本实验方案描述了一种利用激光损伤系统结合用于幼鱼处理的自动化微流控平台,在斑马鱼幼鱼中诱导组织特异性且高度可重复损伤的方法。
本实验方案描述了一种利用激光损伤系统结合用于幼鱼处理的自动化微流控平台,在斑马鱼幼鱼中诱导组织特异性且高度可重复损伤的方法。
斑马鱼幼鱼在受精后仅几天内就具有完全功能的中枢神经系统(CNS),并具备很强的再生能力。这使得该动物模型在研究脊髓损伤与再生方面非常有用。目前诱导此类损伤的标准方法是手动横断躯干的背侧部分。然而,该技术需要大量训练,且会损伤其他组织。为此,研究人员开发了一种基于激光诱导损伤的方案,以克服这些局限性。该方法可在大量个体及不同实验批次间实现高度可重复且完全的脊髓横断,即使未经训练的操作者也能完成。此外,组织损伤主要局限于脊髓本身,减少了皮肤、肌肉和中枢神经系统等其他组织受损带来的干扰效应。同时,该方法还可实现脊髓的半侧损伤。激光损伤后组织完整性的更好保留,有利于后续进行进一步解剖,以开展诸如电生理学等附加分析。因此,该方法能够对损伤程度实现精确控制,这是手动操作无法达到的。这将为这一强大模型未来的实验研究提供新的范式。
与哺乳动物不同,斑马鱼(斑马鱼)能够在损伤后修复其中枢神经系统(CNS)1斑马鱼幼鱼作为脊髓再生模型的应用相对较新,但已被证明在研究修复过程中细胞与分子机制方面具有重要价值2这归因于其易于操作、实验周期短(每周均有新幼虫)、组织具有光学透明性,以及幼虫体型微小,非常适合 体内 荧光显微镜技术
在脊髓再生研究中,使用幼体的另外两个优势在于恢复速度快(数天,而成体需要数周)以及通过手动技术诱导损伤更为简便。这一方法已在多项研究中成功应用3,4,5,包括近期的研究工作6,7。总体而言,这有助于提高有意义数据的产出,增强实验方案的适应性,并降低实验成本。使用受精后5天以内的幼体还符合动物研究中的“3R原则”,减少了实验动物的使用8。
在斑马鱼幼鱼发生脊髓损伤后,会启动多种生物学过程,包括炎症反应、细胞增殖、神经发生、存活细胞或新生成细胞的迁移、功能性轴突的重新形成,以及神经突触回路和脊髓组织的整体重塑6,7,9,10。这些过程的成功协调依赖于多种细胞类型、细胞外基质组分以及生化信号之间精细调控的相互作用11,12。要解析脊髓这类复杂组织发生显著重组的详细机制,需要采用并发展精确且可控的实验方法。
研究斑马鱼脊髓再生的主要实验范式是通过手术手段诱导组织损伤,例如切除、穿刺或冷冻损伤3,13。这些方法的缺点是需要操作者具备显微外科技术方面的专门培训,对于任何新操作者而言都耗时较长,可能限制其在短期项目中的应用。此外,这些方法通常会对周围组织造成损伤,从而可能影响再生过程。
另一种方法是通过化学手段14或遗传操作15来诱导细胞损伤。后者可实现高度特异性的损伤。然而,该技术在开展任何实验前都需要 lengthy 的准备工作以构建新的转基因鱼,并且每次针对不同细胞类型时都需重新进行这一过程。
因此,需要一种能够实现靶向且灵活的损伤方法,以适用于各种再生研究。一种解决方案是使用激光在目标组织中诱导局部损伤16,17,18,19,20。事实上,利用激光诱导组织损伤是一种生成脊髓损伤的可靠方法,具有多种优势。配备此类激光操作模块的显微镜能够精确设定定制形状的区域以实现细胞消融,并额外提供时间控制的优势。因此,可根据具体科学问题灵活调整损伤的大小和位置。
大多数激光损伤系统所缺乏的功能是能够以高度可重复的方式对一系列幼体进行损伤诱导。本文介绍了一种原创性方案,利用紫外激光结合专为自动化幼体操作设计的微流控平台21,实现对斑马鱼幼体进行半自动、精确且可控的损伤。此外,在本系统中,幼体被置于玻璃毛细管内,可在其头尾轴方向自由旋转。用户可选择将幼体的任意一侧面向激光,同时支持荧光成像,以精确定位激光束并在损伤后评估损伤情况。
