本文介绍了一种利用移液器吸头将稀有细胞群体接种至液滴微流控装置的实验方案,以提高细胞在液滴中的包封效率。
方法文章
* These authors contributed equally
本文介绍了一种利用移液器吸头将稀有细胞群体接种至液滴微流控装置的实验方案,以提高细胞在液滴中的包封效率。
在常用于细胞分析的各种微流控平台设计中,液滴微流控技术通过消除外部因素对细胞微环境的影响,为在单细胞水平上分离和分析细胞提供了一种强有力的工具。细胞在液滴中的封装遵循泊松分布,取决于每个液滴中细胞的数量以及单位体积液滴内的平均细胞数。原代细胞,特别是免疫细胞或临床样本,往往数量有限,实现无细胞损失的封装仍具挑战性。本文中,我们提出一种新方法,利用移液枪头将细胞加载至基于液滴的微流控装置,从而避免细胞的显著损失。通过对多种细胞类型的实验,我们展示了液滴中高效的细胞封装效果,其结果与泊松分布预测的封装效率高度一致。该方法确保了细胞向微流控平台的无损加载,且可轻松适用于后续的单细胞分析,e.g., 解析不同类型细胞之间的细胞相互作用。
近年来,微流控技术作为一种强大且多功能的单细胞水平细胞分析平台,其应用迅速增加1这些平台利用极小的样本量,以高通量方式对单个细胞和生物分子进行高精度、高灵敏度的筛选。2,3,4在各类微流控设计中,基于液滴的平台通过将单个细胞分离至由不相混相包围的水相液滴中,实现了对细胞微环境的精确且准确的控制,从而支持高通量的单细胞分析5,6基于液滴的微流控技术具有灵活性,可将单个或多个细胞分离至水相或水凝胶液滴中,在研究复杂的细胞行为(如蛋白质分泌或细胞间相互作用)方面具有重要价值7,8,9. 免疫细胞之间的信号传导与相互作用可受到微环境中其他细胞相互作用的影响10在液滴中分离单个细胞可提供一个有效的无噪声分析实验室环境,避免外部环境因素的干扰,从而获得更高效、更准确的结果11,12通过修改具有多个入口的液滴微流控平台设计,可实现多种细胞类型的包封,以研究细胞间相互作用 通过 细胞配对12,13.
细胞在液滴中的包封过程是随机的,其包封率可通过泊松分布公式进行统计学确定14,15。该包封率可通过考虑细胞到达液滴连接处的平均到达速率,并假设每个细胞的到达与其他细胞的到达相互独立来估算16。尽管无法完全保证细胞到达的独立性,但在细胞分布稀疏的情况下,可近似认为满足独立性假设,并可将液滴中含有一个或多个细胞的概率表示为每个液滴中细胞数量及每液滴平均细胞数的函数16,17。由于对液滴中细胞包封的这一估算依赖于每个液滴中存在的细胞数量,因此可以推断,提高入口处的细胞浓度将增加每液滴中平均存在的细胞数量16。因此,为确保单细胞包封,必须降低细胞浓度,但这通常会导致大量液滴为空液滴18。
在将细胞加载至注射器、管路或生产装置的过程中,由于细胞黏附、沉降和/或聚集导致的细胞损失,是造成实际包封率与预测包封率出现偏差的常见问题19。当接种稀有免疫细胞或临床样本时,这一问题尤为突出,因为这些细胞本身数量稀少,若包封的细胞数量远低于预期,则无法为实验分析提供足够的数据。浆细胞样树突状细胞(pDCs)是一类稀有的免疫细胞亚群,仅占全部白细胞总数的约0.2%–0.6%20。这类细胞在激活后可分泌大量I型干扰素,因此在免疫应答中发挥关键作用21。在研究此类稀有细胞于液滴中的细胞行为时,必须避免在细胞接种和包封过程中发生细胞损失22。近年来已有多种基于设计的改进方法,通过主动包封技术结合声学或电学等不同物理力,实现了单细胞液滴的生成与包封23,24。然而,这些方法在液滴生成效率方面仍存在一定的局限性16。
