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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
脂肪酸β氧化是负责在许多不同细胞类型(包括肝细胞)中产生能量的重要代谢途径。在这里,我们描述了一种使用 14个C标记的棕榈酸测量新鲜分离的原代肝细胞中脂肪酸β氧化的方法。
脂肪酸β氧化是满足肝脏能量需求的关键代谢途径,并为其他过程(如生酮和糖异生)提供底物和辅助因子,这对于维持全身葡萄糖稳态和支持禁食状态下的肝外器官功能至关重要。脂肪酸β氧化发生在线粒体和过氧化物酶体内,并通过多种机制进行调节,包括脂肪酸的摄取和活化,酶表达水平以及辅酶A和NAD +等辅助因子的可用性。在测量肝脏匀浆中脂肪酸β氧化的测定中,细胞裂解和辅助因子的超生理水平的常见添加掩盖了这些调节机制的影响。此外,匀浆中细胞器的完整性难以控制,并且在制剂之间可能会有很大差异。完整原代肝细胞中脂肪酸β氧化的测量克服了上述缺陷。该协议描述了一种测量与 14个C标记棕榈酸一起孵育的新鲜分离的原代小鼠肝细胞悬浮液中脂肪酸β氧化的方法。通过避免数小时至数天的培养,该方法具有更好地保存原始肝脏的蛋白质表达水平和代谢途径活性的优点,包括与喂养小鼠相比,在从禁食小鼠分离的肝细胞中观察到的脂肪酸β氧化的活化。
脂肪酸β氧化是脂质代谢的必要过程,提供分解代谢途径来平衡脂肪酸合成和饮食中的摄入量。该过程为多个器官产生能量,包括心肌,肾皮层和禁食肝脏,并利用从饮食中获得的脂肪酸,脂肪组织脂肪分解和内部甘油三酯储存1,2。
脂肪酸通过β氧化途径的氧化导致脂肪酰基链一次由两个碳连续缩短,以乙酰辅酶A的形式释放,并且该过程同时发生在线粒体和过氧化物酶体中。虽然大多数脂肪酸只经历β氧化,但有些脂肪酸在进入该途径之前在不同的碳中被氧化。例如,3-甲基取代的脂肪酸,如植烷酸,在进入β氧化途径之前,通过过氧化物酶体中的α氧化除去一个碳。类似地,一些脂肪酸首先通过氧化内质网中的末端甲基(ω-氧化)转化为二羧基脂肪酸,然后通过β氧化3在过氧化物酶体中优先氧化。
无论特定的细胞器如何,脂肪酸必须首先转化为辅酶A(CoA)硫酯或酰基辅酶A,才能通过β氧化途径被氧化。线粒体基质中长链酰基辅酶A的β氧化需要肉碱穿梭进行其易位,其中肉碱棕榈酰转移酶1(CPT1)催化酰基辅酶A向酰基肉碱的转化,并且是该过程中的限速酶4。一旦转移到线粒体基质,酰基辅酶A被重新形成并作为线粒体β氧化机制的底物。在禁食状态下,肝线粒体中通过β氧化产生的乙酰辅酶A主要引导至生酮作用。过氧化物酶体是超长链,支链和二羧酸脂肪酸β氧化的主要位点。过氧化物酶体不需要肉碱穿梭来导入脂肪酸底物,而是通过ATP结合盒(ABC)转运蛋白ABCD1-3的活性导入相应的酰基辅酶A5。在过氧化物酶体内,酰基辅酶A随后被一组专用的酶氧化,这与线粒体脂肪酸β氧化机制不同。线粒体和过氧化物酶体也需要供应NAD + 和游离辅酶A来氧化脂肪酰基链。肝脏中的CoA水平已被证明随着空腹而增加,支持在这种状态下发生的脂肪酸氧化速率的增加6。此外,过氧化物酶体中CoA降解的增加导致过氧化物酶体脂肪酸氧化7的选择性降低。因此,细胞内脂肪酸氧化的过程受到参与脂肪酸活化,运输和氧化的酶的表达水平和活性的调节,以及整个多个亚细胞区室的辅助因子和其他代谢物的浓度。
使用组织匀浆来测量脂肪酸氧化的程序破坏了调节和支持该过程的细胞结构,导致数据收集不能准确反映体内代谢。虽然使用接种的原代肝细胞的技术保留了该系统,但长时间培养分离的细胞会导致细胞中仍然存在的体内基因表达谱的丧失,当它们仍然生活在动物体内时8,9。以下方案描述了一种分离原代肝细胞的方法,并使用[1-14C]棕榈酸在分离后立即和悬浮液测定其脂肪酸β氧化的能力。该测定基于测量与酸溶性代谢物(ASM)或产物(如乙酰辅酶A)相关的放射性,由[1-14 C]棕榈酸10,11的β氧化产生。
