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微波辅助下利用过渡金属催化的酮类化合物直接杂芳基化反应

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10.3791/60441

2020年2月16日

本文内容

摘要

杂芳基化合物是有机合成、药物化学和生物化学中重要的分子。利用钯催化进行微波辅助的杂芳基化反应,可提供一种将杂芳基直接连接到酮类底物上的快速高效方法。

摘要

杂芳基化反应可将杂芳基片段引入有机分子中。尽管已有大量通过过渡金属催化的芳基化反应被报道,但直接杂芳基化的相关文献仍较为稀少。由于氮、硫和氧等杂原子的存在,常导致催化剂中毒、产物分解等问题,使得杂芳基化成为一个具有挑战性的研究领域。本实验方案详细描述了一种在微波辐射条件下高效实现酮类化合物α位C(sp³)直接杂芳基化的方法。成功实现杂芳基化的关键因素包括使用XPhos Palladacycle Gen. 4催化剂、过量碱以抑制副反应,以及在密闭反应小瓶中通过微波辐照所达到的高温和高压条件。通过该方法制备的杂芳基化产物均经过核磁共振氢谱(1H NMR)、核磁共振碳谱(13C NMR)和高分辨质谱(HRMS)的全面表征。与已有文献方法相比,该方法具有多种优势,包括广泛的底物适用范围、反应时间短、更环保的工艺,以及无需制备如硅基烯醇醚等中间体所带来的操作简便性。该实验方案的潜在应用包括但不限于:面向多样性导向合成以发现生物活性小分子、用于天然产物制备的串联合成,以及新型过渡金属催化体系中配体的开发。

引言

微波通过离子传导或偶极极化与物质相互作用,实现快速且均匀的加热。自1986年首次报道利用微波实现快速有机合成以来,微波辅助有机反应在科研实验室中日益受到重视。1尽管微波加热的确切本质尚不明确,且是否存在微波特有效应 "非热的" 微波效应仍存在争议,但已观察并报道了微波辅助有机反应的显著速率提升2有报道称,在微波辐射条件下,通常需要数小时或数天才完成的缓慢反应可在数分钟内完成。3,4,5,6一些需要高活化能的困难有机反应,例如环化反应和空间位阻位点的构建,据报道在微波辐射条件下能够成功进行,并且反应产率和纯度均得到提高。7结合无溶剂反应和串联反应等其他特点,微波辅助有机合成在绿色反应设计中具有无与伦比的优势。

与其已被广泛研究的芳基化反应类似物不同,杂芳基化反应,尤其是羰基化合物α位C(sp3)上的杂芳基化反应,在文献中鲜有报道8,9,10。目前已报道的羰基化合物α位杂芳基化反应存在诸多局限性,例如需要化学计量的催化剂、底物适用范围窄以及需分离反应中间体等11,12,13。为了使酮的直接α位杂芳基化成为一种通用的方法,仍存在若干挑战亟待解决。首先,杂原子倾向于与过渡金属催化剂配位,导致催化剂中毒14,15。其次,单(杂芳基)化产物中的α-H比原料中的α-H更具酸性,因此容易进一步反应,生成不希望得到的(双杂芳基)化或多(杂芳基)化副产物。第三,羰基化合物的成本通常低于杂芳基化合物,因此使用过量的羰基化合物以推动反应完全在实际操作中是合理的。然而,过量的羰基化合物常常会引起自缩合反应,这是过渡金属催化的羰基化合物α位杂芳基化反应中经常遇到的问题。

在本报告中,我们描述了近期关于利用微波辅助反应方案实现酮类化合物直接α-C(sp3)杂芳基化的研究。为应对上述第一个挑战——催化剂中毒问题,我们采用了强配位且空间位阻较大的配体,以最大限度地减少杂原子对催化剂的毒化作用。同时,大位阻配体也有望减缓如(双杂芳基)化或(多杂芳基)化16,17等副反应的发生,即前述的第二个挑战。为降低第三个挑战——酮类自身缩合副产物生成的影响,我们使用了超过2当量的碱,以将酮完全转化为相应的烯醇负离子。由于反应时间长、反应温度高,加之直接α-C(sp3)杂芳基化反应本身所特有的诸多挑战,该反应成为微波辅助有机合成研究的理想候选体系。

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方案

注意:

