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方法文章

使用质谱法分析 Drosophila 光感受器中的脂质信号传导

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DOI:

10.3791/63516

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2022年3月7日

本文内容

摘要

该论文提供了多功能、稳健且灵敏的质谱分析方案,用于鉴定和定量果蝇(Drosophila)光感受器中多个类别的脂质。

摘要

磷脂酶Cβ(PLCβ)的激活是果蝇(Drosophila)光感受器中感觉转导过程的关键步骤。PLCβ的活性导致细胞膜脂质磷脂酰肌醇4,5-二磷酸[PI(4,5)P2]的水解,最终引发瞬时受体电位(TRP)和TRP类似(TRPL)通道的激活。PLCβ的活性还继而导致多种脂质分子的生成,其中一些已被提出在TRP和TRPL通道的激活中发挥作用。此外,已有研究提出多类脂质在组织光感受器细胞生物学结构方面发挥关键作用,以优化信号转导反应,实现高效的感觉转导。历史上,这些发现主要依赖于分离控制特定脂质水平的果蝇(Drosophila)突变体,并在这些突变体中进行光感受器生理学分析的能力。近年来,已开发出高灵敏度和高特异性的强大质谱技术,用于脂质的分离与定量分析。这些方法特别适用于果蝇(Drosophila)研究,使得目前无需放射性同位素标记即可对光感受器中的脂质进行分析。本文阐述了在果蝇(Drosophila)光感受器中对多种信号脂质进行稳健、灵敏且准确的定量评估时,脂质质谱分析在概念和实践上的考虑因素。结合现有的分子遗传学和生理学分析方法,此类脂质分析有望进一步增强光感受器作为生物学研究模型系统的应用价值。

引言

Drosophila 中的光转导由 G 蛋白偶联的 PLCβ 级联反应介导,导致光激活通道 TRP 和 TRPL 的激活1。PLCβ 水解膜结合的磷脂磷脂酰肌醇 4,5-二磷酸 [PI(4,5)P2],生成二酰甘油(DAG)和肌醇 1,4,5-三磷酸(IP3)。随后,DAG 被 DAG 激酶磷酸化生成磷脂酸(PA)。接着,通过一系列涉及脂质中间产物生成的反应,PI(4,5)P2 得以再生2。该 PI(4,5)P2 循环中的多个组分在 Drosophila 光感受器中具有功能。PLC 激活导致 TRP 和 TRPL 通道门控的具体机制仍不明确。然而,多条证据表明,PI(4,5)P2 水解过程中产生的脂质中间产物可能介导了这一过程3。因此,鉴定并定量这些脂质中间产物对于阐明 Drosophila 光转导中 TRP 和 TRPL 通道的激活机制至关重要。除了在光转导本身中的作用外,脂质还在光感受器细胞结构组织中发挥多种重要功能(综述见3)。了解脂质的这些功能依赖于在活体(in vivo)中检测和定量其水平的能力。本文概述了从 Drosophila 光感....

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方案

1. 果蝇的饲养与化学试剂的准备

  1. 在25 °C、相对湿度50%且无内部照明的培养箱中,使用标准果蝇培养基饲养果蝇(Drosophila melanogaster)。按如下方法制备果蝇培养基:添加80 g/L玉米粉、20 g/L D-葡萄糖、40 g/L蔗糖、8 g/L琼脂、15 g/L酵母提取物、4 mL丙酸、0.7 g/L TEGO(对羟基苯甲酸甲酯)和0.6 mL正磷酸,具体方法见文献34,也可在 https://bangalorefly.ncbs.res.in/drosophila-media-preparation 获取。另将一组果蝇在羽化后置于持续白光照射(照度约2,000 lux)且温度维持在25 °C的冷却培养箱中培养。
  2. 通过将氯仿:甲醇:2.4 M盐酸按250:500:200(体积比)混合制备磷脂酰肌醇洗脱缓冲液(PEB)。通过将甲醇:1 M盐酸:氯仿按235:245:15(体积比)混合制备下层相洗涤缓冲液(LPWS)。通过将氯仿:甲醇:水按8:4:3(体积比)混合制备衍生化后洗涤溶液。
    注意:使用质谱级溶剂和试剂。PEB和LPWS缓冲液存放时间不得超过3个月。
  3. 检测磷脂酰肌醇类物质PI4P和PI(4,5)P2时使用C4柱(1.7 µm x 1 mm x 100 mm),检测磷脂酸(PA)、磷脂酰胆碱(PC)....

