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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
本协议描述了中性粒细胞 - 生物膜相互作用的研究。 金黄色葡萄球菌 生物膜在体外建立并与 外 周血来源的人中性粒细胞一起孵育。量化中性粒细胞的氧化爆发反应,并通过显微镜确定生物膜内的中性粒细胞定位。
中性粒细胞是免疫系统在微生物感染期间部署的第一道防线。 在体内,中性粒细胞被募集到感染部位,在那里它们使用吞噬作用、活性氧和氮物质(分别为 ROS、RNS)、NETosis(中性粒细胞细胞外陷阱)和脱颗粒等过程来杀死微生物并解决感染。中性粒细胞和浮游微生物之间的相互作用已被广泛研究。近年来,人们对研究由生物膜引起的感染越来越感兴趣。生物膜表现出的特性,包括对中性粒细胞杀伤的耐受性,与浮游生物生长的对应物不同。随着 体外 和 体内 生物膜模型的成功建立,现在可以研究这些微生物群落与不同免疫细胞之间的相互作用。在这里,使用传统生物膜模型和成熟的中性粒细胞活性测定相结合的技术专门用于研究中性粒细胞和生物膜相互作用。宽场荧光显微镜用于监测中性粒细胞在生物膜中的定位。这些生物膜在静态条件下生长,然后添加来自人外周血的中性粒细胞。在显微镜下可视化之前,用适当的染料对样品进行染色。此外,ROS的产生是在生物膜存在下量化的,ROS是针对病原体的众多中性粒细胞反应之一。将免疫细胞添加到该已建立的系统中将扩展对宿主 - 病原体相互作用的理解,同时确保使用标准化和优化的条件来准确测量这些过程。
生物膜是包裹在细胞外聚合物物质(EPS)中的表面相关微生物或非附着聚集体的群落1,2。这些群落保护包裹的微生物免受环境压力源的影响,包括对抗菌剂和免疫系统的耐受性3.几种致病微生物物种形成与慢性感染相关的生物膜4。生物膜的发展是一个复杂的过程,涉及附着在表面上、EPS 产生、细胞增殖、生物膜结构和细胞分离5。一旦细胞分散形成生物膜,它们就会保持浮游或转移到新的基质并重新启动生物膜发育6。
金黄色葡萄球菌是一种机会性病原体,遵循生物膜发育的一般方案,包括附着、增殖、成熟和传播7。 金黄色葡萄球菌 生物膜中的附着过程由疏水相互作用、乳胆酸和识别粘附基质分子 (MSCRAMM) 的微生物表面成分决定8,9。随着 金黄色葡萄球菌 的增殖开始,产生主要由多糖,蛋白质,细胞外DNA和teichoic酸组成的EPS5。随着EPS成分的产生,还会产生各种外切酶和小分子,有助于生物膜的三维结构并有助于分离5。 金黄色葡萄球菌 利用这种高度协调的生活方式来建立各种慢性感染,包括由于医疗设备留置引起的感染10。
耐甲氧西林 金黄色葡萄球菌 (MRSA) 是留置医疗器械相关感染的主要原因之一,例如中心静脉和导尿管、假体关节、起搏器、机械心脏瓣膜和宫内节育器11。在这种感染期间,中性粒细胞是第一个募集到感染部位的宿主免疫细胞,通过多种策略 对抗 病原体12。这些包括吞噬作用、脱颗粒、活性氧和氮物质 (ROS/RNS) 的产生,或释放中性粒细胞细胞外陷阱 (NET) 以消除病原体13。
微生物吞噬时产生ROS是中性粒细胞14表现出的关键抗菌反应之一。如果微生物涂有调理素,特别是血清15中的免疫球蛋白和补体成分,吞噬作用会增强。然后,调理的微生物被中性粒细胞上的细胞表面受体识别并吞噬,形成一个称为吞噬体15的隔室。中性粒细胞通过膜相关的NADPH-氧化酶16在吞噬体中产生和释放ROS。这种多组分酶复合物通过将电子转移到分子氧16来产生超氧阴离子。此外,中性粒细胞还通过表达诱导性一氧化氮合酶(iNOS)产生RNS17。吞噬体内的这些高超氧化物和一氧化氮自由基具有广泛的抗菌活性。它们可以与酶中的金属中心相互作用并破坏病原体18,19,20,21的核酸,蛋白质和细胞膜。许多微生物采用生物膜生活方式,并采用不同的策略来逃避ROS22,23的杀戮。因此,将生物膜与中性粒细胞耦合以量化ROS的标准化测定有利于获得一致的结果。
