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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
这里描述了一个顶空固相微萃取气相色谱平台,用于在成熟的黑醋栗果实中快速、可靠和半自动地进行挥发性鉴定和定量。该技术可用于增加有关水果香气的知识,并选择具有增强风味的品种以进行育种。
人们越来越有兴趣测量成熟水果排放的挥发性有机化合物(VOCs),以培育具有增强感官特性的品种或品种,从而提高消费者的接受度。最近开发了高通量代谢组学平台,用于量化不同植物组织中的各种代谢物,包括负责水果味道和香气质量的关键化合物(挥发性组学)。这里描述了一种使用顶空固相微萃取(HS-SPME)与气相色谱-质谱(GC-MS)结合使用的方法,用于鉴定和定量成熟黑醋栗果实排放的VOCs,这种浆果因其风味和健康益处而受到高度赞赏。
收获黑醋栗植物(Ribes nigrum)的成熟果实并直接在液氮中冷冻。组织均质后产生细粉,解冻样品并立即与氯化钠溶液混合。离心后,将上清液转移到含有氯化钠的顶空玻璃小瓶中。然后使用固相微萃取(SPME)纤维和与离子阱质谱仪耦合的气相色谱仪提取VOC。通过积分峰面积,对所得离子色谱图进行挥发性定量,对每个VOC使用特定的 m / z 离子。通过比较在与样品相同条件下运行的纯商业标准的保留时间和质谱,确认了正确的VOC注释。在不同欧洲地区种植的成熟黑醋栗果实中鉴定出60多种VOC。在已确定的VOC中,关键的芳香化合物,如萜类化合物和C6挥发物,可用作黑醋栗果实质量的生物标志物。此外,还讨论了该方法的优缺点,包括预期的改进。此外,还强调了使用控制装置进行批量校正和最小化漂移强度。
风味是任何水果的基本质量特征,会影响消费者的接受度,从而显着影响适销性。风味感知涉及味道和嗅觉系统的组合,并且在化学上取决于成熟水果排放的各种化合物的存在和浓度,这些化合物积聚在可食用植物部分,或者在VOC的情况下,由成熟的水果排放1,2。虽然传统育种一直专注于产量和抗虫性等农艺性状,但由于遗传复杂性和难以正确表型这些特征,水果品质性状(包括风味)的改善长期以来一直被忽视,导致消费者不满3,4。代谢组学平台的最新进展已成功鉴定和量化负责水果味道和香气的关键化合物5,6,7,8。此外,代谢物分析与基因组或转录组学工具的结合可以阐明水果风味背后的遗传学,这反过来将有助于育种计划开发具有增强感官特征的新品种2,4,9,10,11,12,13,14。
黑醋栗(Ribes nigrum)浆果因其风味和营养特性而受到高度赞赏,在欧洲,亚洲和新西兰的温带地区广泛种植15。大部分生产是加工食品和饮料,这在北欧国家非常受欢迎,主要是由于浆果的感官特性。水果的强烈颜色和风味是成熟水果中存在的花青素,糖,酸和VOC的组合的结果16,17,18。对黑醋栗挥发物的分析可以追溯到20世纪60年代19,20,21。最近,一些研究集中在黑醋栗VOCs上,确定了水果香气感知的重要化合物,并评估了基因型,环境或储存和加工条件对VOC含量的影响5,17,18,22,23。
由于其众多优点,高通量易失性分析的首选技术是HS-SPME/GC-MS24,25。涂有聚合物相的二氧化硅纤维安装在注射器装置上,允许吸附纤维中的挥发物,直到达到平衡相。顶空萃取可保护纤维免受基质中存在的非挥发性化合物的影响24。SPME可以成功地分离出大量高度可变浓度(十亿分之一到百万分之一)的挥发性有机化合物25。此外,它是一种无溶剂技术,需要有限的样品处理。HS-SPME的其他优点是易于自动化和相对较低的成本。
