已建立一系列固定方法,可用于对活体秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)个体进行靶向辐照,所用技术基于一种新近开发的具有保水功能的超薄聚二甲基硅氧烷微流控芯片。这种新型芯片内固定方法同样适用于成像观察。本文详细说明了该芯片的处理步骤及应用实例。
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已建立一系列固定方法,可用于对活体秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)个体进行靶向辐照,所用技术基于一种新近开发的具有保水功能的超薄聚二甲基硅氧烷微流控芯片。这种新型芯片内固定方法同样适用于成像观察。本文详细说明了该芯片的处理步骤及应用实例。
辐射在生物学应用和离子束育种中被广泛使用,其中微束辐射是识别生物体辐射敏感位点的一种强有力手段。本文介绍了一系列为活体生物个体的靶向微束辐射而开发的芯片上固定方法 秀丽隐杆线虫值得注意的是,我们先前开发的用于固定化的聚二甲基硅氧烷(PDMS)微流控芯片的处理方法 秀丽隐杆线虫 无需麻醉即可对个体进行操作的详细说明如下。这种芯片被称为蠕虫片,具有弹性,可使微流控通道得以扩展,其弹性特性可轻柔地包裹动物。此外,由于聚二甲基硅氧烷(PDMS)具有自吸附能力,只需在蠕虫片表面覆盖一层薄盖膜,即可将动物密封于通道内,而无需将动物推入通道进行封闭。通过翻转盖膜,可轻松回收动物。此外,蠕虫片具有保水性能,并允许 秀丽隐杆线虫 可使个体在活体条件下长时间接受显微观察。此外,该片材厚度仅为300 µm,允许重离子(如碳离子)穿透包裹动物的片材,从而实现对离子粒子的检测,并准确测量施加的辐射剂量。由于用于包裹动物的覆盖膜的选择对成功实现长期固定至关重要,我们对多种覆盖膜进行了筛选,并推荐了其中一种适宜的膜材料。作为芯片的应用示例,我们展示了利用线虫片材的微流控通道包裹动物后,对其肌肉活动进行成像观察以及微束辐照的实验。这些实例表明,线虫片材极大地拓展了生物学实验的可能性。
辐射(包括X射线、γ射线和重离子束)广泛应用于癌症的诊断与治疗以及离子束育种等生物学领域。目前,大量研究和技术开发正集中于辐射效应1,2,3。微束辐射是一种识别生物体内辐射敏感位点的有力手段4。日本量子科学技术研究开发机构高崎先进辐射研究中心(QST-Takasaki)一直在开发一种在显微观察下利用重离子微束照射单个细胞的技术5,并已建立针对多种模式生物进行靶向微束辐照的方法,这些模式生物包括线虫Caenorhabditis elegans4,6、家蚕7和Oryzias latipes(日本青鳉)8。对线虫C. elegans进行靶向微束辐照可有效抑制特定区域(如头部的神经环),从而有助于揭示这些系统在运动等生命过程中的作用。
已开发出一种无需麻醉即可在芯片上固定秀丽隐杆线虫(C. elegans)个体的方法,以实现微束辐照4。此外,为了改进先前研究中使用的微流控芯片4,我们近期开发了具有亲水性、离子可穿透性的聚二甲基硅氧烷(PDMS)微流控芯片,称为线虫片(见材料表),用于固定C. elegans个体9。这些线虫片由超薄柔性片材组成(厚度 = 300 µm;宽度 = 15 mm;长度 = 15 mm),其表面具有多个(20 或 25 个)直的微流控通道(深度 = 70 µm;宽度 = 60 µm 或 50 µm;长度 = 8 mm)(图 1A-D)。微流控通道是开放的,可同时容纳多个线虫个体进入其中(图 1E)。该片材具有弹性,可使微流控通道扩张约 10%(图 1F),其弹性可实现对线虫的轻柔包裹。此外,由于 PDMS 具有自吸附能力,可通过在片材表面覆盖一层薄的盖膜将线虫密封在通道内,而无需将线虫推入通道进行封闭。通过翻转盖膜,即可方便地回收线虫个体。
当线虫被限制在通道中或被收集时,这些通道不会对其造成伤害。此外,芯片由本质上具有疏水性的聚二甲基硅氧烷(PDMS)制成,但可通过赋予材料亲水性来实现保水。保水性和厚度是线虫芯片的有利特性。其保水能力可防止动物在长时间固定后脱水,从而能够进行长期观察。
此外,如先前所述9,这些芯片的厚度仅为 300 µm,允许重离子(例如在水中射程约为 1 mm 的碳离子)穿过包裹动物的芯片。这使得离子粒子能够被检测,并可准确测量施加的辐射剂量。而且,线虫芯片可重复使用,因此具有经济性。采用传统的注射方法时,被包裹的动物有时会死亡,且无法从通道中取出;其卵也可能堵塞通道,导致芯片无法继续使用。因此,这类芯片基本上是一次性的,成本效益较差。
