本文介绍一种建立人鼻腔上皮细胞三维球状体培养的方法。通过刺激球状体,诱导其产生囊性纤维化跨膜电导调节因子(CFTR)依赖性的离子和液体分泌,并以球状体管腔大小的变化作为CFTR功能的指标进行定量分析。
方法文章
本文介绍一种建立人鼻腔上皮细胞三维球状体培养的方法。通过刺激球状体,诱导其产生囊性纤维化跨膜电导调节因子(CFTR)依赖性的离子和液体分泌,并以球状体管腔大小的变化作为CFTR功能的指标进行定量分析。
尽管囊性纤维化跨膜电导调节因子(CFTR)调节药物的引入已彻底改变了囊性纤维化(CF)的治疗模式,但目前采用的基因型导向治疗模型仍存在若干局限性。首先,罕见或研究不足的突变类型通常被排除在确证性临床试验之外。此外,随着更多调节药物进入市场,为个体患者优化药物选择将变得愈发困难。上述两个问题可通过使用源自患者的、个性化的CFTR功能与调节的临床前模型系统加以解决。人鼻上皮细胞(HNEs)是构建此类模型时易于获取的呼吸道组织来源。本文中,我们描述了一种利用原代HNEs建立的三维类球体模型,用于评估CFTR功能及其调节。HNEs以微创方式从受试者中分离获得,在条件重编程条件下扩增后接种至类球体培养体系。接种后两周内,类球体培养可形成HNE类球体,可通过添加生成3',5'-环磷酸腺苷(cAMP)的激动剂来激活CFTR功能。随后通过量化类球体的肿胀程度,作为CFTR活性的替代指标。HNE类球体充分利用了鼻源细胞微创获取且具有呼吸道来源特性的优势,构建出一种易于获取、个体化且与反映疾病发病率和死亡率的上皮组织密切相关的研究模型。与气液界面培养的HNE模型相比,类球体成熟速度相对较快,从而降低了整体污染率。目前该模型的局限性在于通量较低,但组织获取的相对简便性在一定程度上弥补了这一不足。HNE类球体可用于在个体水平上可靠地定量和表征CFTR活性。一项正在进行的研究正致力于将该定量结果与 体内 药物反应将决定HNE类球体是否能真正成为预测患者对CFTR调节治疗反应的临床前模型。
囊性纤维化(Cystic Fibrosis, CF)是一种致命的常染色体隐性遗传病,全球有超过7万人受其影响1。这种缩短寿命的遗传性疾病由囊性纤维化跨膜传导调节蛋白(Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator, CFTR)基因突变引起2。CFTR属于腺苷三磷酸结合盒(adenosine triphosphate-binding cassette)蛋白家族,作为离子通道发挥作用,介导氯离子和碳酸氢根离子跨多种极化上皮细胞的顶膜转运,这些上皮组织包括胃肠道、汗腺和呼吸道等3,4。因此,CFTR功能异常会导致多系统上皮功能障碍,其中大多数死亡源于呼吸系统疾病1。在CF患者的肺部,CFTR介导的气道表面液体(airway surface liquid, ASL)调节功能及黏液分泌失控,导致黏液增厚、气道阻塞、慢性感染以及进行性的气道重塑和肺功能下降1,5。
尽管已确定CFTR功能障碍是该疾病的病因,但囊性纤维化(CF)的传统治疗主要集中在缓解症状(例如,胰酶替代疗法、气道清除疗法)1。近年来,随着一类新型治疗药物——即"CFTR调节剂"——的出现,这一治疗模式发生了革命性变化,这类药物可直接靶向功能异常的CFTR蛋白。该策略使临床治疗从症状管理转向疾病修饰治疗,但仍存在若干局限性6,7,8,9,10。调节剂的作用具有特异性,仅针对特定CFTR突变所伴随的蛋白缺陷,且仅适用于部分遗传人群11。这一局限性源于蛋白缺陷的异质性,也受限于在罕见突变群体中开展临床试验的可行性较低。此外,在基因型已被充分研究的患者中(例如,F508del/F508del CFTR,这是最常见的CFTR突变),疾病负担和对调节剂的治疗反应仍存在显著个体差异6,7,8,9,11。
为克服上述两个问题,研究人员已提出在临床前测试中采用个体化模型12。该概念利用患者特异性组织构建个性化的体外(ex vivo)模型系统,用于化合物测试,以个性化方式预测个体对治疗的体内(in vivo)反应。一旦经过验证,此类模型可被临床医生用于指导精准治疗,而无需考虑患者潜在的CFTR基因型。