  • 使用配备4 x 24MG5转子的微波反应器时,微波反应瓶的操作压力应低于20 bar。若反应使用了高挥发性溶剂、产生气体,或溶剂可能发生分解,需计算特定反应温度下的压力,以确保反应瓶内的总压力低于20 bar。
  • 本实验方案中采用了有机合成中的标准技术,包括手套箱操作、快速柱色谱和核磁共振(NMR)分析。
  • 实验过程中应穿戴适当的个人防护装备(PPE),包括护目镜、实验服、腈类手套、长裤和封闭式鞋履。
  • 在使用本实验所涉及的化学品之前,应查阅所有化学品的安全技术说明书(SDS),因为部分化学品具有危险性、腐蚀性、毒性或易燃性。
  • 所有化学废弃物应按规定妥善处置于指定的废液或废物容器中。

1. 反应体系的建立

  1. 图1中的示例反应为例,制备苯乙酮与3-碘吡啶反应生成1-苯基-2-(吡啶-3-基)乙酮(化合物1a)时,请使用以下量的试剂。
  2. 将配备搅拌子的微波反应小瓶在烘箱中干燥过夜。使用前,向甲苯中剧烈通入氩气30分钟,以对溶剂进行脱气处理。
  3. 准备在手套箱中使用的试剂和耗材
    1. 准备两支100 µL注射器、四把小药匙、两根玻璃移液管、两个微波密封垫、两个微波盖帽、两个微波搅拌子、至少四张预折叠称量纸、四张Kimwipe纸、四个橡胶圈、两个100 mL烧杯,以及所有必需的反应物和溶剂。
    2. 将微波小瓶、密封垫和盖帽放入其中一个100 mL烧杯中,用一张Kimwipe纸覆盖烧杯口,并用橡胶圈固定Kimwipe纸,防止其脱落。
    3. 将该烧杯及步骤1.3.1中其余物品一同放入转运盒中,送入手套箱工作站。
  4. 将步骤1.3中的试剂和耗材转运至手套箱内。
    1. 在经过惰性气体置换的手套箱内,直接称取115 mg NaOtBu(分子量(MW)96.1,1.2 mmol,2.4当量)加入微波反应小瓶中。
    2. 使用玻璃移液管将一半脱气甲苯(1 mL)加入微波反应小瓶中。
    3. 称取9 mg预催化剂XPhos Pd G4(MW 860.5,0.01 mmol,2 mol%),加入微波小瓶中。用药匙蘸取小瓶中的溶液并轻轻旋转,确保催化剂完全转移。
    4. 使用合适的微升注射器加入64.4 µL苯乙酮(MW 120.15,66.1 mg,0.55 mmol,1.1当量)至微波小瓶中。
    5. 称取103 mg 3-碘吡啶(MW 205.0,0.5 mmol,1.0当量),加入微波小瓶中。
    6. 加入剩余的一半脱气甲苯,使总反应体系体积约为3 mL。
      注意:反应液体积不得超过微波反应小瓶总容量的¾。本实验方案所用标准玻璃小瓶体积为4 mL,推荐反应体积范围为0.3 mL – 3 mL。
    7. 仔细对齐密封垫与盖帽,并将其安装至微波反应小瓶上。盖帽应手动拧紧即可。
    8. 将化学品、耗材及废弃物移出手套箱。

2. 微波辐照

  1. 将组装好的反应小瓶转移至微波反应仪中,并放置在转子的碳化硅(SiC)板上。若使用多个反应小瓶,应将其均匀分布在转子的四个碳化硅(SiC)板上。
  2. 参数设置
    注意:最重要的参数包括红外(IR)传感器温度上限、微波功率和反应时间。
    1. 将红外(IR)传感器温度上限设定为 113 °C。
      注意:由于样品与反应容器外壁之间存在不可避免的温度梯度,红外传感器测得的温度通常低于反应液的实际温度。两者之间存在线性关系:IR T (°C) = 反应 T (°C)/1.152。当红外传感器温度为 113 °C 时,根据上述公式,实际反应温度将达到 130 °C。
    2. 为每一步设定微波功率和时间:
      步骤 1:功率爬升 = 1300 W,10 分钟,风扇等级 = 1,搅拌器 = 高速
      步骤 2:功率保持 = 1300 W,10 分钟,风扇等级 = 1,搅拌器 = 高速
      步骤 3:冷却至 = 60 °C,风扇等级 = 3
      注意:当实际反应温度达到目标温度时,微波功率将自动调节。
  3. 在微波辐射条件下进行反应。记录实际的反应时间和温度。