虽然定量中性粒细胞ROS产生等测定提供了有关中性粒细胞对生物膜的反应的信息,但可视化生物膜内中性粒细胞相互作用的能力也可以作为一种强大的工具。使用荧光染料进行显微镜检查通常需要优化以获得可用于显微镜成像分析的高质量图像。优化某些条件的灵活性是有限的,因为中性粒细胞在分离后会经历细胞死亡。此外,通常在添加中性粒细胞之前洗涤生物膜以从实验设置中去除浮游生物种群。在洗涤时,如果生物膜松散地粘附在表面上,则由于部分生物质的损失,复制生物膜之间可能会出现差异。
从广义上讲,目前该领域分析中性粒细胞和生物膜之间相互作用的方法主要包括显微镜、流式细胞术和集落形成单位(CFU)计数24,25,26,27。显微镜涉及使用染料,这些染料可以直接染色中性粒细胞和生物膜,或针对微生物的各种中性粒细胞反应,例如NET形成,脱颗粒和细胞死亡25,28。这些反应的一个子集,例如中性粒细胞死亡和脱颗粒,也可以通过流式细胞术进行分析,但要求中性粒细胞优先与生物膜中的大量微生物聚集体无关28,29。流式细胞术还可以量化一些生物膜参数,例如细胞活力27。然而,这些过程需要破坏生物膜生物量,并且对于可视化其他重要相互作用(例如中性粒细胞及其组分在生物膜中的空间分布)没有用27,29,30。
本协议侧重于调整一些传统使用的方法,以研究生物膜上的中性粒细胞 - 生物膜相互作用,这些生物膜已经过优化以在处理过程中提供最小的变异性。因此,该协议提供了标准化方法来生长和定量生物膜,从外周血中分离原代人中性粒细胞,量化ROS产生,并通过显微镜 可视化 生物膜 - 中性粒细胞相互作用。该协议可以适用于不同的系统,以了解生物膜 - 中性粒细胞相互作用,同时考虑供体池之间的异质性。
所有程序均已获得俄亥俄州立大学机构审查委员会(IRB)(2014H0154)的批准。获得所有供体的知情书面同意,收集外周血以分离原代人中性粒细胞。 金黄色葡萄球菌 (USA300 LAC)31 被用作进行实验的模式生物。由于可能暴露于血源性病原体,因此使用适当的个人防护设备(PPE)进行实验。
1. 体外 生物膜的制备
2. 生物膜生物质的定量
3.中性粒细胞分离
注意:按照先前发表的方法分离中性粒细胞,略有变化36。该分离方案首先结合密度梯度离心,然后进行3%葡聚糖沉降。本节仅介绍整个中性粒细胞分离方案,重点介绍对已发布方案所做的更改。此外,下面概述的方案是可以分离中性粒细胞的众多方法之一,可以根据需要进行替代。分离中性粒细胞的其它方法包括使用细胞分离培养基或磁性抗体细胞分离37。
4. 中性粒细胞产生的ROS的测定
5. 成像生物膜-中性粒细胞相互作用
用于培养细菌生物膜的培养基会影响中性粒细胞的存活。测试了不同的培养基,以减少单独培养基对中性粒细胞活力的影响,以研究中性粒细胞-生物膜相互作用(图1)。细菌生长培养基如胰蛋白酶大豆肉汤最大限度地减少了中性粒细胞的活力,使得~60%的中性粒细胞在37°C和5%CO2孵育30分钟后存活。哺乳动物细胞培养基,如MEMα,不影响中性粒细胞的活力,并支持 金黄色葡萄球菌 生物膜的生长。事实上,最小的培养基促进了其他细菌中生物膜的强劲生长46,47。
