更正:用于大规模并行单核RNA测序的成年脊髓核的分离

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2018年11月20日

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摘要

已发布更正:《成年脊髓细胞核的分离用于大规模并行单细胞核RNA测序》。方法部分已更新。

摘要

已发布更正:《成年脊髓细胞核的分离用于大规模并行单细胞核RNA测序》。方法部分已更新。

步骤 3.1 已从以下内容更新:

将腰段脊髓置于预冷的Dounce匀浆器中,并加入500 mL预冷的去垢剂裂解缓冲液。

至:

将腰段脊髓置于预冷的Dounce匀浆器中,并加入500 μL预冷的去垢剂裂解缓冲液。

第 3.6 步已更新,原内容为:

再将1 mL低蔗糖缓冲液通过40 mm滤网,使低蔗糖缓冲液的最终体积达到3 mL,裂解缓冲液的最终体积达到500 mL。

至:

再将1 mL低蔗糖缓冲液通过40 mm滤网,使低蔗糖缓冲液的最终体积达到3 mL,并含有500 μL裂解缓冲液。

第 5.5 步已从以下内容更新:

离心完成后,立即以轻弹的方式倾倒上清液。
注意:如果希望获得体积更小且更纯净的终样品,可根据需要弃去残留的蔗糖缓冲液体积(小于400 mL);但此残留液体中仍含有细胞核,可予以保留以最大化细胞核得率。

至:

离心完成后,立即以轻弹的方式倾倒上清液。
注意:如果希望获得体积更小且更纯净的终末样品,可根据需要弃去残留的少量蔗糖缓冲液(少于400 μL);但此残留液体中仍含有细胞核,为最大化细胞核得率,可予以保留。

第 5.6 步已更新,原内容为:

使用 100 mL - 1 mL 重悬液,重悬附着在管壁上的细胞核。避免接触基于去污剂制备方法中残留的髓鞘“皱褶”。

至:

使用 100 μL - 1 mL 重悬液,重悬附着在管壁上的细胞核。避免含有去污剂制备方法中残留的髓鞘“皱褶”。

步骤 6.1.1 - 6.1.4 已 更新自:

  1. 将细胞核调整至终浓度为每毫升225个细胞核。
  2. 将条形码磁珠配制为每毫升250个磁珠的浓度。
  3. 用含0.7% Sarkosyl的裂解缓冲液进行配制。
  4. 调节流速,使磁珠流速为每分钟35毫升,细胞核流速为每分钟35毫升,油相流速为每分钟200毫升。

至:

  1. 调整细胞核浓度至每微升225个细胞核 μL.
  2. 以每微升250个微珠的浓度制备条形码微珠 μL.
  3. 使用0.7% Sarkosyl配制裂解缓冲液。
  4. 调节流速至35 μ每分钟升数(L/min)用于珠子,35 μL 每分钟用于细胞核,以及 200 μ升/分钟(用于油)

方案

已发布更正:《成年脊髓细胞核的分离用于大规模并行单细胞核RNA测序》。方法部分已更新。

步骤 3.1 已从以下内容更新:

将腰段脊髓置于预冷的Dounce匀浆器中,并加入500 mL预冷的去垢剂裂解缓冲液。

至:

将腰段脊髓置于预冷的Dounce匀浆器中,并加入500 μL预冷的去垢剂裂解缓冲液。

第 3.6 步已更新,原内容为:

再将1 mL低蔗糖缓冲液通过40 mm滤网,使低蔗糖缓冲液的最终体积达到3 mL,裂解缓冲液的最终体积达到500 mL。

至:

再将1 mL低蔗糖缓冲液通过40 mm滤网,使低蔗糖缓冲液的最终体积达到3 mL,并含有500 μL裂解缓冲液。

第 5.5 步已从以下内容更新:

离心完成后,立即以轻弹的方式倾倒上清液。
注意:如果希望获得体积更小且更纯净的终样品,可根据需要弃去残留的蔗糖缓冲液体积(小于400 mL);但此残留液体中仍含有细胞核,可予以保留以最大化细胞核得率。

至:

离心完成后,立即以轻弹的方式倾倒上清液。
注意:如果希望获得体积更小且更纯净的终末样品,可根据需要弃去残留的少量蔗糖缓冲液(少于400 μL);但此残留液体中仍含有细胞核,为最大化细胞核得率,可予以保留。

第 5.6 步已更新,原内容为:

使用 100 mL - 1 mL 重悬液,重悬附着在管壁上的细胞核。避免接触基于去污剂制备方法中残留的髓鞘“皱褶”。

至:

使用 100 μL - 1 mL 重悬液,重悬附着在管壁上的细胞核。避免含有去污剂制备方法中残留的髓鞘“皱褶”。

步骤 6.1.1 - 6.1.4 已 更新自:

  1. 将细胞核调整至终浓度为每毫升225个细胞核。
  2. 将条形码磁珠配制为每毫升250个磁珠的浓度。
  3. 用含0.7% Sarkosyl的裂解缓冲液进行配制。
  4. 调节流速,使磁珠流速为每分钟35毫升,细胞核流速为每分钟35毫升,油相流速为每分钟200毫升。

至:

  1. 调整细胞核浓度至每微升225个细胞核 μL.
  2. 以每微升250个微珠的浓度制备条形码微珠 μL.
  3. 使用0.7% Sarkosyl配制裂解缓冲液。
  4. 调节流速至35 μ每分钟升数(L/min)用于珠子,35 μL 每分钟用于细胞核,以及 200 μ升/分钟(用于油)

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