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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
新鲜切除的人类乳腺癌肿瘤的特点是使用太赫兹光谱和成像遵循新鲜的组织处理协议。组织定位被考虑在内,以实现有效的表征,同时及时为将来的术中应用提供分析。
本手稿提供了一个协议,使用脉冲太赫兹成像和光谱技术处理、描述和成像新切除的人类乳腺肿瘤。该协议涉及在正常入射处的太赫兹传输模式和斜角为30°的太赫兹反射模式。收集的实验数据表示电场的时域脉冲。通过切除组织上的固定点传输的太赫兹电场信号通过分析模型进行处理,以提取组织的折射率和吸收系数。利用步进电机扫描仪,从肿瘤的每个像素反射出太赫兹发射脉冲,提供不同组织区域的平面图像。图像可以在时间或频域中显示。此外,利用每个像素的折射率和吸收系数的提取数据,提供肿瘤的图谱太赫兹图像。该协议表明癌组织和健康组织之间的明显区别。另一方面,由于肿瘤表面存在气泡和液体,不遵守协议可能会导致图像发出嘈杂或不准确。该协议提供了一种乳腺肿瘤的手术边缘评估方法。
在过去的十年里,Terahertz (THz) 成像和光谱学一直是一个快速增长的研究领域。在 0.1-4 THz 范围内持续开发更高效、更一致的 THz 发射器,使得其应用显著增长1。THz 已显示出希望和显著增长的一个领域是生物医学领域2。THz辐射已被证明是非电离和生物安全在功率水平通常用于分析固定组织3。因此,THz成像和光谱学被用来分类和区分各种组织特征,如含水量,以指示烧伤损伤和愈合4,肝硬化5,和癌症在切除组织6,6,7。癌症评估特别涵盖广泛的潜在的临床和外科应用,并已调查脑8,肝脏9,卵巢10,胃肠道11,和乳房7,12,13,14,15,16,17,18,1912,13,14,15,16,17,18的19癌症。7
THz乳腺癌的应用主要侧重于通过保证金评估支持乳房保护手术或乳房切除术。乳房切除术的目的是切除肿瘤和周围健康组织的一小层,与切除整个乳房的全乳房切除术形成鲜明对比。切除组织的手术边缘通过病理学进行评估,一旦样品固定在正式内,切片,嵌入石蜡,并安装在显微镜幻灯片上的4 μm×5μm切片。这个过程可能非常耗时,如果观察到正差值20,则需要稍后进行二次外科手术。美国放射肿瘤学会目前的指导方针将这种正差定义为癌细胞接触表面边缘墨水21。高吸收水合组织的THz成像主要限于表面成像,根据组织类型进行一些不同的穿透,足以满足快速边缘评估的手术需求。快速分析手术设置期间的保证金条件将大大降低手术费用和后续手术率。迄今为止,THz已被证明在区分癌症和健康组织在正式固定,石蜡嵌入(FFPE)组织的有效,但需要额外的调查,以提供可靠的癌症检测在新鲜切除的组织7。
该协议详细介绍了对从生物库获得的新切除人体组织样本进行THz成像和光谱的步骤。建立在新鲜切除的人类乳腺癌组织的THz应用很少用于发表的研究77,18,22,23,18,22,23特别是由研究组不与医院整合。使用新切除组织在其他癌症应用中同样罕见,大多数非乳腺癌的例子都报道了结肠癌24,25。24,原因之一是FFPE组织块比新切除的组织更容易获得和处理,除非用于研究的THz系统是手术工作流程的一部分。同样,大多数商业实验室THz系统不准备处理新鲜组织,而那些确实还处于使用细胞系生长阶段或刚刚开始查看动物模型中切除的组织。要将 THz 应用于术中设置,需要提前为新鲜组织开发成像和表征步骤,以便分析不会干扰执行标准病理学的能力。对于并非本质上意味着术中应用的应用,新鲜组织的表征仍然是一个具有挑战性的步骤,必须加以解决,以在体内应用和分化方面发挥作用。
这项工作的目的是为使用商业 THz 系统的新切除组织 THz 应用提供指南。该协议是在THz成像和光谱系统26为鼠乳腺癌肿瘤13,17,19,17,并13扩展到人类手术组织从生物组197,7,18。虽然该协议是为乳腺癌生成的,但相同的概念可以应用于类似的THz成像系统和其他类型的固体肿瘤癌症,这些癌症在手术中得到治疗,而手术的成功取决于保证金评估27。由于新切除组织上已公布的 THz 结果相当少,这是作者所知的第一部专注于 THz 成像和表征新鲜组织处理协议的工作。
该协议遵循阿肯色大学环境健康和安全部门制定的所有要求。
1. 设置组织处理区域