为了评估培养基对生物膜生长的影响和洗涤生物质以消除浮游细胞后生物膜生物质定量的变异性,在96孔板中生长18小时 金黄色葡萄球菌 生物膜,用聚L-赖氨酸处理或未处理孔。营养丰富的(胰蛋白酶大豆肉汤(TSB))和最少(MEMα)培养基按原样使用或补充2%葡萄糖。用CV染色的生物膜生物质显示,在补充有2%葡萄糖的MEMα中生长的 金黄色葡萄球菌 生物膜在所有测试培养基中产生了最坚固的生物膜(图2A)。此外,在含有MEMα + 2%葡萄糖的PLL预处理孔中生长的生物膜比含有MEMα + 2%葡萄糖的PLL未处理孔中的生物膜表现出更少的变异性。这些生物膜 在 精确处理生物膜进行生物质定量后通过CV测定35 和CFU/mL进行定量时表现出较小的变异性。这些生物膜平均含有 1 x 108 CFU/mL,如在 3 天内接种生物膜所证明的那样(图 2B)。该数字可用于确定添加到生物膜中以进行中性粒细胞功能测定的中性粒细胞数量。
为了测量中性粒细胞响应生物膜产生的ROS,将 金黄色葡萄球菌 生物膜在96孔板中静态生长18-20小时。然后调理生物膜,并加入中性粒细胞。然后测量ROS产生60分钟(图3A)。曲线下面积由动力学曲线计算,以量化中性粒细胞的总ROS产生量。用激动剂(如PMA)治疗的中性粒细胞作为对照,显示ROS产生增加。在没有生物膜的情况下,用PMA处理的中性粒细胞显示出强大的ROS产生。在 存在金黄色葡萄球菌 生物膜的情况下,用PMA处理的中性粒细胞的总ROS产生减少。在没有PMA的情况下,中性粒细胞仅依赖于它们与生物膜的相互作用,这进一步减少了产生的ROS量(图3B)。
为了使用荧光显微镜可视化中性粒细胞-生物膜相互作用,使用了表达GFP的金黄色葡萄球菌,蓝色CMAC染料和乙锭同源二聚体-1菌株,分别对活细胞的细胞质和死细胞的DNA进行染色。金黄色葡萄球菌生物膜在6 μ通道载玻片中生长18小时。将蓝色CMAC染料标记的中性粒细胞与乙锭同源二聚体-1一起加入到洗涤的生物膜中,并在成像前在37°C下用5%CO2孵育30分钟。宽场荧光显微镜显示,许多中性粒细胞位于金黄色葡萄球菌生物膜的表面,而少数位于生物膜内(图4A)。中性粒细胞内金黄色葡萄球菌细胞之间的相互作用也很明显(图4C)。大多数与中性粒细胞(青色)相互作用的金黄色葡萄球菌细胞是死亡的(洋红色),而少数仍然活着(黄色),通过活死染色确定(图4C)。为了进行比较,表达GFP的金黄色葡萄球菌生物膜用乙锭同源二聚体-1染色,这揭示了生物膜中死亡的金黄色葡萄球菌种群的一小部分(图4B)。与金黄色葡萄球菌生物膜孵育后,使用分析软件(参见材料表)对乙锭同源二聚体-1阳性的非活中性粒细胞进行定量。大约48%的中性粒细胞在与金黄色葡萄球菌生物膜孵育后30分钟内已经死亡。在显微镜方案的优化过程中,还评估了孵育30分钟后洗涤生物膜和中性粒细胞以去除非粘附中性粒细胞的效果,显示约33%的死中性粒细胞仍然附着在生物膜上(图4D)。

图 1:LIVE-DEAD 测定比较细菌和哺乳动物生长培养基之间的中性粒细胞存活率。分离中性粒细胞并在HBSS,MEMα,TSB或0.1%SDS中孵育30分钟。 使用钙黄绿素AM(活)和乙锭同源二聚体-1(死)进行LIVE-DEAD染色。确定活中性粒细胞的百分比,其中HBSS孵育的中性粒细胞被视为100%活中性粒细胞。结果代表平均两次独立实验一式三份,中性粒细胞来自两个不同的供体。数据以标准偏差±平均值表示(*p < 0.05,****p < 0.0001。单向方差分析)。请点击此处查看此图的大图。

图2:不同条件下生物膜生物量的定量和优化条件下生长的生物膜的细菌活力计数。 (A)将金黄色葡萄球菌接种在用聚-L-赖氨酸(PLL)包被或未包被的96孔板中。在TSB,MEMα或补充有2%葡萄糖的培养基中在静态条件下生长生物膜18小时。进行结晶紫(CV)染色以染色生物膜生物质。洗脱的CV染色剂以1:10稀释并在酶标仪中读取。结果代表平均三个独立实验一式三份。数据以平均值±SD表示。每组的SD显示在底部,以显示不同的生物膜生长条件变异性。(B)从优化培养基(MEMα + 2%葡萄糖)中生长的生物膜中获得细菌CFU计数。将18小时静态生物膜进行相同次数的洗涤,然后进行10分钟的超声处理以松开生物膜生物质,并在电镀前通过22G针头以破坏聚集体。结果代表一式三份进行的三次重复。数据以平均值表示±SD(ns=不显著。单向方差分析)。请点击此处查看此图的大图。

