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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该协议描述了通过荧光激活细胞分选或免疫磁珠分离从小鼠腹内白色脂肪组织(WAT)库中分离脂肪生成和纤维炎基质细胞亚群的技术方法。
白色脂肪组织 (WAT) 的基质-血管部分 (SVF) 具有显着的异质性,由多种细胞类型组成,这些细胞类型在功能上有助于成年期 WAT 的扩增和重塑。研究这种细胞异质性的影响的一个巨大障碍是无法轻易地从 WAT SVF 中分离出功能不同的细胞亚群以进行体外和体内分析。单细胞测序技术最近在成年小鼠腹内WAT库中鉴定出功能不同的纤维炎和成脂PDGFRβ+血管周围细胞亚群。纤维炎祖细胞(称为"FIP")是非脂肪生成胶原蛋白产生细胞,可以发挥促炎表型。PDGFRβ+ 脂肪细胞前体细胞 (APC) 在细胞移植后在体外和体内都具有高度脂肪生成性。在这里,我们描述了从小鼠腹内 WAT 仓库中分离这些基质细胞亚群的多种方法。FIP 和 APC 可以通过荧光激活细胞分选 (FACS) 或利用基于生物素化抗体的免疫磁珠技术进行分离。分离的细胞可用于分子和功能分析。孤立地研究基质细胞亚群的功能特性将扩展我们目前在细胞水平的生理或病理条件下脂肪组织重塑的知识。
白色脂肪组织(WAT)是哺乳动物储存能量的主要场所。在这种组织中,脂肪细胞或"脂肪细胞"以甘油三酯的形式储存多余的卡路里,这些卡路里被包装成大的单房脂滴。此外,脂肪细胞分泌多种因子来调节能量稳态的各个方面 1,2,3。脂肪细胞占WAT体积的大部分;然而,脂肪细胞仅占 WAT 4,5 中发现的总细胞的不到 50%。WAT 的非脂肪细胞区室或基质血管部分 (SVF) 具有相当异质性,包含血管内皮细胞、组织驻留免疫细胞、成纤维细胞和脂肪细胞前体细胞 (APC) 群体。
随着对储能需求的增加,WAT具有出色的扩展能力。保持这种组织可塑性至关重要,因为在 WAT 中充分储存脂质可以防止有害的异位脂质沉积到非脂肪组织中6.在肥胖的情况下,各个 WAT 仓库因热量过剩而进行这种扩张的方式是胰岛素敏感性的关键决定因素7.在患有代谢综合征的肥胖个体中观察到的病理性 WAT 扩张,其特征是内脏 WAT 库优先扩张,而牺牲代谢有利的皮下脂肪组织。此外,肥胖症中的胰岛素抵抗与 WAT 的病理重塑有关。其特征是现有脂肪细胞的肥大生长(尺寸增加),血管生成不足,慢性代谢炎症,细胞外基质成分(纤维化)的积累和组织缺氧8,9。这些肥胖的 WAT 表型与肝脂肪变性和胰岛素抵抗有关,类似于在脂肪营养不良(缺乏功能性 WAT)条件下观察到的情况。相比之下,在代谢健康的肥胖人群中观察到健康的 WAT 扩张,其特征是保护性皮下 WAT 的优先扩张和通过脂肪细胞增生的仓库扩张10。新脂肪细胞的募集是通过从脂肪细胞前体细胞 (APC) 中新头分化脂肪细胞介导的(称为"脂肪生成")。脂肪细胞增生与相对较低程度的 WAT 纤维化和代谢炎症相吻合 6,11。WAT 微环境中的多种细胞类型直接影响 WAT 在肥胖中的健康和可扩展性12.因此,定义WAT中存在的各种细胞类型的功能仍然是该领域的重中之重。
在过去的十年中,已经采用了几种策略来定义和分离来自人和小鼠 WAT SVF13 的天然 APC。这些策略使用基于抗体的细胞分离技术,根据常见间充质干细胞/祖细胞标志物的细胞表面表达分离 APC。这些方法包括使用荧光团标记抗体的荧光激活细胞分选 (FACS) 或免疫磁珠分离(即化学修饰的抗体)。靶向分离 APC 的细胞表面蛋白包括 PDGFRα、PDGFRβ、CD34 和 SCA-1。这些方法有助于丰富APC;然而,基于这些标记物分离的细胞群具有相当大的异质性。