然而,其成功可能有限,具体取决于VOC的化学性质,提取方案(包括时间,温度和盐浓度),样品稳定性以及足够的果实组织的可用性26,27。本文提出了一种通过HS-SPME分离黑加仑VOCs的方案,并通过气相色谱结合离子阱质谱仪进行分析。在植物材料的数量,样品稳定性以及提取和色谱的持续时间之间实现了平衡,以便能够处理大量的黑醋栗样品,其中一些在本研究中提出。特别是,五个品种("Andega","Ben Tron","Ben Gairn","Ben Tirran"和"Tihope")的VOC图谱和/或色谱图将作为示例数据进行介绍和讨论。此外,在其他水果浆果物种(如草莓(Fragaria x ananassa),覆盆子(Rubusidaeus)和蓝莓(Vaccinium spp.)中,相同的方案已成功用于VOC测量。
1. 水果收获
2. 水果样品和试剂制备
3. 样品制备
4. HS-SPME/GC-MS数据采集
5. GC-MS谱图谱图分析:VOC鉴定和半定量
在不同条件或地点生长或属于不同基因型的大量水果作物中进行高通量VOC分析对于准确的香气表型是必要的。本文介绍了一个快速、半自动化的HS-SPME/GC-MS平台,用于黑加仑品种的VOC相对定量。VOC检测和鉴定基于为分析浆果果实种类而开发的文库(表1)。在上述条件下,HS-SPME/GC-MS获得的典型成熟黑醋栗果实挥发性剖面图(总离子色谱图)如图 1A所示。总共确定了63种VOC,属于几种化学类别,其中大多数是酯类(27种),醛类(12种),醇类(8种),酮类(7种),萜烯(5种)和呋喃(3)(表1)。
萜类化合物、酯类化合物和C6化合物被描述为在黑醋栗挥发物中占主导地位,并且对新鲜水果的香气很重要5,17。与之前的这些研究一致,图1A中观察到的一些最丰富的峰对应于两个单萜(芳樟醇和松油醇)和两个C6化合物((E)-2-己烯醛和(Z)-3-己烯醛)。从黑醋栗剖面中获得的样品质谱及其与纯商业标准品光谱的比较分别显示在图1B和图1C中,用于(E)-2-己烯醛和松油醇。

图1:HS-SPME/GC-MS(来自"Andega"品种)获得的成熟黑醋栗果实的代表性色谱图。(Z)-3-己烯醛(保留时间14.33分钟),(E)-2-己烯醛(15.86分钟),芳樟醇(21.65分钟)和松油醇(24.01分钟)峰分别表示为数字1,2,3和4。(B)来自黑醋栗剖面的对应于(E)-2-己烯峰的质谱,并与纯商业标准进行比较。(C)来自黑醋栗剖面的对应松油醇峰的质谱以及与纯商业标准的比较。缩写:HS-SPME/GC-MS = 顶空固相微萃取与气相色谱-质谱联用。请点击此处查看此图的放大版本。
虽然萜烯被描述为黑醋栗果实新鲜度的指标,但C6化合物被称为"绿叶挥发物",赋予水果和蔬菜香气"绿色"香气34。因此,对不同黑醋栗品种的成熟果实排放的这些VOCs进行半定量可能是改善风味相关性状的第一步。此外,由于环境和植物生长条件强烈影响水果VOC含量,这是香气育种的主要缺点之一,本研究的目标之一是验证同一品种("Ben Tron","Ben Gairn","Ben Tirran"和"Tihope")中已鉴定的VOC的半定量在波兰和苏格兰等截然相反的欧洲地区可重复的假设。正如预期的那样,对四个不同黑加仑品种的VOC剖面进行主成分分析(PCA)表明,环境对挥发性含量有强烈影响,因为主成分(PC)1根据其位置分离样品(图2)。然而,基因型的影响可以用PC2观察到,因为"Ben Tirran"与其余品种明显分开(图2)。
图3显示了4个评估黑加仑品种中芳樟醇和(E)-2-己烯醛的相对含量。对于这两个位置,VOC含量被归一化到同一对照样品,其中半定量证实波兰的芳樟醇含量通常高于苏格兰,而(E)-2-己烯醛显示出相反的趋势(图3)。该结果表明了环境对黑醋栗果实中VOC含量的影响,尽管在四个评估品种中存在的两种挥发物的比例是恒定的,其中"Ben Tirran"和"Ben Tron"品种分别显示出芳樟醇和(E)-2-己烯醛的含量最高(图3)。综上所述,这些结果表明,所提出的方法对表型VOC含量有效,并结合遗传方法,可用于果实品质育种的目的。