本研究建立了一种稳健且简便的方法,克服了传统方法在将单个或多个细胞加载至微流控装置时存在的不足。该方法借鉴了 Rho et al. 的思路,利用不同尺寸的移液器吸头,将少量稀有免疫细胞接种至液滴微流控平台,避免了显著的样品损失,所得结果与理论预测一致25。该技术可轻松且成功地适用于多种基于液滴的微流控应用,并可用于多种细胞类型甚至微粒。
1. 三入口聚二甲基硅氧烷(PDMS)装置的制备
2. 无损耗细胞封装
3. 细胞配对
在实验中,我们使用了一种基于聚二甲基硅氧烷(PDMS)的三入口微流控装置,其高度为25 µm(图1)。在此装置设置中,外侧入口用于冲洗含表面活性剂的油相,两个内侧入口用于冲洗含有细胞悬液或培养基的水相。液滴生成并收集后,在进行下游流式细胞术分析之前,需在芯片外孵育数小时。在孵育期间,培养基中存在的血清成分可能与表面活性剂发生相互作用,导致液滴不稳定并发生破裂。因此,向氟化油中添加优化浓度的表面活性剂至关重要。我们测试了含有添加2%人血清的无血清造血培养基的单分散液滴在不同表面活性剂浓度的氟化油中的稳定性。从图2可以推断,当油相中表面活性剂浓度至少为3%时,这些单分散液滴在24小时内具有高度稳定性。使用含或不含10%胎牛血清(FCS)的RPMI培养基也获得了类似结果(数据未显示)。因此,当使用不同来源的培养基和血清成分时,液滴的稳定性高度依赖于表面活性剂的最佳浓度。
为了验证本方法的包封效率,我们首先使用连接至注射器的管路接种细胞,这是最常规的细胞接种方法(图3A)。我们将Jurkat T细胞以1.0×106 cells/mL、2.0×106 cells/mL和4.0×106 cells/mL的不同浓度进行收获,结果获得的包封效率低于理论预测值(图3B)。在1.0×106 cells/mL浓度下,含有单个细胞的液滴比例为2.5%,即使提高细胞浓度,该比例也未增加。为了提高细胞加载效率,我们改进了先前的方法,将管路长度减半并将其固定在升高的三脚架上,同时将细胞悬液加载至连接PDMS装置的一半管路中(图4A)。采用该方法,我们分别以1.0×106 cells/mL、2.0×106 cells/mL和4.0×106 cells/mL的浓度包封了Jurkat T细胞,并以1.0×106 cells/mL、2.0×106 cells/mL和12.0×106 cells/mL的不同浓度包封了稀有的pDCs细胞。我们预期该方法可通过防止细胞沉降而提高包封率。然而,在所有测试浓度下,实验结果均显著低于理论泊松分布预测值(图4B和图4C)。
采用我们的尖端加样方法,我们优化了细胞包封率,获得的实验结果与统计学预测值一致图5A)。对于不同浓度的Jurkat T细胞,所获得的包封效率在所有浓度下均与我们计算的数值相符(图5B)。值得注意的是,即使对于倾向于成团的贴壁细胞(如 A549 肿瘤细胞),在细胞浓度为 1.0x10⁶ 个/mL 时,我们仍观察到封装效率略有提高。6 细胞/毫升(图5C)。我们还评估了该系统在不同细胞浓度(1.0×10⁶)下包封较为稀有且获取困难的pDCs的效率6 cells/mL,3.0×106 细胞/mL,以及13.0×106 细胞/毫升(图5D)。为了便于加载可能超过 200 µL, 例如在使用细胞系或更丰富的原代免疫细胞时,我们还通过以下方法研究了细胞包封效率 1000 µL 提示(蓝色)。我们证明了这些 1,000 µL 尖端在包封效率方面与之相比具有相似性 200 µL 提示(黄色)(图5E).