在肺移植时从移植组织中获取的人支气管上皮(HBE)细胞,首次证明了此类囊性纤维化(CF)模型的可行性13,14。在气液界面(ALI)培养的HBE细胞可通过电生理检测直接定量功能性的囊性纤维化跨膜电导调节因子(CFTR),或通过气道表面液体(ASL)稳态的指标间接评估13,15。该模型对理解CFTR生物学功能至关重要,并在CFTR调节剂的研发过程中发挥了关键推动作用16。然而,由于获取组织的方式具有侵入性(肺移植或支气管刷检),且罕见突变或轻症患者缺乏可用样本,HBE模型难以作为个体化模型广泛应用。相比之下,通过直肠或十二指肠活检获取的肠道组织可用于肠电流检测(ICM)或基于肿胀的类器官检测,以研究个体化的CFTR功能17,18,19。尤其是类器官检测,对CFTR活性具有极高的敏感性20,21,22。但这两种模型均受限于组织来源(肠道组织,而大多数疾病病理发生在呼吸系统)以及获取方式的半侵入性。此外,已有若干研究者采用人鼻上皮(HNE)细胞来模拟CFTR功能的恢复23,24,25。HNE细胞可通过刷取或刮取方式安全地从各年龄段受试者中获取,在ALI培养条件下可重现HBE细胞的多种特性25,26,27,28。传统上,HNE单层培养模型受限于鳞状化生及成熟周期较长的问题29。此外,报道的HNE细胞短路电流测量值小于HBE细胞,提示其检测治疗效果的动态范围较小25。
鉴于需要一种个性化的、非侵入性的、用于研究CFTR功能的呼吸道组织培养模型,我们尝试将基于肿胀的类器官检测的高灵敏度与HNEs的非侵入性和呼吸道特性相结合。在此,我们描述了一种生成HNEs三维"球状体"培养物的方法,用于在基于肿胀的检测中进行个体化的CFTR研究30。HNE球状体能够稳定地极化,其上皮顶端朝向球体中心,即管腔。该模型重现了下呼吸道上皮的多种特征,并且比气液界面(ALI)培养成熟更快。作为一种功能性检测方法,HNE球状体可稳定地量化一系列CFTR功能,以及在已有深入研究的突变组(e.g.,F508del CFTR)中的功能调节。该基于肿胀的检测利用CFTR的离子/盐转运特性,通过水跟随顶端盐分外排而间接测量液体向球状体内的流入。在这种方式下,具有完全功能性CFTR的刺激后球状体会显著膨胀,而CFTR功能异常的球状体则膨胀较少或发生收缩。这一变化通过图像分析在刺激前和刺激后1小时的球状体进行量化,测量管腔面积并计算其变化百分比。随后,该指标可用于不同实验组之间的比较,以实现针对患者特异性的药物生物活性筛选。
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HNE 样本来自通过辛辛那提儿童医院医学中心囊性纤维化研究中心招募的受试者。本研究所述所有方法均已获得辛辛那提儿童医院医学中心机构审查委员会(IRB)的批准。所有受试者在检测前均签署了书面知情同意书。
1. 准备扩增培养基和抗生素培养基
2. 准备分化培养基
3. 包被培养皿并接种饲养层成纤维细胞
注意:所有步骤均须在生物安全柜内的洁净条件下进行。
4. 获取并处理 HNE 样本
5. 在培养皿中处理并扩增 HNE 细胞
注意:所有步骤均需在生物安全柜内的洁净条件下进行。
6. 传代 HNE 细胞
7. HNE 类球体培养的细胞接种
注意:除离心步骤外,本步骤中的所有操作均须在洁净的生物安全柜中进行。
8. 分化和成熟 HNE 类球体
9. 分析用HNE类球体的预处理、刺激及成像
10. 分析 HNE 类球体图像
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HNE细胞应在接种后72小时内贴附于培养皿并形成小的细胞岛;培养一周后良好和不良细胞岛形成的示例分别见图1A和1B。这些细胞岛应在15至30天内逐渐扩展并覆盖整个培养皿。较小或质量不佳的样本可能需要更长时间,且通常无法形成可用的类球体。若培养基呈现深黄色或浑浊、细胞无法贴附于培养皿,和/或直接观察到真菌/细菌,提示存在病原微生物污染。任何受污染的培养物应立即丢弃,以防止交叉污染。
在培养基质膜基质中的前3-4天内,基质中应开始形成微小的囊状结构。这些结构将在大约10天内发育成熟,成为具有薄壁和腔面的完整球状体。若以所述密度接种,成功的培养物每滴基质中应含有50-100个球状体。腔内可相对清晰(图1C),或充满细胞碎片和黏液(图1D);前者多见...
