本研究描述了一种全面的小鼠心脏左心室功能参数定量评估的心血管磁共振成像(CMR)方案。该方案涵盖了CMR图像的采集、后处理与分析,以及多种心脏功能参数的评估。
本研究描述了一种全面的小鼠心脏左心室功能参数定量评估的心血管磁共振成像(CMR)方案。该方案涵盖了CMR图像的采集、后处理与分析,以及多种心脏功能参数的评估。
小鼠模型在理解健康心脏功能相关的遗传和生理因素、扰动如何导致病理变化以及心肌疾病可能的治疗方法方面做出了重要贡献。心血管磁共振成像(CMR)已成为全面评估心脏解剖结构和功能不可或缺的体内工具。本方案展示了利用7特斯拉CMR对小鼠心脏左心室功能、心肌应变及血流动力学力进行详细测量的方法。首先,演示动物的准备及在扫描仪中的定位。进行定位扫描,以规划多个短轴和长轴视角的成像切面。随后,采集一系列前瞻性心电图触发的短轴(SA)动态电影图像(或称CINE图像),覆盖从心尖到心底的心脏区域,捕捉收缩末期和舒张末期相位。接着,在心室中段短轴切面以及两腔、三腔和四腔切面,采集单层、回顾性门控的CINE图像,并利用自主开发的开源软件重建为高时间分辨率的CINE图像。随后使用专用的CMR图像分析软件对CINE图像进行分析。
在短轴(SA)收缩末期和舒张末期电影图像中勾画心内膜和心外膜边界,可计算收缩末期和舒张末期容积、射血分数及心输出量。对所有心动周期时相的中段心室短轴电影图像进行勾画,以提取详细的容积-时间曲线。对其时间导数的分析可用于计算舒张功能,即早期充盈波与心房收缩波的比值。最后,利用特征追踪技术勾画两腔、三腔和四腔观中的左心室心内膜边界,据此计算心肌纵向应变参数及左心室血流动力学力。综上所述,本方案可实现对小鼠心脏参数的详细体内定量,可用于研究多种心脏病小鼠模型中心功能随时间变化的特征。
小动物心血管磁共振(CMR)可对心肌功能进行准确的体内测量,使其成为心血管疾病临床前研究的理想工具。由于CMR图像具有高空间分辨率以及血液与心肌之间的高对比度,因此可以清晰勾画心内膜和心外膜轮廓,并计算心肌质量及心室容积1,2。尽管心率可高达每分钟600次,但通过使用心电图(ECG)和呼吸触发技术,仍可获得高质量的不同心动周期相位图像(也称为电影图像),且无呼吸运动伪影。通过该方法,可采用多个切面覆盖从心尖到心底的整个心脏,从而提取收缩功能参数,如射血分数(EF)、收缩末期容积(ESV)、舒张末期容积(EDV)和心输出量(CO)3。除了基本的收缩功能评估外,近年来还发展了多种CMR技术用于评估舒张功能障碍4、心肌应变5和血流动力学力(HDF)6。
心电门控通过在检测到R波峰值后启动磁共振信号采集,并在R-R间期内记录特定数量的心动周期时相,从而实现与心动周期的同步。然而,以此方式可采集的心动周期时相数量(帧率)取决于系统在保持可接受的信噪比(SNR)和空间分辨率的前提下所能达到的最短重复时间(TR)4。此外,由于使用高磁场梯度可能暂时扭曲心电信号,采集通常在舒张末期之前停止。这两个因素限制了此类扫描仅适用于收缩功能的评估,因为其他心脏功能参数的计算需要更精确的左心室(LV)容积-时间曲线定义。
通过回顾性门控技术可获取高帧率电影(CINE)图像,该方法在扫描过程中持续采集磁共振信号,并在射频(RF)激发后利用集成的导航回波检测心脏和呼吸运动。由于心脏磁共振(CMR)采集与心脏运动不同步,所采集的磁共振信号随后可被分配至回顾性选定数量的心动周期帧中。因此,若采集了足够的数据,即可重建高帧率CINE图像4,7。这使得能够评估舒张功能,其指标表现为早期充盈峰值速率(E')与心房收缩引起的晚期充盈峰值速率(A')之间的比值。
在临床研究中,可使用心脏磁共振特征追踪(CMR feature-tracking)技术分析电影(CINE)图像,以评估心肌应变和 HDF6,8。心肌应变是一种心肌形变参数,用于测量心肌节段初始长度(通常为舒张末期长度)与最大长度(通常为收缩末期长度)之间的百分比差异9。心肌应变测量值在评估左心室(LV)功能方面具有附加价值,因为应变值能够量化心肌壁的缩短和增厚程度。缩短功能的降低可能提示心内膜下纤维受损10。心肌应变的改变可能独立于射血分数(EF)发生,并可能预示潜在并发症的早期迹象。
