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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
这份手稿描述了一种基于 fac 的从人的皮肤中分离状和网状成纤维细胞的协议。它规避了体外培养, 这是不可避免的与常用的隔离协议通过外植体培养。所产生的成纤维细胞亚群功能不同, 在真皮内显示出不同的基因表达和定位。
成纤维细胞是一种高度异质性的细胞群, 与许多人类疾病的发病机制有关。在人类皮肤真皮 , 成纤维细胞传统上归因于浅状或下网状真皮根据其组织学定位。在小鼠真皮中 , 状和网状成纤维细胞起源于两个不同的谱系 , 在生理和病理过程中具有分化的功能 , 并有一个独特的细胞表面标记表达谱 , 通过这些特征可以区分它们。
重要的是, 来自浅层和低真皮层的外植体培养的证据表明, 人类皮肤真皮中至少存在两种功能不同的真皮成纤维细胞谱系。然而, 与小鼠皮肤不同的是, 能够识别不同成纤维细胞亚群的细胞表面标记尚未为人体皮肤建立。我们开发了一种新的方案 , 通过荧光激活细胞分选 ( FACS ) 分离人类状和网状成纤维细胞群的方法 , 使用两个细胞表面标记成纤维细胞激活蛋白 ( FAP ) 和胸腺细胞抗原 ( Thy1 ) / CD90 。这种方法可以在没有体外操作的情况下分离纯成纤维细胞亚群, 从而影响基因表达, 从而能够准确地分析人真皮成纤维细胞亚群在组织稳态或疾病方面的功能分析病理。
成纤维细胞作为结缔组织的主要细胞成分, 主要负责胶原蛋白和弹性纤维的沉积, 最终形成细胞外基质1, 因此, 它们在组织稳态、再生和疾病长期以来一直被低估。然而, 成纤维细胞最近成为研究人员关注的焦点, 这不仅是因为它们是诱导多能干细胞2的重要细胞来源,还因为它们在其发病机制中具有很高的可塑性和意义。多种疾病, 如器官纤维化3,4,5或癌症6,7。
人的皮肤是由多层上皮 , 表皮 , 其底层结缔组织 , 真皮 , 这可以组织学细分为上状和下网状真皮 , 主要由成纤维细胞和细胞外基质8和皮下组织。根据皮肤成纤维细胞在组织中的位置 , 皮肤成纤维细胞大致分为状和网状成纤维细胞1。
重要的是, 最近的数据表明, 这些真皮成纤维细胞亚群不仅在组织学上是可区分的, 而且其功能也有相当大的差异。在小鼠皮肤中 , 状和网状成纤维细胞在胚胎发生过程中产生于两个不同的谱系9。一些证据表明, 这两种血统不仅在组织稳态、毛囊形态发生、伤口修复和纤维化方面发挥着不同的作用, 而且对不同的疾病也有反应来自肿瘤表皮干细胞的信号 11, 表明不同的作用在癌症的发病机制。方便的是, 这两个血统在成年小鼠皮肤中表达了一套独特的相互排斥的细胞标记物, 从而能够分离出纯真皮成纤维细胞群, 并随后对其在体外的具体功能进行广泛分析9,11个。
相应地, 至少有两个不同的成纤维细胞亚群具有不同的形态和功能, 包括分化的增殖率, 组织重塑能力12,13, 以及支持生长的能力表皮干细胞体外, 已描述为人类皮肤真皮14,15。然而 , 已发表的关于人真皮成纤维细胞的研究大多是使用从皮肤外植体培养物中分离出的混合成纤维细胞群体进行的 , 因为特定的细胞表面标记集能够分离出纯人类状体或网状成纤维细胞亚群类似于小鼠真皮尚未建立。
我们最近已经证明 , 人类皮肤状和网状成纤维细胞的特点是特定的细胞表面标记 , 使分离各自的亚群通过荧光激活细胞分选 ( 流式细胞组织 )16 : fap+CD90成纤维细胞代表状成纤维细胞主要位于上真皮 , 表现出较高的增殖率 , 独特的基因特征 , 但没有脂原体的潜力。FAP+cd90+和 fa-cd90+成纤维细胞属于下真皮隔间的网状谱系, 这些隔间增殖较少, 但容易发生脂肪生成--网状成纤维细胞的标志.这种方法使广泛研究这些明显的成纤维细胞亚群, 不仅在生理条件下的特定功能, 而且在包括皮肤癌的皮肤病的发病机制的背景下。
然而, 由于成纤维细胞改变了其细胞表面标记在二维体外培养中的表达 16, 17, 19, 我们的协议的应用仅限于分离原代生细胞与人真皮 , 不允许在混合细胞培养群体中识别状或网状成纤维细胞。重要的是, 尽管细胞表面标记的表达在体外发生了变化, 但我们已经证明, 根据下面描述的协议分离的成纤维细胞子集在培养16时保留了其特定的功能, 从而能够生理或病理条件下亚基特异性特性的体外研究。
总之, 我们开发了一种通过流式细胞仪分离明显成纤维细胞亚群的方案, 首次允许将纯成纤维细胞群与处于幼稚状态的人皮肤真皮分离。
人的皮肤是从26至61岁的白人男子和妇女身上获得的 (防晒皮肤; 腹部矫正、乳房减少)。根据《赫尔辛基宣言》, 并经维也纳医科大学机构审查委员会批准, 在收集组织之前获得书面知情病人同意。
请注意:我们提供了一种从全厚度真皮 (请参阅第1节) 或将人体皮肤真皮切片到不同层后 (跳过第1节, 直接参考第2节) 的功能不同的成纤维细胞亚群的分离协议。.