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本方案描述了患者来源的鼻腔细胞球状培养物的建立方法,该培养物可用于构建个体化、特异性的CFTR功能模型。该过程包含若干关键步骤,需密切注意以避免操作困难。首先是获取高质量的患者鼻腔样本。理想的样本应具备 >50,000 个细胞,黏液或碎片较少,并且在 4 小时内可进行处理(尽管在冰上过夜运输也容易成功)。研究团队需经过使用刮匙或刷子采集样本的操作培训,建议初期由一至两名操作者集中完成样本采集,以提高其熟练程度。其次,所有组织培养步骤中必须严格遵守无菌操作技术。根据我们的经验,人鼻上皮(HNE)培养失败的主要原因是细菌或真菌污染,这可能会影响原始样本以及其他在培养箱中正在生长的培养物。对于患有慢性感染的受试者,其样本培养的污染风险更高例如,CF),因此成功在很大程度上取决于保持培养物清洁和分离的能力。我们的做法是在最初的5-7天内使用单独的培养箱专门培养易受感染的细胞,以保护较老且已建立成功的培养物免受意外污染。第三,在细胞扩增阶段需密切观察细胞,避免过度汇合。若细胞在培养板上达到完全汇合,培养物可能进入衰老状态,或细胞开始死亡并脱落。最后,在以类球体形式接种细胞时,必须将细胞充分分散于基质中,并接种分布均匀的样品...
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作者无任何利益冲突需要披露。
本工作由囊性纤维化基金会治疗部资助,资助编号为 CLANCY14XX0,以及通过囊性纤维化基金会资助,资助编号为 CLANCY15R0。作者谨此感谢 Kristina Ray 在患者招募和监管监督方面提供的协助。作者还感谢由囊性纤维化基金会支持的 HNE 工作组,该工作组协助建立了 HNE 培养能力:Preston Bratcher、Calvin Cotton、Martina Gentzsch、Elizabeth Joseloff、Michael Myerburg、Dave Nichols、Scott Randell、Steve Rowe、G. Marty Solomon 和 Katherine Tuggle。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 1.5 mL Eppendorf 管 | USA Scientific | 4036-3204 | |
| 150 mL 滤瓶 | Midsci | TP99150 | 用于过滤培养基 |
| 15 mL 锥形管 | Midsci | TP91015 | |
| 1 L 滤瓶 | Midsci | TP99950 | 用于过滤培养基 |
| 35 mm 玻底培养皿 | MatTek Corporation | P35G-0-20-C | 可选 |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤(IBMX) | Fisher Scientific | AC228420010 | 用 1 mL DMSO 溶解 22.0 mg 配制 100 mM 储存液 |
| 50 mL 锥形管 | Midsci | TP91050 | |
| Accutase | Innovative Cell Technologies, Inc. | AT-104 | 细胞解离溶液 |
| 腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | A2786-25G | 参见表 1 |
| 两性霉素 B | Sigma-Aldrich | A9528-100MG | 参见表 1 |
| 牛脑提取物(9 mg/mL) | Lonza | CC-4098 | 参见表 2 |
| 头孢他啶水合物 | Sigma-Aldrich | C3809-1G | 参见表 1 |
| 细胞刮刀 20 cm | Midsci | TP99010 | |
| CFTR Inh172 | Tocris Bioscience | 3430 | 用 1 mL DMSO 溶解 4.0 mg 配制 10 mM 储存液 |
| 霍乱毒素 B(来自霍乱弧菌) | Sigma-Aldrich | C8052-.5MG | 参见表 1 |
| CYB-1 | Medical Packaging Corporation | CYB-1 | 细胞刷 |
| 二甲基亚砜(DMSO) | Sigma-Aldrich | D5879-500ML | |
| Dulbecco 改良 Eagle 培养基(DMEM)/F12 Hepes | Life Technologies | 11330-057 | 基础培养基;参见表 1 和表 2 |
| 表皮生长因子(重组人蛋白,无动物源成分) | Thermo Fisher Scientific | PHG6045 | 参见表 1 |
| 肾上腺素 | Sigma-Aldrich | E4250-1G | 参见表 2 |
| 乙醇 | Fisher Scientific | 2701 | |