图3: 通过 化学发光测定定量中性粒细胞产生的ROS。 (A)中性粒细胞(PMN)与HBSS洗涤的 金黄色葡萄球菌 生物膜(BF)在PMA的存在(闭合灰色三角形)或不存在(开放灰色倒三角形)下孵育,以测量中性粒细胞产生的ROS。使用Luminol在酶标仪中每3分钟检测一次ROS,持续60分钟。在没有生物膜(闭合黑色圆圈)的情况下用PMA处理的中性粒细胞作为阳性对照,仅中性粒细胞(开放黑色圆圈)和仅生物膜(开放灰色三角形)组作为阴性对照。数据代表使用从两个不同供体获得的中性粒细胞一式三份进行的两次独立实验的平均值。数据以平均±SD表示。 (B)计算(A)曲线下的面积以量化中性粒细胞产生的总ROS。数据表示为标准偏差±平均值(***p < 0.0001。单向方差分析)。 请点击此处查看此图的大图。

图 4:使用宽场荧光显微镜可视化金黄色葡萄球菌生物膜和中性粒细胞之间的相互作用。 蓝色CMAC染料标记的中性粒细胞(青色)补充乙锭同源二聚体-1(品红色;死),然后与18小时金黄色葡萄球菌生物膜(黄色)孵育。使用宽场荧光显微镜对生物膜-中性粒细胞相互作用进行成像,并使用图像分析软件处理图像。用三种不同的供体进行了实验。代表性图像呈现为(A)金黄色葡萄球菌生物膜的3D视图,具有活(青色)和死(品红色;少数用白色箭头表示)中性粒细胞,(B)在没有中性粒细胞的情况下金黄色葡萄球菌生物膜的3D视图,其中活金黄色葡萄球菌表达GFP(黄色)或用乙锭同型二聚体-1(品红色)染色的死金黄色葡萄球菌,(C)金黄色葡萄球菌的正交视图 和由XY,YZ和XZ平面描述的中性粒细胞相互作用,以及(D)在金黄色葡萄球菌生物膜存在下定量中性粒细胞活力,在30分钟后立即(未洗涤)或用HBSS洗涤三轮以去除非粘附的中性粒细胞(洗涤)。中性粒细胞死亡表现为SD±平均值(学生t检验)。比例尺表示 (A) 和 (B) 中的 50 μm 和 (C) 中的 10 μm。请点击此处查看此图的大图。
作者没有什么可透露的。
本协议描述了中性粒细胞 - 生物膜相互作用的研究。 金黄色葡萄球菌 生物膜在体外建立并与 外 周血来源的人中性粒细胞一起孵育。量化中性粒细胞的氧化爆发反应,并通过显微镜确定生物膜内的中性粒细胞定位。
这项工作由美国国家过敏和传染病研究所(R01AI077628)资助给DJW,并获得了美国心脏协会职业发展奖(19CDA34630005)给ESG。我们感谢Paul Stoodley博士为我们提供USA 300 LAC GFP菌株。此外,我们感谢来自俄亥俄州立大学校园显微镜和成像设施 (CMIF) 和俄亥俄州立大学综合癌症中心 (OSUCCC) 显微镜共享资源 (MSR) 的资源。我们还要感谢Stoodley实验室的Amelia Staats,Peter Burback和Lisa Coleman进行抽血。
| 0.9% 氯化钠冲洗,USP | Baxter | 2F7124 | 无内毒素;用于分离中性粒细胞 |
| 150 mL 快速流过滤装置 | Thermo Scientific | 565-0020 | |
| 200 级乙醇 | VWR | 89125-188 | |
| 3 mL 注射器 | BD | 309657 | 用于抽血 |
| 50 mL 锥形离心管 | Thermo Scientific | 339652 | |
| 60 mL 注射器 | BD | 309653 | 用于抽血 |
