介绍了一种利用微线圈进行超高场磁共振显微成像(MRM)以高空间分辨率研究生物组织的实验方案。文中提供了微线圈表征的逐步操作指南。最后,以植物根系为例,展示了成像参数的优化过程。
介绍了一种利用微线圈进行超高场磁共振显微成像(MRM)以高空间分辨率研究生物组织的实验方案。文中提供了微线圈表征的逐步操作指南。最后,以植物根系为例,展示了成像参数的优化过程。
本方案描述了一种用于螺线管微线圈与生物样本结合的信噪比(SNR)校准及样本制备方法,适用于高分辨率磁共振成像(MRI),亦称为磁共振显微成像(MRM)。该方法可用于临床前MRI波谱仪,已在 Medicago truncatula 根样品. 微型线圈通过将射频谐振器的尺寸与目标样品的尺寸相匹配,从而在给定的数据采集时间内实现更高的成像分辨率,提高检测灵敏度。由于结构相对简单,螺线管式微型线圈易于构建、成本低廉,并可根据样品需求进行灵活调整。本文系统阐述了如何使用标准参考溶液对新型或自制微型线圈进行校准。校准步骤包括:通过进动曲线确定脉冲功率;评估射频场的均匀性;以及利用标准脉冲序列计算体积归一化的信噪比(SNR)。文中还讨论了小生物样品制备过程中的关键步骤,以及磁化率差异等可能影响成像质量的因素。通过优化后的螺线管线圈,实现了高分辨率(13 × 13 × 13 μm)成像,展示了其在实际应用中的性能。3, 2.2 pL)根样本的三维成像。
磁共振成像是一种多功能工具,可用于无创成像多种生物样本,从人体到单个细胞均可适用1,2,3. 虽然用于医学成像的MRI扫描仪通常使用磁场强度为1.5 T至3 T的磁体,但单细胞应用的成像则在高得多的磁场强度下进行1,3,4将分辨率低于一百微米的样本进行研究称为磁共振显微成像(MRM)5然而,与其它可用的显微或成像技术(如光学显微镜或CT)相比,磁共振显微成像(MRM)的信噪比(SNR)较低。可通过多种方法优化信噪比6一种方法是使用更高的磁场强度,而另一种互补的方法是针对单个样本优化信号检测器。对于后者,检测器的尺寸应调整至与目标样本的尺寸相匹配。对于小型样本,其尺寸应 ≈直径为0.5–2 mm(例如根组织)的样品,使用微线圈是有效的,因为信噪比(SNR)与线圈直径成反比。6,7分辨率高达 7.8 x 7.8 x 15 µm3 使用专用微线圈已在动物细胞上实现8存在多种类型的微线圈,其中平面线圈和螺线管线圈最为常用,具体选择取决于应用需求和组织几何形状9平面线圈在其表面附近具有高灵敏度,适用于薄片样品的成像。例如,已有针对灌注组织成像专门设计的平面微线圈方法被报道。10然而,平面线圈的灵敏度衰减较快,且缺乏明确的参考脉冲功率。而圆柱形的螺线管线圈应用范围更广,更适合较厚的样品。本文介绍了螺线管线圈的特性、用于微线圈磁共振成像(MRI)的样品制备方案,以及螺线管微线圈的校准方法(图1A).
螺线管线圈由导电导线缠绕而成,形似螺旋,围绕着用于盛放样品的毛细管(图1B)。微型线圈组件仅需使用漆包铜线、一组电容器以及适合焊接元件的基底即可制作(图1B主要优势在于其结构简单、成本低廉,同时在单位体积的信噪比性能方面表现良好, B1 磁场均匀性。其构造简便,可快速迭代线圈设计和几何结构。螺线管微线圈设计及探头表征的具体要求(即, 电子学理论、工作台测量以及多种线圈几何结构的波谱仪测量已在其他文献中得到广泛描述7,11,12,13,14.