图2:PCA评估波兰和苏格兰种植的四个黑加仑品种中VOC谱之间的差异。 PC1(环境)解释了46.2%的变异性,而PC2(基因型)贡献了数据集中24.8%的方差。缩写:PCA = 主成分分析;PC1 = 第一主成分;PC2 = 第二主成分;VOC = 挥发性有机化合物。 请点击此处查看此图的放大版本。

图3:在苏格兰和波兰收获的黑加仑香气特征中两种代表性VOC的相对含量 - 芳樟醇和(E)-2-己烯醛。 评估了四种不同的黑加仑品种("Ben Gairn","Ben Tirran","Ben Tron"和"Tihope")。条形表示两个生物重复的平均值,误差线表示标准偏差。通过单因子方差分析进行统计比较,然后进行Tukey的 事后 测试,以确定品种和国家之间VOC含量的显着差异。对于具有相同小写字母(a,ab,b)的VOC含量 ,P< 0.05时未观察到显着差异。缩写: VOCs = 挥发性有机化合物;方差分析 = 方差分析。 请点击此处查看此图的放大版本。
表1:黑醋栗果实中HS-SPME/GC-MS鉴定的挥发性有机化合物清单。 标明了保留时间(分钟)、用于 VOC 鉴定和半定量的选定 m/z 离子、香气描述、化学类别和配方以及 CAS 编号。缩写:HS-SPME/ GC-MS =顶空固相微萃取与气相色谱-质谱联用;挥发性有机化合物=挥发性有机化合物;KRI = 科瓦茨保留指数;化学文摘社编号 = 化学文摘社登记号。请点击此处下载此表格。
作者声明没有利益冲突。
这里描述了一个顶空固相微萃取气相色谱平台,用于在成熟的黑醋栗果实中快速、可靠和半自动地进行挥发性鉴定和定量。该技术可用于增加有关水果香气的知识,并选择具有增强风味的品种以进行育种。
作者感谢马拉加大学的 Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación 对HS-SPME /GC-MS的测量。我们感谢萨拉·费尔南德斯-帕拉西奥斯·坎波斯在波动性定量方面提供的帮助。我们也感谢GoodBerry的财团成员提供水果材料。
| 10 mL 螺口顶空样品瓶 | Thermo Scientific | 10-HSV | |
| 18 mm 螺口盖 硅胶/PTFE | Thermo Scientific | 18-MSC | |
| 5 mL 管,带 HDPE 螺口盖 | VWR | 216-0153 | |
| 离心机 | Thermo Scientific | 75002415 | |
| HPLC 用甲醇 | Merck 34860-1L-R | ||
| N-十五烷 (D32, 98%) | Cambridge Isotope Laboratories | DLM-1283-1 | |
| 氯化钠 | Merck | S9888 | |
| SPME 纤维头 PDMS/DVB | Merck | 57345-U | |
| TissueLyser | Qiagen | 69985 | 不锈钢研磨罐 |
| TissueLyser II | Qiagen | 85300 | 可用研钵和研杵或低温研磨机替代 |
| 痕量 GC 气相色谱仪-ITQ900 离子阱质谱仪 | Thermo Scientific | ||
| Triplus RSH 自动进样器,带自动 SPME 设备 | Thermo Scientific | 1R77010-0450 | |
| HPLC 用水 | Merck | 270733-1L | |
| Xcalibur 4.2 SP1 | Thermo Scientific | 软件 |