本文介绍了一种化学成分明确的人肾足细胞高效(>90%)分化方案,该方案由诱导性多能干细胞衍生而来,无需基因操作或亚群筛选。本方案可在26天内获得目标细胞类型,适用于肾毒性检测和疾病模型研究。
本文介绍了一种化学成分明确的人肾足细胞高效(>90%)分化方案,该方案由诱导性多能干细胞衍生而来,无需基因操作或亚群筛选。本方案可在26天内获得目标细胞类型,适用于肾毒性检测和疾病模型研究。
肾脏疾病影响着全球超过10%的人口,并造成数十亿美元的联邦支出。最严重的肾脏疾病形式以及最终的终末期肾功能衰竭,通常是由肾小球足细胞损伤引起的。足细胞是一类高度特化的上皮细胞,与内皮细胞和肾小球基底膜共同作用,形成肾脏的滤过屏障。由于原代组织来源有限,以及缺乏高效生成功能性人类肾细胞(如足细胞)的可靠方法,肾脏医学的发展受到严重阻碍。若能从可再生来源(如干细胞)获得足细胞,将有助于深入理解人类肾脏发育和疾病的机制,并为新疗法的发现提供重要工具。本实验方案的目标是建立一种高效、特异且在化学成分明确条件下,从人诱导性多能干细胞(hiPS细胞)分化出成熟、终末分化(非增殖性)足细胞的方法。该方法所获得的hiPS细胞来源足细胞表达谱系特异性标志物(包括nephrin、podocin和Wilm’s Tumor 1),并呈现出成熟功能性足细胞所特有的形态学特征(如初级和次级足突结构)。值得注意的是,目前研究领域广泛使用的永生化足细胞系中明显缺乏这些特化结构,这表明本方案所生成的人类肾足细胞在发育成熟度上显著高于现有常用的足细胞系,更接近体内成熟表型。
人类多能干细胞培养技术的进步有望彻底改变再生医学、疾病建模和药物筛选领域,因为它为研究人员提供了一种可再生且可扩展的生物材料来源,可通过工程化手段获得人体内几乎所有类型的细胞1。该策略在获取原本难以获得的特化且具有功能的细胞类型方面尤为有用。由于人类诱导性多能干细胞(hiPS细胞)2,3,4,5来源于体细胞,并在个体化医学方面具有巨大潜力,因而备受关注。然而,开发从hiPS细胞分化获得其他细胞谱系的方法仍面临挑战,主要原因在于常使用定义不明确的培养条件,导致效率低下并产生非特异性的异质细胞群体6,7。
本文介绍一种在化学成分明确的条件下,高效且特异性地从人诱导多能干细胞(hiPS细胞)分化获得成熟肾小球足细胞的方法。通过综合考虑细胞微环境中多种因素的作用,本研究建立了一种干细胞分化策略,该策略优化了细胞培养基中添加的可溶性因子以及诸如细胞外基质成分或黏附基质等不可溶性因子。鉴于整合素信号通路在足细胞发育与功能中的重要作用,首先检测了细胞表面整合素受体的表达情况。结果表明,β1整合素不仅在hiPS细胞中高表达,在其衍生的中胚层及中间中胚层细胞中亦呈高表达8,9,10。后续实验进一步证实,当与下文所述的可溶性诱导培养基联合使用时,能够与β1整合素结合的配体(包括层粘连蛋白511或层粘连蛋白511-E8片段)可有效支持hiPS细胞向足细胞的黏附与分化。
通过在含有Activin A、CHIR99021和Y27632 ROCK抑制剂的培养基中,将hiPS细胞在层粘连蛋白包被的表面培养两天,首先确认其可分化为表达早期中胚层标志物HAND1、goosecoid和brachyury8,11的细胞,从而启动细胞谱系定向分化。将上述中胚层细胞在添加骨形态发生蛋白7(BMP-7)和CHIR99021的培养基中继续培养14天,可获得表达肾单位前体细胞标志物Wilms肿瘤1(WT1)、odd-skipped相关蛋白1(OSR1)8,11和配对盒基因2蛋白(PAX2)12的中间中胚层细胞。为获得成熟的肾脏肾小球足细胞,将中间中胚层细胞在一种新型培养基中处理4–5天,该培养基包含BMP-7、Activin A、血管内皮生长因子(VEGF)、全-trans维甲酸以及CHIR99021。通过流式细胞术和免疫染色证实,>90%的所得细胞表现出成熟肾脏足细胞的分子、形态和功能特征8,11,13。这些特征包括初级和次级足突结构的形成;足细胞谱系特异性基因的表达,如SYNPO、PODXL、MAF、EFNB28,以及足蛋白(podocin)、nephrin和WT1等蛋白的表达14,15,16。此外,研究发现,利用市售培养基可在体外将hiPS细胞来源的足细胞维持培养长达四周8,11,从而为后续实验的时间安排提供了额外的灵活性。有关用于评估hiPS来源足细胞纯度的流式细胞术检测面板的更多信息,请参阅我们此前发表的文献11。