具体而言,全局纵向应变(GLS)和全局周向应变(GCS)在表征心脏病方面已被证明具有额外的临床价值10,11,12。类似地,血流动力学力(HDF)也被认为可能是反映心脏功能改变的一个潜在新参数6,13。这些HDF或心室间压力梯度(IVPG)驱动心脏射血和充盈期间的血流运动,并受到血液与心肌之间动量交换的影响,包括主动脉瓣和二尖瓣的作用14,15。
本研究描述了一种全面的实验方案,用于开展可靠的小动物心脏磁共振(CMR)测量,以定量评估小鼠心脏的左心室(LV)功能、心肌应变以及舒张功能指标(HDF)。该方案包括动物准备、采用前瞻性及回顾性门控心脏电影(CINE)图像进行数据采集的必要步骤,以及使用专用软件进行分析,以计算心脏的容积参数、E'/A' 比值、心肌应变和舒张功能指标(HDF)。该方案可用于多种心血管疾病小鼠模型中左心室功能的系统性评估。
所述动物实验遵循欧盟关于实验动物福利的指南(指令 2010/63/EU),并已获得学术医学中心动物伦理委员会的批准。
1. 实验设置与动物准备

图1:小鼠心脏CMR成像的动物准备与设备设置。(A)仰卧位的完全麻醉小鼠,置于加热的小鼠底座中,腹部放置呼吸气动垫,插入直肠光纤温度传感器,并在胸部靠近前肢处连接皮下ECG导联。(B)将小鼠体线圈覆盖在小鼠底座上方,在将支架置入MRI磁体前,重新连接ECG导联和呼吸垫至ECG及呼吸接口。(C)专用小动物监测软件中显示的ECG与呼吸信号。ECG信号的R波峰值被检测并用作MRI信号采集的起始点。可根据心跳周期手动调整R波峰值之间的空白期。触发仅可在呼吸平台期(中图中的绿线)发生,其起始延迟和最大宽度可手动调节。缩写:CMR = 心血管磁共振成像;ECG = 心电图;MRI = 磁共振成像。 请点击此处查看该图的放大版本。
2. MRI 扫描校准与触发
3. 扫描规划与采集
注意:以下扫描的详细扫描参数见表1。

图2:小鼠心脏磁共振成像的切片规划。(A)利用初始定位扫描,通过三个正交平面(GRE SCOUT)进行心脏扫描切片规划。(B)基于GRE SCOUT冠状面和矢状面图像,进行短轴定位切片规划。(C)利用短轴定位图像和GRE SCOUT冠状面切片,规划2腔心(2CH)定位视图。(D)利用短轴定位图像和2CH定位图像,规划4腔心(4CH)定位视图。(E)利用2CH和4CH定位图像,规划多层短轴切面视图。(F)(左)利用心室中段短轴及2CH/4CH定位图像,规划最终的2CH、3CH和4CH视图。缩写:CMR = 心血管磁共振成像;GRE = 梯度回波;CH = 心腔。请点击此处查看此图的高清版本。
| 扫描编号 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6-9 |
| 扫描名称 | GRE scout | multi-slice SA scout | 2CH scout | 4CH scout | multi-slice SA | SA, 2CH, 4CH, 3CH |
| 总层数 | 15 (3 x 5)* | 4-5 | 1 | 1 | 7-9 | 1 |
| 层厚 (mm) | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 视野 (FOV, mm) | 60 | 35 | 30 | 30 | 35 | 30 |
| 视野比例 (FOV Ratio) | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 翻转角 | 40 | 20 | 20 | 20 | 20 | 15 |
| 回波时间 (TE, ms)** | 3.8 | 3.4 | 2.5 | 2.5 | 2.5 | 3.6 |
| 重复时间 (TR, ms) | 200 | 1 R-R | 7 | 7 | 7 | 8 |
| 帧数 (Nframes) | 1 | 1 | 12-14 | 12-14 | 12-14 | 32 *** |
| 矩阵大小 | 192 x 192 | 192 x 192 | 192 x 192 | 192 x 192 | 192 x 192 | 192 x 192 |
