本方案描述了通过核转染递送附加体质粒,从胎儿组织成纤维细胞生成无整合的诱导多能干细胞(iPSCs),并进一步阐述了用于iPSC鉴定及神经元分化的实验方法。
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本方案描述了通过核转染递送附加体质粒,从胎儿组织成纤维细胞生成无整合的诱导多能干细胞(iPSCs),并进一步阐述了用于iPSC鉴定及神经元分化的实验方法。
染色体非整倍性可导致严重的先天性畸形,包括中枢神经系统畸形以及胎儿死亡。产前遗传学筛查仅为诊断性手段,无法阐明疾病机制。尽管来自非整倍体胎儿的细胞是携带染色体非整倍性的宝贵生物材料,但这些细胞寿命较短,限制了其在后续科研实验中的应用。诱导性多能干细胞(iPSC)模型的建立是一种有效的细胞制备方法,可实现非整倍体特征的长期保存。这类细胞具有自我更新能力,并可分化为类似于胚胎发育过程中的特化细胞,因此iPSC是研究早期发育事件的优良工具。特纳综合征(TS)是一种与X染色体完全或部分缺失相关的罕见疾病,其特征包括不孕、身材矮小、内分泌、代谢、自身免疫和心血管系统疾病,以及神经认知缺陷。本方案描述了从TS(45,XO)胎儿组织中分离并培养成纤维细胞,通过核转染递送附加体型重编程质粒生成无整合的TSiPSC,随后进行表征分析的完整流程。重编程获得的TSiPSC首先通过活细胞碱性磷酸酶染色进行初步筛选,再通过广泛检测多能性生物标志物进行深入验证。挑选出的克隆通过机械法解剖,连续传代数次后,获得稳定自我更新的细胞用于后续实验。这些细胞表达多能性转录因子OCT4、NANOG、SOX2,以及多能干细胞典型的细胞表面标志物SSEA-4和TRA1-81。重编程后,原始的45,XO核型得以保留。TSiPSC能够形成拟胚体,并分化为表达谱系特异性生物标志物的内胚层、中胚层和外胚层细胞(SRY BOX17、MYOSIN VENTRICULAR HEAVY CHAINα/β、βIII TUBULIN)。外源附加体型质粒在细胞中自发丢失,在传至第15代后已无法检测到。这些TSiPSC是研究特纳综合征相关神经认知缺陷背后异常分子与细胞神经发育过程的宝贵细胞资源。
非整倍体会导致人类出生缺陷或先天性畸形以及妊娠丢失。约50%至70%的妊娠丢失样本显示出细胞遗传学异常。在妊娠早期丢失的非整倍体胚胎难以获取用于实验分析,因此有必要开发其他能够紧密模拟人类胚胎发育的模型。已利用携带遗传病诊断结果的细胞所衍生的诱导性多能干细胞(iPSCs)来模拟代表性遗传异常及其对胎儿发育的影响1,2,3,4。这些iPSCs类似于发育中胚胎的上胚层细胞,能够重现胚胎形成的早期事件,有助于理解并表征早期哺乳动物胚胎中细胞谱系的发育程序与模式形成。此前由产前诊断检测中获得的非整倍体综合征(如X单体(特纳综合征)、8三体(瓦尔科尼综合征2型)、13三体(帕陶综合征)以及部分11号与22号染色体三体(埃马纽埃尔综合征))的皮肤成纤维细胞和羊水细胞所衍生的iPSCs,已为研究发育失败机制提供了重要见解4。
特纳综合征(TS)是一种罕见疾病,其特征为女性不孕、身材矮小、内分泌和代谢紊乱、自身免疫性疾病风险增加,以及易患心血管疾病5。尽管它是唯一可存活的单体综合征,但仍可导致胚胎发育过程中死亡,引起自然流产6。存活的TS患者其细胞中均存在不同程度的X染色体物质异常。核型从一条X染色体完全缺失(45,XO)到嵌合体如45,XO/46,XX;45,XO/47,XXX,以及环状染色体的存在、Y染色体物质的存在等5。