根据其他地方所述的指南,设计理想尺寸的螺线管线圈时需遵循相应的设计规则15,16在此特定情况下,使用了一个内径为1.5 mm的线圈,该线圈由直径为0.4 mm的漆包铜线绕制在一支外径为1.5 mm的毛细管上制成。该螺线管线圈固定于一块基板上,基板上构建有电路,包括一个调谐电容(2.5 pF)、一个可变匹配电容(1.5–6 pF)以及铜质连接导线图1A,1C)。调谐电容器用于实现950 MHz的所需共振频率,而匹配电容器则用于在50 Ohm阻抗下实现最大信号传输。较大的电容器为可变电容器,以便进行更精细的调节。在常规操作中,调谐和匹配通过探头底座中的电容器完成。组装好的微线圈需安装在探头上,以便插入磁体中。根据系统不同,可能需要额外的支架。本实验采用22.3 T磁体系统,结合Bruker Console Avance III HD与Micro5探头。在此情况下,我们使用了经过改装的支撑插件,配备必要的连接接口以连接到 1探针的H通道图1A).
线圈的磁化率匹配设计包含一个盛有全氟化液体的储液池,以减少因铜线圈与样品距离过近而产生的磁化率不匹配问题17。储液池由塑料注射器制成,用于包裹线圈,并填充Fomblin液体。由于全氟化液体需完全包裹线圈,样品可用直径被限制为外径1 mm。为便于更换样品,样品被置于外径为1 mm、内径为700 µm的毛细管中进行制备。样品制备所需的工具如图2A所示。
基本的实验磁共振参数在很大程度上依赖于所用系统的硬件,包括梯度系统、磁场强度和控制台。可使用多个参数来描述系统性能,其中最具有实际意义的是90°脉冲长度和功率、B1场均匀性以及单位体积信噪比(SNR/mm3)。SNR/mm3可用于在同一系统上比较不同线圈的性能18。尽管不同系统之间可能存在硬件差异,但统一应用基准测试协议也有助于系统性能的比较。
本方案重点介绍校准和样品制备。逐步展示了螺线管式微线圈性能的表征方法:校准90°脉冲长度或功率;评估射频场均匀性;以及计算单位体积信噪比(SNR/mm3)。通过使用模型样品(phantom)进行标准化的自旋回波测量,便于不同线圈设计之间的比较,从而优化特定应用。文中描述了适用于微线圈的模型样品和生物样本的制备方法。该方案可在任何配备商用微成像系统的合适窄孔径(≤60 mm)垂直磁体上实施;对于其他系统,本方案可作为指导,并可根据情况进行适当调整。
进行MRI测量时,生物样本的制备通常不需要过于复杂,因为样本应尽可能保持完整状态成像。然而,生物组织中的空气间隙可能由于磁化率差异而引起图像伪影19。该效应随磁场强度的升高而增强20。因此,在高场强条件下应避免空气间隙,这可能需要将样本浸入液体中,以消除组织周围及组织内部结构中的空气。具体而言,当使用微线圈时,可能需要先切除目标组织样本,随后将其浸入合适的液体中。接着将样本插入预先切割好的毛细管内,最后用毛细管封蜡密封管口。使用蜡作为密封材料而非胶水、火焰封口或其他替代方法,可便于后续轻松取出样本。本操作以豆科小型植物 Medicago truncatula 的根部为例进行演示。该方案的一个优势在于,由于MRI测量过程中样本未被破坏,后续可实现MRI数据与光学显微镜图像的共定位分析。
本方案适用于高空间分辨率的原位测量,更复杂的设计可实现活体样本成像,但需解决与生命支持系统相关的挑战。
注意:本方案描述了内径(ID)为 1.5 mm 的螺线管线圈的使用方法及其特性评估流程(图 1)。用于演示该方案的线圈安装在磁化率匹配的储液池中,但本方案同样适用于未匹配磁化率的线圈。该方案可调整用于其他尺寸及不同的波谱仪装置。
1. 参考样品制备
2. 样品制备
3. 样品的安装
4. 确定线圈特性
(1)
(2)
(3)5. 高分辨率成像
6. 恢复样本以供进一步研究或储存