本文所述方案适用于一种半自动化的斑马鱼幼体成像系统,该系统配备带有紫外激光器的旋转盘(下文简称VAST系统)。然而,本方案的核心要点以及该技术的大部分应用声明同样适用于任何具备细胞消融能力激光器的成像系统,包括双光子激光扫描显微镜、配备紫外激光器(FRAP模块)的旋转盘显微镜,或带有激光操控模块的视频显微镜。VAST系统与传统样品处理方式之间的一个主要区别在于:后者需要将幼体固定在盖玻片或玻璃底培养皿中的低熔点琼脂糖中,而不是将其装载至96孔板中。
该方法所提供的优势为研究再生过程中的细胞与分子机制开辟了创新性研究的新机遇。此外,高质量的数据使得在多学科背景下开展定量研究成为可能。
所有动物实验均在英国国内事务部的批准和监管下进行,并遵循其相关规定,项目许可证号为 PP8160052。该项目已获得爱丁堡大学机构动物护理与使用委员会的批准。实验分析中使用了以下可获得的转基因品系斑马鱼幼鱼,包括雄性和雌性,年龄不超过5天:Tg(Xla.Tubb:DsRed;mpeg1:GFP)、Tg(Xla.Tubb:DsRed)、Tg(betaactin:utrophin-mCherry)、Tg(Xla.Tubb:GCaMP6s) 和 Tg(mnx1:gfp)(有关转基因斑马鱼品系的构建信息,请参见补充文件1)。图1展示了使用自动化斑马鱼幼鱼处理平台的实验流程示意图。本研究中使用的所有自定义软件、脚本及详细实验方案均可在 https://github.com/jasonjearly/micropointpy/ 获取。
1. 样品制备
2. 显微镜准备
3. 在 VAST 系统上进行激光消融
4. 损伤后处理及附加实验
5. 故障排除
脊髓横断的验证
通过结构和功能研究,评估该方案是否实现了完全的脊髓横断。
首先,为了验证损伤部位荧光信号的减弱是由于神经组织损伤所致,而非激光照射引起的荧光淬灭,我们使用抗乙酰化微管蛋白抗体进行了免疫染色(见材料表和补充文件1)。结果显示损伤部位的尾侧与头侧之间轴突完全中断,证实了脊髓的完全横断(图4B)。成功的脊髓横断不应在损伤部位残留任何神经纤维投射(参见图4C以了解一次不成功的损伤示例)。采用该技术,脊髓激光损伤的成功率估计为75%(在16只动物中有4例为不完全横断)。
通过钙成像技术研究了激光损伤后功能的丧失情况。在完整的斑马鱼幼体中,脊髓全长会自发产生协调的神经元网络活动,并形成荧光信号峰。成功的横断损伤会中断损伤部位两侧之间的神经活动传导。为评估脊髓横断的质量,在3 dpf的tg(Xla.Tubb:GCaMP6s)幼鱼上实施了激光损伤。收集幼鱼至新的多孔板后,对其进行轻度麻醉处理,并将其固定在盖玻片上的低熔点琼脂糖中,以便从损伤后3小时开始在共聚焦显微镜下进行荧光延时成像记录。结果显示,损伤部位尾侧的神经活动消失。事实上,荧光信号的定量分析表明,损伤后仅在损伤部位头侧出现由幼鱼自发活动引起的信号尖峰,而在完整幼鱼中,头侧和尾侧相应位置则表现出协调一致的信号活动(图4D,E)。损伤后尾侧残留的微弱信号可能是由于感觉神经元(可能是脊髓尾侧的Rohon-Beard感觉神经元23)对头侧肌肉收缩所引发的尾部运动产生了反应所致。
激光损伤诱导的再生过程
损伤后24小时(hpi),伤口开始闭合,到48小时时脊髓的初始结构得到部分恢复(图5D)。通过钙成像检测,在48 hpi时确认了功能上的部分重新连接(图5E,F)。作者计算了尾部区域与头部区域动作电位振幅的比值(称为连接性恢复指数,图5G),结果显示该比值在3、24和48 hpi期间逐渐增加,符合脊髓再生过程中的预期变化。