1. 全厚度真皮的制备
2 . 将人皮肤真皮分割成带皮肤的状层和网状层
3. 表皮和真皮的分离
4. 皮肤组织的酶消化
5. 单细胞悬浮液和红细胞裂解的制备
6. 流式细胞仪成纤维细胞的阻塞和染色
7. 人皮肤成纤维细胞亚群分离及流式细胞仪的起动策略
8. 成纤维细胞的培养和脂肪生成法
图 1显示了处理皮肤组织以获得单个细胞悬浮液的主要步骤, 显示了皮肤的皮肤病 (图 1 a)、不同的真皮层 (图 1 b)、皮下脂肪的去除层 (图 1c) 和表皮和状真皮的分离 (图 1C) , 以及人工和酶组织分离的不同步骤 (图 1C, f) 。图 2提供了三个真皮层的方案。
图 3显示了流式细胞仪染色面板的浇注策略, 用于分析人体皮肤中不同的成纤维细胞亚群。没有在成纤维细胞上表达的其他细胞表面标记物允许排除皮肤中存在的各种其他细胞, 如免疫细胞、表皮细胞、间充质干细胞 (MSCs)、红血球或内皮细胞, 以达到最大纯度在孤立的人口。使用图 2中使用的相同的 facs 面板来识别这些成纤维细胞亚群并不重要, 但这是我们的建议。人们可以使用贴有不同荧光染料标签的抗体, 也可以改变排除标记的组合。
值得注意的是, 该协议能够识别人体皮肤中的三个成纤维细胞群体, 这些细胞成纤维细胞群体具有不同的皮内定位、基因表达谱和功能 (图 4)。FAP+cd90-在状真皮中富集 , 而 fap+cd90+和 fap - cd90+在网状真皮中更为丰富 (图 4 a) .这三个亚群在细胞培养中分类后都表现出典型的成纤维细胞形态 (图 4b)。有趣的是, 他们在分化为脂肪细胞的能力方面存在差异, 脂肪细胞是网状成纤维细胞的标志。将这些结果与通过实时聚合酶链反应 (RT-PCR) 16 (图 4c)进行基因表达谱相结合, 显示 fap+cd90细胞表达了高水平的标记, 通常归因于状成纤维细胞如 CD26 、 NTN 和 PDPN而cd90 + 细胞在高水平表达已知的网状标记 , 如 CD36 、 ACTA2 和pparγ,我们得出结论 , fap+cd90 - 细胞属于状细胞和 cd90+细胞属于网状谱系。

图 1: 从完整的人皮肤中分离皮肤单细胞悬浮液.(A) 皮肤用电皮肤切割成状和网状真皮。(B) 与相邻表皮的状真皮为300μm ( 上 ) , 而上网状真皮为 700 微米厚 ( 底部 ) 。(C) 皮下脂肪层用手术刀刮掉下网状真皮。(D) 在37°c 的离解酶溶液中孵育后 1小时, 可以很容易地用钳子去除表皮。(E) 不同的真皮层被剪刀粉碎, 并转移到由胶原酶 i、II 和 iv 以及透明质酸酶组成的酶消化混合物中。(F) 在37°c 下分离1小时后, 组织消化停止, 并通过茶过滤器浇注悬浮液, 以去除未消化的皮肤碎片。(G) 细胞悬浮液通过70μm 电池过滤器再次过滤, 并在4°c 时在 500 x x g下离心 10分钟 (h), 细胞颗粒用 1x PBS 清洗, 采用 10% FCS, 并可进行 facs 染色。请点击这里查看此图的较大版本.