该综合征的诊断通常通过对有症状个体的血液进行核型分析,以及对绒毛组织进行绒毛取样(CVS),以检测早期的非整倍体综合征。由于非整倍体综合征约占自然流产病例的30%,因此在发生自然流产后,常规会对妊娠产物(POC)进行核型分析。这些含有细胞遗传学异常的胎儿细胞,包括绒毛组织及其来源的诱导多能干细胞(iPSCs),为研究非整倍体综合征提供了宝贵的生物材料资源4,6。此前已有研究通过逆转录病毒重编程技术从羊水细胞4、通过逆转录病毒重编程从绒毛组织成纤维细胞(经产前诊断获得) 6、通过仙台病毒重编程从外周血单个核细胞7,以及通过慢病毒重编程从特纳综合征(TS)患者皮肤成纤维细胞中建立TS来源的iPSCs4。由于我们实验室的主要研究方向是理解发育失败的机制,因此我们从自然流产的妊娠产物(POC)中,特别是其中的绒毛组织部分,建立了TS来源的iPSCs8。从该胎儿组织中分离出的所有细胞均具有45,XO核型,并成功诱导生成了具有相同核型的iPSCs。这些iPSCs具有独特性,因为它们是首次从流产胎儿组织中建立的,为研究与非整倍体相关的妊娠失败提供了宝贵的资源。本文详细介绍了通过附加体质粒重编程技术,从这一独特细胞来源生成iPSCs的方法学流程。
早期的iPSC生成方法使用病毒转导和转座子来递送重编程因子。诱导细胞获得多能性的方法已从使用整合型逆转录病毒载体9、可切除的慢病毒载体10,11以及基于转座子的方法12,发展到非整合型腺病毒载体13和基于仙台病毒的载体14。尽管基于逆转录病毒和慢病毒的重编程效率较高,但其会导致重编程因子整合到宿主染色体中,引起插入突变,从而对iPSC产生不可预知的影响。此外,基于病毒的重编程阻碍了iPSC的转化应用。研究人员已探索RNA-based系统15和直接蛋白递送16,以彻底消除与病毒和DNA转染相关的潜在风险。然而,这些方法被证明效率较低。
2011年,Okita 等人报道了通过shRNA抑制TP53可提高附加型质粒重编程的效率。他们还用非转化型LMYC(小细胞肺癌相关MYC)替代cMYC,以增强hiPSCs的安全性。这些附加型质粒表达5种重编程因子:OCT4、LIN28、SOX2、KLF4、LMYC以及针对TP5317,18的shRNA。这些载体在染色体外维持,并在连续传代培养过程中逐渐从重编程细胞中丢失,因此可在10–15代内获得无外源基因整合的细胞系。核转染(Nucleofection)是一种特殊的电穿孔技术,可将核酸直接递送至宿主细胞的细胞核内,是将重编程质粒导入多种细胞类型的高效方法。附加型质粒成本较低,可在一定程度上弥补核转染的高成本。在优化条件下,该方法具有高效性和可重复性,能够从多种体细胞中稳定产生iPSCs。在本方案中,我们描述了通过核转染附加型重编程质粒,从胎儿组织来源的成纤维细胞中生成iPSCs的方法。具体内容包括从胎儿绒毛膜绒毛中分离成纤维细胞、质粒纯化、核转染、从重编程培养板中挑取克隆以及建立稳定的iPSCs系的详细操作步骤。
确认新生成的iPSCs中存在多能性特征至关重要。这包括证明多能性相关因子的存在(例如碱性磷酸酶表达、NANOG、SSEA4、Tra 1-80、Tra 1-81、E-cadherin;通常通过免疫荧光或基因表达检测来显示),以及通过三胚层分化能力鉴定三个胚层的形成 体外 分化实验以验证其分化潜能,核型分析以确定染色体组成,STR分型以确认与亲代细胞的遗传一致性,验证外源基因的丢失情况,以及其他更严格的检测 体内 畸胎瘤形成和四倍体补偿等检测。本文描述了核型分析、活细胞碱性磷酸酶染色、通过免疫荧光检测多能性相关生物标志物的表征方案, 体外 分化检测实验及外源基因丢失的验证方法19.