1. 试剂的准备
2. 培养基的制备
3. 使用hiPS细胞培养基进行无饲养层hiPS细胞培养
4. 将hiPS细胞分化为中胚层细胞(第0-2天)
5. 将 hiPS 细胞来源的中胚层细胞分化为中间中胚层(第 2–16 天)
6. 将 hiPS 细胞来源的中间中胚层细胞分化为足细胞(第 16 至 21 天)
本实验方案的目的是证明在化学成分明确的条件下,可由人诱导多能干细胞(hiPS细胞)分化获得成熟的人肾小球足细胞。本文所展示的数据使用DU11 hiPS细胞系生成17,该细胞系经检测确认无支原体污染。同时进行了染色体分析,结果显示细胞核型正常。从未分化的DU11 hiPS细胞开始,采用本报告中所述的分化策略(图1),首先将干细胞(图2A)分化为表达Brachyury(T)的中胚层细胞(图1B和图2B),随后进一步分化为PAX2阳性的中间中胚层细胞(图2C),最终生成成熟的肾脏肾小球足细胞(图1B、图2D、图3D和图4)。在分化方案的第2天获得中胚层细胞,第16天生成中间中胚层细胞,第21天获得成熟足细胞。所得足细胞在贴附于平坦的组织培养表面(如本实验中使用的层粘连蛋白包被培养板)时,大小约为150–200 µm。由hiPS细胞衍生的足细胞表现出大量类似足突的延伸结构,通过多种互补技术(包括相差显微镜(图1)、免疫荧光显微镜(图4)和扫描电子显微镜8,11)均可观察到。干细胞来源的足细胞对WT115(图2D)以及谱系鉴定标志物nephrin14(图4)呈阳性染色。值得注意的是,nephrin的亚细胞定位主要位于足细胞的足突和细胞质中,符合成熟足细胞的表型特征(图2D和图4A、B)。在发育过程及足细胞生理状态下,nephrin蛋白在细胞核与细胞质之间转运,但随着足细胞的成熟并获得功能性表型,nephrin主要表达于细胞质和足突结构中18。因此,本研究所述分化方案产生的足细胞中,nephrin主要表达于细胞质及类似足突的结构,这一结果凸显了该方案在生成更成熟或特化足细胞方面的实用性。hiPS细胞来源足细胞的扫描电镜图像清晰显示了初级和次级足突的分支结构,这与本课题组先前报道的结果一致8,11。由于WT1本身并非肾足细胞的特异性标志物,强烈建议研究人员同时检测足细胞特异性标志物(如podocin和nephrin)的共表达情况。已有研究证实,采用本方法获得的终末分化足细胞对podocin、nephrin和WT1均呈免疫阳性染色,同时前体细胞标志物PAX2的表达相应下调8,11。综上所述,这些结果表明,采用本方案所获得的足细胞在发育上已达到成熟或特化状态,具备功能性人肾小球足细胞所必需的特征。
在优化分化方法的条件时,曾观察到中间中胚层细胞解离不充分的情况。当细胞接种密度显著超过本方案推荐的密度(即在最终足细胞诱导步骤前,每12孔板孔接种100,000个细胞)时,细胞会形成较大的细胞簇,且在标准实验周期内未能表现出成熟足细胞应有的形态学表型(图3A,B)。因此,建议研究人员在探索其他可能适用于特定下游应用的条件之前,首先采用本方案推荐的接种密度(图3C,D)。综上,这些结果表明,利用上述化学成分明确的培养基,可在三周内实现人诱导多能干细胞向肾小球足细胞的定向分化。

图1:人iPS细胞向足细胞的分化。
(A) 人iPS细胞定向分化为足细胞的方法示意图。BMP7,骨形态发生蛋白7;RA,视黄酸;VEGF,血管内皮生长因子。本图经修改自参考文献11。(B) 人iPS细胞在分化各阶段的代表性图像。从左至右,图像依次显示第0天分化开始前解离前的典型人iPS细胞克隆,分化2天后的中胚层细胞,分化约10天时的中间中胚层细胞,以及第22天终末分化的足细胞。比例尺:所有图像均为100 µm(B图中)。 请点击此处查看该图的放大版本。

