TGT 表面是一种用于研究生长因子与整合素串扰的创新平台。该平台采用灵活的探针设计、特异性的黏附配体以及对刺激条件的精确调控,可对 EGFR 与整合素之间的相互作用进行可靠的定量评估。研究结果表明,EGFR 作为一种“机械组织者”,能够调节整合素的力学特性,影响黏着斑的组装和细胞铺展。
方法文章
TGT 表面是一种用于研究生长因子与整合素串扰的创新平台。该平台采用灵活的探针设计、特异性的黏附配体以及对刺激条件的精确调控,可对 EGFR 与整合素之间的相互作用进行可靠的定量评估。研究结果表明,EGFR 作为一种“机械组织者”,能够调节整合素的力学特性,影响黏着斑的组装和细胞铺展。
多细胞生物依赖细胞膜受体与其周围细胞外基质(ECM)中对应配体的相互作用,以协调多种功能,包括黏附、增殖、迁移和分化。机械力可从细胞传递 通过 细胞黏附受体整合素与细胞外基质(ECM)中配体的相互作用。这些由细胞产生的力学力的大小和空间分布可受到生长因子受体的调控,包括表皮生长因子受体(EGFR)。目前可用的工具可用于量化由信号串扰介导的细胞力学特性变化,并将其与 黏着斑、细胞形态及信号转导的研究受限。基于DNA的分子力传感器,即张力阈值拴系物(tension gauge tethers, TGTs),已被用于量化这些变化。TGT探针的独特之处在于能够调控其内在的力阈值,并在衍射极限的空间分辨率下,报告整个贴壁细胞表面皮牛顿量级的受体受力情况。本文所使用的TGT探针依赖于受体-配体作用力导致DNA双链发生不可逆解离,从而产生荧光信号,由此可量化细胞整合素张力的累积值(即受力历史)。本文介绍了一种利用TGT研究表皮生长因子受体(EGFR)对整合素力学特性及黏附形成影响的实验方案。该探针的组装 TGT机械传感平台被系统地详细阐述,并概述了成像力、黏着斑及细胞铺展的实验流程。总体而言,该平台可通过调节探针的内在力阈值、黏附配体以及所用刺激因子的类型和浓度,成为研究多种膜受体在调控整联蛋白介导的力学作用中相互关系的可靠工具。
细胞具有感知、产生和响应机械力的内在能力,从而导致细胞表型的改变以及局部微环境的重塑1,2。机械力在调控细胞行为的诸多方面发挥着关键作用,包括黏附、迁移、增殖、分化以及伤口愈合3,4。细胞与微环境之间双向力学交换的异常可导致疾病状态,包括癌症5。多种膜受体参与维持细胞-基质稳态,其中整合素(integrins)与表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)之间存在显著的协同作用6,7。传统上,整合素建立微环境与细胞内细胞骨架之间的力学连接,而EGFR则调控细胞生长、增殖和存活8,9。EGFR是一个被广泛研究的治疗靶点,其研究重点在于介导胞外到胞内的信号转导。EGFR与整合素之间的相互作用已在遗传学和生物化学层面被证实,可调控包括癌症在内的多种疾病的进展10,11。尽管研究提示EGFR与整合素之间存在相互作用,但这些效应通常归因于远离质膜的信号通路7,12,13,14。由于缺乏用于测量细胞力学和信号输出的工具,EGFR或其他生长因子对细胞力学的影响在很大程度上仍未被探索。当前的挑战在于识别合适的工具,以研究这两种并行信号模式之间的通讯,并量化它们对细胞力学的特定贡献。
