针对寄生性线虫粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis)和鼠类圆线虫(Strongyloides ratti)的功能基因组学工具包包括转基因技术、CRISPR/Cas9介导的诱变以及RNA干扰技术。本实验方案将演示如何通过性腺内显微注射法,将转基因元件和CRISPR组分导入粪类圆线虫(S. stercoralis)和鼠类圆线虫(S. ratti)中。
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针对寄生性线虫粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis)和鼠类圆线虫(Strongyloides ratti)的功能基因组学工具包包括转基因技术、CRISPR/Cas9介导的诱变以及RNA干扰技术。本实验方案将演示如何通过性腺内显微注射法,将转基因元件和CRISPR组分导入粪类圆线虫(S. stercoralis)和鼠类圆线虫(S. ratti)中。
钩口线虫属(Strongyloides)包含多种可穿透皮肤的线虫,其宿主范围各异,其中包括粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis)和鼠类圆线虫(Strongyloides ratti)。S. stercoralis 是一种感染人类的寄生性皮肤穿透线虫,全球约有6.1亿人受其感染;而鼠类寄生虫 S. ratti 与 S. stercoralis 亲缘关系密切,常被用作研究 S. stercoralis 的实验室模型。通过性腺内显微注射外源核酸的技术,S. stercoralis 和 S. ratti 均易于实现转基因和基因敲除,因此已成为其他尚无法应用该技术的寄生性蠕虫的研究模型体系。
寄生性Strongyloides成虫栖居于宿主的小肠内,并通过粪便将子代释放到环境中。进入环境后,幼虫发育为自由生活的成虫,这些成虫生活在粪便中,并产生必须寻找并侵入新宿主的子代。这种环境世代为Strongyloides物种所特有,其形态与模式自由生活线虫Caenorhabditis elegans高度相似,因此针对C. elegans开发的技术可被改造后用于这些寄生性线虫,包括性腺内显微注射技术。通过性腺内显微注射,可将多种外源转基因导入Strongyloides。此外,也可通过显微注射CRISPR/Cas9组分来创制突变型Strongyloides幼虫。本文详细描述了对Strongyloides进行性腺内显微注射的技术,包括自由生活成虫的准备、注射操作步骤以及转基因子代的筛选方法。文中还展示了利用CRISPR/Cas9诱变技术获得的转基因Strongyloides幼虫图像。本论文的目的是帮助其他研究人员利用显微注射技术创制转基因和突变型Strongyloides。
Strongyloides stercoralis 与更广为人知的钩虫和蛔虫 Ascaris lumbricoides 相比,长期以来一直被忽视,未被视为重要的人类病原体1。 以往对蠕虫负荷的研究常常严重低估了 S. stercoralis 的流行率,原因是常用诊断方法对 S. stercoralis 的敏感性较低2。近年来,基于改进诊断工具的流行病学研究估计,S. stercoralis 感染的真实流行率远高于以往报道,全球约有 6.1 亿人感染2。
S. stercoralis 和其他 Strongyloides 物种(包括亲缘关系相近的大鼠寄生虫及常用的实验室模式生物 S. ratti)具有独特的生命周期,这一特性有利于开展实验性基因组学研究,因其生命周期中包含寄生世代和自由生活(环境)世代3(图1)。具体而言,S. stercoralis 和 S. ratti 均可经历一个单代的自由生活阶段。该自由生活世代由宿主排出后的寄生后幼虫发育而成,最终形成自由生活的成年雄虫和雌虫;所有自由生活成虫的子代均发育为感染性幼虫,必须侵入宿主才能延续其生命周期。此外,这一环境或自由生活世代可在实验室中进行实验操作。由于自由生活的 Strongyloides 成虫与 C. elegans 成虫形态相似,因此原本为 C. elegans 开发的技术(如性腺内显微注射)可被改造后用于自由生活的 Strongyloides 成虫4,5。尽管通常将DNA导入自由生活的成年雌虫体内,但 Strongyloides 的雄虫和雌虫均可进行显微注射6。因此,已有多种功能基因组学工具可用于研究 Strongyloides 生物学的多个方面。其他寄生性线虫缺乏自由生活世代,因而难以应用此类功能基因组学技术3。

