本文介绍了一种检测癌细胞培养上清液中犬尿氨酸通路产生的四种不同色氨酸代谢物(犬尿氨酸、3-羟基犬尿氨酸、黄尿酸、3-羟基邻氨基苯甲酸)的实验方案,该方法采用液相色谱串联单四极杆质谱法进行分析。
方法文章
本文介绍了一种检测癌细胞培养上清液中犬尿氨酸通路产生的四种不同色氨酸代谢物(犬尿氨酸、3-羟基犬尿氨酸、黄尿酸、3-羟基邻氨基苯甲酸)的实验方案,该方法采用液相色谱串联单四极杆质谱法进行分析。
犬尿氨酸通路及其代谢产物犬尿氨酸类物质因参与免疫调节和癌症生物学过程而受到越来越多关注。 体外 细胞培养实验常用于研究不同色氨酸代谢物在疾病机制中的作用,并用于测试治疗策略。富含分泌性代谢物和信号分子的细胞培养基可反映色氨酸代谢及其他细胞活动的状态。目前亟需建立新的可靠方法,以实现对复杂细胞培养基中多种犬尿氨酸类物质进行准确定量,从而能够快速、可靠地分析大量样本。该目标可通过液相色谱-质谱联用技术实现。这一强大技术已被广泛应用于临床和科研实验室中的代谢物定量,亦可用于犬尿氨酸类物质的检测。
本文介绍了采用液相色谱串联单四极杆质谱法(LC-SQ)同时测定体外培养癌细胞收集培养基中四种犬尿氨酸代谢物的方法,这四种代谢物分别为犬尿氨酸、3-羟基犬尿氨酸、3-羟基邻氨基苯甲酸和黄尿酸。in vitro 培养的癌细胞。与其它质谱仪相比,单四极杆检测器操作简便且成本较低。在单四极杆质谱分析中,样品产生多个离子,并根据其特定的质荷比(m/z)进行分离,随后采用单离子监测(SIM)模式进行检测。
本文重点阐述了所报道方法的优势并指出了某些不足之处,聚焦于液相色谱-串联质谱(LC-SQ)分析中的关键要素,包括样品制备、色谱分离及质谱分析过程。同时讨论了质量控制、方法校准条件以及基质效应等问题。我们描述了一种简便的应用方式,即使用3-硝基酪氨酸作为所有目标分析物的单一类似物标准品。通过人卵巢癌和乳腺癌细胞的实验验证,所提出的LC-SQ方法 生成可靠的结果,并可进一步应用于其他 体外 细胞模型
犬尿氨酸通路(KP)是人体细胞中色氨酸(Trp)分解代谢的主要途径。肝外细胞中的吲哚胺-2,3-双加氧酶(IDO-1)是KP的第一步限速酶,可将Trp转化为N-甲酰犬尿氨酸1在犬尿氨酸途径(KP)内的后续步骤中生成其他次级代谢产物,即具有多种生物学特性的犬尿氨酸类物质。犬尿氨酸(Kyn)是色氨酸(Trp)分解代谢产生的首个具有毒性的稳定代谢物,可通过与芳烃受体(AhR)结合来调控细胞事件。2随后,Kyn 通过非酶促自发反应或酶催化过程转化为多种分子,生成如 3-羟基犬尿氨酸(3HKyn)、邻氨基苯甲酸(AA)、3-羟基邻氨基苯甲酸(3-HAA)、犬尿喹啉酸(Kyna)和黄尿酸(XA)等代谢产物。另一下游代谢物 2-氨基-3-羧基-6-醛基甲酰基戊二酸(ACMS)可发生非酶促环化反应,生成喹啉酸(QA)或吡啶甲酸(PA)。1最后,QA 进一步转化为烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)+)3,KP 通路的终末代谢物,是一种重要的酶辅因子。某些犬尿氨酸类物质具有神经保护作用,如 Kyna 和 PA,而其他物质,如 3HAA 和 3HKyn,则具有毒性4黄尿酸由3-羟基犬尿氨酸(3HKyn)生成,具有抗氧化和血管舒张特性5. XA 在老化晶状体中积聚,并导致上皮细胞凋亡6. KP,于20世纪中期被描述th 世纪以来,随着其在多种疾病中的作用被证实,该代谢途径受到更多关注。此代谢通路活性增强及部分犬尿氨酸类物质的累积可调节免疫反应,并与多种病理状态相关,如抑郁症、精神分裂症、脑病、HIV、痴呆、肌萎缩侧索硬化症、疟疾、阿尔茨海默病、亨廷顿病和癌症4,7肿瘤微环境和癌细胞中可观察到色氨酸代谢的一些变化2,8此外,犬尿氨酸类物质被视为有前景的疾病标志物9在癌症研究中, 体外 细胞培养模型已得到充分建立,被广泛用于抗癌药物反应的临床前评估10色氨酸代谢物由细胞分泌到培养基中,可通过检测这些代谢物来评估犬尿氨酸通路的状态。因此,有必要建立适当的方法,采用简便、灵活且可靠的实验方案,对多种生物样本中尽可能多的犬尿氨酸通路代谢物进行 simultaneous 检测。