激光损伤会引发免疫反应
在使用 tg(Xla.Tubb:DsRed;mpeg1:GFP) 幼鱼进行激光损伤后,观察到巨噬细胞(mpeg1:GFP+ 细胞)的募集(图 5H、I)。该结果与作者先前利用机械损伤所开展的研究一致,表明巨噬细胞在斑马鱼幼鱼脊髓成功再生过程中发挥关键作用6,24。此观察结果提示,可在激光损伤后研究免疫反应,并证实了组织损伤的发生。
激光损伤和手动损伤均可诱导脊髓中神经发生增加
既往研究采用手动损伤来研究脊髓损伤后发生的神经发生过程6,15。激光损伤可能成为研究该现象的有力工具。先前发表的实验表明,与未损伤对照组相比,手动脊髓损伤后神经发生显著增加15。本研究使用 tg(mnx1:gfp) 鱼作为运动神经元模型,其可表达荧光标记。采用抗GFP抗体染色以增强幼鱼中GFP信号的可见性,并结合EdU染色25(见补充文件1),后者用于标记新生成的神经元。EdU在3 dpf时损伤后立即加入,因此所有被EdU标记的细胞均为损伤后新生的细胞。据此,呈现共定位染色的细胞即为脊髓损伤后新生的运动神经元。统计损伤部位两侧共定位细胞的数量,或在未损伤对照组中对应损伤部位位置与大小的区域(在两个50 µm窗口内)的共定位细胞数量,并采用单因素方差分析(one-way ANOVA)26比较各组间共定位细胞平均数的差异。
本方案用于手动损伤和激光损伤的幼鱼,以比较两种损伤方法对神经发生的影响(图6)。在手动损伤与激光损伤之间,标记细胞的数量未观察到差异。在两种损伤条件下,未损伤鱼类的双标记细胞数量均少于损伤鱼类(图6D)。这与先前的研究结果一致,即与未损伤鱼类相比,手动损伤鱼类的神经发生增加15。
这些结果支持了钙成像和乙酰化微管蛋白染色的结果,因为激光损伤引发的再生反应与手动损伤相当。这表明激光损伤不仅仅是淬灭细胞中的荧光,而是造成了一种能够触发与手动损伤相同细胞反应的损伤。
激光损伤造成的皮肤和肌肉损伤小于手动损伤
手动损伤通常会导致大量皮肤和肌肉组织损伤。相比之下,激光损伤可更精确地靶向脊髓,从而减少对其他组织的损伤。为说明这一点,使用了 Tg(beta-actin:utrophin-mCh) 幼鱼进行手动和激光损伤实验。该品系可荧光标记一种F-肌动蛋白结合蛋白,从而实现对脊髓细胞和肌纤维的可视化观察。随后将幼鱼活体固定并进行成像(图7A、B)。图7A展示了脊髓的损伤情况。在激光损伤和手动损伤条件下,损伤部位均出现utrophin信号缺失,表明两种损伤方法均对脊髓细胞造成了损伤。图7B展示了肌肉损伤情况。未损伤条件下,肌节呈现清晰的V形结构,且可见成束的肌动蛋白纤维;而在手动损伤条件下,肌节的V形结构明显紊乱,肌动蛋白纤维数量减少,表明存在显著的肌肉损伤。然而,在激光损伤条件下,肌节的V形结构基本保持完整,尽管存在部分肌纤维损伤,但其范围仅局限于一至两个肌节内,而手动损伤则波及约四个肌节。此外,如图7C中体视显微镜图像所示,激光损伤条件下的皮肤损伤也明显轻于手动损伤条件。
综上所述,这些结果表明,可重复的半自动化激光损伤有望成为研究斑马鱼神经再生的有力工具。

图 1:半自动激光损伤实验流程示意图。 受精后第3天(dpf),将幼鱼加载至96孔板中,并置于自动幼鱼处理平台上。随后,每条幼鱼被吸入置于正置显微镜下、10倍NA 0.5物镜下方的毛细管中,进行成像与激光损伤操作。完成损伤后,幼鱼被转移至新的96孔板中收集,用于后续实验。图上方为tg(Xla.Tubb:DsRed)转基因品系3 dpf幼鱼在激光损伤前后的透射光与荧光图像(比例尺 = 50 µm)。所有图中幼鱼均呈头端朝左、背侧朝上。 请点击此处查看该图的放大版本。