| 心电触发 | 无 | 是 | 是 | 是 | 是 | 回顾性 |
| 呼吸触发 | 是 | 是 | 是 | 是 | 是 | 回顾性 |
| 平均次数 | 1 | 3 | 5 | 5 | 5 | 回顾性 **** |
| 总成像时间(估算 *****) | 2 分钟 | 2分钟 | 3-4 分钟 | 3-4 分钟 | 20-25 分钟 | 13 分钟 / 次扫描 |
表1:心血管磁共振成像(CMR)方案中各序列的采集参数。 * 扫描在三个不同的正交方向(轴向、冠状、矢状)上进行。 ** 给定所有其他参数的情况下,所能达到的最短回波时间(TE),具体数值取决于特定扫描仪的配置。 *** 此为回顾性门控后获得的心动周期帧数。 **** 有效平均次数取决于整个采集时间内k空间的随机填充情况。总共进行了400次全k线重复采集。 ***** 包括心电图/呼吸触发延迟。缩写:CMR = 心血管磁共振成像;ECG = 心电图;GRE = 梯度回波;FOV = 视野;TE = 回波时间;TR = 重复时间;Nframes = 心动周期帧数;SA = 短轴;CH = 心腔。 请点击此处下载该表格。
4. 实验的最终完成与数据存储
5. 回顾性采集扫描数据的离线重建
注意:对于回顾性门控扫描的重建,使用了一款自主开发的开源软件(图3)。请对每个回顾性触发的数据分别执行以下步骤。

图3:回顾性触发图形用户界面。 “回顾性”是一款为回顾性触发心脏磁共振成像扫描定制开发的重建应用程序。在该用户界面中,可对导航信号进行评估,调整需重建的电影(CINE)帧数,调节压缩感知参数以优化重建效果,预览作为动态电影的CINE图像,并导出重建后的数据。请点击此处查看此图的放大版本。
6. 图像分析软件
注意:图像分析软件(图4)需要使用 DICOM 图像,并具有多种用于不同心血管分析应用的插件,例如用于容积测量的插件以及用于应变和 HDF 分析的插件。

图 4:图像分析软件的图形用户界面。 图像分析软件中用于体积测量的插件,用于心内膜边界的勾画。对于每套数据集,选择舒张末期和收缩末期的心脏时相,并对所有帧的心内膜边界进行分割。请点击此处查看该图的放大版本。
采用先前描述的方案,对一组健康的C57BL/6野生型小鼠(n = 6,年龄14周)使用7特斯拉磁共振成像仪和直径为38 mm的鸟笼线圈进行扫描。在每次扫描过程中,多层面CINE短轴图像采用前瞻性门控GRE序列获取,而单层面心室中段短轴、两腔心、三腔心和四腔心视图的CINE图像则采用回顾性门控获取。使用自主开发的后处理软件对回顾性门控扫描进行高帧率重建,代表性结果见补充视频1。根据所得图像,绘制出心动周期中的容积-时间曲线(图5A),并计算相应的容积变化率曲线(dV/dt),用于评估收缩功能参数(射血分数EF = 72.4 ± 2.8%)和舒张功能参数(E'/A'比值 = 1.5 ± 0.3)。
采用图像分析软件分析2CH、3CH和4CH切面的CINE图像,以确定心动周期中内膜整体纵向应变(endoGLS)的变化(图5B),并获得相应的峰值GLS值(-22.8 ± 2.4%),作为心肌应变的评估指标。此外,该软件还可计算纵向(心尖-基底部方向)(135.2 ± 31.7%)和横向(下外侧-前间隔方向)(12.9 ± 5.0%)方向的均方根心肌形变梯度(RMS HDF)。对于每只动物,还可生成HDF随时间变化的曲线图,其呈现出一致的正负峰值模式,反映心动周期中HDF的大小和方向(图5C)。所有结局参数的描述性结果汇总于图5D。

图 5:基于小鼠心脏的左心室功能参数定量分析。(A)典型的容积-时间曲线及其对应的 dV/dt 曲线。后者显示血流速度,具有明显的早期充盈峰(E')和心房收缩峰(A')。(B)典型的全局纵向应变(GLS)曲线,表示在整个心动周期中纵向方向的应变变形。(C)典型的血流动力学力(HDF)曲线,在心尖-基底方向上显示出明显的力峰值,包括收缩射血力,随后在收缩期与舒张期过渡阶段出现向下的力、E波减速力、A波加速力及减速力。(D)所有动物的射血分数(EF)、E'/A' 比值、峰值 GLS 以及心尖-基底方向和下外侧-前间隔方向 HDF 均方根值的描述性结果。数据以均值 ± 标准差表示。缩写:LV = 左心室;V = 容积;t = 时间;GLS = 全局纵向应变;HDF = 血流动力学力;EF = 射血分数。请点击此处查看该图的放大版本。