根据芯片设计和具体研究问题的不同,我们的尖端加样技术可用于通过单个入口加样细胞,以探究细胞异质性;或通过多个入口并行加样,以解析细胞间相互作用。我们比较了Jurkat T细胞(浓度为10.0×106 细胞/mL)从一个入口进入,分为两组带有不同标记的Jurkat T细胞(总浓度为10.0 × 106 细胞/mL)从两个入口(图6A 和 图6B)。在包封过程中,使用超低凝胶温度的琼脂糖生成液滴,液滴生成后即凝胶化,形成琼脂糖水凝胶微珠,可用于后续下游分析 通过 显微镜与流式细胞术(图6C 和 图6D)。显微分析显示,不同组合下均实现了细胞配对,表明具有高通量细胞配对能力(图6C)。此外,通过流式细胞术对同一群体的水凝胶微珠进行分析,发现可根据前向散射(FSC,大小)和侧向散射(SSC,颗粒度)的显著差异,将不含细胞的微珠与含细胞的微珠区分开来(图6D). 对不含细胞的微珠群体进行设门,证实了由于缺乏荧光信号,细胞未被包封。此外,对含有细胞的微珠群体设门揭示了多个亚群的存在,表明不同标记的Jurkat T细胞被包封。我们的结果表明,基于显微镜和流式细胞术分析,可实现高效的细胞配对,并显示出包封效率较泊松预测略有提高(图6E).

图1。基于PDMS的三入口单出口液滴微流控芯片。 该芯片包含三个入口,分别用于连续油相、细胞培养基和细胞悬液。生成的液滴从出口处收集。样品以层流形式流向流动聚焦结点,并在此处被包裹形成液滴。在入口处,滤膜结构可阻挡蛋白质聚集体或细胞聚集体等大颗粒物质。滤膜结构中缝隙的直径由蓝色线条标示,生成喷嘴处通道的直径由红色线条标示。整个芯片的通道高度为25 µm。 请点击此处查看该图的放大版本。

图2.液滴在24小时内的稳定性。 图表显示了含有造血无血清培养基 + 2% 人血清的液滴面积随时间的变化情况,分别对应三种不同浓度的表面活性剂:A) 0.5% B) 3% C) 5%。 请点击此处查看该图的高清版本。

图3.基于管路的细胞加样方法。 使用连接管路的注射器将Jurkat-T细胞以不同浓度加载至装置中。A) 示意图显示实验装置;B) 通过光学显微镜测定的细胞包封率。圆点:实验测定值;实线:泊松分布。误差条表示均值的标准误差。请点击此处查看该图的放大版本。

图4。采用垂直管加载方法在不同浓度下包封多种类型的细胞。 对不同浓度的Jurkat T细胞和pDCs进行包封,以确定细胞包封效率。 A) 示意图展示了垂直管加载方法的实验装置。B) 图表显示了Jurkat T细胞的包封效率。C) 图表显示了pDCs的包封效率。圆点:实验测定值;实线:泊松分布。误差条表示均值的标准误差。请点击此处查看此图的放大版本。

图5.通过吸头加载法包封不同类型细胞。A)吸头加载技术的示意图。B)图表显示Jurkat细胞的包封效率。C)图表显示A549细胞的包封效率。D)图表显示pDC细胞的包封效率。E)图表显示使用200 µL吸头(黄色)和1,000 µL吸头(蓝色)包封Jurkat T细胞的效率。圆点:实验测定值;实线:泊松分布。误差线表示平均值的标准误差。请点击此处查看该图的放大版本。

图6.微液滴中的细胞配对。A)通过两个入口将不同细胞在微液滴中配对的尖端加样方法示意图。B) 图中显示使用单个入口或两个并行入口封装Jurkat T细胞的情况。单个尖端的细胞浓度为2.0×106 个细胞/mL,两个尖端各自的细胞浓度均为1.0×106 个细胞/mL。圆点:实验测定值;实线:泊松分布。C) 羟基凝胶微珠与标记的Jurkat T细胞的荧光显微镜叠加图像。D) 琼脂糖水凝胶微珠中配对细胞的流式细胞术分析图。该图显示前向散射和侧向散射信号。E) 荧光显微镜与流式细胞术检测琼脂糖水凝胶微珠中细胞数量的比较。柱状图:平均值;须线:平均值的标准误差,n ≥ 4。误差线代表平均值的标准误差。请点击此处查看该图的放大版本。