线圈表征
在成功调节并匹配线圈后,可通过线圈的品质因数(Q因子)、90°参考脉冲以及每立方毫米信噪比(SNR/mm3)来表征其性能。对于本实验中展示的内径为1.5 mm的磁化率匹配螺线管线圈,测得的无负载Q因子为244,而5 mm鸟笼线圈的Q因子为561。
参考文献 90° 脉冲为 12 µs 在0.6 W的功率水平下; 参见 5 µs 在45 W功率下使用5 mm鸟笼线圈(图4 和 图5)。这相当于射频脉冲场强(B1),使用
0.53 mT(微线圈)和1.17 mT(鸟笼线圈)14 其中 y 为旋磁比,tau 为脉冲持续时间。由于脉冲功率水平(P)存在差异,可通过发射效率对线圈进行比较
0.69 mT/W1/2 和 0.18 mT/W1/2 分别用于微线圈和鸟笼线圈14. 通过 a 进行比较 90° 脉冲,微线圈被发现是一个因素 ≈ 比鸟笼线圈灵敏4倍。
磁化率匹配的影响
在超高场强下,样品和线圈的磁化率成为影响图像质量的主要因素,这一点在 图7A,7B与没有磁化率匹配流体储层的线圈相比,参考样品中的信号保持时间更长且更均匀。然而,由于磁化率储层的存在,样品的最大尺寸相较于无储层线圈有所减小。
高分辨率成像
在 20 小时 23 分钟内,获得了 Medicago truncatula 根样本 13 × 13 × 13 μm3 的高分辨率图像(图 8)。从根的表面开始,可见根皮层以及根外部残留的一些水分。此外,木质部呈现为包围韧皮部的深色条带。一些空气腔隙表现为完全无信号的暗斑。
M. truncatula 的共生根瘤也可采用本方案进行成像(图9)。使用稍大的不匹配线圈(长度约3500 µm,内径1500 μm),可在33分钟内获得分辨率达16 × 16 × 16 μm3 的图像。

图1:螺线管式微线圈。(A)螺线管线圈的设计由导线螺旋缠绕而成,通常绕在毛细管周围。导线的几何参数,如其厚度、直径、绕线圈数和线间距,会影响线圈的特性。(B)一种自制的螺线管微线圈,带有用于磁化率匹配液体(Fomblin)的储液池。该线圈由一根直径为0.4 mm的涂覆铜线在外部直径为1500 µm的毛细管上绕制六圈而成,线圈长度为3500 µm。线圈浸没在一个由注射器制成的储液池中。可插入外径最大为1000 µm的样品毛细管。使用两个电容器:一个1.5 pF电容器与电感器串联,另一个可变电容器(1.5–6 pF)与电感器并联。所有元件均焊接在一块玻璃纤维板(黄色)上。该装置安装在一个商用支架(灰色聚合物)上,该支架经过改装以支撑储液池。 (C)螺线管线圈设计的组成部分:1. 螺线管线圈,2. 样品毛细管,3. 1.5 pF调谐电容器,4. 可变匹配电容器,5. 玻璃纤维基板,6. 铜导线引线。请点击此处查看该图的放大版本。

图2:体视显微镜下的样品制备。(A)制备微线圈所需的物品。从左至右:1. CuSO4参比溶液,2. 全氟十氢化萘,3. 微线圈,4. 手术刀,5. 正张力镊子,6. 镊子,7. 毛细管(外径 = 1000 μm),8. 石蜡笔,9. 毛细管封蜡,10. 腈手套,11. 体视显微镜,12. 带培养皿盖的表面皿,13. 生长基质中的植物材料。未显示:2 mL注射器(配ø 0.8 x 40 mm针头)和细纸巾。(B)使用镊子将样品插入毛细管的特写图,操作过程中两者均保持浸没状态。(C)使用熔化石蜡密封毛细管。(D)将制备好的毛细管插入微线圈中。请点击此处查看该图的放大版本。