小鼠(C57BL / 6J,雄性,9-11周龄)的所有实验程序均已获得西弗吉尼亚大学机构动物护理和使用委员会(IACUC)的批准。
1. 肝细胞分离

图1:灌注装置和灌注肝脏。 (A)蠕动泵,其出口管连接到用于套管和灌注肝脏的针头上。(B)成功的插管表现为肝脏立即均匀地漂白。 请点击此处查看此图的大图。
2. 脂肪酸β氧化法
注意:该测定一式三份进行,每个反应混合物含有750,000个细胞,1.35mg / mL牛血清白蛋白(BSA),100μM棕榈酸和0.4μCi [1-14C]棕榈酸,最终体积为2mL。
注意:放射性化合物是有害的。根据机构,州和联邦法规购买,处理,存储和处置放射性物质。
| 缓冲器/介质组件 | 量 | 最终浓度 | 指示 |
| 解决方案 C | |||
| 氯化钾 | 1.79克 | 480 毫米 | 加水至50毫升。 储存在4°C |
| MgSO4 七水合物 | 1.48克 | 120 毫米 | |
| KH2PO4 | 0.81克 | 119 毫米 | |
| 克雷布斯-亨赛莱特缓冲液(KHB),无钙 | |||
| 氯化钠 | 7.0克 | 120 毫米 | 将水加入900 mL,将pH调节至7.4,并将最终体积降至1L。 |
| NaHCO3 | 2.0克 | 24 毫米 | |
| 1 M 丙酮 pH 值 7.45 | 5 毫升 | 5 毫米 | |
| 葡萄糖 | 1 或 2 克 | 5.6 或 11 mM | |
| 解决方案 C | 10 毫升 | ||
| 缓冲区 1 | |||
| 断续器 | 500 毫升 | 混合组件并过滤灭菌。储存在4°C | |
| 50 毫微米 | 1.0 毫升 | 0.1 毫米 | |
| 缓冲区 2 | |||
| 断续器 | 500 毫升 | 混合组件并过滤灭菌。储存在4°C | |
| 1 M 氯化钙2 二水合物 | 686 微升 | 1.4 毫米 | |
| 庆大霉素溶液 | |||
| 硫酸庆大霉素 | 0.5克 | 50毫克/毫升 | 将水加入 10 mL 并过滤灭菌。等分试样并储存在-20°C |
| 胶原酶溶液 | |||
| 胶原酶I和II混合物 | 10毫克 | 7毫克/毫升 | 将小瓶的全部内容物溶解在1.43 mL水中。 等分试样并储存在-20°C |
| M199型 | |||
| M199型 | 1 袋 | 加水至900毫升,将pH值调节至7.2-7.4。将最终体积降至1 L并过滤灭菌。储存在4°C | |
| NaHCO3 | 2.2克 | 26 毫米 | |
| 1 M HEPES(细胞培养级) | 25 毫升 | 25 毫米 | |
| 额外的葡萄糖(仅适用于喂养的小鼠) | 1 克 | 11 毫米 | |
| 软件安全软件解决方案 | |||
| 无脂肪酸BSA | 400毫克 | 20% (无/ v) | 溶于2毫升水中。 等分试样并储存在-20°C |
| 无放射性棕榈酸溶液 | |||
| 棕榈酸 | 103毫克 | 200 毫米 | 溶于2mL乙醇中,储存在-20°C |
| 1 M 高氯酸 | |||
| 70%高氯酸 | 3.5 毫升 | 1 米 | 用水稀释至40毫升。在室温下储存 |
表1:肝细胞分离和脂肪酸β氧化测定所需的缓冲液,培养基和其他溶液
| 反应次数 | M199 ±抑制剂 | 肝细胞悬浮液(μL) | 底物混合物(μL) | ||||
| 体积(μL) | 艾托莫西 | ||||||
| 1 | 750 | - | 在 37 °C 预热 | 750 | 在37°C下预孵育15分钟 | 500 | 在37°C孵育15分钟 |
| 2 | |||||||
| 3 | |||||||
| 4 | + | ||||||
| 5 | |||||||
| 6 | |||||||
| 7 | + | 立即停止 | |||||
| 8 | |||||||
| 9 | |||||||