3. 产物分离

  1. 待微波反应小瓶冷却至室温后,用少量乙酸乙酯(EtOAc)将反应混合物转移至分液漏斗中。
  2. 采用酸碱萃取法分离粗产物。
    1. 向分液漏斗中加入 2 mL 饱和 NH4Cl 溶液。
    2. 向分液漏斗中加入 10 mL EtOAc,萃取产物。分离有机相,并将其保存至洁净干燥的烧杯中。重复萃取两次,合并所有有机相。
    3. 用无水 Na2SO4 干燥合并后的有机相,持续 20 分钟。
    4. 将澄清溶液倾入圆底烧瓶中,减压下通过旋转蒸发除去溶剂,得到粗产物。
    5. 记录粗产物的形态、颜色和质量。
  3. 对粗产物进行 1H 和 13C 核磁共振(NMR)谱分析,以确认预期产物特征峰的存在。
  4. 将用于 NMR 测试的粗产物与其余粗产物合并,用于后续的快速柱色谱纯化。
  5. 采用自动快速柱色谱法纯化最终产物。
    1. 上样:将粗产物溶于 1–2 mL 丙酮中,随后加入 1.5 g 硅胶制成浆状。小心使用旋转蒸发仪彻底除去丙酮,使产物吸附在硅胶上。将所得硅胶转移至空的快速柱色谱上样 cartridge 中。
    2. 组装上样 cartridge、预装柱、试管架和溶剂管路,连接至自动中压液相色谱(MPLC)系统。
    3. 设置 MPLC 系统的溶剂梯度及其他参数,运行快速柱色谱。
      注:自动快速柱色谱的溶剂梯度建议根据杂芳基产物的结构特征选择:
      1) 若产物含有一个或零个氮原子(N)或羟基(OH),使用 EtOAc/正己烷(0% 至 100%,12 分钟内),并在 100% EtOAc 条件下延长洗脱 2–6 分钟。
      2) 若产物含有两个或更多氮原子(N)或羟基(OH),使用 CH3OH/CH2Cl2(0% 至 30%,12 分钟内),并在 30% CH3OH 条件下延长洗脱 1–3 分钟。
    4. 合并目标 MPLC 馏分,蒸发溶剂以收集纯产物。将纯化产物在高真空下干燥至少 1 小时,以除去残留溶剂。

4. 产品表征

  1. 称取5 - 10 mg最终纯化产物,溶于氘代氯仿(CDCl3)(或其他合适的氘代溶剂)中,测定1H NMR谱。
  2. 称取10 - 30 mg最终纯化产物,溶于CDCl3(或其他合适的氘代溶剂)中,测定13C NMR谱。
  3. 分析核磁共振谱图以确认产物结构。
  4. 通过蒸发溶剂,将核磁共振样品回收至1 dram小瓶中。
  5. 当核磁共振谱图支持结构正确后,提交1 mg样品进行高分辨质谱(HRMS)检测,以确认分子式。

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结果

利用这种高效的微波辅助方案,可实现酮类化合物的直接α-C(sp3)杂芳基化。本研究中合成的部分杂芳基酮类化合物示例如图1所示。具体而言,化合物1a被合成并分离为淡黄色油状物(0.49 mmol,192 mg,98%)。其1H和13C NMR谱图如图2所示,用于确认其结构和纯度。1H谱图中δ 4.26 ppm处出现的两质子单峰信号,证实了酮α碳与杂芳基卤化物之间成功发生了C-C偶联反应。所有合成的杂芳基化合物的结构均通过1H NMR、13C NMR和HRMS18确认。

在使用非极性或弱极性溶剂进行微波辅助有机反应时,最大的挑战是将反应温度提升至所需范围。本研究中所用的微波反应器具备若干独特功能,可有效实现这一目标。首先,该反应器配备了四块碳化硅(SiC)板(

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讨论

本文所述方法旨在获取有价值的合成砌块——杂芳基化合物。与以往文献报道的杂芳基化反应相比,本研究所采用的催化体系具有多项显著优势。首先,该方法无需使用保护基团,无需分离活性中间体,无需化学计量的催化剂,且反应时间较短11,17。其次,碳化硅(SiC)板为面向多样性药物发现的平行合成提供了良好机会19。理论上,可在微波辐照条件下同时进行多达96个反应,每个反应规模为0.5 – 1 mmol。实际操作中,限制因素主要在于各反应的后处理与纯化步骤。第三,该方法符合绿色化学的多项原则,包括节能设计、催化反应、减少化学废物产生等21。因此,这是一种更为环境友好的构建重要分子实体的方法。

本实验方案涉及多个步骤,且有许多因素可能影响反应结果(例如催化剂、配体、碱、溶剂、温度和时间)。本方案中的关键步骤如下:(1)催化剂的选择及催化剂的添加。我们优化反应条件的起点是筛选多种催化剂。XPh...