图3:微型成像探头的组成部分。(A)Micro5探头基座,包含水冷、加热、温度传感器、梯度功率、射频(可见同轴连接器)以及可选的探头识别(PICS)所需的所有连接部件。探头基座下方设有旋钮,可用于调节可变调谐和匹配电容器,同时还配有固定螺钉,用于将探头稳定固定在波谱仪内部。(B)自制微线圈安装在探头基座顶部。注意探头基座上安装的可变电容器(白色陶瓷材质),用于实现调谐与匹配。(C)集成的三轴梯度线圈安装在探头基座上,配有水冷接口以及镀金接地触点。请点击此处查看该图的放大版本。

图4:章动曲线。 通过采集摆动曲线来确定参考脉冲功率。参考脉冲功率(90° 脉冲)定义为产生所需效果所需组合的功率与脉冲长度 B1 将所有可用的纵向磁化完全翻转至横向平面的射频脉冲。在无梯度编码的情况下记录一系列脉冲信号。每次脉冲施加时,脉冲长度或脉冲功率逐步递增。此处脉冲功率设定为 0.6 W,脉冲长度则逐步增加 1 µs 每次。最大信号强度表示 90° 脉冲,周围 12 µs。该 180° 脉冲也可通过最小强度以这种方式确定。 请点击此处以查看此图的放大版本。

图5:90°脉冲功率的可视化确定。通过进动曲线找到近似的参考脉冲功率后,可通过改变脉冲长度进行目视检查。根据线圈的不同,B1 场对变化的敏感程度可能有所差异。(A)11 µs 脉冲长度。(B)12 µs 脉冲长度,对此线圈为最佳。(C)13 µs 脉冲长度。(D)20 µs 脉冲长度。若脉冲功率设置过高,可能发生过度翻转,从而降低线圈中心区域的图像强度(箭头所示)。增强的 B1 场还会扩大线圈的作用范围,这可从图像的宽度上观察到。请点击此处查看该图的放大版本。

图6:感兴趣区域的放置。 可见用于体积归一化信噪比(SNR)计算的感兴趣区域(ROI)。样本平均信号强度取自位于参考溶液样本区域内的一个ROI。平均噪声和标准差则通过计算图像角落中的一个或多个ROI得到。请点击此处查看该图的放大版本。

图7:通过梯度回波成像评估射频均匀性。 采用多梯度回波(MGE)序列,利用一系列梯度回波来评估射频(B1 场)的均匀性。基本参数如下:重复时间200 ms,回波时间3.5 ms,回波数48,回波间隔3.5 ms,信号平均64次,采集时间27分18秒,翻转角30°。视野为5 × 5 mm,矩阵为128 × 128,分辨率为39 × 39 × 200 µm。(A)磁化率匹配线圈。围绕射频线圈的磁化率匹配液体(Fomblin)可减少线圈导线引起的磁化率效应。随着回波时间延长,微小气泡会导致信号丢失。(B)直径相同但未进行磁化率匹配的线圈。在较长回波时间下,可观察到由B0场不均匀性引起的逐渐增加的伪影。请点击此处查看该图的放大版本。

图8:Medicago truncatula 根切片的三维成像。(上图)FLASH图像。可分辨出根切片的多个结构特征,包括表皮(e)、皮层(c)、韧皮部(ph)和木质部(xy)。根部的气隙(a)导致信号完全丢失。基本参数如下:重复时间70 ms,回波时间2.5 ms,累加次数256次,采集时间20小时23分钟。分辨率13 × 13 × 13 µm3。矩阵大小为128 × 64 × 64,视场1.6 × 0.8 × 0.8 mm。接收带宽50 kHz。(下图)MSME图像。基本参数如下:重复时间500 ms,回波时间5.2 ms,累加次数28次,采集时间15小时55分钟。分辨率13 × 13 × 13 µm3。矩阵大小为128 × 64 × 64,视场1.6 × 0.8 × 0.8 mm。接收带宽70 kHz。 请点击此处查看该图的放大版本。

图9:Medicago truncatula 根瘤的三维成像。(上图)低分辨率图像。基本参数如下:重复时间 60 ms,回波时间 2.3 ms,累加次数 4 次,采集时间 4 分钟。分辨率为 31 x 31 x 31 µm3。矩阵大小为 64 x 32 x 32,视场为 2 x 1 x 1 mm。接收带宽 50 kHz。(下图)高分辨率图像。基本参数如下:重复时间 60 ms,回波时间 2.3 ms,累加次数 8 次,采集时间 33 分钟。分辨率为 16 x 16 x 16 µm3。矩阵大小为 128 x 64 x 64,视场为 2 x 1 x 1 mm。接收带宽 50 kHz。 请点击此处查看该图的放大版本。
