方法文章

研究糖原代谢的方法

DOI:

10.3791/65023

2023年3月3日

本文内容

摘要

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文章讨论:

Wilson, WA 研究真核糖原代谢的分光光度法。可视化实验杂志。(174),e63046 (2021)。

Wang, J. J. et al.一种用于细菌糖原颗粒分子结构表征的非降解性提取方法。可视化实验杂志。(180),e63016 (2022)。

Wang, Z., Liu, Q., Wang, L., Gilbert, R. G., Sullivan, M. A.提取肝糖原分子进行糖原结构测定。可视化实验杂志。(180),e63088 (2022)。

Jensen, R., Ortenblad, N., di Benedetto, C., Qvortrup, K., Nielsen, J. 使用透射电子显微镜定量骨骼肌纤维中的亚细胞糖原分布。可视化实验杂志。(180),e63347 (2022)。

Fermont, L., Szydlowski, N., Colleoni, C. 使用荧光团辅助碳水化合物电泳 (FACE) 方法测定糖原的葡聚糖链长度分布。可视化实验杂志。(181),e63392 (2022)。

社论

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糖原是一种支链葡萄糖聚合物,在原核生物和真核生物的能量代谢中起着重要作用。在营养限制条件下,细菌和酵母利用糖原来维持细胞存活1。在哺乳动物中,糖原具有组织特异性作用,包括局部用于肌肉以促进收缩,在肝脏中用于调节血糖水平2。糖原的合成是由糖原合酶催化的,糖原合酶通过α1,4键 连接 葡萄糖残基,而支链酶形成α1,6键,从而在糖原大分子中产生分支。糖原磷酸化酶与去支酶结合促进了这种能量储存的利用,导致糖原的重塑和葡萄糖-1-P的释放。糖原的结构,包括粒径和支化,之所以令人感兴趣,部分原因是支化会影响糖原溶解度,糖原颗粒的大小会影响其降解速率,而糖原结构不稳定与糖尿病有关。此外,研究糖原在肌肉等组织中的亚细胞定位对于产生有关这种燃料在运动过程中的作用的信息非常重要。

糖原的积累受糖原合成酶和降解大分子酶的相对活性控制。Wilson3 描述了测量糖原合酶、糖原磷酸化酶、支化酶和去支化酶的酶活性的技术。这些生化方法用分光光度计测量NADH/NADPH的产生或消耗或比色变化。这些是可扩展的方法,可以规避与利用放射性同位素的更敏感的方法相关的高成本、专用设备和监管负担。所描述的方法最适合用纯化酶测量酶活性,尽管通过足够的匀浆稀释和适当的控制,它们已用于组织样品。Wilson3 还描述了一种用于测量糖原分支的简单比色测定。尽管与更费力的分离技术相比,这种方法产生的糖原精细结构信息较少,但它确实提供了对分支相对程度的简单快速测量。

Fermont等人4 描述了荧光团辅助碳水化合物电泳(FACE)的使用,这是一种确定链长分布(CLD)的方法,该方法反映了糖原粒径和支化百分比。糖原的结构影响细菌在饥饿中生存的能力,异常糖原在几种糖原贮积病中积累,从而凸显了研究这种燃料来源的大小和分支的方法的重要性。FACE 涉及与 8-氨基 1,3,6 芘三磺酸 (APTS) 的半缩醛基团的还原胺化。除了提供有关 CLD 的信息外,FACE 还可用于测量来自各种来源的支链酶的催化特性。主要竞争技术 HPAEC-PAD 的优点是不需要非还原端,但该技术存在质量偏差问题。