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

感谢美国化学会石油研究基金的捐赠者对本研究提供的资助(PRF# 54968-UR1)。本工作还得到了美国国家科学基金会(CHE-1760393)的支持。我们衷心感谢北肯塔基大学科学与数学整合中心、北肯塔基大学STEM国际研究项目以及化学与生物化学系提供的资金和后勤支持。同时,我们感谢伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校化学科学学院质谱实验室协助获取高分辨质谱(HRMS)数据。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
氘代氯仿(99.8%以上原子D)Acros OrganicsAC209561000含0.03 v/v% TMS
CombiFlash Rf 快速色谱系统Teledyne Isco自动化快速色谱系统
CombiFlash 固相加载柱(5克)Teledyne Isco69-3873-235一次性使用
CombiFlash 预装柱(4克)Teledyne Isco69-2203-304RediSep Rf 硅胶 40-60 µm,一次性使用
微波反应器 - Multiwave ProAnton Paar108041微波反应器
微波反应器转子 4X24 MG5Anton Paar79114用于平行有机合成,配备4个SiC深孔板24孔
微波反应小瓶Wheaton® 玻璃224882一次性使用,13-425,15×46 mm,反应液体积0.3–3.0 mL,工作压力20 bar
微波反应小瓶密封垫,成套Anton Paar41186聚四氟乙烯(Teflon)材质;一次性使用
微波反应小瓶螺口盖Anton Paar41188聚醚醚酮(PEEK)材质;可永久重复使用
微波反应小瓶搅拌子CTechGlassS00001-0000磁性,聚四氟乙烯(PTFE)涂层,长度9 mm,直径3 mm(每包5个)
NaOtBuSigma-Aldrich703788储存于氮气氛围手套箱中
核磁共振波谱仪Joel500 MHz 波谱仪
硅胶Teledyne Isco60539447840–60 微米,60 埃
甲苯Sigma-Aldrich244511使用前用氩气剧烈吹扫2小时
XPhos 钯环催化剂第4代STREM46-0327储存于氮气氛围手套箱中
多种酮类化合物Sigma-Aldrich 或 Fisher 或 Ark Pharm.用于杂芳基化反应的底物
多种杂芳基卤化物Sigma-Aldrich 或 Fisher 或 Ark Pharm.用于杂芳基化反应的底物

