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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
我们报告了一种简单、省时和高通量荧光光谱分析,用于从啮齿动物和人类受试者脑组织 中对 活体细丝进行定量。
Actin 是细胞骨骼的主要成分,在维持神经元结构和功能方面起着至关重要的作用。在生理状态下,行为素以两种形式以平衡形式发生:单体球状(G-actin)和聚合丝(F-actin)。在突触终端,作用细胞细胞细胞形成关键突触前和突触后功能的基础。此外,作用素聚合状态的动态变化(球状和细丝形式的作用之间的转换)与突触结构和功能的可塑性相关变化密切相关。我们在这里报告一种基于荧光的修改方法,以评估 前体内 环境中作用素的聚合状态。该检测采用荧光标签的法洛丁,一种法洛托辛,专门结合到作用丝(F-actin),提供聚合丝活性蛋白的直接测量。作为原则的证明,我们为在啮齿动物和死后人类脑组织同质化中进行检测的适用性提供了证据。使用拉特伦库林A(一种使肌细丝脱聚的药物),我们确认该检测在监测F-actin水平变化方面的作用。此外,我们扩展检测到分离突触终端的生化部分,其中我们确认通过高细胞外 K+去极化刺激刺激时增加作用素聚合。
细胞骨质蛋白作用素涉及多种细胞功能,包括结构支持、细胞传输、细胞动力和分裂。Actin 以两种形式以均衡形式发生:单体球状作用素 (G-actin) 和聚合丝作用素 (F-actin)。actin的聚合状态(其G-和F-形式之间的互通)的快速变化导致快速的丝组装和拆卸,并成为其细胞生理学调控作用的基础。Actin是神经元细胞骨结构的主要组成部分,影响广泛的神经元功能1,2。值得注意的是,细胞球菌的作用是突触终端结构平台的组成部分。因此,它是突触形态形成和生理学的主要决定因素,在控制突触3、4、5的大小、数量和形态方面起着基础性作用。特别是,动态作用聚合-去聚合是与记忆和学习过程背后的突触可塑性相关的突触重塑的关键决定因素。事实上,前突性(如神经递质释放6,7,8,9,10)和后突体功能(可塑性相关的动态改造11,12,13,14)都严重依赖于在细胞细胞细胞顿的聚合状态的动态变化。
在生理条件下,F-actin水平通过多式联运途径进行动态和严格调节,包括后翻译修饰4、15、16以及活性结合蛋白(ABPs)4、17。ABP 可以影响多个级别的活性动力学(如启动或抑制聚合、诱导丝分枝、将细丝分离到较小的碎片、促进去聚合和防止脱聚),并依次在对各种细胞外信号敏感的严格调制控制下18、19、20。这种多层次的监管检查要求对突触细胞细胞细胞的活性动力学进行严格监管,在基础和活动诱发状态下对神经元生理学的前期和后突触方面进行微调。
鉴于行为素在神经元生理学中的重要作用,一些研究提供了证据,证明行为动力学的改变与各种神经系统疾病有关,包括神经退化、心理疾病以及神经发育疾病3、21、22、23、24、25、26、27等。然而,尽管大量的研究数据表明作用在神经元生理学和病理生理学中的关键作用,但在对行为动力学的理解上,特别是在突触细胞细胞细胞学方面,仍然存在着重大差距。需要更多的研究来更好地了解神经元作用及其在病理条件下的改变。在这方面,一个主要的重点领域是评估作用物聚合状态。有西方印迹为基础的商业套件(G-Actin/F-Actin在体内测定生化套件;赛托斯凯尔顿SKO BK03728,29)和自制的检测评估F-actin水平6。然而,由于这些需要F-actin和G-actin的生化分离,并且由于它们随后的定量基于免疫凝固协议,因此它们可能非常耗时。我们这里报告一个荧光光谱为基础的检测,改编自先前的研究30与修改,可用于评估F-actin的基础水平,以及其组装拆解的动态变化。值得注意的是,我们已经有效地修改了原来的协议,要求样品适合1 mL的cuvette到目前的96井板格式。因此,修改后的方案显著减少了检测所需的组织/样本量。此外,我们提供证据表明,该协议不仅适用于脑组织同质化,还适用于细胞下部分,如分离突触终端(突触体和突触体)。最后,该检测可用于刚解剖的啮齿动物脑组织和长期储存的死后人类大脑样本。值得注意的是,虽然测定是在神经元环境中呈现的,但它可以适当地扩展到与之相关的其他细胞类型和生理过程。