支化程度和糖原颗粒的大小都是葡萄糖聚合物的重要特性。使用电子显微镜观察到,糖原以三种结构存在:球形 β 颗粒 (~20 nm),其中包括多个伽马粒子 (3 nm),以及由β 粒子组成的较大的莲座状 α 颗粒 (~300 nm) 5。分离糖原的传统方法足以测量糖原浓度,但它们会损害糖原的精细结构,这意味着需要开发更温和的技术。Wang、Wang等人6描述了使用蔗糖密度梯度离心的冷水提取用于细菌。该技术在保存较大的糖原分子(通过尺寸排阻色谱(SEC)测量)和较长链(通过荧光团辅助毛细管电泳(FACE)测量)方面优于其他方法6。Wang, Liu 等人 7 也将类似的方法应用于肝脏。最近的一份报告证明了了解糖原结构的重要性,该报告显示,在糖尿病中,肝糖原 α 颗粒是“脆弱的”,与稳定的 α 颗粒相比,这会导致降解更快,从而可能影响血糖控制。这些基于蔗糖梯度的分离方法的局限性包括上清液中糖原的损失(可以通过较低的蔗糖浓度来减轻),以及由于使用的温和条件而导致部分糖原的酶促降解。后者可以通过短暂的煮沸步骤来缓解,尽管这会破坏相关蛋白质。

最后,Jensen等人8描述了使用 透射电子显微镜(TEM)对单骨骼肌纤维中的糖原亚细胞分布和粒径进行成像。该方法是唯一可用于研究肌膜下、肌原纤维间和肌原纤维内糖原库的方法,并已用于多种动物的肌肉组织。由于一些亚细胞过程优先利用糖原作为燃料,因此表征这些燃料储存的位置非常重要。此外,该方法还能够检查不同肌纤维类型中的糖原代谢,这在运动中很重要,因为运动中疲劳仅在选定的纤维中依赖于糖原。TEM 方法的一个局限性是无法检测小糖原颗粒,这尤其在糖原降解的条件下(例如在肌肉收缩期间)是一个问题。

总之,该方法集合提供了用于探测糖原结构以及调节该大分子合成代谢和分解代谢的酶的技术样本。这些方法将有助于提高我们对生理和病理条件下糖原代谢的理解。

披露

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作者没有什么可透露的。

参考文献

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  1. Wilson, W. A., et al. Regulation of glycogen metabolism in yeast and bacteria. FEMS Microbiology Reviews. 34 (6), 952-985 (2010).
  2. Pederson, B. A. Mammalian Glycogen Metabolism: Enzymology, Regulation, and Animal Models of Dysregulated Glycogen Metabolism. Enzymology of Complex Alpha-Glucans. , CRC Press. Baca Raton. First edition 84-137 (2021).
  3. Wilson, W. A. Spectrophotometric methods for the study of eukaryotic glycogen metabolism. Journal of Visualized Experiments. (174), e63046(2021).
  4. Fermont, L., Szydlowski, N., Colleoni, C. Determination of glucan chain length distribution of glycogen using the fluorophore-assisted carbohydrate electrophoresis (FACE) method. Journal of Visualized Experiments. (181), e63392(2022).
  5. Prats, C., Graham, T. E., Shearer, J. The dynamic life of the glycogen granule. Journal of Biological Chemistry. 293 (19), 7089-7098 (2018).
  6. Wang, J. J., et al. A non-degradative extraction method for molecular structure characterization of bacterial glycogen particles. Journal of Visualized Experiments. (180), e63016(2022).
  7. Wang, Z., Liu, Q., Wang, L., Gilbert, R. G., Sullivan, M. A. The extraction of liver glycogen molecules for glycogen structure determination. Journal of Visualized Experiments. (180), e63088(2022).
  8. Jensen, R., Ortenblad, N., di Benedetto, C., Qvortrup, K., Nielsen, J. Quantification of subcellular glycogen distribution in skeletal muscle fibers using transmission electron microscopy. Journal of Visualized Experiments. (180), e63347(2022).

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Spectrophotometric MethodsBacterial Glycogen ParticlesLiver Glycogen ExtractionGlycogen Structure DeterminationSubcellular Glycogen DistributionSkeletal Muscle FibersTransmission Electron MicroscopyGlucan Chain Length DistributionFluorophore assisted Carbohydrate Electrophoresis

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