图1:组织处理区域的设置。请点击此处查看此图形的较大版本。
2. 处理用于THz透镜的新鲜乳腺癌肿瘤
注意事项:在处理任何活组织之前,戴上手套、护目镜、面罩和实验室外套。始终使用实验室钳子来处理组织,避免直接用手触摸它们。所有与密封容器外或扫描阶段外的新组织进行的工作都应在步骤 1.1 中确立的组织处理区域进行。
注:这项工作处理的所有组织都用Dulbecco的改良鹰介质(DMEM)和生物库的抗生素溶液运出。

图 2:用于 THz 透镜测量的肿瘤切片。(A) 大体肿瘤的照片。(B) 从大体积肿瘤切除肿瘤的小部分(0.5 毫米)的照片。(C) 切片肿瘤部分放置在两个石英窗之间的液体样品支架中,带有 0.1 mm 聚四氟乙烯垫片,用于光谱测量。图重新公布从T.鲍曼等人18在得到SPIE的许可。请点击此处查看此图形的较大版本。
3. THz透光测量

图3:THz透光模块设置。(A) 装有传输模块的 THz 型芯室。(B) 液体样品支架的照片。(C) 样品支架放置在芯腔内进行测量。请点击此处查看此图形的较大版本。
4. 处理用于THz反射模式成像的新鲜乳腺癌肿瘤

图4:用于THz成像的新鲜肿瘤样品制备。(A) 肿瘤放在滤纸上晾干。(B) 用纸巾垫放在聚苯乙烯板上的肿瘤,以吸收多余的液体。(C) 肿瘤从下面查看,以跟踪方向并检查气泡。请点击此处查看此图形的较大版本。

图 5:用于反射成像的系统设置。(A) 反射成像模块镜像模块镜像底座。(B) 扫描阶段。请点击此处查看此图形的较大版本。
注:其他厚度和板材适用于步骤 4.5,但应具有均匀的厚度和足够低的吸收,不会妨碍 THz 信号。

图 6:聚苯乙烯板下部和上部接口的 THz 反射。(A) THz 信号事件,并从 1.2 毫米厚的聚苯乙烯板中反射。(B) 测量来自聚苯乙烯的主和次 THz 时域信号。请点击此处查看此图形的较大版本。
5. 为组织病理学程序做准备的新鲜组织后处理

图7:THz成像后肿瘤的后处理。(A) 肿瘤正面朝下放在纸板支架上,并染上组织标记染料。(B) 过滤纸放在肿瘤上并贴上胶带以保持接触。(C) 染色肿瘤固定在纸板上,浸入10%中性缓冲形式溶液中,用副膜密封。请点击此处查看此图形的较大版本。
6. 危险废物处置

图8:生物危险废物袋的照片。请点击此处查看此图形的较大版本。
7. 数据处理以构造 THz 图像


是区域j中的复杂传播系数,其中α是角频率,c是真空中光速,nj是折射率的实际部分,βabs,j是吸收系数18。区域 1 是空气,区域 2 是聚苯乙烯板,区域 3 是组织。8. 利用透射光谱数据提取组织电性能

。*是定义为
的复式折射率,其中 n是折射率的实际部分;c是光速;*是角频率;和αabs是吸收系数15。图9中介绍了根据上述人类乳腺癌肿瘤标本#ND14139从生物库接收的THz成像结果。根据病理报告,#ND14139肿瘤是I/II级渗透导管癌(IDC),通过左乳房结块切除术手术从一名49岁的妇女那里获得。肿瘤的照片如图9A所示,图9B中的病理图像,以及协议中使用方程(1)获得的THz功率光谱图像,如图9C所示。病理图像的评估是由俄克拉荷马州立大学的咨询病理学家完成的。在将THz图像与病理图像关联后,很明显,癌症区域(即图9C中的红色区域)比脂肪区域(即图9C中的蓝色区域)表现出更高的反射率。图9C中靠近癌症中心的蓝色圆圈是由于在成像过程中肿瘤下方存在气泡。
还介绍了基于使用上述模型获取的肿瘤的电像图像,每个像素(共2,477像素)。图9D、9E、9F和9G分别显示了基于肿瘤吸收系数(cm-1)数据(+-图像)和折射率(n-图像)数据的地形图像。随着频率的增加,癌症和脂肪像素的计算吸收系数(cm-1)值增加,癌症像素在两个频率上都显示比脂肪更高的值。相反,两个组织的折射率随着频率的增加而降低。需要注意的是,随着频率的增加,测量相在成像级调平、聚苯乙烯板厚度和步进电机抖动中受到微米级变化的影响。例如,图 9E和9G中观察到的水平线是由于步进电机在扫描过程中引入的小相移,在较低频率下未观察到。