图 2:半自动斑马鱼幼鱼成像系统与激光控制系统软件启动界面。(A)VAST 软件启动时的界面。(B)VAST 软件主窗口,显示空毛细管。(C)LP Sampler 窗口,带有空白孔板模板。(D)运行 Watch_for_ROIs_py3.py 脚本的 Python IDE 界面。橙色矩形框出终端标签页,其中显示激光衰减器初始化过程中的消息。请点击此处查看该图的放大版本。

图3:tg(Xla.Tubb:DsRed) 3 dpf幼鱼激光损伤序列示例。(A)使用ImageJ工具栏中的线形ROI工具,以20 µm线进行激光损伤的第一步。(B)第二步使用80 µm线完成脊髓的完全横切。(C)用于从ImageJ控制激光的脚本界面。(D)激光损伤过程中的图像序列。上图:损伤前;中图:第一步损伤后立即成像;下图:第二步损伤后立即成像(比例尺 = 50 µm)。请点击此处查看该图的放大版本。

图 4:乙酰化微管蛋白免疫染色(A-C)和钙成像(D,E)表明激光损伤完全破坏了脊髓组织的连续性。(A)完整的脊髓。(B)脊髓完全横断,显示沿背腹轴和内外侧轴脊髓组织完全中断。(C)不完全横断。(比例尺 = 50 µm)。(D)在 tg(Xla.Tubb:GCaMP6s) 转基因 3 dpf 幼鱼上的横断脊髓。矩形框表示用于量化损伤前后(蓝色)和后部(橙色)区域荧光强度的感兴趣区域(ROIs)。(E)前后和后部分析区域荧光强度随时间变化的图表。请点击此处查看该图的放大版本。

图5激光损伤可引发免疫反应,并促进解剖结构和功能的成功恢复。 (A-D) 转基因 tg(Xla.Tubb:DsRed) 3天龄幼鱼在处理前的最大强度投影荧光图像(A)以及激光损伤后的不同时间点:损伤后3小时(B),24 小时后(C),以及48小时后(D). (E-G利用钙成像评估功能恢复。E损伤的tg(Xla.Tubb:GCaMP6s)幼虫及其分析用感兴趣区域(ROIs)。F) 头侧和尾侧分析感兴趣区域(ROIs)中荧光强度随时间变化的曲线图。G) 损伤后3、24、48小时(N = 3)尾侧与头侧峰电位振幅比值的量化(连接性恢复指数)。H-我损伤后免疫反应的表征。H) 未损伤(左)和损伤后(右)tg(Xla.Tubb:DsRed;mpeg1:GFP) 3 dpf 幼鱼的荧光图像,显示在损伤后6小时巨噬细胞(mpeg1+细胞,绿色)的聚集情况。我) 损伤后6小时受伤与完整幼鱼中巨噬细胞数量的定量分析(N = 3)(比例尺 = 50 µm)。 请点击此处查看此图的放大版本。

图 6:激光损伤与手动损伤条件下运动神经元的损伤诱导生成效果相当。(A-C)ApoTome 显微镜下拍摄的 tg(mnx1:gfp) 转基因5天龄幼鱼图像,经 EdU 染色,分别显示激光损伤(A)、手动损伤(B)和无损伤(C)条件。箭头指示两种标记物双阳性细胞。比例尺 = 100 µm。(A'-C')白色方框所示区域的双阳性细胞高倍放大图像。(D)每条幼鱼中共定位细胞数量的定量分析。在损伤部位两侧各放置50 µm的窗口,并在所有Z轴层叠图像中计数共定位细胞。采用单因素方差分析(One-way ANOVA)结合Tukey事后检验27进行统计分析。激光损伤与手动损伤之间无显著差异(p = 0.909)。与激光损伤组(2.4倍变化,p = 0.011)和手动损伤组(2.3倍变化,p = 0.018)相比,无损伤对照组中mnx1:gfp+/EdU+细胞数量显著减少。请点击此处查看该图的放大版本。