表2:在存在和不存在依托莫西的情况下一式三份测定肝细胞悬浮液的实验设置示例。
这里描述的肝脏灌注通常产生3000-4000万个细胞/肝脏,平均活力为80%,通过台盼蓝排除估计(图2)。用于制备灌注缓冲液1和2的克雷布斯 - 亨赛莱特缓冲液(KHB)中葡萄糖的典型浓度为11 mM。当测量从禁食小鼠分离的肝细胞中的脂肪酸β氧化时,可以降低KHB中葡萄糖的浓度以更好地代表禁食状态。如图 2所示,将葡萄糖浓度降低到5.6mM对肝细胞的产量或活力没有负面影响。
表2 显示了在存在和不存在etomoxir(CPT1的有效抑制剂,因此线粒体脂肪酸氧化10,13)的情况下一式三份测定肝细胞悬浮液的典型实验设置。在存在这种或其他线粒体脂肪酸氧化抑制剂的情况下,由[ 1-14C]棕榈酸氧化产生的任何残留的14个C标记产物都可以归因于过氧化物酶体中β氧化的第一个循环。因此,线粒体脂肪酸氧化对总脂肪酸β氧化的贡献可以计算为总(-etomoxir)和过氧化物酶体(+etomoxir)脂肪酸氧化7,14,15 之间的差异(图3)。
对于肝细胞,在ASM中发现了超过95%的与[1-14 C]棕榈酸的β氧化产物相关的放射性,其余释放为14C-CO210。与背景放射性相关的每分钟计数(CPM)随[1-14C]棕榈酸的批次而变化。然而,它们仍然显着低于在允许与底物混合物一起孵育15分钟的样品中获得的CPM(图3A)。正如预期的那样,从禁食小鼠中分离的肝细胞显示出线粒体和过氧化物酶体脂肪酸β氧化的速率的显着增加,与这些途径的已知激活16,17,18,19一致。

图2:使用本文所述的程序分离的肝细胞的活力和产量。 从雄性小鼠中分离肝细胞 ,随意 喂食或禁食16-18小时,自由取水。(A)肝细胞活力和(B)每个肝脏的产量。数据被报告为单个肝细胞制剂(圆圈)的测量平均值(条)±SEM.使用未配对的双尾学生t检验比较从喂养和禁食小鼠中分离的肝细胞。* p < 0.05。 请点击此处查看此图的大图。

图3:从喂养和禁食雄性小鼠中分离的肝细胞中的脂肪酸β氧化能力,并在悬浮液中测定。在加入底物混合物之前,将新鲜分离的肝细胞与依托莫西(45μM,+Eto)或DMSO(载体,-Eto)预孵育。(A)在每次测定中引入的总CPM并在ASM部分反应中回收,以估计背景放射性,总(-Eto),过氧化物酶体(+Eto)和线粒体脂肪酸β氧化。这些数据在进行任何校正(背景,细胞数或蛋白质水平)或任何其他计算之前显示。(B)中针对背景校正的数据,测定的总体积,归一化为100万个活细胞,并表示为从喂养和禁食小鼠分离的肝细胞中棕榈酸被氧化的速率。(C)总蛋白对应于估计使用的750,000个肝细胞/测定。(D)(A)中的数据与(B)中的数据一样校正,但归一化为mg蛋白质。数据被报告为单个肝细胞制剂(圆圈)的测量平均值(条)±SEM.使用未配对的双尾学生t检验比较从喂养和禁食小鼠中分离的肝细胞。* p < 0.05;** 第<页,0.01。请点击此处查看此图的大图。
作者没有利益冲突需要披露。
脂肪酸β氧化是负责在许多不同细胞类型(包括肝细胞)中产生能量的重要代谢途径。在这里,我们描述了一种使用 14个C标记的棕榈酸测量新鲜分离的原代肝细胞中脂肪酸β氧化的方法。
这项工作得到了美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)向罗伯塔·莱昂纳迪(Roberta Leonardi)授予R35GM119528的支持。
| (R)-(+)-依托莫昔钠盐 | Tocris Bioscience | 4539/10 | |
| [1-14C]-棕榈酸,50–60 mCi/mmol,0.5 mCi/mL | 美国放射性标记化学品 | ARC 0172A | |
| 1 M HEPES,无菌 | 康宁 | 25060CI | |
| 10 &微量;L 用于外置活塞式移液器 | Mettler Toledo | 17008604 | |