图9:使用THz成像技术对乳腺癌肿瘤#ND14139分析。(A) 肿瘤的照片.(B) 肿瘤的低功耗病理图像。(C) 频率范围内的 THz 功率光谱图像在 0.5 THz 下获得 0.5 THz+1.0 THz.(D) THz 光度吸收系数图像。此图像是使用肿瘤原始反射成像数据中每个像素提取的吸收系数数据构建的。(E) 在 1.0 THz(F) 折射率图像(n- 图像) 获得 0.5 THz 的吸收系数图像.此图像是使用从肿瘤的原始反射成像数据中提取的折射率数据构建的。(G) 折射率图像(n- 图像) 获得在 1.0 THz. 图重新公布从 T. 鲍曼等人18获得获得 SPIE 的许可.请点击此处查看此图形的较大版本。
图 9中讨论的 THz 结果是通过成功遵循所述协议获得的。组织处理不当会导致成像结果误导。例如,图10中的THz成像结果对人类乳腺癌肿瘤#ND10405显示干燥不足的影响。组织中多余的DMEM溶液主导了图10B28中肿瘤的THz功率光谱图像,其高反射与图10A28所示的病理图像无关。这导致了一个假阳性的结果,表明肿瘤中癌症的存在更大。DMEM对水的折射率和吸收系数同样高,如图10C 19和10D 10D19所示,因此强烈建议在成像前正确干燥肿瘤。19

图10:使用滤纸从DMEM溶液中取出的肿瘤成像效果,(A) 肿瘤的低功耗病理图像#ND10405。(B) 在频率范围内肿瘤#ND10405的 THz 功率光谱图像 0.5 THz=1.0 THz. (C) DMEM、PBS 和水的传输折射率图范围为 0.15 THz~3.5 THz.(D ) DMEM 的传输吸收系数 (cm+1)图, PBS和水范围从0.15 THz~3.5 THz.图10A,10B从T.Bowman等人28号重新发布,获得IEEE和图10C的许可,图10D由N.Vohra等人19重新发布,请点击此处查看此图的较大版本。 10B
图11显示了肿瘤#ND11713不遵循协议的另一个例子。在这种情况下,当肿瘤被放置在板上进行成像程序时,聚苯乙烯板和肿瘤之间的气泡没有去除。这导致图11B中THz图像的反射率低,从而无法与图11A中的病理学进行准确的比较。因此,如果将肿瘤放在板上后观察到任何气泡,请用钳子按压肿瘤或抬起肿瘤,轻轻将其滚到聚苯乙烯上,直到气隙被移除。

图11:聚苯乙烯板和肿瘤之间存在气泡引起的THz图像中的伪影。(A) 肿瘤#ND11713的低功耗病理图像。(B) 肿瘤#ND11713的THz功率光谱图像频率范围为0.5~1.0 THz。请点击这里查看此图的较大版本。
同一样品(# ND14139)的透镜光谱结果18如图12所示。肿瘤部分取自点
和
图12A,并按照协议进行特征。根据图12B中的病理图像,两个选定的点都是从肿瘤中的肿瘤组织区域取出来的。图12C、D给出了两个肿瘤部分的提取吸收系数和折射率。这两个点对整个频率范围都表现出良好的一致。图 12C和图12D中的 0.15⁄2 THz 的黑色曲线表示从文献23中获取的数据,用于比较我们作品中获得的结果。