图1:该 粪类圆线虫 生命周期 的 S. stercoralis 寄生雌虫栖息于其哺乳动物宿主(人类、非人灵长类、犬类)的小肠内。寄生雌虫通过孤雌生殖在小肠内产卵。卵在宿主体内孵化,形成后寄生期幼虫,随后随粪便排入环境。若后寄生期幼虫为雄性,则发育为自由生活的成年雄虫;若为雌性,则可发育为自由生活的成年雌虫(间接发育),或发育为第三期感染性幼虫(iL3s;直接发育)。自由生活的雄虫与雌虫通过有性繁殖产生后代,这些后代只能发育为iL3s。在特定条件下, S. stercoralis 也可发生自体感染,即部分寄生后幼虫不随粪便排出体外,而是滞留在宿主肠道内。这些幼虫可在宿主体内发育为自体感染性幼虫(L3a),穿透肠壁,经体内迁移后最终返回肠道,发育为具有生殖能力的成虫。其生活史为 S. rattii 相似,但以下情况除外: S. rattii 感染大鼠,且不具有自体感染周期。环境世代对于其应用至关重要。 粪类圆线虫 用于遗传学研究的物种。自由生活的成年雌性(P0)可通过显微注射;其子代均将发育为iL3阶段幼虫,是潜在的F代1 转基因。该图已根据 Castelletto 修改 等3. 请点击此处以查看此图的放大版本。
S. stercoralis 在生物学特性上与其他人源性肠道寄生线虫有许多相似之处,包括宿主侵入机制和宿主免疫调节。例如,属于 Necator 和 Ancylostoma 属的人源性钩虫也通过皮肤穿透感染,体内迁移路径相似,最终以寄生成虫形式定植于小肠7。因此,多种肠道线虫可能采用共通的感觉行为和免疫逃逸策略。由此,从 Strongyloides 研究中获得的知识将补充其他遗传操作较困难的线虫的研究成果,从而促进对这些复杂且重要寄生虫的全面理解。
本显微注射方案概述了将DNA导入自由生活期雌性Strongyloides线虫以获得转基因和突变后代的方法。文中描述了菌株维持的相关要求,包括用于显微注射的成虫线虫的发育时间点以及转基因后代的收集方法。方案还包括完整的显微注射技术操作步骤及其演示,以及转基因后代的培养与筛选方案,并列出了所有必需的仪器设备和耗材清单。
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注意:使用沙鼠传代粪类圆线虫(S. stercoralis),使用大鼠传代类鼠圆线虫(S. ratti)。所有实验操作均经加州大学洛杉矶分校动物研究监督办公室批准(方案编号:2011-060-21A),该机构遵循AAALAC标准及《实验动物护理与使用指南》。以下操作必须在显微注射前至少一天完成:线虫培养、制备显微注射垫、构建显微注射用质粒、在6 cm线虫生长培养基(NGM)平板上涂布大肠杆菌(E. coli HB101)8。自由生活的雌虫自粪便中收集后,需在25 °C条件下培养至少24小时,发育为年轻成虫后方可进行显微注射。显微注射垫必须完全干燥。细菌平板需充分干燥并形成较小的菌苔。
1. 显微注射载玻片的准备:注射前至少一天进行
注意:线虫被放置在带有干燥琼脂垫的显微注射盖玻片上进行注射。
2. 培养Strongyloides以获取用于显微注射的线虫:注射前1-2天
注意:可在补充材料中找到菌株保藏方案,其中详细描述了如何用线虫感染长爪沙鼠和大鼠,以及如何从感染动物的粪便中收集线虫。
3. 制备显微注射混合液:注射前或注射当天进行
注意:显微注射混合液由目的质粒用线虫缓冲盐水(BU)(50 mM Na2HPO4, 22 mM KH2PO4, 70 mM NaCl)稀释至所需浓度而制成11。
| 显微注射混合液:报告基因构建体 | |||
| 组分 | 储存浓度 | 用量 | 终浓度 |
| pMLC30 gpa-3::gfp | 300 ng/µL | 1.7 µL | 50 ng/µL |
| BU | na | 8.3 µL | na |
| total | 10 µL | 50 ng/µL | |
| 显微注射混合液:CRISPR/Cas9 诱变 | |||
| 组分 | 储存浓度 | 用量 | 终浓度 |
| pMLC47 tax-4 sgRNA | 300 ng/µL | 2.7 µL | 80 ng/µL |
| pEY11 Ss-tax-4 HDR 质粒 | 400 ng/µL | 2.0 µL | 80 ng/µL |
| pPV540 strCas9 质粒 | 350 ng/µL | 1.1 µL | 40 ng/µL |
| BU | na | 4.2 µL | na |