图2:人诱导多能干细胞及其分化衍生物的免疫荧光图像,显示在分化时间线过程中谱系特异性标志物的表达及细胞核复染情况。
(A)表达多能性标志物Oct4的人iPS细胞;(B)表达中胚层标志物brachyury(T)的中胚层细胞;(C)表达PAX2的中间中胚层细胞;以及(D)由hiPS细胞分化而来的足细胞,表达谱系鉴定标志物nephrin及关联标志物WT1。比例尺,所有图像均为100 µm。请点击此处查看本图的放大版本。

图3:初始接种密度次优对DU11 hiPS细胞系来源的中间中胚层细胞分化潜能的影响。
(A)当初始细胞接种密度过高(约500,000个细胞/12孔板每孔)时,细胞在足细胞诱导阶段可形成致密的细胞聚集体(B)。(C) 推荐的接种密度可防止细胞成团(100,000个细胞/12孔板每孔),并可在显微镜下观察到足细胞分化阶段出现足突样结构的延伸(D,插图)。比例尺:A-D为200 µm;D图插图为100 µm。请点击此处查看该图的放大版本。

图4:人诱导多能干细胞(hiPS细胞)来源的足细胞在体外表现出形态成熟的表型 in vitro。
(A)hiPS细胞来源足细胞的nephrin免疫染色;(B)足细胞足突的高倍放大图像,显示初级和次级突起(白色箭头),以及这些特化细胞结构中nephrin的表达。比例尺,100 µm(A);50 µm(B)。 请点击此处查看该图的高清版本。
本报告中,我们描述了一种从人诱导多能干细胞(hiPS细胞)生成肾脏肾小球足细胞的实验方案。由hiPS细胞分化而来的足细胞表现出与成熟肾脏足细胞表型相关的形态学和分子特征13。在先前的研究中,我们已证明当hiPS细胞来源的足细胞与肾小球微血管内皮细胞在可灌注的微流控器官芯片装置中进行共培养时,能够模拟肾脏肾小球的结构及其选择性滤过功能8,11。
研究人员若有意采用本方案,应考虑以下关键步骤。首先,将人诱导多能干细胞(hiPS细胞)接种至层粘连蛋白包被的培养板以诱导中胚层细胞,是至关重要的一步。尽管推荐接种密度为每孔100,000个细胞,但研究人员可根据所用干细胞系的增殖速率调整初始接种密度。如有必要,此优化可确保中胚层诱导阶段具有适当的细胞密度,并防止形成细胞聚集体或过大的细胞团块,从而避免影响中胚层、中间中胚层或足细胞表型的质量(图3)。还需注意,某些试剂(如CHIR99021)因生产厂家规格不同,可能影响分化细胞的质量。因此,建议对来自不同批次或供应商的试剂进行生物学活性检测,并确保独立实验之间的结果一致性。此外,应避免hiPS细胞过度暴露于解离酶,以免导致细胞从粘附基质上非预期脱落,并在换液过程中造成细胞丢失。另一个值得注意的关键步骤是,足细胞诱导培养基需避光保存,以防止视黄酸发生光诱导失活。
与以往的人类肾脏足细胞分化方法相比,本文所述方法采用化学成分明确的因子(包括小分子、生长因子以及基底膜蛋白的特定同工型,并以所需浓度添加),以调控肾脏发育和足细胞功能中涉及的特定细胞信号通路。具体而言,由hiPS细胞生成中胚层细胞的过程涉及使用小分子CHIR99021激活经典的Wnt信号通路19。经典的Wnt信号通路已知可调控体内组织发育与模式形成相关基因的转录活性,同时也调控细胞增殖与迁移20,21。本方案所用的细胞诱导培养基可将由iPS细胞衍生的中间中胚层细胞进一步诱导为足细胞。该足细胞诱导培养基包含Activin A、BMP7、VEGF、视黄酸以及CHIR99021。值得注意的是,该足细胞诱导培养基无需添加成分未明的血清成分(如胎牛血清),从而避免了特定因子作用的模糊化,并克服了其他细胞分化方法在组织发育与疾病机制研究中的应用局限,因而区别于以往生成肾细胞类型的方法22。此外,研究发现FGF2与FGF9在hiPS细胞向肾脏足细胞分化过程中并非必需6,7,22。以往的方法依赖多细胞聚集体(如拟胚体或类器官)的形成,而本文所述方法所获得的细胞在形态学上表现出成熟表型,并表达nephrin和podocin等谱系特异性标志物,同时下调PAX2等前体细胞标志物的表达。预计本方案中所使用的化学成分信息将有助于未来开展人类肾脏组织发育、足细胞谱系特化以及疾病发病机制的机制性研究。