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FCV 毒株由班加罗尔玛希普尔医院提供,并已获得玛希普尔医院伦理委员会批准。
注意:所有缓冲液和溶液的成分见表1。
1. 从胎儿绒毛膜绒毛(FCV)中分离成纤维细胞
2. 质粒DNA的提取与验证
3. 核转染
4. iPSC 克隆的挑选与扩增
5. 诱导多能干细胞的表征
注意:在第五代之后进行包括PCR和多能性生物标志物免疫染色在内的表征研究。核型分析在更晚的代数进行。
6. 体外分化实验
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从核型为45XO的自然流产胎儿中生成无整合iPSCs
我们从具有特纳综合征(TS)特异性45,XO核型的特纳综合征患者成纤维细胞(FCV)中分离出成纤维细胞,并利用附加体型重编程质粒对其进行核转染,以生成TS诱导性多能干细胞(TSiPSCs),可用于后续对该综合征特别是其相关的神经功能缺陷进行建模研究。图1a&b)。我们采用非整合型附加体质粒和核转染技术进行转染实验(图1 c&d)。我们通过监测细胞形态学变化来评估重编程是否成功。观察到细胞从成纤维细胞形态转变为上皮样形态,随后形成界限清晰的紧凑集落(图 2a)。转染后约第20天,TSiPSCs呈现出类似人类胚胎干细胞的形态,边缘清晰,核质比高。图2b相比之下,重编程不完全的细胞虽获得上皮样形态,但无法形成致密的克隆集落。
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建立具有细胞遗传学异常的胎儿组织的稳定细胞模型,对于持续保留缺陷表型是必要的。诱导多能干细胞(iPSC)方法是用于长期保存缺陷特性的最有效的细胞制备手段20。
多能干细胞(PSC)具有自我更新能力,并能分化为类似于早期卵裂胚胎的特化细胞21。因此,PSC 可作为研究早孕期自然流产胎儿中早期分子、细胞及发育缺陷的优良模型。
本文介绍了利用核转染技术结合改良的附加体型载体生成人类诱导多能干细胞(iPSC)的方法。结果表明,该组合是一种高效且稳健的方法,可用于生成无整合的人类iPSC细胞系,这一点已由单次转染即可成功实现重编程的结果所证实。我们通过显微镜观察了FCV成纤维细胞逐步转化为多能性细胞的过程。转染后20天,我们观察到重编程产生的TSiPSC细胞集落,周围仍残留未重编程的FCV成纤维细胞。形态学上,所获得的人类iPSC与实验室中同步培养的胚胎干细胞相似,通常形成结构致密、边缘光亮的细胞集落。集落中的细胞具有较大的细胞核,排列紧密,...
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作者无任何利益冲突需要披露。
上述研究的经费由马尼帕尔高等教育学院提供。该品系的表征工作部分在印度国家生物科学中心M. M. Panicker的实验室完成。我们感谢Anand诊断实验室在核型分析方面提供的协助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 0.15% 胰蛋白酶 | 赛默飞世尔科技 | 27250018 | G显带 |
| 2-巯基乙醇 | 赛默飞世尔科技 | 21985023 | 多能性与拟胚体培养基 |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Sigma Aldrich | D8417 | 免疫细胞化学 |
| 激活素A | Sigma Aldrich | SRP3003 | 分化检测 |
| 活细胞碱性磷酸酶染色 | 赛默飞世尔科技 | A14353 | 碱性磷酸酶染色 |
| AMAXA Nucleofector II | Lonza | - | 核转染 |
| AmnioMAX II 完全培养基 | 赛默飞世尔科技,Gibco | 11269016 | 适用于胎儿绒毛细胞培养的培养基 |
| 氨苄青霉素 | HiMedia | TC021 | 质粒纯化 |
| 抗小鼠 IgG(H+L)Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11059 | 免疫细胞化学 |
| 抗兔IgG(H+L)Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11034 | 免疫细胞化学 |
| 抗兔IgG(H+L)Alexa Fluor 546 | Invitrogen | A11035 | 免疫细胞化学 |
| 抗生素-抗真菌剂 | 赛默飞世尔科技,Gibco | 15240096 | 污染控制 |
| 抗E-钙黏蛋白 | BD Biosciences | 610181 | 免疫细胞化学 |
| 抗Nanog | BD Biosciences | 560109 | 免疫细胞化学 |
| 抗OCT3/4 | BD Biosciences | 611202 | 免疫细胞化学 |
| 抗SOX17 | BD Biosciences | 561590 | 免疫细胞化学 |
| 抗SOX2 | BD Biosciences | 561469 | 免疫细胞化学 |
