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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
我们提出了一种方法, 以量化淀粉含量的卵巢原基在冬季休眠期间使用图像分析系统结合组织化学技术。
在几个植物发育过程中, 淀粉的变化与关键事件有关, 包括从授粉到受精的生殖阶段和果实的开始。然而, 淀粉在花分化过程中的变化尚不完全清楚, 主要是由于难以量化淀粉含量的特别小的结构的花原体。在这里, 我们描述了一种方法, 以定量淀粉在卵巢原基甜樱桃 (金银花) 使用图像分析系统附加到显微镜, 允许将淀粉含量的变化与不同阶段的关系从秋天到春天的休眠状态。为此, 通过评价在冬季不同时刻转移到可控条件下的芽芽生长, 确定花蕾的休眠状态。为了定量卵巢原基中的淀粉, 花蕾按顺序收集、固定、嵌入石蜡、切片, 并用 i2kl (碘化钾) 染色。在显微镜下观察制剂, 并通过图像分析仪进行分析, 该分析仪可将淀粉与背景明确区分开来。淀粉含量值是通过测量与染色淀粉相对应的图像的光学密度得到的, 同时考虑到每个像素的光学密度之和作为对所研究框架淀粉含量的估计。
温带多年生植物通过调节生长发育来适应季节。虽然它们在春季和夏季发育, 但在秋天停止生长, 在冬季处于休眠状态。虽然休眠使他们能够在较低的冬季温度下生存, 寒意是一个先决条件, 在春天适当的芽2。休眠对温带水果生产和林业的重要影响, 导致了确定和预测休眠期的各种努力。在果树物种中, 将芽转移到强迫条件下的经验实验和基于开花数据的统计预测是目前确定休眠打破日期的方法, 这使得研究人员能够估计每个品种的冷却要求。然而, 如何根据生物过程确定休眠状态仍不清楚3。
在温带果树上开花, 如甜樱桃, 每年开花一次 , 持续约两周。然而, 花开始分化和发展大约10个月前, 在前一个夏天4。花原基在秋天停止生长, 在冬季在芽内保持休眠状态。在此期间, 每个品种需要积累适当开花的特定冷却要求 4.尽管在冬季芽缺乏物候变化, 但在休眠期间, 花原体在生理上是活跃的, 最近, 寒冷温度的积累与淀粉积累或减少的动态有关在卵巢原基细胞内, 为休眠测定提供了一种新的方法 5.然而, 卵巢原基的小尺寸和位置需要一种特殊的方法。
淀粉是木本植物中主要的碳水化合物.因此, 淀粉的变化与花组织的生理活性有关, 花组织需要碳水化合物来支持它们的发育7,8。不同的关键事件在生殖过程中也与不同花系中淀粉含量的变化有关, 如花药减数分裂9、花粉管的生长通过花粉室受精 10.组织化学技术可以在休眠期检测花原基每个特定组织中的淀粉。然而, 在量化淀粉, 使其随着时间的推移减少的模式或比较组织, 品种或年份之间的淀粉含量仍然是困难的。这是因为可用于分析技术的组织数量很少11。作为一种替代方法, 与显微镜12 相关联的图像分析允许对植物组织13的非常小的样本中的淀粉进行定量。
