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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
在这里, 我们提出了一种基于细胞的流式细胞仪方法来检测中和抗体或其他因素, 干扰细胞吸收酶替代疗法在人类基质, 如脑脊髓液 (CSF) 或人血清。
对患者的酶替代疗法 (ERTs) 和其他生物疗法的管理可能引起抗药物免疫应答。这些抗药物抗体 (ADA) 的特性, 特别是那些可能中和药物的生物活性的, 称为中和抗体 (哥们), 对于了解这些抗体对药物的影响至关重要。药理学资料。本协议描述了一种基于细胞的流式细胞仪方法, 用于检测与人基质中有代表性的溶酶酶的细胞吸收的因子。该协议包括三程序: 筛选, 验证步骤, 和效价测定, 以检测, 识别, 并建立相对水平的中和抗体滴度在主题样品。
在这种方法中, 样品首先混合与荧光共轭的受体产物, 然后孵化与细胞 [例如, 人 T 淋巴细胞 (Jurkat 细胞)], 表达细胞表面阳离子无关甘露糖 6-磷酸盐受体 (CI-M6PR), 并最后, 用流式细胞仪进行分析。一个没有哥们的样本将导致通过CI-M6PR 吸收荧光共轭的产品, 而哥们的存在将与药物结合, 并干扰 CI-M6PR 的束缚和吸收。用流式细胞仪测量 Jurkat 细胞内化的荧光共轭应答剂的数量, 并将其与具有代表性的药物-天真基质存在的反应相比, 评估为百分比 (%) 信号抑制。在验证性的步骤中, 样品是预先孵化的与药物治疗结合的磁性珠子, 以耗尽药物特异的因素, 绑定到药品 (如哥们) 之前, 孵化与细胞。样品的筛选和确认阳性的药物特异的哥们在化验中, 然后连续稀释, 以产生抗体滴度。半定量抗体滴度可能与药物安全性和疗效的测量相关。
免疫原性评估是任何生物治疗产品, 包括 ERTs 的安全和效能监测计划的重要组成部分。患者可能会产生免疫反应, 直接影响药物的安全性、功效和药动学/药效学的概况。这些 ADA 的一个子集, 称为哥们, 可以通过两种方式抑制疗效: 通过抑制对靶向细胞的吸收, 或抑制反应酶的催化活性。这里提出的方法是用来测量干扰哥们细胞吸收的。为了充分监测治疗性反应的安全性和有效性, 持续监测哥们是至关重要的, 以阐明任何潜在的相关性与临床结果或药效学效果1。
评估哥们对蛋白质治疗的平台包括细胞基础, 酶活性和配体结合测定1。根据各种标准选择最佳检测平台: 治疗产物的作用机理、检测平台的灵敏度、选择性、精密度, 以及其在体内模拟哥们抑制作用的能力。.配体结合化验在某些情况下可能是适当的 (例如, 当一个相关的细胞系不能被辨认, 或者如果适当的敏感性不能达到在细胞基础的化验)。然而, 在 2016 FDA 关于工业文件和其他行业接受的白皮书草案中, 建议以细胞为基础的检测方法, 因为它们可以更好地反映药物在体内1、2的生物机制。,3。
开发流式细胞术细胞的关键部件包括一个合适的细胞系, 反应药物刺激, 一个替代品阳性对照, 中和的应答, 荧光共轭反应, 和测试物种生物矩阵4,5,6。细胞系的选择依赖于反应机制的作用和多细胞系应评估在检测发展3。在这里描述的方法, 人 Jurkat T 细胞被选择为他们的内源性 CI-M6PR 表达在细胞表面和缺乏抗体片段受体 (FcRs), 不加区别地束缚多数抗体的 Fc 区域7,8.在化验的发展过程中, 重要的是建立一个阴性对照的验证研究和病人样本测试, 如血清汇集从个人没有被治疗的测试文章1。细胞系还应容忍不同物种的相关基质, 以便在药物开发1的有意、临床和后营销阶段保持连续性。另一个成分是检测的阳性控制的选择。根据其结合治疗和中和吸收通过 CI-M6PR9,1的能力, 选择阳性对照的细胞吸收试验。通常很难获得有用的或可持续的数量的中和血清从人类的对象, 以用作化验控制, 特别是在罕见的疾病患者群体2。替代品包括来自超免疫动物的血清, 或亲和纯化的多克隆或单克隆抗体, 被注射到相关基质1中。在使用一种特定于物种的基质时, 可能存在于基质中的抗体以外的抑制因子可能会抑制其吸收。该检测的另一个关键成分是荧光共轭酶。根据检测对亮度、pH 稳定性以及流式细胞仪上其他通道的潜在光谱重叠的需要, 对荧光的选择进行评估。
这里所描述的化验是一个例子, 用来测量一个治疗蛋白, 例如,通过CI-M6PR 进入细胞的药物疗法。一些 ERTs, 目的是治疗溶酶体存储紊乱 (LSDs), 利用这一途径, 以细胞吸收和溶酶体靶向, 包括 elosulfase Morquio 综合征, cerliponase 阿尔法 CLN2 条病, agalsidase 阿尔法病, 并alglucosidase 阿尔法为庞贝氏病10,11。该方法的目的是通过CI-M6PR 来测量干扰药物结合和内化的哥们的相对水平。这是在分层筛选、验证和效度步骤3中执行的。样品先筛选出的阳性, 然后确认积极的步骤。最后, 筛选和确认阳性的样品可以连续稀释以产生抗体滴度1。这种基于细胞的流式细胞仪药物摄取检测提供了一种敏感和机械化相关的体外测量药物特异性哥们的方法, 可能会影响药物的药理学特征。我们以前验证的方法和测试临床样品使用这个平台的药物 elosulfase 阿尔法8。在这里, 我们描述的详细的分步协议, 可能适用于其他治疗蛋白或 ERTs。
人的矩阵是从商业来源购买的, 经其机构审查委员会批准, 但应视为潜在的传染性。确保实验室环境使用维护安全文化12。
1. 在开始化验之前
2. 1 天: 细胞电镀和样品制备
3. 1 天: 化验程序