已开发出多种方法用于测量细胞黏附受体产生的力,读者可参考有关这些技术的深入综述15,16简而言之,牵引力显微镜和微柱阵列检测依赖于基底材料的形变来推断纳牛顿(nN)级的力,该力级比单个受体所受的力高一个数量级。17,18单分子技术(包括原子力显微镜和光镊)能够检测单个蛋白质的皮牛顿(pN)级力,但每次仅能测量一个受体,且空间分辨率较差(或无空间分辨率)。基于DNA的分子张力探针和张力阈值拴系(TGT)探针则可在衍射极限(或更高)的空间分辨率下实现pN级力的检测,因而在单细胞力学研究中具有独特作用。19,20 来自多种细胞类型,包括成纤维细胞、癌细胞、血小板和免疫细胞21,22,23,24. 尽管分子张力探针具有可延伸性 "弹簧" 元素,适用于实时成像,TGT 探针不可逆地破裂,留下荧光标记 "受力历史"TGT 还可调节其下方基底的张力阈值;一系列具有相似化学组成但断裂力或张力耐受性(Ttol),可用于量化黏着斑形成和细胞铺展所需的最小张力。TGT探针由两条互补的DNA链组成,其中一条固定在表面,另一条向细胞呈现配体。当受体结合该配体并施加的力超过Ttol 探针的链将被分开。Ttol 定义为在理想条件下,2秒内使50%的探针断裂所需的恒定力。在 "开启" TGT探针中,上链的淬灭剂可与下链的荧光团分离。只有在TGT探针发生断裂的位置(推测是由于受到大于或等于T的力所致),才会出现这种分离现象tol,将产生荧光信号。TGT探针还可被固定,便于对生物系统进行操作以及多种条件的测试。因此,本研究采用了TGT探针。
采用TGT探针研究了活化的EGFR如何调节整合素依赖性细胞黏附和机械力21。该研究确立了EGFR作为一种“机械组织者”的作用,可调控黏着斑的组装及张力生成。此外,研究发现EGF刺激影响了黏着斑的分布与成熟度,并促进细胞铺展。该方法可用于未来研究生长因子如何影响肿瘤进展和动态过程中的机械力。尽管EGFR与整合素串扰在调控上皮-间质转化中的作用已较为明确,但机械力在该过程中的作用仍缺乏深入研究10。
本文详细介绍了这些实验的操作流程,涵盖56 pN TGT探针的合成与组装、在玻璃盖玻片上构建TGT表面、将Cos-7细胞接种于TGT表面并用EGF刺激、细胞固定、鬼笔环肽染色以及抗paxillin抗体染色、高分辨率全内反射荧光(TIRF)显微镜和反射干涉对比显微镜(RICM)成像,以及图像定量分析。尽管本实验方案旨在研究EGF对Cos-7细胞的刺激作用,但其可轻松适用于多种基于TGT的实验。通过替换不同的配体、Ttol、细胞类型、刺激参数、固定后标记的蛋白质以及定量分析方法,该方案具有高度的灵活性和广泛的应用价值。
1. TGT 寡核苷酸的制备
注意:此处概述了寡核苷酸探针的合成细节。请注意,某些修饰和纯化步骤可外包进行定制合成。
2. 表面准备
第1天:
第2天:
3. 细胞准备与染色
4. 图像采集
5. 数据分析
注意:使用 Fiji 软件进行定量图像分析,并使用统计学软件进行数据分析。
开启型TGT探针被用于研究配体激活的表皮生长因子受体(EGFR)对Cos-7细胞中整合素介导的细胞力学及黏附形成的影响21。该探针呈递环状Arg-Gly-Asp-Phe-Lys(cRGDfK)配体21,23,25,26,其对整合素异源二聚体αVβ3具有选择性,仅对α5β1整合素具有微弱亲和力27,28,29,30。TGT探针由一个双链DNA构成,通过生物素-链霉亲和素结合将底链固定在玻璃盖玻片表面。via底链固定于玻璃盖玻片表面。顶链展示整合素配体,并可与细胞膜上的相应整合素受体结合(图5A)。底链标记有荧光团,顶链标记有淬灭剂,因此当双链TGT完整时,背景荧光极低。当整合素结合配体并施加超过探针Ttol的力时,DNA双链将发生解离,从而产生荧光信号(图5A)。任何未被机械力破坏的TGT探针将保持非荧光状态。这种力选择性的荧光开启机制可在衍射极限分辨率下系统性、定量地绘制皮牛顿(pN)尺度的整合素产生力图谱。此外,TGT探针还可调节基底的张力阈值。