| total | 10 µL | 200 ng/µL | |
| 显微注射混合液:piggyBac 整合 | |||
| 组分 | 储存浓度 | 用量 | 终浓度 |
| pMLC30 gpa3::gfp | 300 ng/µL | 2.0 µL | 60 ng/µL |
| pPV402 转座酶质粒 | 450 ng/µL | 0.9 µL | 40 ng/µL |
| BU | na | 7.1 µL | na |
| total | 10 µL | 100 ng/µL | |
表1:显微注射混合物示例。 三种典型显微注射混合物的质粒及其浓度:一种用于 gpa-3::GFP 报告基因构建体10,一种用于通过 CRISPR/Cas9 技术破坏 Ss-tax-4 位点14,15,另一种用于通过 piggyBac 介导整合 Ss-gpa-3::GFP 构建体13,17,18。strCas9 表示经过 Strongyloides 密码子优化的 Cas9 基因。所列终浓度为 Strongyloides 显微注射混合物中常用的浓度。
4. 收集用于显微注射的幼年成虫Strongyloides:注射当天上午

图 2:用于从培养物中收集寄生蠕虫的贝尔曼装置10。 将粪炭培养板的内容物置于一柱温水的顶部。蠕虫迁移到水中,并聚集在漏斗底部。(A) 设置贝尔曼装置时,将贝尔曼漏斗的支架用C形夹固定在实验台上。漏斗末端连接的橡胶管用止水夹封闭,并在管下方放置接液桶以收集滴液。向玻璃漏斗中加入温水。(B) 然后用3片实验室纸巾衬垫粪炭混合物用的塑料环形支架(左)。使用木棒或压舌板(中)将粪炭培养板的内容物(右)转移至塑料环形支架中。(C) 粪炭混合物用塑料环形支架底部的特写,显示支架底部由双层尼龙网衬垫。(D) 将粪炭支架放置在玻璃漏斗顶部。(E) 用水润湿实验室纸巾,并将其覆盖在粪炭混合物上。再加入更多温水,使粪炭混合物大部分浸没。(F) 完整的贝尔曼装置,其中粪炭培养物完全浸没于温水中。请点击此处查看该图的放大版本。
5. 显微注射针的拉制与装样:注射前操作

图3:显微注射针和一个 粪类圆线虫 已确定显微注射最佳位点的成年雌性 (A-F显微注射针的图像。A-B) 柄部锥度(A)和尖端(B用于显微注射的针头应具有合适的形状,其尖端足够锋利以刺穿角质层,且足够细小以避免造成过度损伤。C-D) 柄部锥度(C)和尖端(D显微注射针头形状不正确,不适合进行显微注射。针头过于钝且宽,会对线虫造成过度损伤。E-F) 柄部锥度(E)和尖端(F) 的针头可能过长且过于细长,不适合用于显微注射。针尖在 F 与尖端非常相似 D然而,针体较窄且过于柔韧,难以有效刺穿表皮。此外,过于细长的针头容易堵塞。G) 一条正确放置以进行显微注射的完整线虫图像,假设显微注射针从右侧进入。图中下方偏左为前端;箭头指示阴门位置。雌虫右侧可见其生殖腺。该雌虫子宫内仅含一枚卵(由星号标示)。H,I微注射位点的放大图。箭头的角度近似于注射针的角度。可将阴门作为定位标志;它位于与性腺臂相对的线虫体侧。性腺臂环绕肠道弯曲,其末端(含有分裂核)与阴门相对。H) 性腺的后臂;(I前臂。可注射一侧或双侧手臂。对于 H,I,约定与原文相同 G比例尺 = 50 µm (B、D、F、H、I); 100 µm (A、C、E、G). 请点击此处以查看此图的放大版本。
6. 准备显微镜并折断针头
注意:显微注射使用配备5倍和40倍物镜的倒置显微镜,并连接显微注射装置以控制针头的移动。倒置显微镜应放置在重型实验台或防震气浮台上,以减少振动噪声。显微注射针头夹持器连接氮气,以提供输送显微注射混合液所需的压力。附近可配备一台较小的解剖显微镜,用于转移线虫。
7. 显微注射 Strongyloides
8. 注射后胚胎的回收与培养 粪类圆线虫
9. 收集并筛选F1代幼虫以获得转基因/敲除个体
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如果实验成功,F1 幼虫将表达目标转基因和/或突变表型(图4)。然而,转化率具有高度变异性,取决于所用构建体、线虫的健康状况、注射后的培养条件以及实验人员的技术水平。通常情况下,一次成功的实验将获得 >15 F1 每只注射雌虫的幼虫数及转化率 >3%用于荧光标记。如果每只雌虫产生的存活后代平均少于10条幼虫,则可能表明该构建体具有毒性,导致转基因幼虫无法存活。观察到大量荧光卵但无荧光幼虫是注射混合物可能存在毒性的另一迹象。初次学习该技术时,建议使用表达效果良好的构建体,例如 act-2::mRFPmars, 在体壁肌中驱动强烈表达13 (图4).