该方案最适合用于生物样品,因为许多材料和地质样品的 T2 弛豫时间显著更短,无法通过本实验所用的序列进行成像。即使某些表现出较高磁化率异质性的生物组织,在超高场下也难以成像,因为这些效应与磁场强度相关24。该方案不仅适用于新线圈,还可用于排查和诊断潜在问题。在测试新型或未知样品前,可先对参考溶液执行本方案,以验证实验装置是否按预期正常运行。这有助于故障排查,因为可排除波谱仪本身作为伪影或故障来源的可能性。此外,该过程还可将探头上的调谐和匹配电容设置为微线圈典型的数值。
当首次实验未记录到信号时,可扩大定位扫描的视野以检查是否能观察到样品。接着,重新检查线圈是否已正确调谐,并尝试再次进行定位扫描。线圈可能存在额外的非预期共振模式,此时需要确定正确的共振模式。如果仍然无法获得图像,应取出样品检查其在微线圈组件中的位置,并确认样品完好无损(即密封处无气泡或泄漏)。最后,有可能样品制备时误用水代替了全氟化碳(PFD)。在这种情况下,即使样品本身在定位扫描中信号微弱,毛细管周围的水仍可能被检测到。
由于微线圈理想状态下非常接近样品,空气与导线之间的磁化率差异可能导致额外的信号损失,如图所示 图7B潜在的伪影包括空间错配和异常的信号强度变化。尤其是梯度回波类脉冲序列易受这种不均匀信号丢失的影响。因此,我们提出了一种磁化率匹配的线圈,即将导线浸入氟化惰性液体(Fomblin 或 FC-43)中。 B1 本方案中包含的估算方法可用于确定是否 B1 磁化率差异的存在要求在设计线圈组件时纳入磁化率匹配策略。构建磁化率匹配线圈的另一种方法是使用磁化率匹配的导线。25此外,该方法仅解决了由线圈引起的磁化率问题。样品内部的磁化率不匹配(例如,由于空气间隙所致)仍然具有挑战性。
气穴或气泡会带来实验挑战,由于空气与液体或样本界面处的磁化率差异,导致严重的信号丢失19(图5A)。成功制备样本的一个关键环节是确保样本和毛细管均完全浸入液面以下。然而,即使微小的气泡也可能引起信号损失,尤其是梯度回波类序列更为敏感。可通过轻微倾斜毛细管(使其一端略高于另一端)来减轻部分影响。倾斜可使潜在的气泡滞留在较高的一端,从而避免干扰样本。此外,还需确保毛细管封蜡形成良好的密封,因为脱水可能导致形成较大的气泡。
对于样品内部的气隙,采用 PFD 填充细胞间隙中的空气空间,而不会穿透细胞膜26。然而,即使采用这种方法,我们仍无法完全去除所有气隙。此外,这种方法意味着需要引入额外的试剂,而通常出于尽可能非侵入性地研究系统的需求,这种方法并不理想。
毛细管的圆柱形结构意味着灌流装置应当是可行的,尤其适用于易降解的组织,例如活检样本或对活体根系材料中过程的研究。实现灌流装置可分为两个步骤:首先,在毛细管两端分别连接培养基供给管和引流管,即可构建一个恒化器系统;其次,在样品毛细管内增加一个凹陷结构,可使样品在流体流动方向上固定就位。这一点类似于已发表的平面微线圈实验方案10。
磁共振成像的非侵入性,结合本实验方案中使用的惰性液体(PFD 或 Fomblin),意味着实验完成后,样品可从毛细管中取出,用于进一步研究。可结合的技术包括光学显微镜、电子显微镜及其他破坏性成像技术。我们近期已成功将该方法与光学显微镜联用,用于研究Medicago truncatula根瘤27。