最近的单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 研究强调了小鼠 WAT 14,15,16,17 分离的基质-血管部分 (SVF) 内基质细胞的分子和功能异质性。根据我们自己的 scRNA-seq 和功能分析,我们已经鉴定并表征了成年小鼠腹内 WAT 基质区室中功能不同的免疫调节和成脂 PDGFRβ+ 血管周围细胞亚群15。纤维炎症前体 (FIP) 是 PDGFRβ+ 细胞的重要亚群,可以根据 LY6C 表达(LY6C+ PDGFRβ+ 细胞)15 进行分离。FIPs缺乏成脂能力,对各种刺激产生强烈的促炎反应,产生胶原蛋白,并分泌抗脂肪生成因子15。这些细胞的促炎和纤维化活性与小鼠肥胖有关而增加,表明这些细胞是WAT重塑的调节因子。LY6C-CD9-PDGFRβ+ 亚群代表脂肪细胞前体细胞 (APC)。这些 APC 富含 Pparg 和其他促脂肪基因的表达,并且在体外和体内很容易分化成成熟的脂肪细胞15。在这里,我们提供了一个详细的方案,用于使用FACS从成年小鼠的腹内WAT库中分离这些不同的细胞群,并使用生物素化抗体进行免疫磁珠分离。该协议可用于从成年雄性和雌性小鼠的多个腹内WAT库中分离功能不同的脂肪祖细胞亚群15。单独研究这些功能不同的细胞群可能极大地有助于我们目前对健康和疾病中调节脂肪生成和腹内脂肪组织重塑的分子机制的理解。
以下方案详细介绍了从小鼠附睾WAT中分离脂肪祖细胞的方法;然而,相同的程序可用于从雄性和雌性小鼠的肠系膜和腹膜后 WAT 库中分离相应的细胞15。关于如何在小鼠中识别和分离这些仓库的详细方案可以在Bagchi等人18中找到。该协议已针对6-8周龄的小鼠的使用进行了优化。APCs的频率和分化能力可能随着年龄的增长而下降。
所有动物协议和程序均已获得德克萨斯大学西南医学中心机构动物使用和护理委员会的批准。
1. 从性腺白色脂肪组织中分离基质血管分数 (SVF)
2. 使用FACS分离APC和FIP
3. 成脂和非成脂部分的免疫磁性分离
4. 通过流式细胞术评估成脂和非成脂部分的纯度
5. 使用定量 PCR 进行基因表达分析,以评估 FIP 和 APC 的纯度
6. 细胞培养和分化
该协议描述了两种策略,允许从成年小鼠的腹内WAT仓库中分离不同的基质细胞群。APC和FIP可以通过FACS(图1)或使用生物素化抗体(图2)分离免疫磁珠来分离。这两种方法都利用了市售的试剂和抗体。免疫磁珠分离可从 gWAT SVF 中分离出成脂细胞和非成脂细胞。流式细胞术分析显示,成脂部分内75%的细胞代表LY6C-CD9-APCs。>75% 的非成脂部分代表 FIP(LY6C+ 细胞)。

图 1:通过 FACS 从性腺 WAT 中分离 PDGFR β + 基质细胞亚群。 (A) 程序示意图概述:通过酶促组织消化和离心从成熟脂肪细胞中分离基质血管部分(非脂肪细胞)。然后使用荧光激活细胞分选 (FACS) 去除内皮 (CD31+) 和造血 (CD45+) 谱系细胞,并分离 LY6C+ PDGFRβ+ 细胞 (FIPs) 和 LY6C-CD9- PDGFRβ+ 细胞 (APCs)。(B) 具有代表性的FACS收集闸口。面板A经许可转载自参考文献11。请点击这里查看此图的较大版本.

图 2:通过免疫磁珠分离分离成脂和非成脂基质细胞。 (A) 程序示意图概述:第 1 步:CD31+ 和 CD45+ 细胞与磁铁结合。这既去除了内皮细胞又造血谱系细胞。收集含有CD31-和CD45-细胞的洗脱液,然后分别与识别LY6C和CD9的抗体一起孵育。第 2 步:CD9+ 和 LY6C+ 细胞与磁铁结合。步骤3:收集含有CD9-和LY6C-细胞的上清液(未结合部分),因为这代表脂肪生成部分(APCs)。与纳米球结合的非成脂 CD9+ 和 LY6C+ 细胞被洗脱为含有 FIP 的非 APC 部分。(B) 流式细胞术分析,分别评估成脂和非成脂部分中 APC (LY6C-CD9-) 和 FIP (LY6C+) 的频率。请点击这里查看此图的较大版本.