该 hiPS 细胞分化方法还能以超过 90% 的效率生成成熟、有丝分裂后且具有功能的足细胞,且无需亚群筛选、基因操作或异种移植。这与以往的研究尝试明显不同,此前的方法由于细胞异质性水平较高6,7,23,限制了干细胞分化技术在转化医学应用中的使用。鉴于从其他来源(如原代组织或类器官)获取人肾足细胞极为困难,该方法为该领域带来了显著进展。其中一些挑战包括:采用依赖拟胚体或类器官形成的方法时,分化效率极低,不足 1%6,7。
本方案的一个局限性在于干细胞培养和分化步骤所需的试剂成本相对较高,这可能会阻碍其在某些实验室或研究团队中的实施。此外,由于细胞微环境中的多种因素(即可溶性因子以及不溶性或黏附性信号)均经过大量优化,因此我们建议严格按照所述方案进行操作。其他有意采用此足细胞分化方法的研究者曾出现的一个常见错误是使用了不合适的细胞黏附基质,例如BM基质1或其他定义不明确的动物源性蛋白。只有在严格按照所述方案操作后,才能进一步开展实验,以评估对本方案其他修改措施的有效性。此外,由于不同人干细胞系之间存在固有的差异,需要注意的是,分化方法的某些方面,例如分化培养基或细胞解离培养基的处理时间以及细胞接种密度,可能需要进一步优化。然而,截至目前所测试的hiPS细胞系和胚胎干细胞系中,这些条件均未进行调整。该足细胞分化方法已在多个hiPS细胞系中成功应用,包括PGP1、IMR-90–1和IISH3i-CB6,以及H9胚胎干细胞系8,11。在本报告中,我们还展示了利用相同方案成功实现了DU11 hiPS细胞系的分化(图1 和 图2)。因此,鉴于该方法在多种细胞系中表现出的一致性,以及来自其他独立研究实验室未发表工作的结果(发表前数据),我们预期该分化方案将适用于从多种hiPS细胞系中获得肾足细胞,因而并不局限于本方案中所使用的特定细胞系。
鉴于hiPS细胞具有无限自我更新的能力,该分化方法可为研究人员提供一种易于获取的人类肾小球足细胞来源。这有助于增进当前对人类肾脏生物学及疾病的理解24,并推动用于模拟人类肾脏功能及药物反应的新型体外肾脏系统的开发。例如,本文所述方案最近已被采用,并与微流控器官芯片系统相结合,成功构建出功能性的人体肾小球毛细血管壁体外模型。该肾小球芯片能够选择性过滤循环分子,并在暴露于化疗药物阿霉素(Adriamycin)时重现药物诱导的肾毒性8。未来,这些成果有望与3D生物打印技术相结合,构建更为复杂的人体肾脏体外模型。此类进展可为评估候选药物提供全新的平台,特别是针对由肾小球足细胞功能障碍引发的各类肾脏疾病。这一点尤为重要,因为动物模型存在物种特异性差异,且标准组织培养方法通常缺乏器官层级的功能特性,这些因素均会阻碍针对多种人类肾脏疾病的靶向治疗药物的开发25。因此,该方案未来有望为揭示人类肾脏发育过程中的信号通路以及疾病发病机制提供新的研究机会。
S.M. 是一项关于从多能干细胞生成肾小球足细胞的方法的待批专利的发明人之一(美国专利申请号 14/950859)。其余作者声明不存在利益冲突。
本工作得到了杜克大学普拉特工程学院、杜克大学医学院肾病科、杜克大学医学院内科系主任研究奖以及伯勒斯威康基金PDEP职业转型项目的资助。 临时 S.M. 获得奖项资助。M.B. 受美国国家科学基金会研究生研究奖学金项目支持。我们感谢 Bursac 实验室慷慨提供 DU11 干细胞系,以及杜克大学 Varghese 实验室临时与我们团队共享组织培养设施。本出版物献给麻省理工学院化学系诺华教授 Laura L. Kiessling 教授,以庆祝她 60 岁生日th 生日
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| <强>细胞 | |||
| DU11 人iPS细胞 | DU11(杜克大学克隆#11)诱导多能干细胞系由杜克大学iPSC核心实验室构建,并由杜克大学Bursac实验室提供给我们。本实验室已对该细胞系进行支原体检测,并于2019年7月完成最近一次核型分析,结果显示核型正常。 | ||