显微镜和图像分析相结合的方法已被用来量化植物组织中不同成分的含量, 如钙质14、微管15或淀粉16, 方法是测量按特定染色面积的大小。污渍。对于淀粉, 它可以很容易地检测到它使用碘钾 (i2ki) 反应17。此方法是非常具体的;i2 ki 在淀粉颗粒的层流结构内进行夹层, 并根据淀粉18的直链淀粉含量形成深蓝色或红棕色。染色 i2ki 染色的切片显示淀粉和背景组织之间的充分对比度, 允许明确的淀粉检测和随后的量化图像分析系统19。虽然这种染料不是化学计量的, 但碘的积累与淀粉分子的长度成正比, 淀粉分子的长度变化很大,变化很大。因此, 以像像像像素数表示的染色面积的大小可能无法准确地反映淀粉的含量, 因为在染色面积相似的字段之间可以发现淀粉含量的高差异。作为一种替代方法, 可以通过测量从显微镜获得的黑白图像上的染色颗粒的光学密度来评估淀粉含量, 因为在杏子8,13的不同组织中都有报道。,19, 鳄梨10,20和橄榄21.
本文介绍了一种将休眠状态的实验测定与秋季至春季甜樱桃卵巢原基组织淀粉含量的定量相结合的方法, 为理解和预测提供了一种新的工具。休眠的基础上研究的生物机制与休眠。
1. 休眠测定和植物材料收集
2. 淀粉定量的植物材料制备
3. 淀粉含量的量化
休眠研究需要确定满足冷却要求的时刻。尽管在野外条件下冬季缺乏物候变化 (图 1a), 但樱桃树在低温下度过一定时期之前, 在适当的条件下无法恢复生长能力。在冬季, 芽定期转移到受控条件室 (图 1b), 从而可以评估花蕾的休眠状态。通过测定花蕾重量的增加, 对花蕾生长进行了评价。虽然在休眠期间, 在10天的适当条件下无法观察到任何变化 (图 1c), 但一旦克服休眠, 生长室的芽就会膨胀和爆裂 (图 1C)。这一分析的结果使芽的休眠状态得以确定。由于冬季发生的温度不同, 根据年份的不同, 在不同的日期克服了休眠问题。而在研究的第一年, 休眠的打破发生在 1月, 第二年则是一个温和的冬天;因此, 令人寒心的满足发生在大约三个星期后, 在2月。
甜樱桃在刺中带有花蕾, 其中顶芽是植物芽, 侧芽是花蕾 (图 1C和1C)。在夏末开始分化为花蕾或植物芽, 当它们在冬季进入休眠状态时, 几个花原体仍留在芽内, 由无数的绿色鳞片保护, 并被棕色的外鳞片覆盖 (图 1c和 图 2a)。花蕾的解剖显示了花芽内的小花原基 (图 2a)。每个花蕾含有一到五个单独的花原体 (图 2B)。尽管每个花原基的小尺寸, 花的所有部分都是区分的, 可以区分: 雌蕊, 花药, 花瓣, 和隔片 (图 2c)。使用组织化学技术 (酒精: 醋酸 [3: 1] 固定、石蜡包埋、微分片和碘基淀粉染色) 可以观察到淀粉在花原基组织中的分布 (图 2d)).
卵巢原基中的淀粉在每个部分进行了量化。四种测量指标为 1337μm 2, 放大 40x, 代表了甜樱桃卵巢原基中淀粉的总体布局 (图 3 a).在 i2ki 染色 (图 3B) 后, 淀粉颗粒与背景明显区分开来。图像分析系统通过调整红色、绿色和蓝色的颜色阈值来识别淀粉, 直到所观察到的所有淀粉颗粒都被系统根据定义的颜色参数 (图 3C) 创建的二值图像覆盖。所获得的淀粉含量值是测量黑白图像上遮罩下每个像素的光学密度的结果 (图 3d)。
淀粉的定量显示了淀粉在冬季动态的一致模式 (图 4)。通常情况下, 初冬淀粉的数量的光学密度值不到 40, 0003, 而最大数量在这两年的价值达到 120, 000 至 140, 000 之间。虽然第一年1月份达到了最大值 (图 4 a), 但第二年2月达到了最大值 (图 4 b)。将这些结果与休眠肤色相比较, 淀粉的最大含量与这两年的冷却效果同时发生。
这种方法要求确定休眠状态 (图 5a) 与卵巢组织上的淀粉定量 (图 5A), 以确定淀粉含量的变化与休眠。

