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方法文章

优化流式细胞分选参数以实现小细胞外囊泡的高通量分离与纯化

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DOI:

10.3791/64360

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2023年1月20日

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本文内容

摘要

本方案通过优化空气喷雾喷嘴尺寸、鞘液压力、样品流压力、电压、增益和触发阈值等参数,提供了一种快速且基于尺寸特异性的外泌体小细胞外囊泡分离方法。

摘要

所有细胞类型均可释放小型细胞外囊泡(sEV),其内携带蛋白质、DNA 和 RNA。这些信号分子可作为细胞生理与病理状态的指示标志。然而,目前尚无标准化的 sEV 分离方法,这限制了后续生物标志物的鉴定及药物干预研究。本文提供了一种利用流式细胞分选仪分离和纯化 50–200 nm sEV 的详细实验方案。实验中选用 50 µm 喷嘴及 80 psi 鞘液压力,以获得良好的分选速率和稳定的侧向液流。采用标准尺寸的聚苯乙烯微球对 100、200 和 300 nm 颗粒群体进行定位。通过进一步优化电压、增益以及前向散射光(FSC)触发阈值,可将 sEV 信号与背景噪声有效分离。这些优化条件构成了一套关键的分选参数,使研究者仅通过前向散射光(FSC)与侧向散射光(SSC)即可获得具有代表性的 sEV 群体。基于流式细胞术的分离方法不仅可实现高通量分析,还可根据生物标志物的表达情况对 sEV 进行同步分类或蛋白质组学分析,从而为多种下游研究应用提供了可能。

引言

细胞会释放不同大小的细胞外囊泡(EVs),这些囊泡含有信号分子和膜内含物,在细胞间通讯中具有重要作用1。不同大小的EVs具有不同的生物学功能,其中50–200 nm的小细胞外囊泡(sEV)能够将RNA、DNA和蛋白质精确地分布到特定的细胞外位置。sEV还有助于决定其分泌机制,不仅参与调控免疫监视、干细胞维持、血液凝固和组织修复等正常生理过程,也涉及肿瘤进展和转移等多种疾病的病理机制2,3。有效分离和分析sEV对于发现生物标志物以及设计未来的药物干预策略至关重要。

随着对sEV临床应用的持续研究,sEV的分离方法面临着更高的要求。由于sEV在大小、来源和内容物方面具有异质性,且其理化和生化特性与其他EV相似,目前尚无标准的sEV分离方法4,5。目前,超速离心法、尺寸排阻色谱法(SEC)、聚合物沉淀法和免疫亲和捕获法是最常见的sEV分离方法6。尽管超速离心法耗时较长,所得sEV纯度较低,粒径分布范围宽(40–500 nm),且长时间离心会对sEV造成显著的机械损伤7,

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方案

1. 细胞培养

  1. 制备添加10%胎牛血清(FBS)的杜氏改良伊格尔培养基(DMEM)。将人胰腺癌细胞PANC-1以1 × 106 个细胞/mL的密度接种于75 cm2 培养瓶中,在37 °C、5% CO2 条件下培养。
  2. 在显微镜下观察,当细胞密度达到75%–80%时进行传代。吸除培养基,用3–5 mL磷酸盐缓冲液(PBS;0.01 M,pH 7.2–7.4)冲洗2次。
  3. 弃去液体,加入1–2 mL胰蛋白酶-EDTA溶液,观察细胞在显微镜下变圆并从瓶壁脱落。加入新鲜培养基终止消化,吹打混匀后按1:2至1:4的传代比例(推荐)将细胞悬液分装至新的75 cm2 培养瓶中,每瓶加入15 mL培养基。
    ​注意:所有操作均需在生物安全柜中进行,以避免细胞污染。

2. 培养基收集

  1. 将细胞在 37 °C、5% CO2 条件下孵育 48 小时。收集细胞上清液(90 mL)至两个 50 mL 离心管中,并在 4 °C 下以 300 x g 离心 10 分钟。
  2. 将上清液转移至新的无菌管中,并在 4 °C 下依次以 2,000 x g 离心 20 ....