| <强>生长因子与培养基添加剂 | |||
| 全反式维甲酸(500 mg) | 72262 | 干细胞技术 | |
| B27无血清添加剂 | 17504044 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| CHIR99021 | 04-0004 | Stemgent | 可能存在批间差异 |
| 含 CultureBoost-R 的完全培养基试剂盒 | 4Z0-500-R | 细胞系统 | 足细胞维持培养基 |
| DMEM/F12 | 12634028 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| 含GlutaMAX补充剂的DMEM/F12培养基 | 10565042 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | 含谷氨酰胺补充剂的DMEM/F12培养基 |
| 热灭活胎牛血清 | 10082147 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| 人激活素A | PHC9564 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| 人BMP7 | PHC9544 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| 人血管内皮生长因子 | PHC9394 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| mTeSR1 培养基 | 05850 | 干细胞技术 | hiPS 细胞培养基(CCM) |
| 青霉素–链霉素,液体(100×) | 15140-163 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| Y27632 ROCK抑制剂 | 1254 | Tocris | |
| <强>抗体 | |||
| Alexa Fluor 488– 和 Alexa Fluor 594–偶联的二抗 | A32744;A32754;A-11076;A32790 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| Brachyury(T) | ab20680 | Abcam | |
| Nephrin | GP-N2 | 祖细胞 | |
| OCT4 | AF1759 | R&D Systems | |
| PAX2 | 71-6000 | Invitrogen | |
| WT1 | MAB4234 | Millipore | |
| <强>细胞外基质分子 | |||
| iMatrix-511 层粘连蛋白-E8(LM-E8)片段 | N-892012 | Iwai North America | 基底膜(BM)基质2 |
| 基质胶 hESC 验证级基质,5 mL 瓶装 | 354277 | BD 生物科学 | 基底膜(BM)基质1. 可能存在批间差异 |
| <强>酶及其他试剂 | |||
| Accutase | A1110501 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | 细胞解离溶液 |
| BSA | A9418 | Sigma-Aldrich | |
| 二甲基亚砜(DMSO) | D2438 | Sigma-Aldrich | DMSO 具有毒性,应在化学安全通风橱中操作 |
| 无酶细胞解离缓冲液,Hank’平衡盐溶液 | 13150016 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| 70%(体积/体积)乙醇溶液,生物技术级 | 97065-058 | VWR | 乙醇易燃且有毒 |