| 1000 µ 的一次性毛细管/活塞;L、200 和微量;L 和 10 µL 移液器和吸头 | |||
| 5 mL、10 mL 和 25 mL 血清移液器 | |||
| 50 mL 无菌离心管 | CellTreat | 229421 | |
| 70% 高氯酸 | Fisher Scientific | A2296-1LB | |
| BSA,不含脂肪酸 | Fisher Scientific | BP9704100 | |
| CaCl2 二水合物 | MilliporeSigma | 223506 | |
| D-(+)-葡萄糖 | MilliporeSigma | G7021 | |
| EGTA | Gold Biotechnology | E-217 | |
| 乙醇 | Pharmco | 111000200CSPP | |
| 过滤系统,0.22 &μ;m PES 过滤器,500 mL,无菌 | CellTreat | 229707 | |
| 硫酸庆大霉素 | Gold Biotechnology | G-400-25 | |
| HDPE,6.5 mL 闪烁样品瓶 | Fisher Scientific | 03-342-3 | |
| 血细胞计数器 | |||
| 皮下注射针 22 G,1.5 in | BD Biosciences | 305156 | |
| 异氟烷 | VetOne | 502017 | |
| KCl | Fisher Scientific | BP366-1 | |
| KH2PO4 | MilliporeSigma | P5655 | |
| Liberase TM 研究级 | MilliporeSigma | 5401119001 | 纯化的胶原酶 I 和 II 与中等浓度的嗜热菌蛋白酶 |
| M199 培养基 | MilliporeSigma | M5017 | 的确定混合物 |
| MgSO4 七水合 | 物MilliporeSigma | M1880 | |
| 微量离心机 | Fisher Scientific | accuSpin Micro 17 | |
| 显微解剖剪刀 | Roboz 手术器械公司 | RS-5980 | |
| NaCl | Chem-Impex International | 30070 | |
| NaHCO3 | Acros Organics | 424270010 | |
| 棕榈酸 | MilliporeSigma | P0500 | |
| 青霉素/链霉素 (100x) | Gibco | 15140122 | |
| 磷酸盐缓冲盐水 (PBS) | Cytiva 生命科学 | SH30256.01 | |
| 外置活塞式移液器 MR-10、10 和微量;L | Mettler Toledo | 17008575 | |
| 带插件的冷冻离心机,用于 50 mL 锥形管 | Eppendorf | 5810 R | |
| 圆底, 14 mL, 聚丙烯培养试管 | Fisher Scientific | 14-956-9A | |
| 闪烁计数器 | Perkin Elmer | TriCarb 4810 TR | |
| ScintiVerse BD 鸡尾酒 | Fisher Scientific | SX18-4 | |
| 振荡水浴,30 L 容量 | New Brunswick Scientific | G76 | |
| 型无菌细胞过滤器,100 & 微型;m | Fisher Scientific | 22363549 | |
| 拇指敷料钳 | Roboz 手术器械公司 | RS-8120 | |
| 台盼蓝 | 康宁 | 25900CI | |
| 可变流量蠕动泵 | Fisher Scientific | 138762 | |
| 水浴,2–2.5 L 容量 |