本文介绍了一种通过液相色谱-单级质谱(LC-SQ )同时测定癌细胞培养后培养基中犬尿氨酸代谢途径四种代谢物——Kyn、3HKyn、3HAA和XA的实验方案。在现代分析方法中,与使用Ehrlich试剂的非特异性生化检测方法11,12相比,液相色谱法13,14,15,16更适用于同时检测和定量各色氨酸分解代谢产物。目前已有多种用于人体样本中犬尿氨酸类物质测定的方法, 主要基于配备紫外或荧光检测器的液相色谱技术13,17,18,19。而液相色谱串联质谱检测器(LC-MS)由于具有更高的灵敏度(更低的检测限)、选择性和重复性,似乎更适用于此类分析。
色氨酸代谢物已在人血清、血浆和尿液中被测定13,20,21,22,23,但人们也期望建立适用于其他生物样本(如细胞培养基)的检测方法。此前,已有研究采用液相色谱-质谱法(LC-MS)检测人胶质瘤细胞、单核细胞、树突状细胞或星形胶质细胞经γ-干扰素(IFN-γ)处理后收集的培养基中的色氨酸衍生产物24,25,26。目前亟需建立新的经过验证的检测方案,以实现对癌症模型中不同培养基、细胞类型及处理条件下多种代谢物的评估。
所开发方法的目的 该方法用于在一次分析运行中定量四种主要的犬尿氨酸类物质,以指示犬尿氨酸通路(KP)中的异常情况。本文展示了我们近期发表的定量LC-SQ分析方法中的关键步骤,该方法采用一种内标物(3-硝基酪氨酸,3NT),对细胞培养上清液中选定的具有重要生物学意义的犬尿氨酸类物质进行检测。 体外 培养的人类癌细胞27据我们所知,这是首次采用液相色谱-串联质谱法(LC-SQ)同时定量检测细胞培养基中3-羟基犬尿氨酸(3HKyn)、3-羟基蒽犬尿啉(3HAA)、犬尿氨酸(Kyn)和黄尿酸(XA)的方案。 体外 培养的细胞。经过一些改进后,该方法还可进一步应用于更广泛的细胞培养模型中色氨酸代谢变化的研究。
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1. 3NT、Kyn、3HKyn、3HAA、XA 标准品储备溶液的制备
2. 活性炭处理培养基的制备
3. 配制校准溶液和绘制校准曲线
4. 质量控制(QC)样品的制备
5. 设置液相色谱-质谱系统
6. 构建校准曲线
7. 体外细胞培养及用于分析的样品采集
8. 准备用于液相色谱-质谱分析的样品
9. 蛋白质含量评估与数据标准化
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液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)在生物活性分子的定量分析中具有无可争议的优势,尽管复杂样品中的某些组分可能引起所谓的基质效应,从而干扰分析物的离子化过程。这会导致离子抑制或离子增强,显著降低检测的准确性,并影响LC-MS的检出限/定量限,因此被视为该方法的“薄弱环节”。在本实验方案中,离子通过电喷雾离子化(ESI)在正离子模式下生成,该模式也已被用于其他色氨酸(Trp)代谢物测定的研究中13。然而,与大气压化学离子化(APCI)相比,ESI更容易受到基质效应的影响28。因此,为了准确测定细胞培养基中的Trp代谢物,我们采用了内标法和基质匹配校准法,以补偿基质依赖性效应对分析物信号的影响,并校正样品前处理过程中目标化合物的损失。我们对所有待测分析物(3HKyn、Kyn、3HAA、XA)均使用同一种内标物(3NT)。3NT在用于细胞培养的原始新鲜培养基中未被检出,且在所采用的分析条件下表现出与目标化合物相似的行为,因此3NT是合适的内标物27。此外,为了简化实验流程,使其更易于被广大用户所采用,...