所有实验程序均按照奥塔哥大学保护和使用实验室动物道德委员会的规定进行(道德议定书第1号)AUP95/18 和 AUP80/17)和新西兰立法机构。人脑组织是从西班牙巴塞罗那的Clénic-IDIBAPS生物库的神经组织库获得的。所有组织收集协议均得到巴塞罗那克莱尼奇医院道德委员会的批准,并征得家属的知情同意。
1. 准备缓冲器和试剂
2. 脑组织同质化
3. 准备孤立的神经末梢
4. KCl 调解的分离突触终端的去极化
5. 样品的固定和法乐丁染色
6. 荧光分析和光散射
7. 数据分析
F-actin 水平评估的检测的线性
首先,确定了亚历克萨荧光647法洛丁荧光线性增加的标准曲线,并重复了每组实验(图1)。为了调查检测的线性范围,处理了不同数量的大脑同质性,从啮齿动物(图2A和2B)和死后人类受试者(图3A和3B)。检测结果发现,该检测在50-200微克蛋白质范围内是线性的,通过保留的标记法洛丁量进行评估。在540纳米处散射的光用于确认不同数量的样品(图2C和图3C)。
拉特伦库林, 一种行为脱聚剂, 减少标签法利丁的绑定
拉特伦库林A是众所周知的去聚合行为丝和减少F-actin36,37,38,39的水平。来自啮齿动物或人类脑组织的同质物在37°C下用2μM拉特伦库林A孵育1小时,以去聚肌细丝。在 37 °C 的相同持续时间内,使用 DMSO 孵育了相应的未经处理的控制集。 该检测有力地测量了对照样本中F-actin水平的损失,从对照样本中的95.7±6.6(平均±SEM)到3.2(平均 ±±SEM)μU在鼠脑同质性(图4A)中受约束的phalloidin。当人类脑组织中的同质素受到拉修剪素A治疗时,也观察到在保留标记的巴霍丁方面,保留标记的巴霍丁的降幅(从83.7 ±±3.9降至66.9(图4B)。值得注意的是,通过免疫凝血评估,总作用素水平在治疗大鼠(补充图1A-B)和人(补充图1C-D)大脑均质后没有变化。
分离突触终端的去极化刺激作用聚合和细丝形成
分离突触终端的外活脱极化已被证明导致活性聚合6,30,40的快速刺激,这种现象被用作进一步确认此处报告的检测结果。在突触终端中浓缩的生化分数以两种不同的方式准备:基于梯度的超中心化方法,以获得"突触体"41,42,43,44和顺序过滤为基础的协议,以获得"突触体"43,45,46。由于后者的产量较高,我们将其用于人体死后脑组织,其中组织数量经常受到限制。另一方面,我们更倾向于使用突触体与更高程度的突触片段41的丰富度用于我们的大鼠脑组织实验。
突触体或突触体的去极化和作用素聚合的刺激是通过细胞外K+ 到50m的短暂(30秒)爆发实现的。与各自的模拟刺激对照组(图5A:另见 补充图2A)相比,KCl暴露导致啮齿类脑突触体中的巴洛丁结合增加近40%。较小的(约20%)但在接受KCl治疗的人类突触体中也观察到持续增加(图5B:另见 补充图2A)。这些实验验证了我们检测的稳健性,以确定脑组织样本(包括分离突触终端)中F-actin水平的变化。

图1。亚历克萨荧光647法洛丁荧光的标准曲线。 荧光光谱仪在激发645纳米和670 nm(R 2 = 0.9942)时确认了不同量(25-500 μU)的荧光发射的线性。数据表示为平均± SEM (n=3)。请单击此处查看此图的较大版本。

图2。与大鼠脑组织中的全细胞同质素结合的巴霍林的线性。 (A) 评估了巴霍林与不同数量的同质物质(50-300μg蛋白质)的结合。(B) 结合在 50-200 μg 蛋白质 (R2 = 0.9602) 范围内是线性的。(C) 散射在 540 nm 用于确认不同数量的样品 (R2 = 0.8319)。数据表示为平均± SEM (n=4)。请单击此处查看此图的较大版本。