图 1: 实验板布局的示例.样品和一个荧光标记的应急检测在2–8°c 过夜。对 HQC、低质量控制 (LQC) 和负质量控制 (NQC) 等控制进行了筛选, 并在板的相对角上进行了确认, 以评估板材的均匀性。请单击此处查看此图的较大版本.
4. 2 天: 将准备好的样品添加到单元格中
5. 2 天: 细胞活力染色
6. 2 天: 用1% 多聚甲醛固定细胞
7. 流式细胞仪

图 2: 流式细胞仪加载器设置的示例.加载器设置应针对每个已开发的检测进行优化。请单击此处查看此图的较大版本.

图 3: 流式细胞术门策略.Jurkat 细胞与总事件分离, 通过绘制正散射 (FSC)与侧向散射 (SSC) 通道并在目标种群周围绘制一个门来收集。汗衫 (单细胞) 与双峰或更大的细胞聚集使用 fsc 区域 (fsc A) 和 fsc 高度 (fsc H) 通道分离。活细胞被选择的门对单线细胞阴性的活性染色。在单、活 Jurkat 细胞中测定了中值荧光强度, 并绘制成直方图。用药物吸收阻断的细胞 (如HQC) 和具有控制摄取量的细胞 (分别为红色和蓝色) 的多药电池值显示。请单击此处查看此图的较大版本.
8. 数据分析


在该方法的第一天, 解冻和电镀 Jurkat 细胞的冷冻整除, 并制备了试验样品。图 1显示了一个例子板块图。第二天, 样品与 Jurkat 细胞混合, 在37摄氏度处孵化约3小时和15分钟。这些细胞被洗涤, 固定与粉煤灰, 并分析了流式细胞仪。图 2显示了流式细胞仪设置示例。
采用流式细胞术门策略, 测定活单 Jurkat 细胞24 (图 3) 中荧光共轭药物的含量。这些细胞是通过绘制一个不包括细胞碎片 [通常, 低正散射 (FSC)] 和死细胞 [通常, 高侧散射 (SSC)] 的门与碎片分离的, 只留下活细胞进行分析25。通过绘制一个不包括高 fsc 区域和低 fsc 高度26的门, 将单个细胞与细胞簇分离。细胞被治疗的生存能力染色标记任何死亡或不健康的细胞没有完整的膜, 并创建了一个额外的门, 以排除死亡的细胞22。利用活单细胞的荧光, 对其进行了分析。作为潜在筛查结果的一个例子, 基质中有大量的替代药物抗体阳性控制 (例如, 高质量的控制 (HQC)) 抑制了荧光共轭的吸收, 导致了低的多边化大约 300 (图 3)。相比之下, 在没有阳性控制抗体的情况下, 与基质一起孵化的细胞应该有一个更高的多边基金会 (如图3所示的 37830), 表明了荧光共轭反应的吸收。
以该药物的作用机制为例, 选择了中和阳性对照抗体 (即通过 CI-M6PR 吸收)。还对显影进行了测试, 并对最佳检测灵敏度和动态范围1进行了比较。由于其在酸性 pH 值上的荧光增加, 对5e 进行了测试, 这可能与某些 ERTs 相关, 作为对药物27的溶酶体靶向的补充措施。还研究了一种绿色荧光染料 (例如, alexa 488) 和一种远红色荧光染料 (例如, alexa 氟 647)。图 4a和4b显示了不同显影可能执行的示例。在这个例子中, Alexa 的647的研究是最好的性能, 由于其优越的灵敏度 (例如, 最高的%SI 在最低的 PC 浓度) 和广泛的动态范围 (3 级的数量)。