图7:激光损伤比手动损伤引起的肌肉和皮肤损伤更小。(A-B)在共聚焦显微镜下以20倍放大倍数拍摄的未损伤、手动损伤和激光损伤条件下tg(beta-actin:utrophin-mCherry) 3 dpf幼鱼的单个Z层图像。白色箭头指示损伤部位。比例尺 = 50 µm。(A)显示可见脊髓和脊索的Z层图像。SC标注脊髓,NC标注脊索。(B)显示可见肌纤维的Z层图像。(C)在体视显微镜下拍摄的未损伤、手动损伤和激光损伤条件下3 dpf幼鱼的图像。幼鱼使用钨丝针固定在平台上(可见于激光损伤图像中)。黑色方框指示损伤部位。比例尺 = 50 µm。 请点击此处查看该图的放大版本。
补充文件1:实验方案的详细信息。本文描述了转基因斑马鱼品系的构建、人工脊髓损伤操作、乙酰化微管蛋白免疫组织化学染色、Hb9/EdU染色、成像以及图像处理与分析方法。请点击此处下载该文件。
目前迫切需要更深入地了解斑马鱼再生过程中所涉及的机制。这一动物模型在生物医学研究中具有诸多优势,尤其适用于脊髓损伤研究1。大多数研究采用手动造伤方法,需要操作者经过良好训练,且往往导致多组织损伤。本文介绍一种激光损伤方案,可精确控制损伤特征,并减少对周围组织的损伤。此外,该技术操作简便,即使经验较少的实验人员也能成功掌握和应用。
该方案中的关键步骤是激光校准和感兴趣区域(ROI)的定义。在实际操作中,校准具有很高的稳定性(甚至可达数月),一旦确定了ROI的合适大小和位置,该技术的使用就非常简便。尽管本方案描述的是在特定设备上进行损伤操作的方法,但激光损伤的大部分优势在其他系统上同样可以获得,例如转盘显微镜。
本方案的主要局限性在于需要使用脊髓的荧光报告基因,以及完成损伤所需的时间(约5分钟/条鱼)。后一项不足可通过高重复性从而减少动物使用数量来弥补。然而,在药物筛选等需要大量损伤动物的应用中,手动损伤仍然是可行的。如本研究所示,激光损伤与手动损伤诱导的神经发生程度具有可比性。
然而,激光损伤具有巨大的潜在应用价值,其中一些应用与该技术所提供的独特优势相关。例如,通过旋转毛细管可以在多种位置以受控方式制造损伤。该方法可用于在Mauthner细胞中诱导单个神经元的轴突切断(数据未显示),这一点已在Bhatt等人的研究中得到证实15。而使用手动损伤方法则无法实现这一操作。
结果还表明,损伤主要集中于脊髓,对周围组织的损伤极小。这意味着激光损伤后观察到的细胞反应更有可能是脊髓本身所致,而非来自其他受损组织的信号。这也意味着经激光损伤的幼体可能更能耐受后续实验操作。例如,进行电生理学研究时的解剖操作需要使用镊子去除躯干皮肤28,29,30,这会对本已脆弱的损伤部位施加较大的机械压力,增加轴突连接再次断裂的风险。激光损伤幼体中皮肤和肌肉组织的完整性可能有助于保护损伤部位免受进一步损伤,从而更准确地反映所达到的再生水平。
此外,激光损伤后损伤定位的改善限制了不同再生过程之间的耦合扩展,而在使用人工损伤时可能会掩盖更细微的过程。本文所述的幼年斑马鱼实验性损伤方法,可能为定量生物学、生物物理学和计算生物学领域的研究开辟一系列新的方向。
作者无任何利益冲突需要披露。
本研究由英国生物技术和生物科学研究理事会(BBSRC,项目编号:BB/S0001778/1)资助。CR 由苏格兰公主皇家 TENOVUS 医学研究奖学金项目资助。我们感谢爱丁堡大学 CRH 的 David Greenald 和爱丁堡大学 CDBS 的 Katy Reid 慷慨提供转基因鱼(见补充文件)。我们感谢爱丁堡大学 CRH 的 Daniel Soong 慷慨提供 3i 转盘共聚焦显微镜的使用权限。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 软件 | |||
| 显微镜软件 Zen Blue 2.0 | Carl Zeiss | ||
| ImageJ/FIJI | 开源 | ||