图3。法罗丁与死后人类脑组织产生的全细胞同质素结合。 (A) 评估了一系列同质物质(50-300μg蛋白质)中的法乐蛋白保留量。(B) 发现法罗丁结合在 50-200 μg 蛋白质 (R2 = 0.8832) 范围内是线性的。(C) 散射在 540 nm 确认样本的不同数量 (R2 = 0.9730)。数据表示为平均± SEM (n=4)。请单击此处查看此图的较大版本。

图4。拉特伦库林 A 对 F - actin 水平的影响。 与通过在啮齿动物中保留标记的法乐素(p = 0.0034) 相比,使用行为脱聚剂拉特伦库林 A (2 μM, 1 h 在 37°C) 进行的大脑同质化治疗导致行为素细丝的量显著减少: 配对双尾学生 t测试(A)和验尸人体组织 (p = 0.0011; 配对双尾学生 t测试)(B)。数据表示为平均± SEM(n=6 对)。请单击此处查看此图的较大版本。

图5。KCl 介导去极化对孤立突触终端中 F-actin 量的影响。 (A) 在 37°C 时,用 50 mM KCl 从大鼠大脑中孵化出 30s 的突触体刺激作用素聚合,从而导致巴洛丁结合增加(p = 0.0014;配对双尾学生 t测试)。(B) 在死后人类脑组织的突触分子分数中也观察到较小的增加(p = 0.014;配对双尾学生 t测试)。数据表示为平均± SEM(n=6 对)。请单击此处查看此图的较大版本。
补充图1。拉特伦库林 A 对总作用水平的影响。 大脑同质化与拉特伦库林A(2μM,1小时在37°C)或等量的DMSO(1小时在37°C)孵育。在固定之前收集了每个样本10微克蛋白质(拉伦库林A处理和DMSO模拟处理控制)。通过免疫凝血评估了行为素水平的总水平。代表斑点显示为大鼠(A)和人类(C)大脑同质化。拉特伦库林A没有改变两只大鼠(B;p=0.40;配对双尾学生t测试)和人(D;p=0.42;配对双尾学生t测试)大脑均质的总作用水平。数据表示为平均± SEM(n=3 对)。请单击此处下载此文件。
补充图2。KCl介导的去极化对大鼠突触体和人类突触体的F-actin水平的影响。 (A) 从大鼠大脑中用 50 mM KCl (30 s 在 37 °C) 中孵化突触体,刺激了作用素聚合,并随之增加了巴洛丁结合(p = 0.0019;配对双尾学生 t测试)。(B) 与各自的未刺激控制(p = 0.015;配对双尾学生 t测试)相比,KCl去极化的人类突触神经分量中也观察到巴洛丁保留率的增加。数据表示为平均± SEM(n=6 对)。请单击此处下载此文件。
作者没有什么可透露的。
我们报告了一种简单、省时和高通量荧光光谱分析,用于从啮齿动物和人类受试者脑组织 中对 活体细丝进行定量。
这项工作得到了新西兰神经学基金会(1835-PG)、新西兰健康研究理事会(#16-597)和新西兰奥塔哥大学解剖学系的支持。我们感谢HCB-IDIBAPS生物库(西班牙)的神经组织库用于人体脑组织。我们感谢张嘉贤在录制和编辑视频方面所做的帮助。
| 3.5 mL,顶部开口厚壁聚碳酸酯管 | Beckman Coulter | 349622 | 用于梯度离心(突触体制备) |
| Alexa Fluor 647 鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | A22287 | F-肌动蛋白特异性配体 |
| 抗体 b-肌动蛋白 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-47778 | 用于通过免疫印迹评估总肌动蛋白水平 |
| 抗 GAPDH 抗体 | Abcam Ab181602 | 用于通过免疫印迹评估 GAPDH 水平 | |
