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方法文章

农杆菌介导的遗传转化、转基因植株创制及其在水稻雄性生殖发育研究中的应用

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DOI:

10.3791/61665

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2020年10月6日

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* These authors contributed equally

本文内容

摘要

本研究描述了利用CRISPR-Cas9基因组编辑技术敲除内源性基因的方法 OsABCG15 随后进行改良的 农杆菌-通过介导转化方案培育水稻稳定雄性不育系

摘要

雄性不育是杂交种子生产中重要的农艺性状,通常表现为雄性生殖器官或配子的功能缺陷。近年来,CRISPR-Cas9基因组编辑技术的进步使得在特定位点对内源候选基因进行高效编辑和快速敲除突变成为可能。此外, 农杆菌介导的水稻遗传转化也是基因修饰的一种关键方法,已被众多公共和私人实验室广泛采用。在本研究中,我们应用了CRISPR-Cas9基因组编辑工具,通过靶向基因组编辑成功获得了三个雄性不育突变系 OsABCG15 在一个 japonica 品种。我们采用了一种改良的 农杆菌介导的水稻转化方法,可为水稻杂交种子生产提供优良的遗传雄性不育手段。在2–3个月内即可获得转基因植株,并通过PCR扩增和Sanger测序进行基因分型以筛选纯合转化子。对雄性不育纯合系的基本表型特征分析,通过显微镜观察水稻雄性生殖器官,并利用碘化钾碘溶液(I2-KI染色发育中花药的半薄横切片。

引言

水稻是最重要的粮食作物,尤其是在发展中国家,全球超过一半人口以水稻为主食。总体而言,稻米的需求量正在不断增长,预计到2030年将增加50%,到2050年将翻倍1,2。未来水稻产量的提升需要充分利用多种分子和遗传资源,这些资源使水稻成为单子叶植物研究的理想模式作物。这些资源包括高效的遗传转化系统、先进的分子遗传图谱,以及多年来积累并公开可获取的表达序列标签数据库3,4。提高作物产量的一种策略是杂交种子生产5,其核心在于对雄性育性的调控能力。深入了解谷类作物雄性育性的分子调控机制,有助于将关键科学知识转化为实用技术,从而改进杂交种子生产并提高作物产量6,7。

遗传转化是基础研究和商业农业中的关键技术,因为它能够将外源基因导入作物植物或对内源基因进行改造,从而获得转基因品系。合适的转化方案有助于加速遗传学和分子生物学研究,促进对基因调控机制的深入理解8在细菌中,遗传转化是自然发生的;然而,在植物中,该过程需通过分子生物学技术进行人工实现。<....

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方案

1. sgRNA-CAS9 植物表达载体构建与 农杆菌介导的转化

  1. 根据已发表的文献28,靶向水稻中的雄性不育基因 OsABCG15。
  2. 设计针对 OsABCG15 第二个外显子中位于 106–125 bp 区域的靶位点的 sgRNA(图 1)。
  3. 使用 T4 多核苷酸激酶合成 sgRNA 寡核苷酸(sgR-OsABCG15-F:5’TGGCAAGCACATCCTCAAGGGGAT3’ 和 5’sgR-OsABCG15-R:AAACATCCCCTTGAGGATGTGCTT’)。
  4. 使用内切酶 BbsI 消化 psgR-Cas9 骨架载体29。
  5. 按照制造商的说明,使用 T4 连接酶将合成的 sgRNA 寡核苷酸与线性化的 psgR-Cas9 骨架进行连接。
  6. 使用 HindIII/EcoRI 从步骤 1.5 中消化出 sgRNA 表达盒,并将其亚克隆至 pCAMBIA1300 双元载体的 HindIII/EcoRI 位点,用于稳定转化29。
  7. 通过酶切和测序验证构建的质粒。随后,将该双元载体转化至农杆菌 Agrobacterium tumef....

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结果

此处展示的是利用基因编辑技术创建雄性不育系,以用于后续研究 农杆菌介导的水稻遗传转化。以创建水稻雄性不育系 osabcg15CRISPR-Cas9介导的诱变用于双元载体构建。sgRNA由OsU3启动子驱动,hSpCas9表达盒由双35S启动子驱动,中间载体被组装至单一双元载体中 pCAMBIA1300 专为 农杆菌介导的水稻稳定转化。文中提供了用于CRISPR/Cas9介导水稻突变的载体构建图示。 图1A.

图2 和 图3 代表水稻转基因生产的完整流程。选择幼嫩的花序作为外植体(图2)并在接种到NBD2培养基后14天内诱导出松脆的胚性愈伤组织(FEC)图3A)。将胚性愈伤组织直接用于 农杆菌介导的转.......

