本方案展示了如何利用超分辨率显微镜研究原代神经元培养物中蛋白质的共定位。
本方案展示了如何利用超分辨率显微镜研究原代神经元培养物中蛋白质的共定位。
突触是神经元的功能单元,其缺陷或丢失是多种神经退行性疾病和神经系统疾病的基础。成像研究被广泛用于探究突触在生理和病理条件下的功能与可塑性。由于突触的尺寸和结构特点,对蛋白质进行定位研究需要高分辨率成像技术。在本实验方案中,我们描述了一种利用结构光照明显微镜(SIM)在原代神经元中以超分辨率水平研究目标蛋白与突触标志物共定位的方法。SIM 是一种采用模式化光照的技术,可使宽场显微镜的空间分辨率提高一倍,达到约 100 nm 的精细程度。本方案列出了进行可靠共定位研究所需对照和设置,并概述了正确分析成像数据的统计方法。
自 Foster 和 Sherrington 于 1897 年首次描述突触以来,人们对突触的理解和认识发生了巨大变化1。此后,我们对神经元通讯及其背后分子过程的认识呈指数级增长2。目前明确,突触可被视为一个双区室系统:包含用于释放神经递质囊泡的突触前区室,以及带有受体的突触后区室3。在过去二十年中,这一简化的观点已发展为一个复杂的蛋白质网络,这些蛋白质负责将递质结合转化为信号传导4。
理解上的进展部分得益于超分辨率技术,这些技术克服了传统光学显微镜的衍射极限,更适用于突触尺度的观察5,6,7,8,9,10。由于衍射极限的存在,光学显微镜在横向上的分辨率无法超过200 nm11,12....
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1. 原代培养
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我们在此介绍了研究神经元蛋白共定位的标准工作流程。首先对显微镜进行校准,随后对样品进行SIM分析。为校准系统,我们使用了荧光微球 0.1 μm 直径。获得珠子的超分辨3D-SIM图像后,将原始图像数据进行傅里叶变换,以重新转换为空间频率表示形式。在 图2A,独特的花朵图案呈现出超分辨率细节水平的指示。接下来,我们通过计算单个微珠强度分布峰值的半高全宽(FWHM)来测量所实现的分辨率(图2B,C)。最后,我们再次使用荧光微球通过通道配准来校正色差图3A,B)。接下来,我们使用100倍物镜开始对样品进行分析,并采集了3D-SIM图像。我们利用SIMCheck评估成像过程中照明场的均匀性或样品是否发生移动(图 4A)。我们检测了不同照明模式角度之间的强度差异(图4B)我们.......
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阐明突触的结构与组成对于理解调控记忆和认知的生理及病理过程至关重要。在正常状态下,突触是记忆的基本构成单元,同时也与阿尔茨海默病等复杂的神经系统疾病密切相关32。本文所述的实验方案旨在利用一种称为SIM(结构光照明显微镜)的超分辨率显微成像技术,研究神经元蛋白的共定位情况。SIM通过特定的照明模式,可实现约0.1 μm的分辨率,适用于研究通常大小在0.03至0.15 μm之间的突触。若需更高细节,还可采用其他超分辨率技术,如STED(受激发射损耗显微镜)、PALM(光激活定位显微镜)或STORM(随机光学重建显微镜),这些技术的分辨率可达10–20 nm33。
本文介绍了在原代神经元中分析靶蛋白与突触标志物共定位的方法。该方案可应用于任何原代神经元细胞培养体系,例如海马神经元、小脑神经元或皮层神经元,甚至也可用于不属于中枢神经系统的原代神经元培养,如肠神经系统神经元。然而,实现超分辨率水平分析的关键在于成像过程中所使用的试剂,例如与物镜折射率匹配的带腔盖玻片和封片介质。我们选用带腔盖玻片.......
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作者无任何利益冲突需要披露。
作者感谢 Edoardo Micotti 对手稿提出的建设性批评。本研究得到了以下资助:BrightFocus A2019296F、Intesa Sanpaolo 集团慈善基金(LC)、伦巴第生物医学研究基金会(Care4NeuroRare CP_20/2018)(CN)、玛丽·斯克沃多夫斯卡-居里创新培训网络(JK),以及 Telethon 基金会 TCP15011、阿尔茨海默协会 AARG-17-505136(LF)。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 0.4% 台盼蓝溶液 | 赛默飞世尔科技 | 15250061 | 化学 |
| 70 µm 滤膜 | 康宁 | 352350 | 设备 |
| Alexa | 赛默飞世尔科技 | - | 抗体 |
| 抗体 SENP1 | 圣克鲁斯 | sc-271360 | 抗体 |
| B27 补充剂 | Life Technologies | 17504044 | 化学 |
| 牛血清白蛋白 | 默克 | 5470 | 化学 |
| CaCl2 | 默克生命科学 | 21115 | 化学 |
| 带孔盖玻片 | Ibidi | 80826 | 仪器 |
| DyLight | 赛默飞世尔科技 | - | 抗体 |
| FBS(Hyclone) | GIBCO | SH3007002 (CHA1111L) | 血清 |
| FluoSpheres 羧基修饰微球,0.1 μ米,黄色–绿色荧光 | 赛默飞世尔科技 | F8803 | 仪器 |
| 葡萄糖 | 默克生命科学 | G8769 | 化学 |
| Glutamax | GIBCO | 35050061 | 化学 |
| HEPES | 默克生命科学 | H3537 | 化学 |
| L-半胱氨酸 | 默克生命科学 | C6852-25g | 化学 |
| MAP2 | 默克 | AB15452 | 抗体 |
| MEM | Life Technologies | 21575022 | 培养基 |
| MgCl | 默克生命科学 | M8266 | 化学 |
| NaOH | VWR International | 1,091,371,000 | 化学 |
| Neurobasal A | Life Technologies | 10888022 | 培养基 |
| N-SIM 超分辨率显微镜 | 尼康 | - | 仪器 |
| 木瓜蛋白酶 | 默克生命科学 | P-3125 | 化学 |
| 多聚甲醛 | 赛默飞世尔科技 | 28908 | 化学 |
| 青霉素/链霉素 10倍液 | Life Technologies | 15140122 | 化学 |
| 磷酸盐缓冲液 | Gibco | 10010023 | 化学 |
| 聚-L-赖氨酸 | Sigma | P2636 | 化学 |
| ProLong Diamond 抗荧光淬灭封片剂 | 赛默飞世尔科技 | P36970 | 化学 |
| PSD95 | NeuroMab | K28/43 | 抗体 |
| 圆形盖玻片 | 赛默飞世尔科技 | 12052712 | 仪器 |
| SUMO1 | Abcam | ab32058 | 抗体 |
| 突触素 | 默克 | S5768 | 抗体 |
| Triton X-100 | 默克 | T8787 | 化学 |
| 胰蛋白酶抑制剂 | 默克生命科学 | T9003-500MG | 化学 |
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