图 4: 不同荧光的例子结果.(a) 在分析开发过程中, 应使用不同的荧光共轭 ERTs 评价阳性控制 (PC) 稀释曲线。在这里所示的例子中, 两个荧光共轭 ERTs (alexa 488 和 5e) 在6.25 µg/毫升和一个更明亮的荧光共轭反应 (alexa 氟 647) 在1.56 µg/毫升的存在增加浓度的积极控制哥们。(B) 本小组用一幅图表显示了面板中的曲线, 利用多边基金会显示了使用 Alexa 的647共轭应变器的动态范围的显著增加。请单击此处查看此图的较大版本.
所描述的方法是检测、确认和插值3的准定量水平的分层方法。为确定该检测的有效性, 应根据已建立的指导1、3 等参数对检测灵敏度、精密度、选择性、特异性、耐药性、鲁棒性和切口点进行评估..
当%SI 值大于筛切点 (SCP) 时, 样品被认为可能是阳性的。通过对来自代表性人群的药物天真样本进行测试, 并测量信号强度的相对下降 (SI)3, 对 SCP 进行了统计学测定。指导 (例如 FDA) 建议 scp 建立在正常分布数据集的95个百分点上 , 并且在其他地方1详细描述了用于计算 scp 的方法。任何减少检测信号的样品 (测量为%SI 中的增加) 在 scp 或以上被确定是潜在的阳性, 并且结果的样品以高于 scp (在%SI 没有变动或减退) 被认为阴性。
在验证性试验中测试了筛选阳性的样本 (%SI 以上的 SCP), 以确定哥们对反应酶的特异性。验证性的实验是通过预先孵化的样品与预结合的磁性珠子去除药物特异抗体或抑制因素。评估的 RR (验证性的多边化的比例, 以筛选多边基金会), 以确定从样本中删除的哥们的数量。高于计算出的阳性阈值的 RR (即证实性切口点 (CCP)) 表明存在抗药物哥们。在筛查试验中, 应首先通过对有代表性人群中的治疗-天真样本进行验证性试验, 建立中国共产党。中国共产党以统计确定的1% 假阳性率为基础, 是指定一个正确认样本 (图 5)3的阈值。
样品, 筛选和确认阳性被连续稀释和测试的效价测定, 以确定哥们的相对水平或效价在每个样品。当样品在越过指定阈值时测试阳性的最高稀释度 [例如,滴度切点 (TCP)] 是样品滴度 (图 5)1,3。

图 5: 示例测试结果.这些面板显示的例子, 测试阳性或阴性的筛查以上或低于 17.51%si SCP。用药物共轭磁珠在验证性试验中测试阳性样品, 在化验前从样品中消耗药物特异抗体。具有回收率 (rr) 大于验证性切口点 (即rr = 1.315) 的样品被认为是阳性的。证实阳性的样品被稀释, 直到信号越过滴度切点 (TCP), 以建立的效价 (稀释因子) 的样品结果等于滴度切点。请单击此处查看此图的较大版本.
检测重复性和变异性在几天内和一个以上的分析师测试。QCs 最初是在一个批次和亚 aliquoted 准备1x 使用。在3维的过程中, 两位分析家用几组 QCs 进行了化验, 以证明化验的精确度。在所示的示例数据中, QCs 的%CV 和内检测精度低于 FDA 指导建议的%CV < 20% (图 6)1。

图 6: 与两位分析员三天内生成的 QC 精度数据示例.用 DeSilva等公式对方差 (方差分析) 进行了计算, 得出了精度数据。28. 批内 (在运行中) 和批间 (运行之间) 统计数据被报告为%CV.请点击这里查看这个数字的大版本.
作者是 BioMarin 制药公司的员工和股东。
在这里, 我们提出了一种基于细胞的流式细胞仪方法来检测中和抗体或其他因素, 干扰细胞吸收酶替代疗法在人类基质, 如脑脊髓液 (CSF) 或人血清。
作者没有确认。
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