| 乙醇胺 | Sigma-Aldrich | E0135-500ML | 16.6 mM 溶液;参见表 2 |
| 乙二胺四乙酸(EDTA) | TCI America | E0084 | |
| 胎牛血清(高性能 FBS) | Invitrogen | 10082147 | 参见表 1 |
| 福斯科林(Forskolin) | Sigma-Aldrich | F6886-50 | 用 1 mL DMSO 溶解 4.1 mg 配制 10 mM 储存液 |
| 生长因子减少型 Matrigel | Corning, Inc. | 356231 | Corning Matrigel 生长因子减少型(GFR)基底膜基质,无酚红,无LDEV,10 mL |
| 血细胞计数板 | Hausser Scientific | 1483 | |
| 人胶原蛋白溶液 I 型(VitroCol;3 mg/mL) | Advanced BioMatrix | 5007-A | 胶原溶液 |
| HyClone(又称 FetalClone II) | GE Healthcare | SH30066.03HI | 参见表 2 |
| 氢化可的松 | StemCell Technologies | 07904 | 参见表 1 和表 2 |
| 胰岛素,人重组,锌溶液 | Life Technologies | 12585014 | 4 mg/mL 溶液;参见表 2 |
| IVF 4 孔板,未处理 | NUNC(通过 Fisher Scientific) | 12566350 | 用于类球体培养的 4 孔板;孔大小与 24 孔板相似 |
| MEF-CF1-IRR | Globalstem | GSC-6001G | 经辐照的小鼠胚胎成纤维细胞 |
| Metamorph 7.7 | Molecular Devices | 分析软件;https://www.moleculardevices.com/systems/metamorph-research-imaging/metamorph-microscopy-automation-and-image-analysis-software 获取报价 | |
| Olympus IX51 倒置显微镜 | Olympus Corporation | 已停产 | 成像显微镜。替代型号:Olympus IX53,https://www.olympus-lifescience.com/pt/microscopes/inverted/ix53/ 获取报价 |
| 青霉素-链霉素(Pen Strep) | Life Technologies | 15140122 | 参见表 2 |
| 磷酸乙醇胺 | Sigma-Aldrich | P0503-5G | 参见表 2 |
| 视黄酸 | Sigma-Aldrich | R2625-50MG | 参见表 2 |
| Rhinoprobe | Arlington Scientific, Inc. | 96-0905 | 鼻腔刮匙 |
| Slidebook 5.5 | 3i, Intelligent Imaging Innovations | 已停产 | 成像软件。替代型号:Slidebook 6,https://www.intelligent-imaging.com/slidebook 获取报价 |
| 无菌磷酸盐缓冲液(PBS) | Thermo Fisher Scientific | 20012050 | |
| 无菌水 | Sigma-Aldrich | W3500-6X500ML | |
| 组织培养皿 100 | Techno Plastic Products | 93100 | 用于细胞扩增的组织培养皿 |
| 妥布霉素 | Sigma-Aldrich | T4014-100MG | 参见表 1 |
| 转铁蛋白(人转铁蛋白 0.5 mL) | Lonza | CC-4205 | 参见表 2 |
| 三碘甲腺原氨酸 | Sigma-Aldrich | T6397-1G | 3,3′,5-三碘-L-甲状腺原氨酸钠盐 [T3];参见表 2 |
| 猪胰蛋白酶 | Sigma-Aldrich | T4799-10G | |
| Ultroser-G | Crescent Chemical(通过 Fisher Scientific) | NC0393024 | 20 mL 冻干粉末;参见表 2 |
| 万古霉素盐酸盐(来自东方链霉菌) | Sigma-Aldrich | V2002-5G | 参见表 1 |
| VX770 | Selleck Chemicals | S1144 | 用 1 mL DMSO 溶解 0.4 mg 配制 1 mM 储存液 |
| VX809 | Selleck Chemicals | S1565 | 购买或用 1 mL DMSO 溶解 4.5 mg 配制 10 mM 储存液 |
| Y-27632 二盐酸盐 ROCK 抑制剂 | Enzo LifeSciences | ALX-270-333-M025 | 参见表 1 |
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