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讨论

人工基因雄性不育突变体传统上通过随机的物理、化学或生物诱变方法产生。尽管这些技术十分有效,但其随机性无法充分利用现代基因组学知识,而这些知识具有在分子育种中实现定制化改良的潜力32。CRISPR-Cas9 系统因其操作简便且成本低廉,已被广泛应用于植物中以实现DNA的操控与编辑29,33;与传统诱变方法相比,该系统有望节省大量时间。

在此,我们开发了一种简便的方法 农杆菌以幼穗作为外植体的介导转化体系用于愈伤组织诱导。在转基因流程中,某些步骤可以省略以节省时间。与使用种子作为外植体相比,采用幼穗作为起始材料能够显著缩短愈伤组织诱导的整体周期。此外,由幼穗获得的愈伤组织具有很强的细胞分化和再生能力。在此过程中可避免水稻愈伤组织的继代培养,从而进一步节约时间,并降低细菌和真菌污染的风险。此外,本实验使用替米汀(timentin)作为抗生素,替代羧苄青霉素(carbenicillin),其对细菌的抑制效果更.......

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致谢

作者感谢陈晓飞提供水稻幼穗并协助配制水稻组织培养基。本工作受到国家自然科学基金(31900611)的资助。

....

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
1-萘乙酸Sigma-AldrichN0640
2,4-二氯苯氧乙酸Sigma-AldrichD7299
6-苄氨基嘌呤(6-BA)Sigma-AldrichB3408
乙酰丁香酮Sigma-AldrichD134406
琼脂国药集团化学试剂有限公司10000561
硫酸铵国药集团化学试剂有限公司10002918
盐酸硫胺素Sigma-AldrichT4625
无水乙醇国药集团化学试剂有限公司10009218
细菌性蛋白胨生工生物工程(上海)股份有限公司A100636
牛肉浸膏生工生物工程(上海)股份有限公司A600114
硼酸国药集团化学试剂有限公司10004808
二水氯化钙国药集团化学试剂有限公司20011160
酪蛋白酸水解物北京西美杰科技有限公司C184
六水合氯化钴(II)国药集团化学试剂有限公司10007216
五水合硫酸铜(II)国药集团化学试剂有限公司10008218
无水D-(+)-葡萄糖国药集团化学试剂有限公司63005518
D-山梨醇国药集团化学试剂有限公司63011037
EDTA二钠盐二水合物Sigma-AldrichE5134
EOS数码单反及微单相机佳能EOS 700D
甲醛国药集团化学试剂有限公司10010018
全自动旋转切片机徕卡生物系统公司Leica RM 2265
冰乙酸国药集团化学试剂有限公司10000208
甘氨酸国药集团化学试剂有限公司62011516
潮霉素北京西美杰科技有限公司H370
肌醇国药集团化学试剂有限公司63007738
碘国药集团化学试剂有限公司10011517
七水合硫酸亚铁国药集团化学试剂有限公司10012116
卡那霉素北京西美杰科技有限公司K378
激动素Sigma-AldrichK0753
L-精氨酸国药集团化学试剂有限公司62004034
L-天冬氨酸国药集团化学试剂有限公司62004736
L-谷氨酰胺北京西美杰科技有限公司G229
L-脯氨酸北京西美杰科技有限公司P698
七水合硫酸镁国药集团化学试剂有限公司10013018
一水合硫酸锰国药集团化学试剂有限公司10013418
显微镜尼康Eclipse 80i
MS培养基PhytotechM519
烟酸Sigma-AldrichN0765
植物凝胶Sigma-AldrichP8169
氯化钾国药集团化学试剂有限公司10016308
磷酸二氢钾国药集团化学试剂有限公司10017608
碘化钾国药集团化学试剂有限公司10017160
硝酸钾国药集团化学试剂有限公司1001721933
盐酸吡哆醇(B6)Sigma-Aldrich47862
利福平北京西美杰科技有限公司R501
氢氧化钠国药集团化学试剂有限公司10019718
二水合钼酸钠国药集团化学试剂有限公司10019816
体视显微镜徕卡显微系统公司Leica M205 A
蔗糖国药集团化学试剂有限公司10021418
Technovit包埋试剂盒7100Heraeus Teknovi, 德国14653
特美汀北京西美杰科技有限公司T869
甲苯胺蓝OSigma-AldrichT3260
石蜡切片水浴锅徕卡生物系统公司Leica HI1210
酵母提取物生工生物工程(上海)股份有限公司A515245
七水合硫酸锌国药集团化学试剂有限公司10024018

参考文献

  1. FAO. FAO statistical yearbook, World Food and Agriculture. Rome. ISBN 978-92-5-107396-4. , Available from: http://www.fao.org/3/i3107e/i3107e.pdf (2013).
  2. FAO. The future of food and agriculture: Trends and challenges. Rome. ISBN 978-92-5-109551-5. , Available from: http://www.fao.org/3/a-i6583e.pdf 109551-109555 (2017).
  3. Izawa, T., Shimamoto, K.

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