| 琼脂 | Fisher 生物试剂 | BP1423-2 | |
| 酒精拭子 | BD | 用于抽血 | |
| 创可贴 | 用于 | 抽血 | |
| BD Bacto 胰蛋白酶大豆肉汤 | BD | DF0370-07-5 | 与 1.5% 琼脂结合制备胰蛋白酶大豆 |
| 细胞计数器 | Bal Saupply | 202C | |
| CellTracker blue CMCH | Invitrogen | C2111 | 蓝色 CMAC 染料 (BCD) |
| 透明底 96 孔平底聚苯乙烯板 | Costar | 3370 | |
| 棉纱布 | Fisherbrand | 13-761-52 | 用于抽血 |
| 结晶紫 | Acros 有机 | 40583-0250 | |
| 培养管 | Fisherbrand | 14-961-27 | 硼硅酸盐玻璃 13 x 100 毫米 |
| D-(+)-葡萄糖 | Sigma | G-8270 | |
| 葡聚糖来自 Leuconostoc spp. | Sigma | 31392-250G | 用于分离中性粒细胞 |
| Dulbecco 磷酸盐缓冲盐水 (DPBS) 1x | Gibco | 14190-144 | |
| 乙锭同型二聚体-1 | Invitrogen | L3224 B | |
| Ficoll-Paque 加 | Cytiva | 17144003 | 用于分离中性粒细胞(密度梯度培养基) |
| Hanks 平衡盐溶液 (HBSS) 1x | 不含 | 钙、镁和酚红 | 的康宁 cellgro21-022-CV |
| 血细胞计数器 | 亮线 | ||
| 肝素 | Novaplus | NDC 63323-540-57 | 1000 USP 单位/mL,用于抽血 |
| IMARIS 9.8 | 牛津仪器 | 显微镜图像分析软件 | |
| Luminol | Sigma | A8511-5G | |
| Minimal必需培养基 (MEM) Alpha 1x | Gibco | 41061-029 | |
| 针 (23 G1) | BD | 305145 | 用于抽血 |
| Nikon Eclipse Ti2 | Nikon | ||
| NIS-Elements | 死亡中 | 性粒细胞的定量 | |
| 正常人血清 | 补体技术 | NHS | |
| 培养皿 (100 x 15 mm) | VWR | 25384-342 | |
| 佛波醇 12-肉豆蔻酸酯 13-乙酸 | |||
| 聚-L-赖氨酸溶液 | Sigma | P4707-50ML | |
| 氯化钠 | Fisher 生物试剂 | BP358-10 | 用于中性粒细胞分离 |
| SoftMax Pro 软件 | 分子设备 | 用于 | 数据采集的酶标仪软件 |
| SpectraMax i3x | Molecular Devices | 酶标仪 | |
| 无菌冲洗用水,USP | Baxter | 2F7114 | 无内毒素;用于中性粒细胞分离 |
| Surflo 翼状输液器 | Terumo | SC*19BLK | 19 G x 3/4",用于抽血 |
| 台盼蓝染色 (0.4%) | Gibco | 15250-061 | |
| Turnicate | 用于抽血 | ||
| 超纯蒸馏水 | Invitrogen | 10977015 | |
| 白色不透明 96 孔板 | Falcon | 353296 | 组织培养处理和平底板 |
| μ-载玻片 VI 0.4 | 同比迪 | 80601 | μ-通道载玻片 |