光学显微镜和基因表达分析表明,通过FACs或通过磁珠从gWAT中分离的APCs在6-8周龄小鼠的gWAT中首次接种细胞后7-10天内高度分化为含脂质的脂肪细胞在性腺APC培养基中(图3)。相比之下,非成脂肪前体(如纤维炎症前体或FIP)保持成纤维细胞样,当维持在同一培养基(性腺APC培养基)中时,不会 变成脂肪细胞(图3)。应该注意的是,非APCs培养物中很少有细胞显示出一些脂质积累(图3D)。这些可能是由细胞分离过程中的 APC 污染引起的。额外的洗涤可能会提高该馏分的纯度。

图 3:从成年小鼠的 gWAT 中分离的 PDGFR β + 基质细胞群的体外分化。 (A-D)通过免疫磁珠分离 (AB) 或 FACS (C-D) 从 6-8 周龄小鼠 gWAT SVF 中分离的分化基质细胞亚群的代表性明场图像。图像是在将细胞接种到性腺 APC 培养基中 7 天后拍摄的。在电镀后 7-10 天内,APC 发生自发脂肪细胞分化。放大倍率 10 倍。规模 = 250 μM。 (EF) A-D 中分化培养物中脂肪细胞选择性基因的 mRNA 水平。条形图代表平均值 + SEM。 请点击这里查看此图的较大版本.
| FIP的 | 富集基因(与 APC) | 正向引物 5'-3' | 反向引物 5'-3' |
| Ly6c1 | ACTGTGCCTGCAACCTTGTCT | GGCCACAAGAAGAATGAGCAC | |
| CD9型 | GCGGGAAACACTCAAAGCCAT | AAAGCTGTTTCTTGGGGCAGG | |
| 11 月 | GTTCCAAGAGCTGTGGAATGG | CTCTTGTTCACAAGGCCGAAC | |
| EFHD1型 | GGCCGCTCTAAGGTCTTCAAT | GTCAATAAAGCCGTCCCTTCC | |
| STMN4 | ACCTGAACTGGTGCGTCATCT | CTTGGGAGGGAGGCATTAAAC | |
| Dact2的 | AGCCCCCTAAAGGAAGAAACC | GGTCCTTGGCCACAGTCATTA | |
| 伊尔33 | ATTTCCCCGGCAAAGTTCAG | AACGGAGTCTCATGCAGTAGA | |
| 氯化碳2 | CCACAACCACCTCAAGCACTTC | AAGGCATCACAGTCCGAGTCAC | |
| TGFB2型 | GGTGTTGTTCCAGGGGTTA | CGGTCCTTCAGATCCTCCTTT | |
| Fn1 | GAGAGCACACCCGTTTTCATC | GGGTCCACATGATGGTGACTT | |
| DPP4型 | TGGTGGATGCTGGTGTGGATT | AAGGGGCCTCTTCTCTTCCT | |
| thy1 | TCTTCTTTCCCTTGCCCCTCTG | AGGTTGCAAGACTCTCGCTGT | |
| 运兵车 | 富集基因(与 FIP) | 正向引物 5'-3' | 反向引物 5'-3' |
| AGT | GTTCTGGGCAAAACTCAGTGC | GAGGCTCTGCTGCTCATCATT | |
| Cxcl14型 | TGGACGGGTCCAAGTGTAAGT | TCCTCGCAGTGTGGGTACTTT | |
| MMD2 | ATCTGGGAGCTGATGACAGGA | AGTGGGTACCAGCACCAAATG | |
| PDE11a(PDE11a) | CGAGCTTGTCAGGAAAGGAGA | TTCAGCCACCTGTCTGGAGAT | |
| Lrn1 | CAACATGGGAGAGCTGGTTTC | GCACACTACGGAAAGCCAAAC | |
| 帕格 | GCATGGTGCCTTCGCTGA | TGGCATCTCTGTGTCAACCATG | |
| 晶圆厂4 | ACTGGGCGTGGAATTCGATGA | ACCAGCTTGTCACCATCTCGT | |
| 有限责任合伙企业 | CATCGAGAGAGGATCCGAGTGAA | TGCTGAGTCCTTTCCCTTCTG | |
| CD36型 | GAGTTGGCGAGAAAACCAGTG | GAGAATGCCTCCAAACAGC |
表 1:用于验证 FIP 和 APC 分离的 qPCR 引物序列
T.A.P. 是 Novo Nordisk A/S 的员工和股东
该协议描述了通过荧光激活细胞分选或免疫磁珠分离从小鼠腹内白色脂肪组织(WAT)库中分离脂肪生成和纤维炎基质细胞亚群的技术方法。