图 2 : 将人的皮肤真皮与皮肤科分离成状和网状层 .显示通过将全厚度皮肤切割成状真皮 ( 包括表皮 ; 0 \ u2012300 ; 真皮层 1 ) 、上网状 ( 3002201 千μm ; 真皮层 2 ) 和下网状真皮 ( & gt ; 1 , 000 μm ; 真皮层 3 ) 而获得的三个真皮层的方案 , 其带皮肤科。请点击这里查看此图的较大版本.

图 3: 人真皮成纤维细胞亚群的流式细胞仪门控策略.(A\ u2012e)首先, 细胞在单个 (b) 和活 (dapi-)细胞 (c) 上被门控。免疫细胞 (CD45+)、间充质干细胞 (cd106+)、红细胞 (cd235ab+) 被排除 (c) 和太平洋蓝色阴性细胞进一步被门控在 E-CADHERIN (ecad) 和 itga6 双阴性细胞 (pe 通道, d).E-钙粘蛋白和 ITGA6 是表皮细胞上表达的标记物。接下来, CD31-FITC 阳性细胞 (内皮细胞和淋巴细胞) 被排除在外 (d), 导致三个成纤维细胞群表达两个细胞表面成纤维细胞标记 FAP 和 cd90:fap+ cd90-,Fap+cd90+和 fa-cd90+ (e).请点击这里查看此图的较大版本.

图 4: FAP+cd90-、fap+cd90+和 fa-cd90+成纤维细胞在皮肤定位、基因表达和功能方面存在差异.(A) 从状、上网状和下网状真皮中分离的门控成纤维细胞的代表性流式细胞仪图。列分策略在图 3中进行了说明。脂肪+cd90 -成纤维细胞在状真皮富集 ( 19 . 2% )与下网状真皮相比 (0.83)。FAP+cd90+细胞可以在整个真皮中找到, 但它们的最高丰度是在上网状真皮 (40.7)。FAP-CD90+在下网状真皮中富集 (64.4%).(B) 值得注意的是, 所有三个分类的亚群在培养 7天 (左) 时都会显示典型的成纤维细胞形态。有趣的是, 它们在脂肪生成试验中的行为不同。培养14天后, FAP+cd90-不分化为脂肪细胞, 而 fap+cd90 +和 fap-cd90+容易发生脂肪生成 (右;油红色 O 污渍含脂细胞红色)。标度条 = 1 , 000μm(c) 直接排序的 fap+ cd90 - 成纤维细胞表示状成纤维细胞标记 CD26 、 NTN1 和 PDPN , 而 FAP - CD90+细胞表示 Cd36 、 acta2 和pparγ , 已知为由网状血统表示。* p ≤0.05;与 FAP+/cd90 细胞相比, p≤0.0005;# p ≤0.05;# # p≤0.0005 与 Fap-/cd90+细胞相比.请点击这里查看此图的较大版本.