参考文献

  1. Gedye, R. The use of microwave ovens for rapid organic synthesis. Tetrahedron Letters. 27 (3), 279-282 (1986).
  2. Garbacia, S., Desai, B., Lavastre, O., Kappe, C. O. Microwave-Assisted Ring-Closing Metathesis Revisited. On the Question of the Nonthermal Microwave Effect. The Journal of Organic Chemistry. 68 (23), 9136-9139 (2003).
  3. Amato, E., et al. Investigation of fluorinated and bifunctionalized 3-phenylchroman-4-one (isoflavanone) aromatase inhibitors. Bioorganic & Medicinal Chemistry. 22 (1), 126-134 (2014).
  4. Bonfield, K., et al. Development of a new class of aromatase inhibitors: Design, synthesis and inhibitory activity of 3-phenylchroman-4-one (isoflavanone) derivatives. Bioorganic & Medicinal Chemistry. 20 (8), 2603-2613 (2012).
  5. Yılmaz, F., Mentese, E. A Rapid Protocol for the Synthesis of N-[2-(alkyl/aryl)-4-phenyl-1Himidazol-1-yl] benzamides via Microwave Technique. Current Microwave Chemistry. 1 (1), 47-51 (2014).
  6. Xia, Y., Chen, L. Y., Lv, S., Sun, Z., Wang, B. Microwave-Assisted or Cu-NHC-Catalyzed Cycloaddition of Azido-Disubstituted Alkynes: Bifurcation of Reaction Pathways. The Journal of Organic Chemistry. 79 (20), 9818-9825 (2014).
  7. Lei, C., Jin, X., Zhou, J. S. Palladium-Catalyzed Heteroarylation and Concomitant ortho-Alkylation of Aryl Iodides. Angewandte Chemie International Edition. 54 (45), 13397-13400 (2015).
  8. Muratake, H., Hayakawa, A., Nataume, M. A Novel Phenol-Forming Reaction for Preparation of Benzene, Furan, and Thiophene Analogs of CC-1065/Duocarmycin Pharmacophores. Tetrahedron Letters. 38 (43), 7577(1997).
  9. Viciu, M. S., Germaneau, R. F., Nolan, S. P. Well-Defined, Air-Stable (NHC)Pd(Allyl)Cl (NHC=N-Heterocyclic Carbene) Catalysts for the Arylation of Ketones. Organic Letters. 23 (4), 4053-4056 (2002).
  10. Biscoe, M. R., Buchwald, S. L. Selective Monoarylation of Acetate Esters and Aryl Methyl Ketones Using Aryl Chlorides. Organic Letters. 11 (8), 1773-1775 (2009).
  11. Chobanian, H. R., Liu, P., Chioda, M. D., Guo, Y., Lin, L. S. A facile, microwave-assisted, palladium-catalyzed arylation of acetone. Tetrahedron Letters. 48 (7), 1213-1216 (2007).
  12. Amat, M., Hadida, S., Pshenichnyi, G., Bosch, J. Palladium(0)-Catalyzed Heteroarylation of 2- and 3-Indolylzinc Derivatives. An Efficient General Method for the Preparation of (2-Pyridyl)indoles and Their Application to Indole Alkaloid Synthesis. The Journal of Organic Chemistry. 62 (10), 3158-3175 (1997).
  13. Tennant, G. J., Wallis, C. W., Weaver C, G. Synthesis of the first examples of the imidazo[4,5-c]isoxazole ring system. Journal of the Chemical Society, Perkin Transactions. 1, 817-826 (1999).
  14. Spergel, S. H., Okoro, D. R., Pitts, W. One-Pot Synthesis of Azaindoles via Palladium-Catalyzed α-Heteroarylation of Ketone Enolates. The Journal of Organic Chemistry. 75 (15), 5316-5319 (2010).
  15. Jiang, Y., Liang, G., Zhang, C., Loh, T. P. Palladium-Catalyzed C-S Bond Formation of Stable Enamines with Arene/Alkanethiols: Highly Regioselective Synthesis of β-Amino Sulfides. European Journal of Organic Chemistry. 2016 (20), 3326-3330 (2016).
  16. King, S. M., Buchwald, S. L. Development of a Method for the N-Arylation of Amino Acid Esters with Aryl Triflates. Organic Letters. 18 (16), 4128-4131 (2016).
  17. Ge, S., Hartwig, J. F. Nickel-catalyzed asymmetric alpha-arylation and heteroarylation of ketones with chloroarenes: effect of halide on selectivity, oxidation state, and room-temperature reactions. The Journal of the American Chemical Society. 133 (41), 16330-16333 (2011).
  18. Quillen, A., et al. Palladium-Catalyzed Direct α-C(sp3) Heteroarylation of Ketones under Microwave Irradiation. The Journal of Organic Chemistry. 84 (12), 7652-7663 (2019).
  19. Kremsner, J. M., Kappe, C. O. Silicon Carbide Passive Heating Elements in Microwave-Assisted Organic Synthesis - SI. The Journal of Organic Chemistry. 71 (12), 4651-4658 (2006).
  20. Dortmund Data Bank (DDB). Saturated Vapor Pressure. , http://ddbonline.ddbst.com/AntoineCalculation/AntoineCalculationCGI.exe (2019).
  21. Erythropel, H. C., et al. The Green ChemisTREE: 20 years after taking root with the 12 principles. Green Chemistry. 20 (9), 1929-1961 (2018).
  22. Barge, A., Tagliapietra, S., Tei, L., Cintas, P., Cravotto, G. Pd-catalyzed reactions promoted by ultrasound and/or microwave irradiation. Current Organic Chemistry. 12 (18), 1588-1612 (2008).
  23. Kimura, M., Mukai, R., Tanigawa, N., Tanaka, S., Tamaru, Y. Triethylborane as an efficient promoter for palladium-catalyzed allylation of active methylene compounds with allyl alcohols. Tetrahedron. 59 (39), 7767-7777 (2003).

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Csp3 XPhos 13

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