我们展示了一种在超高场核磁共振波谱仪上使用专用微线圈对植物材料进行成像的方法。该方法可在射频场均匀性良好的条件下,以高分辨率研究相对较大的样品体积。此外,光谱成像的分辨率可达到常规条件下无法实现的水平。通过一种高效的方法确定线圈性能参数,有助于根据样品特点优化微线圈设计。该螺线管线圈方法也可便捷地应用于植物以外的其他样品,包括动物组织。
作者无任何利益冲突需要披露。
950 MHz仪器上的实验得到了uNMR-NL的支持,uNMR-NL是荷兰由NWO资助的国家大型研究设施国家路线图项目(项目编号184.032.207)。R.S.得到了BioSolarCells联盟项目U2.3的支持。J.R.K.得到了荷兰磁共振研究学校(NMARRS)研究生院[022.005.029]的支持。我们感谢Defeng Shen和Ton Bisseling提供了Medicago truncatula样品。我们还感谢Klaartje Houben、Marie Renault和Johan van der Zwan在uNMR-NL设施中提供的技术支持。我们还要感谢Volker Lehmann、Henny Janssen和Pieter de Waard提供的技术帮助。我们对Frank Vergeldt、John Philippi和Karthick B. Sai Sankar Gupta提供的建议表示衷心感谢。最后,我们感谢Jessica de Ruiter为视频提供了配音。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 参比溶液制备 | |||
| CuSO4 | Sigma-aldrich | 469130 | 用于制备参比溶液的结晶粉末 |
| D2O | Sigma-aldrich | 151882 | 用于制备参比样品的液体 |
| 电子天平 | Sartorius | PRACTUM513-1S | 用于称量化合物的天平 |
| 样品制备 | |||
| 毛细管 1000 μm(外径) | Hilbenberg GmbH | 1408410 | 样品毛细管 |
| 封蜡 | Hampton Research | HR4-328 | 用于密封样品的固体蜡 |
| 一次性手术刀片 | Swann-Morton | No. 11 | 用于切除样品 |
| 全氟十氢化萘 | Sigma-aldrich | P9900 | 用于浸没样品的液体 |
| 体视显微镜 | Olympus | SZ40 | 台式双目显微镜 |
| 注射器 | 通用 | - | 用于添加PFD并操作样品 |
| 真空泵 | Vacuubrand | MZ2C | 两级膜式真空泵,用于去除样品中的气泡 |
| 蜡笔枪 | Hampton Research | HR4-342 | 手持式蜡笔枪,用于熔化并涂抹毛细管封蜡 |
| 成像硬件 | |||
| 22.3 T 磁体 | Bruker GmbH | 950 US2 | 窄孔超导磁体 |
| 空气冷却器 | Bruker GmbH | - | 用于调节探头温度 |
| 控制台 | Bruker GmbH | Avance III HD | 控制波谱仪运行 |
| Micro5梯度线圈 | Bruker GmbH | Mic5 | 可拆卸梯度线圈,安装于Micro5探头主体上 |
| Micro5探头主体 | Bruker GmbH | Mic5 | 用于固定微线圈和梯度线圈 |
| 射频微线圈 | 自制 | - | 内含Fomblin |
| 矢量网络分析仪 | Copper Mountain Technologies | TR1300/1 | 用于执行S11反射率测试,频率范围为300 kHz至1.3 GHz |
| 水冷却器 | Bruker GmbH | BCU-20 | 开环水冷系统,用于耗散梯度线圈工作时产生的热量 |