此处展示的是一个具有 56 pN Ttol 的 TGT 表面的代表性示例。将 Cos-7 细胞接种于该 TGT 表面,并在有或无 EGF 刺激的条件下培养,以研究配体刺激下 EGFR 激活对细胞黏附和整合素力学的影响(图 5A、B)。细胞在 TGT 表面上有或无 EGF 刺激孵育 60 分钟,随后固定并进行免疫荧光染色,以显示黏着斑分布(paxillin)和细胞骨架的组织结构(F-actin)(图 5B)。然后使用反射干涉显微镜(RICM)和全内反射荧光显微镜(TIRF)对细胞成像。RICM 图像中可明显看出,在 56 pN TGT 表面上,经 EGF 刺激后 Cos-7 细胞的铺展显著增强,相较于无刺激组。通过测量 RICM 图像中细胞-基底接触区域的大小,对每种条件下 50 个细胞进行了量化分析(图 5C)。经 EGF 刺激后,细胞呈现更趋圆形的形态,这代表了 Cos-7 细胞在其天然生理环境中铺展和生长的典型特征(图 5D)。在张力荧光图像中也可观察到,EGF 刺激下开放探针的荧光信号更强。开放探针的积分荧光强度(与开放探针数量成正比)在 EGF 刺激下明显高于无刺激组(图 5B、E)。这反映了所有受体-配体结合事件中,整合素施加的力超过 Ttol(56 pN)的情况。
使用paxillin染色显示,EGF刺激也影响了黏着斑的分布、数量、成熟度(大小)和组织结构。与未添加EGF的对照组相比,经EGF刺激的细胞中的黏着斑显得更为成熟,并呈放射状排列。通过鬼笔环肽染色评估发现,EGF刺激还增强了F-肌动蛋白细胞骨架的组织性(图5B)。这些定性评估是通过对两组处理的图像进行视觉比较得出的。虽然可以进行黏着斑的定量分析,但这超出了本实验方案的范围。在本实验中,TGT表面为系统阐述EGFR激活对细胞铺展、整合素力学以及黏着斑形成的影响提供了平台。

图1:TGT表面制备第一天的示意图。 (A)清洗盖玻片。(B)蚀刻盖玻片表面。(C)中和piranha溶液。(D)对表面进行硅烷化处理以生成反应性氨基。(E)使盖玻片与有机相平衡。(F)用惰性气体干燥盖玻片。(G)对表面的氨基进行生物素标记。请点击此处查看该图的放大版本。

图2:TGT表面制备第二天的示意图。(A)清洗并干燥盖玻片,以去除前一天残留的生物素。(B)用BSA进行封闭,防止后续步骤中试剂发生非特异性结合。(C)用链霉亲和素对盖玻片进行功能化处理。(D)在热循环仪中使探针杂交。(E)将合成的探针加到盖玻片上。(F)将盖玻片组装到细胞成像室中。请点击此处查看该图的放大版本。

图3:整个实验设置中主要步骤的总体工作流程示意图。(A)在基础培养基(DMEM)中将细胞从培养表面解离并接种到TGT表面的过程,可选择是否添加EGF刺激。(B)细胞在TGT表面贴附并铺展后,进行固定和免疫染色各步骤的流程图。(C)染色完成后,使用倒置荧光显微镜结合RICM和TIRF显微镜对细胞进行成像。请点击此处查看该图的放大版本。

图 4:数据处理与定量分析示例。 (A)在 Fiji(ImageJ)中用于 RICM 和张力图像定量分析的分析流程逐步分解图。 (B)使用上述流程分析细胞形态计量学结果的代表性示例。 (C)使用上述流程分析细胞力学结果的代表性示例。 请点击此处查看该图的放大版本。