本文详细描述了一系列利用蠕虫片在芯片上固定活体C. elegans个体的方法。通过在芯片上固定后3小时进行动物运动能力测定,我们评估了合适的盖膜。此外,我们还展示了在芯片上固定用于成像观察和微束辐照的实例。
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1. 菌株及保藏
2. 芯片上固定化缓冲液的选择
3. 芯片上固定化适用覆盖膜的选择
4. 芯片上的固定化
注意:应佩戴一次性无菌手套,以避免污染线虫培养板。
5. 从线虫培养皿中收集动物
6. 蠕虫切片在成像观察中的应用
注意:蠕虫载片可广泛用于显微观察。该芯片能够保持水分,并且在芯片上固定线虫3小时后,不会影响秀丽隐杆线虫(C. elegans)个体的运动能力9。此外,该芯片本身无自发荧光,适用于荧光成像实验。以下提供一个荧光成像实验的应用示例。
7. 蠕虫薄片在微束辐照中的应用
注意:准直微束辐照系统5可使用由QST高崎先进辐射应用离子加速器设施(TIARA)的方位场变化回旋加速器加速产生的多种重离子粒子(图4A)。在束流出口下方设有用于辐照的自动载物台(图4B)。利用该系统对C. elegans进行重离子微束辐照的操作步骤如下。
8. 蛔虫切片的重复使用处理
注意:如果使用后按照以下方法进行清洁和灭菌,蠕虫培养片至少可重复使用10次,且对动物无任何不良影响9。
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使用超薄、可润湿的PDMS微流控芯片(蠕虫片)可成功固定活跃的C. elegans个体。我们按照方案第3节所述,考察了不同覆盖膜用于密封蠕虫片的适用性。为评估覆盖膜的密封效果,我们分别采用盖玻片(厚度:130–170 µm)、PET膜(厚度:125 µm)和PS膜(厚度:约130 µm)进行芯片内固定后3小时动物运动能力的检测。如图5所示,自由活动3小时的对照组动物与使用PS膜密封在蠕虫片中的动物在运动能力(体弯曲次数)上无显著差异。相比之下,使用盖玻片密封的动物其运动能力显著降低;部分动物出现干燥现象,提示盖玻片排斥液滴,导致密封不严,使动物部分脱水,从而引起运动能力下降。使用PET膜密封的动物运动能力也显著降低;尽管未观察到脱水现象,但动物运动能力呈均匀性下降趋势,提示其较低的氧气透过率(约30 mL/[24 h·m²·MPa]),约为PS膜的1/100,导致动物窒息。这些结果表明,在蠕虫片中封装动物时应使用PS覆盖膜。
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利用可润湿的聚二甲基硅氧烷(PDMS)微流控芯片在活体条件下实现秀丽隐杆线虫(C. elegans)的芯片上固定,可高效地对多个线虫进行靶向微束辐照。该系统操作简便,并具备防止干燥的特性,不仅适用于微束辐照,还可广泛应用于多种行为学实验。此类线虫芯片已实现商业化,可方便获取。传统的微流控芯片(如嗅觉芯片)存在线虫和卵在封闭微通道中堵塞的问题,导致线虫难以回收,因此这类芯片通常为一次性使用,增加了实验成本。相比之下,当前线虫芯片的微流控通道为开放式设计,便于线虫的回收。因此,该线虫芯片可重复使用,更具经济性。
近年来,PDMS微流控芯片的技术创新呈现出结构复杂性和多功能性日益增强的趋势16,18,19,20,21,
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作者无任何利益冲突需要披露。
作者感谢Atsushi Higashitani博士在秀丽隐杆线虫(C. elegans)处理方面提供的宝贵建议,感谢Yuya Hattori博士、Yuichiro Yokota博士和Yasuhiko Kobayashi博士的有益讨论。作者感谢秀丽隐杆线虫遗传中心(Caenorhabditis Genetic Center)提供秀丽隐杆线虫(C. elegans)和大肠杆菌(E. coli)菌株。我们感谢QST高崎先进辐射源研究所(QST-Takasaki TIARA)回旋加速器团队在辐照实验中给予的热心协助。我们感谢Susan Furness博士对本手稿初稿的编辑。本研究部分由日本学术振兴会(JSPS)的KAKENHI基金(资助编号JP15K11921和JP18K18839)支持,资助对象为M.S.