补充视频 1:短轴(SA)、两腔心(2CH)、三腔心(3CH)和四腔心(4CH)视图的心电图回顾性门控电影图像的代表性重建。 缩写:SA = 短轴;CH = 腔室。请点击此处下载该视频。
补充材料: 请点击此处下载此文件。
本方案描述了使用心脏磁共振(CMR)成像进行纵向、无创、活体(in vivo)小鼠心脏功能分析的实验方法。这些结果来自健康动物,用于展示利用CINE图像量化心脏参数的可行性。然而,所述方法也可应用于多种动物模型。尽管特定疾病模型可能需要对方案进行微小调整,但其用于评估不同心脏功能参数的基本结构将非常相似。一个值得特别提及的情况是心肌梗死模型,其中心脏部分区域的收缩能力显著丧失,可能导致该层面心脏导航信号质量下降。在此情况下,可选择从另一个独立层面获取导航信号,如Coolen等人的先前研究中所述16。不同视角的CINE图像通过回顾性门控数据并采用压缩感知(CS)算法重建,并利用图像分析软件进行分析,以计算应变和HDF值。
所获取图像的质量自然取决于所有制备步骤,在开始心脏磁共振成像(MRI)方案之前,这些步骤必须仔细完成。例如,当将动物放入MRI扫描仪时,若无法观察到清晰的心电图(ECG)和呼吸信号,则很可能导致图像采集质量欠佳,甚至由于磁流体动力学失真的叠加效应而延长扫描时间17。需要注意的是,由于切面方向是依次规划的,因此在扫描过程中不能随意重新调整动物位置。因此,无法在扫描之间重新调整ECG导联,因为这会改变小鼠在扫描仪中的位置。在扫描过程中,温度控制对于维持稳定的心率和呼吸频率至关重要,这对于需要较长时间采集的回顾性门控扫描尤其有益。在高占空比扫描期间,动物体温可能持续上升,导致心率和呼吸频率升高。在扫描前或扫描过程中调节加热系统温度和麻醉水平,可显著有助于稳定呼吸频率。
分析过程中的一个关键步骤是轮廓绘制的一致性。尽管自动分割在临床数据中表现良好,但在小鼠心脏数据中(大鼠未测试)其性能不够稳健。由于高心率以及特定心脏时相(尤其是左心室充盈初期)的高血流速度,可能导致体素内信号去相位和信号缺失,从而影响心肌壁边界的清晰显示。因此,不建议对每一帧图像独立进行分析,而应目视观察心肌壁在各帧之间的运动情况,并在所有帧的轮廓绘制中考虑这一运动连续性。建议在相邻两帧之间复制并调整心内膜轮廓,以在分析中保持更自然的收缩运动。在本方案中,短轴(SA)图像用于评估收缩和舒张功能时,将乳头肌从心室腔容积中排除;而在两腔心(2CH)、三腔心(3CH)和四腔心(4CH)图像中进行应变和HDF分析时则包含乳头肌,因为后者依赖于对心肌壁精确运动的了解,而非心室腔容积的精确测量。
虽然收缩期和舒张期功能参数是基于整个心动周期中左心室容积的测量,但应变和心脏形变功能(HDF)参数还依赖于心肌壁内的运动模式。为此,采用特征追踪技术,通过识别连续电影相位之间不同的解剖特征和信号强度,来评估心肌节段的位移。心脏磁共振(CMR)图像中血池与心肌之间具有明显的对比度,这有利于应用特征追踪技术进行后续的应变和HDF分析8。在CMR特征追踪技术出现之前,心肌应变主要通过斑点追踪超声心动图和CMR组织标记技术来测定。与CMR组织标记相比,CMR特征追踪无需额外的扫描时间。然而,尽管采用了回顾性触发技术,CMR的时间分辨率仍然有限,这可能使其难以准确评估心动周期中快速发生的形变过程。
在整个心动周期中评估心形变形分数(HDF)需要测量二尖瓣和主动脉瓣的直径,以利用先前描述的公式18计算心尖-基底方向和下外侧-前间隔方向的HDF。该方法与作为参考标准的4D-flow MRI相比,对HDF的估算结果具有一致性,但由于4D-flow MRI操作复杂,在临床应用中可用性有限6。需要注意的是,瓣膜直径的可靠估算较为困难,因此在一组动物实验中以及纵向研究的重复测量中,应保持瓣膜直径恒定,因为该参数若因估算错误而产生变化,可能轻易掩盖HDF参数中的细微改变。用于计算整体纵向应变(GLS)和HDF参数的特定软件可能并非所有用户均可获取。因此,可参考Voigt等人的研究19 (GLS)以及Pedrizzetti等人的研究6,20(HDF),其中包含了分析软件所采用的各项计算方法的全部数学描述。