| FBS | 431097 | 康宁 | |
| 多聚甲醛(PFA) | 28906 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | PFA 应在通风橱中操作,并佩戴适当的个人防护装备,包括手套、实验服和护目镜。避免吸入及皮肤接触。 |
| 磷酸盐缓冲液(PBS) | 14190-250 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| 无菌蒸馏水 | 15230162 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| Triton X-100 | 97062-208 | VWR | |
| 0.05% 胰蛋白酶-EDTA | 25300-120 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | |
| <强>仪器设备 | |||
| 单独包装的吸液管 | 29442-462 | 康宁 | |
| Avanti J-15R 离心机 | B99516 | 贝克曼库尔特 | |
| 15 mL 锥形离心管 | 352097 | 康宁 | |
| 50 mL 锥形离心管 | 352098 | 康宁 | |
| 冻存盒 | 3395465 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | 用于储存冻存分装样本 |
| EVOS M7000 | AMF7000 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | 用于获取固定并染色的iPS细胞及其衍生物图像的荧光显微镜 |
| 血细胞计数板 | 100503-092 | VWR | |
| Heracell VIOS 160i CO2 培养箱 | 51030403 | 赛默飞世尔科技/生命技术公司 | 用于iPS细胞及其衍生物的常规培养与维持 |
| 配备 AxioCam 503 相机的倒置 Zeiss Axio Observer 显微镜 | 491916-0001-000(显微镜);426558-0000-000(相机) | 卡尔·蔡司显微镜 | 用于获取活体iPS细胞及其在足细胞分化各阶段衍生物的相差图像 |
| Kimberly-Clark 丁腈手套 | 40101-346 | VWR | |
| Kimwipes,大号 | 21905-049 | VWR | |
| Kimwipes,小型 | 21905-026 | VWR | |
| P10 精密屏障式移液器吸头 | P1096-FR | 德内维尔科学公司 | |
| P100 防污染吸头 | P1125 | 德文特科学 | |
| P1000 防污染吸头 | P1126 | 德文特科学 | |
| P20 移液器滤芯吸头 | P1121 | 德文特科学 | |
| P200 阻隔式移液器吸头 | P1122 | 德文特科学公司 | |
| 10 mL 血清移液管,独立包装 | 356551 | 康宁 | |
| 25 mL 血清移液管,单独包装 | 356525 | 康宁 | |
| 5 mL 血清移液管,独立包装 | 356543 | 康宁 | |
| Steriflip,0.22 μ米,聚醚砜 | SCGP00525 | EMD Millipore | |
| 无菌微量离心管 | 1138W14 | Thomas Scientific | 用于分装生长因子 |
| 组织培养–经处理的12孔板 | 353043 | 康宁 | |
| 组织培养–经处理的六孔板 | 353046 | 康宁 | |
| VWR 白色 Techuni 实验服 | 10141-342 | VWR | |
| 宽斜面细胞刮刀 | 3008 | 康宁 |