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 秀丽隐杆线虫 野生型菌株 | 美国明尼苏达州秀丽隐杆线虫遗传学中心(CGC) | N2 | 野生型 秀丽隐杆线虫 本研究中通常使用的菌株 |
| 秀丽隐杆线虫 unc-119(e2498) III 突变菌株 | 美国明尼苏达州秀丽隐杆线虫遗传学中心(CGC) | CB4845 | 秀丽隐杆线虫 仅用作体形异常突变体示例的菌株 |
| 秀丽隐杆线虫转基因品系 HBR4 | 美国明尼苏达州秀丽隐杆线虫遗传学中心(CGC) | HBR4 | 该转基因的基因型 秀丽隐杆线虫 菌株为 HBR4:goeIs3[pmyo-3::GCamP3.35::unc-54]–3’utr, unc-119(+)]V该菌株仅用于成像观察。 |
| 大肠杆菌菌株 | 美国明尼苏达州秀丽隐杆线虫遗传学中心(CGC) | OP50 | E. coli 用作食物的菌株 秀丽隐杆线虫 |
| 蠕虫板红外(50/60) | Biocosm, Inc.,日本兵库县 | BCM17-0001 | 微流控芯片,含25个直通道,50/60-µ本文所有实验和观察中使用的通道宽度 |
| 蠕虫培养板 60 | Biocosm, Inc.,日本兵库县 | BCM18-0001 | 带有20个直通道60的微流控芯片 µm-宽度通道。适用于孵化后20℃条件下饲养3-5天的成虫°C. |
| 蠕虫培养板 50 | Biocosm, Inc.,日本兵库县 | BCM18-0002 | 具有20个直通道50的微流控芯片 µm-宽度通道。适用于孵化后约3天、20℃条件下的年轻成虫°C. |
| 盖玻片 | MATSUNAMI GLASS IND. LTD. | C030401 | 盖玻片(厚度:130-170 µm)在方案3的运动测定实验中使用 |
| 聚苯乙烯薄膜 | Biocosm, Inc.,日本兵库县 | BCM18-0001/ BCM18-0002 | Worm Sheets 套装物品。PS 薄膜(厚度:~130 µm) 在方案3的运动性实验中使用。 |
| 聚酯薄膜Lumirror | 东丽株式会社,日本东京 | Lumirror T60 (t 125 µm) | PET薄膜(厚度:125 µm) 在方案3的运动行为检测中使用 |
| IWAKI 60 mm/未处理培养皿 | AGC Techno Glass Co., Ltd.,日本静冈 | 1010-060 | 未处理的培养皿,用于孵育 秀丽隐杆线虫 在方案1中 |
| IWAKI 35 mm/未处理培养皿 | AGC Techno Glass Co., Ltd.,日本静冈 | 1010-035 | 在方案3的运动性实验中使用的未经处理的培养皿 |
| Milli-Q | 默克,法国 | 超纯水 | |
| Kimwipe S-200 | 日本东京 Nippon Paper Crecia 公司 | 62020 | 120 毫米 × 215 毫米;每盒 200 张 |
| WormStuff 虫体挑取工具 | Genesee Scientific Corporation,加利福尼亚州,美国 | 59-AWP | Platina 镊子,专用于夹取 秀丽隐杆线虫 |
| 研究用体视显微镜系统 | OLYMPUS CORPORATION,日本东京 | SZX16 | 本文所有实验和观察所使用的显微镜 |
| SZX16电动调焦支架 | OLYMPUS CORPORATION,日本东京 | SZX2-ILLB | 此步骤用于方案3-8中的明场观察。 |
| 物镜(×1) | OLYMPUS CORPORATION,日本东京 | SDFPLAPO1×PF | 数值孔径:0.15;工作距离:60 mm。该物镜用于方案3-8中的明场观察。 |
| 物镜(×2) | OLYMPUS CORPORATION,日本东京 | SDFPLAPO2XPFC | 数值孔径:0.3;工作距离:20 mm。这 使用lends进行成像观察。 |
| 汞灯光源 | OLYMPUS CORPORATION,日本东京 | U-LH100HG | 宽发射光谱使得可使用所有常见荧光染料进行多种荧光成像实验。 |
| SZX16 荧光滤光片装置(YFP 高性能) | OLYMPUS CORPORATION,日本东京 | SZX2-FYFPHQ | 激发波长:490-500 nm;发射波长:510-560 nm。用于HBR4菌株的成像观察。 |
| 高速数码相机EXILIM | 日本东京卡西欧计算机株式会社 | EX-F1 图1B、1E、1F,图2A-C以及视频1均使用该数码相机获得。 | |
| Office 2013 | 微软公司,美国华盛顿州雷德蒙德 | 用于统计分析的 EXCEL 软件 |
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