图 1: 测定甜樱桃花蕾休眠状态的实验装置.(a) 在冬季, 树枝显示休眠的芽关闭, 被深棕色鳞片覆盖。(b) 这个面板显示转移到生长室的芽。1月中旬, 一些品种仍然处于休眠状态, 芽仍然关闭 (白色箭头), 而另一些品种则能够生长, 显示出膨胀的芽 (黑色箭头)。(c) 这个面板显示了一个拍摄与休眠花蕾位于侧向和一个单一的植物芽位于顶端位置的刺。(d) 这个面板显示了一个拍摄的细节, 一旦在生长室的休眠克服了 10天, 显示芽肿胀。请点击这里查看此图的较大版本.

图 2: 淀粉定量的植物材料制备.(a) 这个面板显示花芽的横向部分, 显示两个花原生 (fp) 由许多鳞片 (sc) 保护。(b) 三朵花原体 (fp) 聚集在花蕾中。(c) 这个面板显示了花原基的横向部分, 所有的轮回都有区别: 隔片 (片)、花瓣 (pe)、花药 (a) 和雌蕊 (pi)。卵巢原基在雌蕊 (箭头) 的底部被区分。(d) 1月份收集并固定了一个花原基的中间部分, 嵌入石蜡中, 用 i 2 ki (深棕色) 染色.此面板显示卵巢原基 (箭头)。在a和b面板中, 刻度条为 500μm, 在 c 和d面板中, 刻度条为 200μm. 请点击这里查看此图的较大版本.

图 3: 甜樱桃卵巢原基中的淀粉定量.(a) 这个面板显示了一个涂有 i2ki 的卵巢原基的中间部分, 显示了测量淀粉含量的四个框架。(b) 这个面板显示了卵巢原基的细节。淀粉颗粒被染成深棕色。(c) 此面板显示一个伪彩色图像, 其中淀粉对应于不同色调的蓝色。(d) 此面板显示一个二进制图像面膜覆盖 i2ki 染色淀粉 (蓝色) 的黑白原始图像。光学密度仅在掩码所覆盖的原始图像的像素中进行测量。在 a 面板中, 刻度条为 100μm, 在 b-d 面板中, 刻度条为 20μm. 请点击这里查看此图的较大版本.

图 4: 在两年不同的冬季温度条件下, 从秋季到春季每月采集的甜樱桃卵巢原基淀粉定量的代表性结果.(a) 该小组显示了2010-2011年冬季寒冷的结果。冷却的满足 (雪花) 发生在 1月, 伴随着淀粉的最大数量。(b) 该小组显示了2011-2012年的结果, 该年是一个温和的冬季。冷却的满足 (雪花) 发生在 2月, 伴随着淀粉的最大数量。这些值是平均值±的平均值的标准误差。请点击这里查看此图的较大版本.

图 5: 评价甜樱桃卵巢原基芽休眠状态和淀粉定量的实验设计方案.(a) 此面板显示休眠状态确定的工作流程: 工厂材料的制备、工艺和获得的结果。(b) 该面板展示了淀粉定量的工作流程: 对淀粉进行显微观察的芽的组织化学制备、淀粉的图像分析检测和淀粉的定量。请点击这里查看此图的较大版本.
作者没有什么可透露的。
我们提出了一种方法, 以量化淀粉含量的卵巢原基在冬季休眠期间使用图像分析系统结合组织化学技术。
作者感激地感谢玛丽亚·赫雷罗和埃利塞奥·里瓦斯的有益讨论和建议。这项工作得到了欧洲联盟欧洲区域发展基金----欧洲区域发展基金----的支持 [赠款编号 bes-2010-037992 至 E. f.];国家调查研究所 [赠款编号 Rfp2015-00015-00, RTA全85-00, RTA2017-00003-00];和 Gobierno de Aragón----欧洲社会基金, 欧洲联盟 [Grupo 格兰达·阿林塔多 a12-17r]。
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