| Visual Studio Code | Microsoft | ||
| 显微镜及附件 | |||
| ApoTome 显微镜 | Carl Zeiss | ||
| C-Plan-Apochromat 10X (0.5NA) 浸入式物镜 | Carl Zeiss | ||
| 双 AxioCam 506 m CCD 相机 | Carl Zeiss | ||
| 激光扫描共聚焦显微镜 LSM880 | Carl Zeiss | ||
| 转盘式共聚焦模块 CSU-X1 | Yokogawa | ||
| 正置显微镜 Axio Examiner D1 | Carl Zeiss | ||
| 紫外激光器 | Micropoint | ||
| VAST BioImager | Union Biometrica | ||
| 实验耗材 | |||
| 90 mm 培养皿 | Thermo-Fisher | 101R20 | |
| 96 孔板 | Corning | 3841 | |
| 化学试剂 | |||
| Click-It EdU 成像试剂盒 | Invitrogen | C10637 | |
| 氨基苯甲酸乙基甲酯(MS222) | Sigma-Aldrich | A5040 | |
| 苯硫脲(PTU) | Sigma-Aldrich | P7629 | |
| 抗体 | |||
| 驴抗鸡 Alexa Fluor 488 | Jackson | 703-545-155 | |
| 驴抗小鼠 Cy3 | Jackson | 715-165-150 | |
| 小鼠抗 GFP 抗体 | Abcam | AB13970 | |
| 小鼠抗乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma | T6793 | |
| 转基因斑马鱼品系 | |||
| Tg(beta-actin:utrophin-mCherry) | N/A | 由爱丁堡大学 David Greenhald 建立 | |
| Tg(mnx1:gfp) | N/A | 首次描述于 [Flanagan-Steet et al. 2005] | |
| Tg(Xla.Tubb:DsRed) | N/A | 首次描述于 [Peri 和 Nusslein-Volhard 2008] | |
| Tg(Xla.Tubb:DsRed;mpeg1:GFP) | N/A | 由爱丁堡大学 Katy Reid 建立 | |
| Tg(Xla.Tubb:GCaMP6s) | N/A | 由爱丁堡大学 David Greenhald 建立 |
An erratum was issued for: Controlled Semi-Automated Lased-Induced Injuries for Studying Spinal Cord Regeneration in Zebrafish Larvae. The title was updated.
The title was updated from:
Controlled Semi-Automated Lased-Induced Injuries for Studying Spinal Cord Regeneration in Zebrafish Larvae
to:
Controlled Semi-Automated Laser-Induced Injuries for Studying Spinal Cord Regeneration in Zebrafish Larvae