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本文介绍了一种详细的液相色谱-串联质谱(LC-SQ)方法,用于同时定量测定培养基中四种主要的色氨酸代谢物(3HKyn、Kyn、3HAA、XA) 体外 培养的人类癌细胞。分析过程中特别关注样品制备、色谱/质谱操作步骤以及数据解读,这些是整个分析中最关键的环节。
通常,由于液相色谱-质谱(LC-MS)分析具有高灵敏度,因此要求实验方案必须严格规范,并确保所用材料的高纯度。这包括在整个标准操作流程中使用经过彻底清洁和正确清洗的玻璃器皿,以及高纯度的化学试剂。使用新鲜配制的水相流动相溶剂至关重要,以避免微生物污染,此类污染在该高灵敏度检测方法中可能严重影响分析结果。在将样品注入液相色谱系统之前,必须仔细检查样品中是否存在任何不溶性颗粒。需要注意的是,在进行样品分析前,色谱柱必须充分平衡。若未遵守上述规定,可能导致样品、液相色谱系统或分析柱受到污染,或导致质谱离子源中样品离子化不充分,最终引起信号偏移。
为了获得最佳结果,本方案中有两个关键点需要特别强调。其中最关键的步骤是样品制备。采用不适当的处理方法会导致目标化合物...
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作者无任何利益冲突需要披露。
本工作获得了欧洲区域发展基金(European Regional Development Fund)通过2007-2013年东部波兰发展运营计划(Operational Programme Development of Eastern Poland)(项目编号:POPW.01.03.00-06-003/09-00)的资助,以及卢布林若望保禄二世天主教大学生物技术和环境科学学院(Ilona Sadok青年科学家基金)、波兰国家科学中心OPUS13项目(项目编号:2017/25/B/NZ4/01198,负责人:Magdalena Staniszewska)的支持。 作者感谢卢布林若望保禄二世天主教大学跨学科研究中心氧化应激实验室Agnieszka Ścibior教授共享细胞培养和蛋白质定量相关设备。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 3-羟基-DL-犬尿氨酸 | Sigma-Aldrich | H1771 | |
| 3-羟基邻氨基苯甲酸 | Sigma-Aldrich | 148776 | 97% |
| 3-硝基-L-酪氨酸 | Sigma-Aldrich | N7389 | |
| 乙腈 | Supelco | 1.00029 | LC-MS用超纯级LiChrosolv |
| 活性炭 | Supelco | 05105 | 粉末 |
| 分析天平 | Ohaus | ||
| 分析柱 | Agilent Technologies | 959764-902 | Zorbax Eclipse Plus C18快速分离HT(2.1 × 100 mm,1.8 µm) |
| 甲酸铵 | Supelco | 7022 | LC-MS流动相添加剂,LiChropur,≥99.0% |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | 1001887398 | |
| 色谱小瓶瓶盖 | Agilent Technologies | 5185-5820 | 蓝色螺旋盖,PTFE/红色硅胶隔垫 |
| 细胞培养皿 | Nest | 704004 | 聚苯乙烯,无热原,无菌 |
| 细胞培养板 | Biologix | 07-6012 | 12孔,无热原,无细胞毒性,无菌 |
| 细胞培养箱 | Thermo Fisher Scientific | HERAcell 150i Cu | |
| 离心机 | Eppendorf | 型号 5415R | |
| 离心机 | Eppendorf | 型号 5428 | |
| 离心管 | Bionovo | B-2278 | Eppendorf型,1.5 mL |
| 离心管 | Bionovo | B-3693 | Falcon型,50 mL,聚丙烯材质 |
| 色谱数据采集与分析软件 | Agilent Technologies | LC/MSD ChemStation (B.04.03-S92) | |
| 色谱插入式小瓶 | Agilent Technologies | 9301-1387 | 100 µL |