作者感谢 Lisa Hansen 和 Kirsten Vestergaard 提供的出色技术援助,以及 P. Scherer、N. Joffin 和 C. Crewe 对手稿的批判性阅读。作者感谢UTSW流式细胞术核心在制定本文所述方案方面提供的出色指导和帮助。R.K.G. 受 NIH NIDDK R01 DK104789、NIDDK RC2 DK118620 和 NIDDK R01 DK119163 支持。J.P.由丹麦创新基金的博士前奖赞助。
| 机械组织制备和 SVF 分离 | |||
| 40 和 100 µM 细胞过滤器 | Fisher Scientific | 352340/352360 | |
| 1X 磷酸盐缓冲盐水 (PBS) | Fisher Scientific | 21040CV | |
| 5 ml 聚丙烯管 | FisherScientific | 352053 | |
| 消化缓冲液(10 mL) | |||
| 10 ml HBSS | Sigma | H8264 | |
| 10 mg 胶原酶 D(1 mg/ml 最终 cc.) | 罗氏 | 11088882001 | |
| 0.15 g BSA(1.5% 最终 cc.) | Fisher Scientific | BP1605-100 | |
| APC和非APC的免疫磁性分离 | |||
| 5X MojoSort缓冲液(MS缓冲液) | BioLegend | 480017 | |
| 5 ml MojoSort磁铁(MS磁铁) | BioLegend | 480019 | |
| 100 µL MojoSort 链霉亲和素纳米珠 | BioLegend | 480015 | |
| 纯度检查和 FACS | |||
| 10X 红细胞裂解缓冲液 | eBioscience | 00-4300-54 | |
| Fc 块(小鼠 CD16/CD32) | eBioscience | 553141 | |
| 抗体 | |||
| 生物素 CD45 | BioLegend | 103103 | 浓度:≤ 0.25 µ每 10^6 个细胞 g 物种:小鼠 克隆:30-F11 |
| 生物素 CD31 | BioLegend | 102503 | 浓度:≤ 0.25 µ每 10^6 个细胞 g 物种:小鼠 克隆:MEC13.3 |
| 生物素 CD9 | BioLegend | 124803 | 浓度:≤ 0.25 µ每 10^6 个细胞 g 物种:小鼠 克隆:MZ3 |
| 生物素 LY6C | BioLegend | 128003 | 浓度:≤ 0.25 µ每 10^6 个细胞 g 物种:小鼠 克隆:HK1.4 |
| CD31-PerCP/Cy5.5 | BioLegend | 102419 | 浓度:稀释度 1:400 物种:小鼠 克隆:390 |
| CD45-PerCP/Cy5.5 | BioLegend | 103131 | 浓度:稀释度 1:400 物种:小鼠 克隆:30-F11 |
| CD140b PDGFRβ-PE | BioLegend | 136006 | 浓度:稀释度 1:50 种类:小鼠 克隆:APB5 |
| LY6C-APC | BioLegend | 128016 | 浓度:稀释度 1:400 物种:小鼠 克隆:HK1.4 |
| CD9-FITC | BioLegend | 124808 | 浓度:稀释度 1:400 物种:小鼠 克隆:MZ3 |
| 细胞培养和区分强> | |||
| <强>性腺 APC 培养基(500 mL)强> | |||
| 288 mL DMEM,含 1 g/L 葡萄糖 | 康宁 | 10-014-CV | |
| 192 mL MCDB201 | Sigma | M6770 | |
| 10 mL 胎牛血清 (FBS)** lot#14E024 | Sigma | 12303C | |
| 5 mL 100% ITS 预混料 | BD Bioscience | 354352 | |
| 5 mL 10 mM L-抗坏血酸-2-2磷酸 | Sigma | A8960-5G | |
| 50 µL 100 g/ml FGF-碱性 | R&D 系统 | 3139-FB-025/CF | |
| 5 mL 笔/链球菌 | 康宁 | 30-001-CI | |
| 500 µL 庆大霉素 | Gibco | 15750-060 | |
| **注:初级 APC 的成脂能力可能因商业 FBS 的批次而异。应测试多个批次/来源的 FBS。 |