图 5:TGT 实验的示例数据。 (A)示意图突出显示细胞膜与 TGT 表面界面处的接触区域。插图展示了整合素与其特异性配体 cRGDfK 的相互作用,在有(右)或无(左)EGF 刺激的情况下。 (B)Cos-7 细胞在 56 pN TGT 表面上铺展后的 RICM 和 TIRF 图像。图像采集于接种后 60 分钟,分别在有或无 EGF 刺激条件下获取。分别展示了 RICM(原始采集图像)、整合素张力(灰度)、paxillin(橙红色调)和 F-actin(蓝绿色)图像,并对两种刺激条件均提供了叠加图像。比例尺:10 μm。插图放大显示了一个感兴趣区域(ROI),详细说明了由 paxillin 标记的黏附形成位点处产生的整合素张力,以及由肌动蛋白标记的底层亚细胞骨架组织的共定位情况。比例尺:5 μm。 (C-E)Cos-7 细胞在有或无 EGF 刺激条件下的铺展面积(RICM 细胞投影面积)(C)、圆形度(D)和总张力积分值(E)的散点图。柱状图表示均值 ± 标准差。组间差异通过 Student's t-检验进行统计学评估;****P < 0.0001。数据来自三次独立实验,共分析了 50 个细胞。 请点击此处查看该图的放大版本。

图6:不同潜在问题的TGT表面示例。(A)理想TGT表面的张力和RICM图像,探针在细胞黏附前已组装并淬灭。(B)TGT探针缺少上链(淬灭剂)的TGT表面的张力和RICM图像。张力图像显示下链中开放荧光团的均匀荧光。(C)细胞在理想TGT表面上铺展的张力和RICM图像。(D)细胞在制备不良的TGT表面上铺展的张力和RICM图像,该表面存在钝化不足或探针降解问题。(E)细胞接种在含cRGDfK配体的理想表面上的张力、RICM和明场图像,表明cRGDfK-整合素相互作用对细胞黏附和张力生成至关重要。(F)细胞接种在TGT表面无cRGDfK配体的表面上的张力、RICM和明场图像。尽管明场图像中可见细胞,但未观察到细胞黏附或整合素张力的生成。比例尺:10 μm。请点击此处查看该图的放大版本。
通过上述详细的逐步操作流程,可制备TGT表面,用于量化经EGF处理后贴壁细胞在黏附和铺展过程中产生的细胞形态变化及整合素张力。该探针设计简洁,合成与表面制备过程简便,实验装置简单,为研究EGFR与整合素之间的相互作用提供了稳定的平台。总体结果表明,配体依赖性激活的EGFR可增强细胞铺展,调节整合素受体的承力特性,并促进黏着斑的组装与成熟。利用TGT探针获得的结果支持了总体假设:生长因子(如EGFR)可作为“机械组织者”,增加整合素张力的强度及其空间分布的有序性,并调控黏着斑的取向与力学特性。
当细胞施加于TGT表面时,其会着陆、附着并铺展,此时整合素(αVβ3)受体感知并结合cRGDfK配体。在此过程中,TGT探针可能因机械断裂而在配体结合位点产生荧光信号。该信号读出的是细胞与表面相互作用过程中的累积"受力历史"。在这些实验中,TGT表面可能出现一些常见问题,例如表面背景荧光过高(图6A、B)、表面呈现斑驳外观、细胞未能产生张力信号(图6C、D)以及细胞未能铺展(图6E、F),这些问题可能源于TGT探针或表面合成过程中的技术缺陷。针对这些常见问题的解决方案见表1。