| Bio-Rad 蛋白质测定 染料试剂浓缩 | 液Bio-Rad | 5000006 | 基于布拉德福德的蛋白质估计 |
| 氯化钙二水合物 (CaCl2·2H2O) | Sigma-Aldrich | C3306 | 克雷布斯缓冲液组分 |
| cOmplete、Mini、不含 EDTA 的蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | 4693159001 | 用于样品制备过程中的内源性蛋白酶活性 |
| 康宁 96 孔透明平底聚苯乙烯 | Corning | 3596 | 用于光散射测量 |
| D-(+)-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G8270 | 克雷布斯缓冲组分 |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D5879 | 鬼笔环肽和拉脱纽菌素的溶剂 荧光 |
| 平板扫描仪(Odyssey 红外扫描仪) | Li-Cor Biosciences | 用于检测免疫印迹上的免疫反应信号 | |
| 戊二醛溶液(25% 水溶液) II 级 | Sigma-Aldrich | G6257 | 固定剂 |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | 用于样品制备的缓冲成分和三羧酸缓冲成分 |
| Latrunculin A | Sigma-Aldrich | L5163 | 肌动蛋白丝解聚剂 |
| 氯化镁六水合物 (MgCl2·6H2O) | Sigma-Aldrich | M2670 | Krebs 缓冲液组分 |
| 微孔板 | |||
| Mitex 膜过滤器 5 mm | Millipore | LSWP01300 | 突触神经体的制备 |
| Nunc F96 MicroWell 黑色板 | Thermo Fisher Scientific | 237105 | 用于荧光测量 |
| 尼龙网过滤器 100 mm | Millipore | NY1H02500 | 突触神经体的制备 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 IV | Abcam | ab201115 | 用于样品制备过程中的内源性磷酸酶活性 |
| 氯化钾 (KCl) | Sigma-Aldrich | P9541 | 克雷布斯缓冲液组分和突触末端的去极化 |
| 磷酸二氢钾 ((KH2PO4) | Sigma-Aldrich | P9791 | 克雷布斯缓冲液组分 |
| 硼氢化钠 (NaBH4) | Sigma-Aldrich | 71320 | 透化缓冲液组分 |
| 氯化钠 (NaCl) | LabServ (Thermo Fisher Scientific) | BSPSL944 | 克雷布斯缓冲液组分 |
| 碳酸氢钠 (NaHCO3) | LabServ (Thermo Fisher Scientific) | BSPSL900 | 克雷布斯缓冲液组分 |
| SpectraMax i3x | 分子装置 | 用于荧光测量 | |
| 蔗糖 | 费舍尔化学 | S/8600/60 | 用于样品制备的缓冲液成分 |
| Swimnex 过滤器支架 | Millipore | Sx0001300 | 突触神经体的制备 |
| 组织研磨机 5 mL Potter-Elvehjem | Duran Wheaton Kimble | 358034 | 用于组织匀浆 |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | 透化缓冲液成分 |
| Trizma 碱 | Sigma-Aldrich | T6066 | 用于样品制备的缓冲液成分 |