMAX | Gibco | 35050 | 补充完全培养基 |
| 2-巯基乙醇 (2-ME) | MP 生物医学 | 190242 | 补充完全培养基 |
| 75 mM 真空过滤器 | Thermo Scientific | 156-4045 | 对完全培养基进行消毒 |
| ACK 裂解缓冲液 | Lonza | 10-548E | 裂解红细胞 |
| HBSS 缓冲液 | 康宁 | 21-020-CM | 在红细胞裂解后挽救白细胞 |
| 盐缓冲盐水 (PBS),Dulbecco 的 | Lonza | 17-512F | 必须不含内毒素;在 4 &°g 下冷却;C |
| 35 和微型;m 细胞过滤器 | Falcon | 352235 | 在通过细胞仪之前将其分解为团块。 |
| GM-CSF | 生物来源 | PMC2011 | 可用浓度为 10 ng/mL |
| 组织培养处理板 | VWR | 10062-896 | 用于收获后骨髓细胞 |
| 抗 Ly6C,克隆 HK1.4 | Biolegend | 128018 | |
| 抗 CD115,克隆 AFS98 | Tonbo Bioscience | 20-1152-U100 | |
| 抗 CD11c,克隆 HL3 | BD Biosciences | 557400 | 区分 CMP 和 MoDCS |
| MoFlo XPD 流式细胞仪 | Beckman Coulter | ML99030 | |
| BD Accuri C6 | BD Biosciences 660517 | ||
| 100% 乙醇 | Pharmco-Aaper | 111000200CSPP | |
| 60 mm 培养皿 | Corning, Inc | 353002 | |
| 50 mL 锥形管 | VWR | 21008-242 | |
| C57BL/6 小鼠 | 杰克逊实验室 | 000664 | 女性;10-20 周龄 |
| 生物安全罩 | Thermo Scientific | 8354-30-0011 | |
| 10 mL 注射器 | BD Biosciences | 301604 | |
| 23 G 针 | BD Biosciences | 305145 | |
| 离心机 5810 R | eppendorf | 22625501 | |
| FlowJo 软件 v10 | BD Biosciences | 版本 10 | flowjo.com |