作者没有什么可透露的。
这份手稿描述了一种基于 fac 的从人的皮肤中分离状和网状成纤维细胞的协议。它规避了体外培养, 这是不可避免的与常用的隔离协议通过外植体培养。所产生的成纤维细胞亚群功能不同, 在真皮内显示出不同的基因表达和定位。
我们感谢 Bärbel Reininger 和 Wolfgang Bauer 在 fns 分拣方面提供的协助。这项工作得到了奥地利科学基金 (FWF:V 525-B28) 和欧洲生化协会联合会 (FEBS, 后续研究基金) 向 b. m. l. 提供的赠款的支持。S. F. 是奥地利科学院 (OeAW) doc 研究金的获得者。我们感谢维也纳医科大学核心设施的大力支持。我们感谢 Bernhard Gesslbauer、Christine Radtke 和 Martin Vierhapper 提供的人体皮肤材料。
| <强>材质:强> | |||
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌 | Sigma | I5879 | |
| 氯化铵 | Sigma | 9718 | 用于自制的 ACK 裂解缓冲液 |
| Amniomax-C100 (1x) 基础培养基 | Gibco | 17001-074 | 用于成纤维细胞生长培养基 |
| &β;-巯基乙醇 | Scharlau | ME0095 | 注意 |
| C100 补充剂 | Thermo Scientific | 12556015 | 用于成纤维细胞生长培养基 |
| 胶原酶 I | Thermo Scientific | 17100017 | 注意 |
| 胶原酶 II | Gibco | 17101015 | 注意 |
| 胶原酶 IV | Sigma | C5138 | 注意 |
| DAPI | Thermo Scientific | 62248 | |
| 地塞米松 | Sigma | D8893 | |
| 分散酶 II | 罗氏 | 4942078001 | 注意 |
| Dulbecco's 改良 Eagle 培养基 + GlutaMAX | Gibco | 31966-021 | |
| EDTA 二钠盐 | Sigma | E1644 | 用于自制 ACK 裂解缓冲液 |
| 胎牛血清(热灭活) | Gibco | 10500-064 | |
| 透明质酸酶 | Sigma | H4272 | 注意 |
| 胰岛素 | Sigma | I5500 | |
| 异丙醇 | Merck | 1,096,341,011 | |
| OilRed O | Sigma | O-0625 | |
| 多聚甲醛 Sigma | 158127 | 注意 致癌性。对皮肤和眼睛有刺激性。小心处理。 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15070-063 | |
| 不含 Ca2+ 的磷酸盐缓冲盐水Mg2+ | Lonza | BE17-512F | |
| 碳酸氢钾 | Sigma | 237205 | 用于自制 ACK 裂解缓冲液 |
| PureLink RNA MicroKit | Invitrogen | 12183-016 | |
| SuperScript III 第一链合成 qRT-PCR | 专用 SuperMix Invitrogen | 11752 | |
| Taqman 2x 通用 PCR 预混液 | Applied Biosystems | 4324018 | 注意 对皮肤和眼睛有刺激性。 |
| 曲格列酮 | Sigma | T2573 | |
| 名称 | Company | 目录号 | 评论< |
| strong>流式细胞术抗体: | |||
| anti 人 CD31-AF488 | Biolegend | 303109 | 稀释度:1:30,批次:B213986,RRID:AB_493075 |
| 抗人CD45-Pacific blue | Biolegend | 304029 | 稀释度:1:20,批次:B218608,RRID:AB_2174123 |
| 抗人CD49f/ITGA6-PE | Serotec | MCA699PE | 稀释度:1:20,批次:0109,RRID:AB_566833 |
| 抗人CD90/Thy-1-AF700 | Biolegend | 328120 | 稀释度:1:30,批号:B217250,RRID:AB_2203302 |
| 抗人CD106-AF421 | BD | 744309 | 稀释度:1:100,批次:7170537,RRID:x |
| 抗人 CD235ab-Pacific blue | Biolegend | 306611 | 稀释度:1:1000,批次:B224563,RRID:AB_2248153 |
| 抗人 E-钙粘蛋白-PE | Biolegend | 147304 | 稀释度:1:20,批次:B197481,RRID:AB_2563040 |
| 抗人 FAP-APC | R&D | FAB3715A | 稀释度:1:20,批次:AEHI0117111,RRID:x |
| 人 TruStain FcX | Biolegend | 422302 | 稀释度:1:20,批次:B235080,RRID:x |
| 名称 | Company | 目录号 | 评论 |
| 设备: | |||
| 1.4 mL 微量离心管 | Thermo Scientific | 4140 | |
| 1.5 mL 螺口盖微量离心管 | Sarstedt | 72,692,405 | |
| 5 mL 聚苯乙烯圆底管,带细胞过滤器盖 | Falcon | 352235 | |
| 48 孔细胞培养簇 | Costar | 3548,50 | |
| mL 聚丙烯经典管 | Falcon | 352070 | |
| 70 µm 细胞过滤器尼龙 | Falcon | 352350 | |
| Aesculap Acculan 3Ti Dermatome | VWR | AESCGA670 | |
| Aesculap Dermatome 刀片 | VWR | AESCGB228R | |
| MicroAmp Fast 光学 96 孔 | Applied Biosystems | 4346906 | |
| 原代细胞培养皿 | Corning | 353803 | |
| 手术刀刀片 | FST | 10022-00 | |
| 滤茶 | 器x | x | |
| 名称 | 公司 | >目录号 | 评论 |
| >成纤维细胞生长培养基: | |||
| 含 AmnioMAX C-100 添加剂的 AmnioMAX 基础培养基, 10% FCS 和 1% P/S |