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方法文章

线粒体内膜对 Na+ 的敏感性揭示了功能型辅酶Q池的部分区室化

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DOI:

10.3791/63729

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2022年7月20日

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本文内容

摘要

本方案描述了一种比较性检测方法,通过检测在有或无 Na+ 存在条件下线粒体复合物 CI+CIII 和 CII+CIII 的活性,以研究部分区隔化的功能性辅酶Q池是否存在。

摘要

线粒体内膜(IMM)中的泛醌(CoQ)库部分地被分隔,分别供给复合物I或FAD依赖性酶。这种区室化可通过使用冻融线粒体中以NADH或琥珀酸作为电子供体的比较性测定法轻松评估,其中检测细胞色素c(cyt c)的还原程度。该测定依赖于Na+对线粒体内膜的作用,即降低其流动性。本文介绍了一种在NaCl或KCl存在下测定NADH-细胞色素c氧化还原酶活性和琥珀酸-细胞色素c氧化还原酶活性的实验方案。反应通过在比色皿中逐步加入试剂混合物进行,并在Na+或K+存在下于4分钟内通过分光光度法测定。同时平行进行另一组实验,在反应体系中加入特异性酶抑制剂,以扣除非特异性吸光度变化。NADH-细胞色素c氧化还原酶活性在这些阳离子存在下不降低,而琥珀酸-细胞色素c氧化还原酶活性在NaCl存在下则显著下降。这一简单实验说明了以下三点:1)Na+可降低线粒体内膜流动性及泛醌(CoQ)的传递;2)超复合物I+III2能够保护泛醌(CoQ)传递不受线粒体内膜流动性降低的影响;3)复合物I与复合物III之间的泛醌传递在功能上不同于复合物II与复合物III之间的泛醌传递。这些结果支持线粒体内膜中存在功能上分离的泛醌库,并表明这些泛醌库可受线粒体所处Na+环境变化的调控。

引言

线粒体氧化磷酸化系统(OXPHOS)是驱动三磷酸腺苷(ATP)合成、活性氧(ROS)生成以及线粒体消耗还原当量(如烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)或琥珀酸)的主要通路。OXPHOS系统由五个蛋白质复合物组成:复合物I(CI)氧化NADH,并将辅酶Q(CoQ)还原为泛醇(CoQH2);复合物II(CII)将琥珀酸氧化为延胡索酸,同时将CoQ还原为CoQH2;复合物III(CIII)将CoQH2重新氧化为CoQ,并还原细胞色素c(cyt c);最后,复合物IV(CIV)氧化cyt c,并将氧气还原为水。这一氧化还原链,即所谓的线粒体电子传递链(mETC),与质子(H+)跨内膜(IMM)的泵送相偶联,从而形成电化学梯度,复合物V(CV)利用该梯度将二磷酸腺苷(ADP)磷酸化为ATP。

线粒体电子传递链复合物(mETC)可单独存在于内膜(IMM)中,也可组装成称为超复合物的四级结构。复合物IV(CIV)可与复合物III(CIII)组装,形成III2+IV或Q型呼吸体(因其在CoQH2存在下能够进行呼吸作用)1,2,3,或形成同源二聚体或同源寡聚体

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方案

所有动物实验均遵循《实验动物护理和使用指南》进行,并根据2010年9月22日欧洲联盟指令(2010/63/UE)以及2013年2月1日西班牙皇家法令(53/2013)的规定,经西班牙卡洛斯三世国家心血管研究中心(Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III, CNIC)机构伦理委员会批准。所有努力均旨在尽量减少使用动物的数量及其所受痛苦。

注意:本比较测定法用于研究线粒体辅酶Q池的区室化,具体描述如下:

1. 蛋白质定量

  1. 在实验前,将从小鼠肝脏中分离的野生型线粒体反复冻融三次(即线粒体膜),以使细胞器对反应底物具有通透性26。
  2. 采用Bradford法或二辛可宁酸(BCA)法测定分离线粒体样品的蛋白含量。若使用Bradford法,将2 µL样品加入1 mL 1x Bradford试剂中。
  3. 将样品均分为四个各含20 µg蛋白的亚样品(分别标记为A、B、C、D;图2A)。

2. 测定复合物I+III(CI+CIII)活性

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结果

本方案的典型结果如下所示(图3)。由于还原型细胞色素c在550 nm处有吸收峰,所有未抑制的样品均应显示550 nm处吸光度的增加。理想情况下,抑制样品的吸光度变化应呈平直线或略微上升的斜率(图3)。应从未抑制样品的斜率中减去抑制样品的斜率。

样品A和B均经过相应的抑制校正,代表NADH:细胞色素c氧化还原酶活性,二者斜率相似(图3A)。然而,经过相应抑制校正的亚样品C和D代表琥珀酸:细胞色素c氧化还原酶活性,二者存在差异,其中亚样品C的活性高于亚样品D(图3B)。请注意,不同样品之间的基础吸光度可能略有差异(图3A)。

这些结果(即已通过抑制剂校正的斜率;表2)可通过将所用蛋白质的量(0.01 m.......

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讨论

尽管该方案是一种识别部分区室化的辅酶Q池是否存在的非常直接的方法,但仍有一些关键步骤需要注意。底物(如NADH或琥珀酸)最好最后加入,因为这些化合物可能发生自氧化。翻转比色皿时必须小心,以避免产生气泡,以免干扰读数。

此外,本技术存在一些局限性,值得指出。测量并非在完整的线粒体中进行,因此缓冲液的人工成分和比例可能与线粒体的天然环境存在差异。
试剂以过量方式添加,可能无法真实反映完整组织中底物的实际可利用性。

目前的方法需要构建和使用非常特定的遗传模型及设备,而这些在许多实验室中并不容易获得1。本实验方案提供了一种可靠且易于操作的方法,利用广泛可得的试剂和工具来检测部分分化辅酶Q(CoQ)池的存在。因此,该方法有望在今后用于比较线粒体疾病遗传模型的研究中。

流动电子载体在mETC中的移动性仍是一个备受争议的话题25,

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披露

作者声明无利益冲突。

致谢

感谢 R. Martínez-de-Mena 博士、M. M. Muñoz-Hernandez、A.、C. Jimenez 博士和 E. R. Martínez-Jimenez 提供的技术支持。本研究由 MICIN:RTI2018-099357-B-I00 和 HFSP(RGP0016/2018)资助。西班牙国家心血管研究中心(CNIC)由卡洛斯三世健康研究所(ISCIII)、科学、创新与大学部(MCNU)以及 Pro CNIC 基金会资助,并被授予塞韦罗·奥乔亚卓越中心(SEV-2015-0505)。图2使用 BioRender.com 制作。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
抗霉素 ASigma-AldrichA8674
牛血清白蛋白 (BSA)Sigma-Aldrich10775835001
Bradford 蛋白测定试剂盒Bio-Rad5000001
马心细胞色素 cSigma-AldrichC7752
K2HPO4Sigma-AldrichP3786
KClSigma-AldrichP3911
丙二酸Sigma-AldrichM1296
MgCl2Sigma-AldrichM8266
NaClSigma-AldrichS9888
NADHRoche10107735001
氰化钾Sigma-Aldrich207810
鱼藤酮Sigma-AldrichR8875
Spectra Manager 软件JASCOversion 2
紫外-可见分光光度计UV/VISJASCO
琥珀酸Sigma-Aldrich398055

参考文献

  1. Calvo, E., et al. Functional role of respiratory supercomplexes in mice: SCAF1 relevance and segmentation of the Qpool. Science Advances. 6 (26), (2020).
  2. Garcia-Poyatos, C., et al. Scaf1 promotes respiratory superc....

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重印与许可

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