| 抗SSEA4 | BD Biosciences | 560073 | 免疫细胞化学 |
| 抗TRA 1-81 | Millipore | MAB4381 | 免疫细胞化学 |
| 碱性成纤维细胞生长因子[FGF2] | Sigma Aldrich | F0291 | 多能性培养基 |
| 骨形态发生因子4 | Sigma Aldrich | SRP3016 | 分化检测 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma Aldrich | A3059 | 封闭 |
| 人Ⅳ型胶原蛋白 | BD Biosciences | 354245 | 分化检测 |
| 胶原酶混合物 | Sigma Aldrich | C8051 | 消化胎儿绒毛组织 |
| 地塞米松 | Sigma Aldrich | D4902 | 分化检测 |
| DMEM F12 | 赛默飞世尔科技 | 11320033 | 分化检测 |
| FastDigest EcoR1 | 赛默飞世尔科技 | FD0274 | 限制性酶切 |
| 纤连蛋白 | Sigma Aldrich | F2518 | 分化检测 |
| 吉姆萨染色 | HiMedia | S011 | G显带 |
| 冰醋酸 | HiMedia | AS001 | 核型分析用固定剂 |
| 葡萄糖 | Sigma Aldrich | G7528 | 分化检测 |
| GlutaMAX | 赛默飞世尔科技 | 35050061 | 多能性与拟胚体培养基 |
| 肝素钠 | Sigma Aldrich | H3149 | 分化检测 |
| 人胰岛素溶液 | Sigma Aldrich | I9278 | 分化检测 |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒酸盐 | Sigma Aldrich | I1884 | 分化检测 |
| KAPA HiFi PCR 试剂盒 | Kapa Biosystems | KR0368 | OriP, EBNA1 PCR |
| KaryoMAX Colcemid | 赛默飞世尔科技 | 15210040 | 有丝分裂阻滞用于核型分析 |
| KnockOut DMEM | 赛默飞世尔科技 | 10829018 | 多能性与拟胚体培养基 |
| KnockOut血清替代物 | 赛默飞世尔科技 | 10828028 | 多能性与拟胚体培养基 |
| Luria Bertani 琼脂 | HiMedia | M1151F | 质粒纯化 |
| 基质胶 | BD Biosciences | 356234 | 分化检测 |
| MEM 非必需氨基酸 | 赛默飞世尔科技 | 11140035 | 多能性与拟胚体培养基 |
| 甲醇 | HiMedia | MB113 | 核型分析用固定剂 |
| 肌球蛋白心室重链 α/β | Millipore | MAB1552 | 免疫细胞化学 |
| NHDF Nucleofector 试剂盒 | Lonza | VAPD-1001 | 核转染 |
| 多聚甲醛(PFA) | Sigma Aldrich | P6148 | 固定细胞 |
| pCXLE-hOCT3/4-shp53-F | Addgene | 27077 | 游离型重编程质粒 |
| pCXLE-hSK | Addgene | 27078 | 游离型重编程质粒 |
| pCXLE-hUL | Addgene | 27080 | 游离型重编程质粒 |
| 青霉素-链霉素 | 赛默飞世尔科技 | 15070063 | 多能性与拟胚体培养基 |
| 鬼笔环肽-异硫氰酸四甲基罗丹明 | Sigma Aldrich | P1951 | 免疫细胞化学 |
| 磷酸盐缓冲液 | Sigma Aldrich | P4417 | 1 × PBS 1片PBS溶于200 mL去离子水中,经高压灭菌 储存条件:室温。 PBST - 含 0.05% Tween 20 的 1X PBS 储存条件:室温。 |
| 质粒纯化试剂盒-中量提取 | QIAGEN | 12143 | 质粒纯化 |
| 氯化钾溶液 | HiMedia | MB043 | 核型分析用低渗溶液 |
| QIAamp DNA Blood Kit | Qiagen | 51104 | 基因组DNA提取 |
| RPMI 1640 | 赛默飞世尔科技 | 11875093 | 肝细胞分化培养基 |
| 柠檬酸钠 | HiMedia | RM255 | 核型分析用低渗溶液 |
| Triton X-100 | HiMedia | MB031 | 透化 |
| 胰蛋白酶-EDTA(0.05%) | 赛默飞世尔科技,Gibco | 25300054 | 传代培养 胎儿绒毛膜绒毛成纤维细胞 |
| Tween 20 | HiMedia | MB067 | PBST 的制备 |
| β βIII 微管蛋白 | Sigma Aldrich | T8578 | 免疫细胞化学 |
| Y-27632 二盐酸盐 | Sigma Aldrich | Y0503 | 分化检测 |
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