在通过CRISPR/Cas9介导的靶向诱变产生突变体时,建议使用包含act-2::mRFPmars或act-2::GFP转基因的修复模板
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本显微注射方案详细介绍了将转基因构建体以及CRISPR/Cas9介导的诱变构建体导入粪类圆线虫(S. stercoralis)和鼠类圆线虫(S. ratti)的方法。对于粪类圆线虫(S. stercoralis)和鼠类圆线虫(S. ratti)而言,注射后的存活率以及转基因或诱变效率均受多种可优化调节的因素影响。
成功进行转基因的首要关键因素是质粒转基因的构建方式。先前的研究发现,外源转基因在 粪类圆线虫 需要使用 粪类圆线虫 5' 启动子和 3' 非翻译区元件3,13,19. 与……类似 秀丽隐杆线虫 构建体, 粪类圆线虫 构建体通常使用基因特异性启动子和一个常见的3'非翻译区(UTR),例如来自 Ss-e...
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作者声明无利益冲突。
pPV540 和 pPV402 是由宾夕法尼亚大学的 James Lok 博士慷慨赠送的。我们感谢 Astra Bryant 对手稿提出的有益意见。本研究由布罗德-韦尔奇基金会传染病发病机制研究者奖、霍华德·休斯医学研究所教员学者奖以及美国国立卫生研究院 R01 DC017959 项目(E.A.H.)资助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| (−)-尼古丁,≥99%(GC),液体 | Sigma-Aldrich | N3876-5ML | 用于麻痹线虫的尼古丁 |
| 3" 铁制C型夹,3" x 2"(容量 x 深度) | VWR | 470121-790 | 用于将装置固定在实验台面上的C型夹 |
| 低电渗琼脂糖(Agarose LE) | Phenix | RBA-500 | 用于载玻片的琼脂糖 |
| 骨炭,4磅桶装,10 x 28目 | Ebonex | n/a | 用于粪便-炭培养的活性炭 |
| 骨炭,颗粒状,10 x 28目 | Reade | bonechar10x28 | 用于粪便培养的活性炭(上述产品的替代品) |
| 粗调微操作器 | Narishige | MMN-1 | 粗调微操作器 |
| Corning Costar Spin-X 离心管滤器 | Fisher | 07-200-385 | 微型滤柱 |
| 盖玻片,48 x 60 mm,1号厚度 | Brain Research Lab | 4860-1 | 盖玻片(48 x 60 mm) |
| 深型培养皿,加厚型,带6个通气孔,直径100 mm | VWR | 82050-918 | 10 cm 培养皿(用于粪便-炭培养) |
| Eisco 带杆铁架台底座 | Fisher | 12-000-101 | Baermann 装置用支架 |
| Eppendorf FemtoJet 显微注射器微加载吸头 | VWR | 89009-310 | 用于填充显微注射针头 |
| Fisherbrand 吸水垫巾 | Fisher | 14-206-62 | 实验台纸(用于样品制备) |
| Fisherbrand 铸铁环 | Fisher | 14-050CQ | Baermann 装置用O型环 |
| Fisherbrand 三角形聚丙烯烧杯 | Fisher | 14-955-111F | 塑料烧杯(用于混合) |
| Fisherbrand 三角形聚丙烯烧杯 | Fisher | 14-955-111F | 塑料烧杯(用于接液桶/水桶) |
| Fisherbrand 三角形聚丙烯烧杯 | Fisher | 14-955-111F | 塑料烧杯(x2)(用于制作支架) |
| 注射器装Gorilla环氧树脂 | McMaster-Carr | 7541A51 | 胶水(用于连接管路) |
| 卤代烃油700 | Sigma-Aldrich | H8898-50ML | 卤代烃油 |
| 食品饮料级耐高温硅橡胶管,内径1/2",外径5/8" | McMaster-Carr | 3038K24 | 管路(用于漏斗) |
| KIMAX 长颈漏斗,60° 角,Kimble Chase | VWR | 89001-414 | Baermann 漏斗 |
| Kimberly-Clark Professional Kimtech Science 实验台保护垫 | Fisher | 15-235-101 | 实验台纸(用于样品制备) |
| 带荧光功能的Leica体视显微镜 | Leica | M165 FC | 用于鉴定和分选转基因线虫的GFP体视显微镜 |
| microINJECTOR 黄铜直臂针夹 | Tritech | MINJ-4 | 显微注射针夹 |
| microINJECTOR 系统 | Tritech | MINJ-1 | 显微注射系统 |
| 蒙古沙鼠 | Charles River Laboratories | 213-Mongolian Gerbil | 用于维持粪类圆线虫(S. stercoralis)的沙鼠,雄性,4–6周龄 |
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| 大鼠-Long Evans品系 | Envigo | 140 HsdBlu:LE Long Evans | 用于维持类圆线虫(S. ratti)的大鼠,雌性,4–6周龄 |
| 大鼠-Sprague Dawley品系 | Envigo | 002 Hsd:Sprague Dawley SD | 用于维持类圆线虫(S. ratti)的大鼠,雌性,4–6周龄 |
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| Whatman 定性滤纸圆片,1号等级,直径9 cm | Fisher | 09-805D | 滤纸(用于10 cm 培养皿) |
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