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结果

质谱中测量线性的确定。线性是指质谱方法提供的结果与脂质分析物浓度成正比的能力。线性取决于(a)脂质分析物的电离效率,以及(b)在不同浓度下脂质分析物的电离行为,后者与所使用的离子源有关。在本研究采用的电喷雾电离(ESI)中,线性在较低浓度范围内成立,具体取决于(a)离子从ESI源到质量分析器的传输效率,以及(b)质量分析器的设计和检测器信号的线性特性。每次实验均需使用被分析分子的内标物来评估线性。作为示例数据集,图4展示了在浓度跨越两个数量级的范围内,DIMS实验中PA(12:0/13:0)标准品的线性响应情况。

DIMS 方法。 图 5 展示了利用全局 DIMS 方法从野生型 Drosophila 中检测并定量的所有脂质类别。Y 轴表示摩尔百分比,该值通过计算每个脂质类别中检测到的所有分子种类总和得出,总脂质中各类脂质所占百分比显示在 .......

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讨论

大量证据表明,信号脂质在调控细胞结构与功能方面具有多种作用 果蝇 光感受器。除了脂质在调控光转导中已被广泛研究的作用之外3信号脂质还参与蛋白质运输和亚细胞结构的组织23,30,39,40,41这些研究得益于已建立完善的生理学方法42 和遗传分析43 光感受器功能在 果蝇 模型系统。然而,为了充分理解脂质分子的功能 果蝇 感光细胞,还需要采用能够在不同生理条件下(例如,黑暗与光照)检测并量化感光细胞中脂质水平的方法,以及在相关情况下 果蝇 预测会影响信号脂质代谢和感光细胞生理学的突变体。