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结果

实验方案的流程图如图1所示。本方法中,采用标准尺寸的聚苯乙烯微球作为粒径分布的参考标准。在特定的仪器参数条件下,通过FSC与SSC散点图的对数形式,可将颗粒信号与背景噪声明显区分开。门控策略如图2所示。R4、R5和R6分别代表100 nm、200 nm和300 nm微球的位置。R7为低于50 nm的电子噪声检测限,R8为50–200 nm颗粒的位置范围。

经超速离心后,源自PANC-1细胞的EVs混合物的粒径分布范围较宽,为40–400 nm(图3)。为分离和纯化50–200 nm的sEV,根据标准微球的位置进行流式细胞分选,以获得特定粒径的sEV(图4)。通过NTA对分离质量进行验证,结果显示分选后sEV的粒径范围在50–200 nm之间(如图5所示)。进一步通过TEM观察到sEV的存.......

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讨论

本方案概述了一种利用流式细胞分选仪分离和纯化粒径为50-200 nm的小细胞外囊泡(sEV)的优化方法,并通过纳米颗粒追踪分析(NTA)对该方法进行了验证。该方法解决了获取粒径均一、纯度高的sEV的技术瓶颈,避免了包裹在较大尺寸细胞外囊泡中的无关生物分子的干扰22。流式细胞术可实现快速、高通量分析,每秒可捕获100,000个颗粒,并每秒做出70,000次分选决策17,显著缩短了处理时间,同时反映了sEV颗粒的异质性。此外,基于流式细胞术的本方案可根据研究者对特定尺寸EV亚群的兴趣进行定制。在保持上述仪器参数(如气雾喷嘴、鞘液压力、样本流压力和触发阈值参数)不变的前提下,可通过设置不同的设门范围来识别和分离目标群体。

该方法的技术难点在于分离不同尺寸范围的群体,尤其是将其与背景噪声区分开来。我们确定了一组关键的分选参数。首先,喷嘴尺寸会影响分选速率。为了提高分选后获得的小细胞外囊泡(sEV)的浓度,本方法采用50 µm的喷嘴,并需要80 psi的鞘液压力以稳定侧流。鞘液压力越高,液滴频率增.......

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披露

作者声明无利益冲突。

致谢

本工作得到了浙江中医药大学科研基金(2020ZG29)、浙江省基本公益研究计划项目(LGF19H150006,LTGY23B070001)、浙江省教育厅科研项目(Y202147028)以及浙江大学实验室部门实验技术项目(SJS201712,SYB202130)的资助。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
离心管Beckman Coulter344058
细胞培养瓶Corning 430641
Dulbecco’s 改良伊格尔培养基Corning Cellgro10-013-CV
胎牛血清SUERSUER050QY
流式细胞分选仪Beckman CoulterMoflo Astrios EQ
人胰腺癌细胞 PANC-1NANAPANC-1 细胞由浙江大学生命科学学院杨卫军教授提供
激光粒度与Zeta电位分析仪 MalvernZetasizer Nano ZS 90
磷酸盐缓冲液GibcoC20012500BT
聚苯乙烯荧光微球Beckman Coulter6602336
透射电子显微镜JEOLJEM-1200EX
胰蛋白酶-EDTA 溶液Gibco1713949
超彩虹荧光颗粒Beckman CoulterB28479
超速离心机Beckman CoulterOptima-L80XP
超速离心机转子Beckman CoulterSW32TI

参考文献

  1. Raposo, G., Stoorvogel, W. Extracellular vesicles: exosomes, microvesicles, and friends. Journal of Cell Biology. 200 (4), 373-383 (2013).
  2. Meldolesi, J. Exosomes and ectosomes in intercellular communication. Current Biology. 28 (8), 435-444 (2018).
  3. ....

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重印与许可

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