| 色谱小瓶 | Agilent Technologies | 5182-0714 | 2 mL,透明玻璃 |
| 二甲基亚砜 | Supelco | 1.02950 | Uvasol |
| Dubelcco’s改良Eagle’s培养基(DMEM) | PAN Biotech | P04-41450 | |
| 双通道pH/电导率仪 | Mettler Toledo | SevenMulti | |
| 浓缩仪 | Genevac | 型号 EZ-2.3 Elite | |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F9665 | |
| 甲酸 | Supelco | 5.33002 | LC-MS用LiChropur |
| 试剂储存玻璃瓶 | Bionovo | S-2070 | 50 mL,透明玻璃 |
| 保护柱 | Agilent Technologies | 959757-902 | Zorbax Eclipse Plus-C18窄径保护柱(2.1 × 12.5 mm,5 µm) |
| 盐酸 | Merck | 1.00317.1000 | |
| L-犬尿氨酸 | Sigma-Aldrich | K8625 | ≥98%(HPLC) |
| 磁力搅拌器 | Wigo | ES 21 H | |
| 微量天平 | Mettler Toledo | 型号 XP6 | |
| Milli-Q纯水系统 | Millipore | ZRQSVPO30 | Direct-Q 3 UV带泵系统 |
| 四极杆质谱仪 | Agilent Technologies | G1948B | 型号 6120 |
| 青霉素-链霉素 | Sigma-Adrich | 048M4874V | |
| 酶标仪 | Bio Tek | Synergy 2,由Gen5软件控制 | |
| 氯化钾 | Merck | 1.04936.1000 | |
| 磷酸二氢钾 | Merck | 1.05108.0500 | |
| 蛋白检测试剂浓缩液 | BioRad | 500-0006 | |
| 往复式摇床 | Stuart | SSL4 | |
| 移液管 | Nest | 326001 | 5 mL,聚苯乙烯,无热原,无菌 |
| 氯化钠 | Sigma-Aldrich | 7647-14-5 | |
| 磷酸氢二钠 | Merck | 1.06346.1000 | |
| 溶剂入口过滤器 | Agilent Technologies | 5041-2168 | 玻璃滤器,孔径20 μm |
| 溶剂储液瓶(用于LC-MS) | Agilent Technologies | 9301-6524 | 1 L,透明玻璃 |
| 溶剂储液瓶(用于LC-MS) | Agilent Technologies | 9301-6526 | 1 L,棕色玻璃 |
| 电子表格软件 | Microsoft Office | Microsoft Office Excel | |
| 搅拌子 | Bionovo | 6-2003 | 聚四氟乙烯涂层 |
| 用于培养基过滤的注射器滤器 | Bionovo | 7-8803 | 再生纤维素,Ø 30 mm,0.45 µm |
| 用于流动相组分过滤的注射器滤器 | Bionovo | 6-0018 | 尼龙,Ø 30 mm,0.22 µm |
| 组织培养板 | VWR | 10062-900 | 96孔,无菌 |
| 胰蛋白酶-EDTA溶液 | Sigma-Aldrih | T4049-100 mL | |
| 超高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | G1367D, G1379B, G1312B, G1316C | 1200 Infinity系统,包含自动进样器(G1367D)、脱气装置(G1379B)、二元泵(G1312B)、柱温箱(G1316C) |
| 超声波清洗机 | Polsonic | 104533 | 型号 6D |
| 涡旋振荡器 | Biosan | 型号 V-1 plus | |
| 黄尿酸 | Sigma-Aldrich | D120804 | 96% |
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