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

本研究工作得到了印度原子能部(项目编号:RTI 4006)、印度生物技术部(BT/PR4833/MED/30/744/2012)以及印度联盟高级研究员项目(IA/S/14/2/501540)对PR的资助。我们感谢NCBS质谱平台,特别是Dhananjay Shinde博士以及PR实验室成员在开发这些方法过程中所做出的贡献。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
0.1 N 甲醇 HCl用于总脂质提取
0.88% KClSigma AldrichP9541用于总脂质提取
1.5 ml / 2 ml LoBind Eppendorf 管Eppendorf022431081/022431102用于总脂质提取
2.3.18 16:0/18:1 二醚磷脂酰乙醇胺Avanti 极性脂质999974脂质内标
37% 纯度的 HClSigma Aldrich320331用于总脂质提取
96孔板总有机磷酸盐测定
丙酮Fisher Scientific32005用于解剖
钼酸铵总有机磷酸盐测定
抗坏血酸总有机磷酸盐测定
超声波清洗机
BEH300 C18 色谱柱 [1.0 mm × 100 mm × 1.7 mm]Waters India Pvt. Ltd.186002352液相色谱
刀片架精细科学工具10052-11用于解剖
BOD 培养箱总有机磷酸盐测定
可断裂刀片精细科学工具10050-00用于解剖
黄油纸GE 医疗10347671用于解剖
C4, 300 A0, [1.7 μm × 1 mm × 100 mm] 柱Waters India Pvt. Ltd.186004623液相色谱
带衬管的棕色玻璃色谱小瓶默克27083-U
d18:1/17:0Avanti 极性脂质860517脂质内标
d5-磷脂酰肌醇3,5-二磷酸 [PI(3,5)P2]-16:0/16:0Avanti 极性脂质850172脂质内标
体视显微镜OlympusSZ51用于解剖
干热浴
洗脱液 A正己烷:异丙醇:100 mM 乙酸铵水溶液(68:30:2),用于液相色谱
洗脱液B正己烷:异丙醇:100 mM 乙酸铵水溶液 (70:20:10),用于液相色谱
滤纸Indica-HM274039用于解剖
烧瓶硼硅酸盐用于解剖
果蝇NANARaghu Padinjat 实验室
果蝇培养基NANANCBS 实验室培养基配方:玉米粉 80 g/L,D-葡萄糖 20 g/L,蔗糖 40 g/L,琼脂 8 g/L,酵母提取物 15 g/L,丙酸 4 mL,对羟基苯甲酸甲酯(TEGO)0.7 g/L,正磷酸 0.6 mL
镊子精细科学工具11254-20用于解剖
通风橱
漏斗硼硅酸盐用于解剖
冰醋酸Fisher ScientificA35-500用于衍生化
玻璃瓶:透明色和琥珀色用于总脂质提取
耐高温无磷玻璃管总有机磷酸盐测定
含氧化锆珠的匀浆管用于总脂质提取
匀浆仪Precellys
加湿的 CO₂2 连接至果蝇培养垫用于果蝇操作
光照可控培养箱松下三洋MIR-553用于果蝇培养
初始有机混合物甲醇:氯仿(2:1),用于总脂质提取
LC-MS级氯仿Sigma Aldrich650498用于总脂质提取
LC-MS级甲醇Sigma Aldrich34860用于总脂质提取
LC-MS级水Sigma Aldrich34877用于总脂质提取
光度计HTC 仪器LX-103
低吸附吸头Eppendorf0030072006/72014/72022/72030用于总脂质提取
LTQ Orbitrap XL 仪器赛默飞世尔科技,德国不来梅
溶血磷脂酸(LPA)- 13:0Avanti 极性脂质LM-1700脂质内标
溶血磷脂酸(LPA)- 17:1Avanti 极性脂质LM 1701脂质内标
溶血磷脂酰胆碱(LPC)-13:0Avanti 极性脂质LM-1600脂质内标
溶血磷脂酰胆碱(LPC)-17:1Avanti 极性脂质855677脂质内标
溶血磷脂酰胆碱(LPC)- 19:0Avanti 极性脂质855776脂质内标
高氯酸总有机磷酸盐测定
磷酸盐标准品 磷酸二氢钾总有机磷酸盐测定
磷酸盐缓冲液(PBS)NANA成分:137 mM NaCl、2.7 mM KCl、10 mM Na2HPO4 和 1.8 mM KH2PO4,pH 7.4
磷脂酸(PA)- 12:0/13:0Avanti 极性脂质,LM-1400 脂质内标
磷脂酸(PA)- 17:0/14:1Avanti 极性脂质LM-1404脂质内标
磷脂酸(PA)-(17:0/17:0)Avanti 极性脂质830856脂质内标
磷脂酸(PA)-16:0-D31/18:1Avanti 极性脂质860453脂质内标
磷脂酰胆碱(PC)-12:0/13:0Avanti 极性脂质LM-1000脂质内标
磷脂酰胆碱(PC)- 17:0/14:1Avanti 极性脂质LM-1004脂质内标
磷脂酰乙醇胺(PE)- 17:0/14:1Avanti 极性脂质LM-110脂质内标
磷脂酰肌醇 (PI) - 17:0/14:1Avanti 极性脂质LM-1504脂质内标
磷脂酰肌醇4,5-二磷酸 [PI(4,5)P2)]-17:0/20:4Avanti 极性脂质LM-1904脂质内标
磷脂酰肌醇-4-磷酸(PI4P)- 17:0/20:4Avanti 极性脂质LM-1901脂质内标
机器人纳流离子源TriVersa NanoMate(Advion BioSciences,美国纽约州伊萨卡)
Rotospin 仪器Tarsons3090X
硅胶垫用于解剖
溶剂A水相中含0.1%甲酸,用于液相色谱
溶剂B乙腈中含0.1%甲酸,用于液相色谱
台式离心机
恒温混匀仪
TMS-重氮甲烷阿克罗斯AC385330050用于衍生化
三重四极杆质谱仪AB SciexQTRAP 6500
超高效液相色谱系统Waters Acquity
真空离心浓缩仪Scanvac,Labogene
涡旋混合器

参考文献

  1. Hardie, R. C. C., Raghu, P. Visual transduction in Drosophila. Nature. 413 (6852), 186-193 (2001).
  2. Raghu, P., Yadav, S., Mallampati, N. B. N. Lipid signaling in Drosophila photoreceptors. Biochimica et Biophysica Acta. 1821 (8), 1154-1165 (2012).
  3. Hardie, R. C.

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磷脂酶CβPI(45)P2水解TRP通道TRPL通道脂质定量分子遗传学感觉转导

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