图12:使用THz透镜#ND14139乳腺癌肿瘤的表征。(A) 肿瘤的照片有两个选定点
标记
,从中切割肿瘤的 0.5 毫米厚部分用于传输光谱测量。(B) 肿瘤的低功耗病理图像。(C) 在点
和
下,传输吸收系数 (cm+1)的图范围为 0.15×3.5 THz。(D) 传输折射率图在点
和
时范围为 0.15~3.5 THz。图重新公布从T.鲍曼等人18在得到SPIE的许可。请点击此处查看此图形的较大版本。
提交人声明他们没有利益冲突。
新鲜切除的人类乳腺癌肿瘤的特点是使用太赫兹光谱和成像遵循新鲜的组织处理协议。组织定位被考虑在内,以实现有效的表征,同时及时为将来的术中应用提供分析。
这项工作由国家卫生研究院(NIH)奖(R15CA208798)资助,部分由美国国家科学基金会(NSF)奖1408007资助。脉冲THz系统的资金是通过NSF/MRI奖1228958获得的。我们承认使用国家疾病研究交流会 (NDRI) 在 NIH 赠款 U42OD11158 的支持下采购的纸巾。我们还感谢与俄克拉荷马州立大学俄克拉荷马动物疾病诊断实验室合作,对本工作处理的所有组织进行组织病理学程序。
| 70% 异丙醇 | VWR | 89108-162 | 含有 70% USP 级异丙醇和 30% USP 级去离子水 |
| Alconox 粉末洗涤剂 | VWR | 21835-032 | 浓缩洗涤剂,用于去除玻璃、金属、不锈钢、瓷器、陶瓷、塑料、橡胶和玻璃纤维中的有机污染物 |
| 生物危害袋 | Fisher Scientific | 19-033-712 | Justrite FM批准的生物危害废物容器更换袋 |
| 纸板架 | N/A | N/A | 废弃纸板,用于在福尔马林离心管中浸泡时保持组织成像面的完整 |
| VWR | 10026-078 | 离心管带平盖,锥形底,聚丙烯,无菌,标准线 | |
| 棉签沃尔 | 玛 | 551398298 | Q-tips原始棉签用于染色纸巾 |
| 乙醇 | VWR | 71002-426 | KOPTECH 纯(未变性)无水(200 度/100%) 乙醇 |
| 护目 | 镜VWR | 89130-918 | Kimberly-clark 专业安全眼镜 |
| 口罩 | VWR | 95041-774 | DUKAL Corporation 外科口罩 |
| 滤纸 | Sigma Aldrich | Z240087 | Whatman 1 级纤维素过滤器 |
| 福尔马林溶液 | Sigma Aldrich | HT501128-4L | 10% 中性缓冲福尔马林 |
| 人新鲜切除的肿瘤(滤过性导管癌 (IDC)) | 国家疾病研究交流(NDRI 生物库 | N/A | 与NDRI签署所需肿瘤类型的方案 |
| IRADECON 漂白剂溶液 | VWR | 89234-816 | 预稀释的次氯酸钠漂白剂溶液 |
| KIMTECH SCIENCE 湿巾 | VWR | 21905-026 | Kimberly-clark 专业 Kim 湿巾实验室 |
| 外套 | VWR | 10141-342 | 此目录号适用于中等尺寸外套 |
| 实验室镊子/镊子 | VWR | 82027-388 | 任何实验室镊子都可以使用,只要它不会损坏组织 |
| 液体样品架(两个石英窗,带有 0.1 毫米特氟龙垫片) | TeraView, Ltd | 不适用 | 1 英寸直径和 0.1452 英寸厚的石英窗口 |
| 丁腈手套 | VWR | 82026-426 | 此目录号适用于中等尺寸手套 |
| 氮气瓶 | Airgas | NI UHP300 | 氮气 UHP GR 5.0 尺寸 300 |
| 纸巾 | VWR | 14222-321 | 11 英寸 x 8.78 英寸 片材,1 层 |
| 封口膜 | VWR | 52858-076 | 柔性热塑性塑料。卷起的防水片材与纸张交织,以防止自粘。 |
| 培养皿 | VWR | 470210-568 | VWR 培养皿,可滑动,单板(未分割的底部) |
| 聚苯乙烯板 | 家得宝 | 1S11143A | ~ 10 cm x 10 cm 方形块,从 11" x 14" x 0.05" 防眩光苯乙烯片材上切割 |
| ScanAcquire 软件 | TeraView, Ltd | N/A | 用于太赫兹反射成像测量的系统软件 |
| 不锈钢低矮型刀片 (#4689) | VWR | 25608-964 | Tissue-Tek Accu-Edge 一次性切片机刀片 |
| 不锈钢金属托盘 | 快速医疗 | 10F | Polar Ware 不锈钢医疗器械托盘 |
| 组织标记染料 | Ted Pella, Inc | 黄色染料 #27213-1 红色染料 #27213-2 蓝色染料 #27213-4 | 用于定位送到组织病理学实验室的切除组织样本 |
| TPSSpectra 3000 | TeraView, Ltd | N/A | 太赫兹成像和光谱系统 |
| TPS Spectra 软件 | TeraView, Ltd | N/A | 用于太赫兹透射光谱测量的系统软件 |