本研究中,该方案在健康动物(N = 6)中进行了评估。图5A-C展示了左心室容积、dV/dt、心内膜全局纵向应变(endoGLS)和心形舒张功能(HDF)的代表性时间曲线。多个心脏功能参数的平均值(射血分数EF、E'/A'比值、峰值GLS和HDF)如图5D所示。这些结果与文献中报道的类似方案结果高度一致21。目前关于小鼠GLS和HDF数据的文献较为有限。本研究测得平均GLS值为-22.8%,与临床数据范围相近8,表明采用所述方法在小鼠中获取GLS测量值是可行的。在小鼠中获得的HDF曲线也呈现出与人类数据相似的明确分期,证明该技术成功转化应用于临床前研究。尽管HDF参数被认为可能作为心脏功能障碍的早期生物标志物,但仍需进一步研究以评估这一新参数的诊断和预测价值。本方案的结果表明,HDF和GLS的检测结果在不同动物间可能存在较大变异性,因此在预期动物模型或治疗效应存在细微差异时,需充分考虑这一因素。
Ruslan Garipov 是位于英国吉尔福德的 MR Solutions Ltd. 公司的员工。David Hautemann 是位于荷兰莱顿的 Medis medical imaging systems B.V. 公司的员工。
作者感谢 Dorita Dekkers 和 Fatimah Al Darwish 在小鼠测量和数据分析方面提供的帮助。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
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| <强>仪器设备 | |||
| AccuSens 单通道和多通道信号调理器 | Opsens solutions inc.,加拿大 | ACS-P4-N-62SC | 与光纤温度传感器配合使用,用于监测体温 |
| 杜拉泰眼膏 | Alcon Nederland B.V.,荷兰 | ||
| 小鼠细胞 | É设备 Vété里内尔,法国 | 称为小鼠固定架 | |
| 磁共振兼容监测 &用于小型动物的门控系统 | SA Intuments, Inc.,美国 | Model 1030 | ERT 模块(心电/呼吸接口模块)、ERT 控制/门控模块、电池组和皮下心电电极套装 |
| MRI 扫描仪 | MR Solutions Ltd.,英国 | 型号:MRS-7024 | 7.0T/24 cm 前临床磁共振成像系统 |
| 多站温度控制单元和高流量PCA | É设备 Vété法国里内尔-米涅尔夫 | 模型:URT Multipostes | 动物加热系统 |
| 呼吸传感器 | 英国格拉斯比医疗有限公司 | Ref 2005100 | |
| 射频线圈 | MR Solutions Ltd.,英国 | MRS-MVC | 用于小鼠体部研究的38毫米小鼠容积射频线圈 |
| SF 流量计 | 流量计,意大利 | SF 3 | |
| Vaporizer sigma delta Intermed | Penlon有限公司,英国 | ||
| <强>材料 | |||
| 异氟烷 | AST farma,荷兰 | ||
| 凡士林石油冻 | 联合利华,英国 | ||
| <强>软件 | |||
| BART 工具箱 | https://mrirecon.github.io/bart/ | ||
| Mathematica 12.0 | 美国沃尔弗拉姆研究公司 | ||
| MATLAB 2019a | 美国 MathWorks, Inc. | ||
| MEDIS Suite MR | Medis Medical Imaging Systems B.V.,荷兰 | 图像分析软件 | |
| PC-SAM | SA Intuments, Inc.,美国 | ||
| 临床前扫描 | MR Solutions Ltd.,英国 | 扫描软件 | |
| 回顾性版本 7.0 | 荷兰阿姆斯特丹大学医学中心 | 重建软件:https://github.com/Moby1971?tab=repositories |