TGT探针的简单设计为细胞生物学家提供了一种强大工具,可在仅提供特定配体和刺激的情况下,独立研究特定生长因子-整合素信号转导的结果,而不受其他细胞表面受体的干扰。此外,TGT探针能够在细胞黏附过程中以皮牛顿(pN)级别的灵敏度,检测单个整合素受体所涉及的张力阈值。其他方法无法在固定样本中以高空间分辨率报告单个受体施加的力31。牵引力显微镜仅对纳牛顿(nN)级别的力敏感,比单个整合素受体施加的力高出一个数量级15;而分子张力探针虽可测量皮牛顿级别的力,但由于其可逆性,无法在固定过程中保持稳定。基于这些原因,TGT探针成为研究生长因子-整合素相互作用力学特性的理想工具。
在设计实验之前,应考虑与TGT探针相关的若干技术细节。张力图像代表的是某一时间点的快照,反映的是受体-配体相互作用的力历史,而非在任意特定时刻受体-配体结合状态的指示。由于信号的产生依赖于探针的分离,TGT荧光来源于未处于受体-配体相互作用主动张力下的开放探针。这意味着在TGT表面获得的整合素张力读数具有历史性和累积性,仅反映曾经存在超过Ttol的力的位置;而当前受体-配体作用力低于Ttol的位置则不会被报告19,32。由于TGT断裂会导致受体-配体相互作用的终止,因此细胞铺展是由所受力低于Ttol的整合素-配体相互作用所介导的。因此,用户在定义接种后的时间点以评估基于整合素黏附的力学结果时必须谨慎。最后,必须理解Ttol的含义。本研究所采用的TGT探针的Ttol为56 pN,其中Ttol是指在持续施加2秒时能够使50%探针断裂的恒定力值。在复杂的生物系统中,TGT探针可能经历具有不同时间依赖性的异质且多样的力梯度。若TGT探针受到高于Ttol的力而断裂,则荧光信号将低估总张力。相反,低于Ttol的力若作用时间更长,也可能导致与高强度短时作用力相似数量的探针断裂。上述两种情况可能产生相同的荧光强度读数,使得利用TGT探针难以分辨确切的张力大小或动态变化33,34。
总体而言,在进行生长因子刺激下整合素张力的评估时,应谨慎设计实验,设置内部对照,比较细胞在其他基质包被表面的铺展特征,平行检测有无生长因子刺激条件下细胞中TGT荧光信号的变化,并使用具有不同Ttol的TGT探针。TGT技术可实现对生长因子信号通路在调控整合素受体力学特性、黏着斑动态行为及细胞铺展过程中作用的定量分析。本实验方案可作为多种基于TGT探针的研究工作的模板,适用于不同Ttol、不同配体、不同细胞类型或不同刺激条件的实验体系。固定后可对任何感兴趣的蛋白质进行标记,并可采用任意类型的定量图像分析方法。因此,本文提供了一个适用于多种TGT实验的通用模板。
TGT探针的应用不仅限于整合素的研究,通过更换配体,还可扩展至不同类型细胞的多种细胞膜受体。TGT探针已被用于研究力学在调控各种受体信号通路中的作用,包括揭示Notch受体力学在胚胎发育和神经发生中的机械作用35,B细胞受体识别和内化抗原过程中介导的力学作用36,以及T细胞表面受体通过检测力学变化实现机械校对的能力,从而增强信号传递的强度与特异性37。这些研究结果共同凸显了TGT探针在多种实验条件下的巨大应用潜力。
作者声明无利益冲突。
作者谨向 Mattheyses 实验室的成员致以感谢,感谢他们富有成效的讨论和宝贵意见。我们感谢 NSF CAREER 1832100 和 NIH R01GM131099 项目对 A.L.M. 的资助支持。
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| 12 pN TGT | 5' AmMC6/3' BioTEG | CGCATCTGTGCGGTATTTCACTTT | 下链 TGT 探针 |
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