在本实验方案中,我们展示了一种高效且简便的技术,用于将细胞加载并封装到液滴中,以实现高通量的单细胞分析,并进行可控的细胞配对,用于细胞相互作用研究。此外,我们比较了多种将细胞加载至微流控装置的传统方法,结果表明,与其它方法相比,我们所采用的尖端加载法是一种更为高效的细胞加载技术。
通过基于液滴的微流控技术研究临床样本或数量稀少的稀有细胞类型存在一些固有挑战。正如我们已证实的,细胞倾向于在注射器及管路表面发生沉降,从而导致细胞包封效率无法达到预期预测值。为避免这一问题,一些研究团队在注射器中使用搅拌子。然而,当处理稀有且数量有限的细胞群体时,总体细胞体积也十分有限,因而难以使用大体积注射器和搅拌子。此外,我们曾尝试用聚四氟乙烯(Teflon)涂层管路替代常用的普通管路以减少细胞黏附,但该方法并未改善实验结果;若管路过长,细胞黏附问题反而更加严重(数据未显示)。作为替代方案,我们采用垂直管路加样法,将细胞直接加载至管路中而非注射器内,以避免细胞在大体积注射器中损失。利用该技术,可实现小体积样本的加样,例如数量稀少且有限的浆细胞样树突状细胞(pDCs)。同时,样本通过垂直方向从管路加载至微流控装置,以防止细胞沉降。用于细胞接种的管路尺寸较小,可类比于微通道。管路内的流动由压力驱动,并遵循抛物线速度分布26。这意味着管路中心处流速最大,而管壁边缘处流速最小27。当细胞群体随流体通过管路时,速度梯度会将细胞推向流速接近于零的管壁边缘,导致细胞在边缘处沉降。因此,细胞在管路内的沉降或积聚会降低包封效率,这一点在代表性结果中已得到体现:实验数据与理论预测模型并不吻合。
科学家在进行液滴微流控实验时,另一种常用的解决方案是通过添加密度匹配试剂(如碘克沙醇)来增加细胞培养基的密度,以防止细胞在注射器中发生沉降19。然而,密度匹配试剂可能影响细胞行为,并对细胞的细胞因子分泌产生不利影响(数据未显示)28。
尽管对传统细胞加载技术进行了一些大大小小的改进,使包封效率略有提升,但实验结果仍未能达到理论计算值。然而,通过尖端加载法,我们能够克服先前方法的局限性,突破由泊松统计规律主导的包封效率限制。该技术不仅适用于悬浮细胞的加载,还可应用于贴壁细胞(如原代角质形成细胞和A549细胞)在微流控芯片上的加载。当使用大量细胞系(例如A549、K562)时, 等等。,可以使用更大的样品体积。因此,根据样品体积的不同,也可选用不同规格的移液器吸头,该简单技术可适用于单细胞封装和多细胞封装。
虽然低细胞浓度有助于确保液滴中包裹单个细胞,但为了提高每个液滴中平均包裹的细胞数量以用于细胞配对相关研究,通常需要较高的细胞浓度。已有多种单细胞方法被报道,可用于在微流控芯片或微加工纳米孔中实现免疫细胞的配对。29,30,31在液滴微流控技术中,泊松统计学表明,通过优化两种不同类型细胞的浓度,可实现1:1的细胞配对。根据泊松分布预测,液滴中也可能存在其他细胞组合形式。尽管1:1细胞配对有利于在单细胞水平研究细胞间相互作用,并有助于加深对细胞行为的理解,但多细胞配对同样具有重要优势。它能够揭示一种细胞类型的多个细胞对另一种细胞类型的影响。不同免疫细胞之间的相互交流有助于针对多种感染和病原体产生有效的免疫应答,同时增强免疫系统的稳健性。32因此,可以在不同背景下以高精度探究细胞间通讯。 例如, 1:1, 2:1, 1:2, 2:2, 3:1, 等等从而加深了对单个或成对细胞如何调控免疫反应启动机制的理解。这一现象尤其适用于研究自然杀伤细胞或细胞毒性T细胞连续杀伤其相应靶细胞的能力。
如前所述,为了在液滴中实现多重细胞包封,需要更高的细胞浓度。然而,当从单一入口加载细胞进行包封时,较高的细胞样品浓度可能导致细胞在入口处发生聚集,从而降低包封效率,并使实验结果与理论值产生较大偏差。为避免这一问题,可同时从两个独立的入口加载细胞。理论上,还可设计具有更多入口的微流控装置,以实现更高的细胞包封水平,满足平均包封 x 个细胞的需求。在本研究中,我们在保持总浓度相同的条件下,分别比较了从单一入口和双入口加载Jurkat T细胞的包封效率,结果表明两者的包封效率相似。该改进方法使研究人员能够在芯片上组合不同类型的细胞。
尽管该方法有助于在无显著细胞损失的情况下将细胞加载至微流控装置,但仍需注意某些事项。在用矿物油填充注射器以及用移液器吸头吸取细胞样品时,应避免混入气泡,确保整个系统无空气。还需注意,矿物油不应与样品混合。含有样品的移液器吸头应牢固插入微流控装置的入口,并采取最大程度的预防措施,以防止泄漏及进一步引入气泡。总之,尖端加载法是一种简单而稳健的技术,能够以经济高效的方式实现细胞的高通量行为分析,通过细胞封装且无显著细胞损失。当在入口处使用最佳样品浓度时,这种利用移液器吸头加载细胞的方法具有很高的灵活性,可适用于不同类型的细胞,特别是稀有的原代免疫细胞,从而获得接近理论预测模型的更高封装效率。
我们没有需要披露的内容。
感谢埃因霍温理工大学的大力支持。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 1H,1H,2H,2H-全氟-1-辛醇 | Sigma-Aldrich | 171468-5G | |
| 1H,1H,2H,2H-全氟辛基三乙氧基硅烷 | Fluorochem/UK | S13150 | 硅烷(有毒) |
| 琼脂糖(超低凝胶温度) | Sigma-Aldrich | 9012-36-6 | |
| BD 带鲁尔锁头的一次性注射器 | Fisher Scientific | 10630694 | 注射器 |
| 1.2 mm 活检穿孔器 | Harris Uni-Core | ||
| 细胞增殖染料 eFluro 670 | eBioscience | 65-0840-85 | |
| CellTrace CFSE | Invitrogen | C34554 | |
| CellTrace 远红细胞染料 | Invitrogen | C34564 | |
| Eppendorf 管 | Eppendorf 管 | Safe-Lok 管,1 mL 和 2 mL | |
| 载玻片 | Sigma Aldrich | CLS294775X38-72EA | Corning 显微镜载玻片,平片,长 × 宽 75 mm × 38 mm |
| 哈佛泵 | Harvard Apparatus | C-400750; C-400727 | 注射泵 |
| HFE-7500 3M Novec 工程流体 | Fluorochem/UK | 51243 | 氟化油 |
| 5 mm Kai 活检穿孔器 | Amstel Medical | 1980130 | |
| 鲁尔短管接头 | Instechlabs/USA | LS20S | 鲁尔短管接头,20 号(粉红色)× 0.5 英寸(12 mm),非无菌 |
| 矿物油(轻质) | Sigma Aldrich | M8410-1L | |
| 磷酸盐缓冲液 | Sigma-Aldrich | P4417-50TAB | 片剂 |
| Pico-Surf 1(Novec 7500 中 5%) | Sphere Fluidics | 020317-09 | 表面活性剂 |
| 等离子体灰化仪 | Emitech | K1050X | 等离子体灰化仪 |
| RPMI 1640 培养基 | Gibco | 11875093 | |
| 硅弹性体基础剂 184 | Sylgard | 9355218 | PDMS 基础剂 |
| 硅弹性体固化剂 | Sylgard | 9355218 | 固化剂 |
| 不锈钢导管连接器 | Instechlab/USA | SC20/15 | 20 号 × 15 mm,非无菌 |
| TFE 聚四氟乙烯管 | Sigma-Aldrich | 58696-U | PTFE 管 长 × 外径 × 内径 50 英尺 × 1/16 英寸 × 0.031 英寸 |
| Thinky 混合器 ARE-250 | EX-4025F | 预混处理 |