我们介绍一种利用氘代水(重水 D2O)探针结合受激拉曼散射(DO-SRS)显微技术直接可视化氨基酸调控的细胞代谢活性的实验方案,该技术与双光子激发荧光显微技术(2PEF)相整合。
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我们介绍一种利用氘代水(重水 D2O)探针结合受激拉曼散射(DO-SRS)显微技术直接可视化氨基酸调控的细胞代谢活性的实验方案,该技术与双光子激发荧光显微技术(2PEF)相整合。
必需芳香族氨基酸(AAAs)是细胞合成新生物量和维持正常生物学功能的基本组成单元。例如,充足的AAAs供应对于癌细胞维持其快速生长和分裂至关重要。因此,人们越来越需要一种高度特异、非侵入性且样品前处理最少的成像方法,以直接观察细胞如何利用AAAs进行代谢活动 原位. 此处,我们开发了一种光学成像平台,该平台结合了重水(D₂O)2O)探测结合受激拉曼散射(DO-SRS),并将DO-SRS与双光子激发荧光(2PEF)集成于同一显微镜系统,以直接可视化AAA调控下HeLa细胞的代谢活性。总体而言,DO-SRS平台可在单个HeLa细胞水平上实现新合成蛋白质和脂质的高空间分辨率与高特异性成像。此外,2PEF模态能够以无标记方式检测烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)和黄素的自发荧光信号。此处描述的成像系统同时兼容 体外 和 体内 模型,适用于多种实验。本方案的通用工作流程包括细胞培养、培养基制备、细胞同步化、细胞固定,以及使用DO-SRS和2PEF模式进行样本成像。
苯丙氨酸(Phe)和色氨酸(Tryp)是重要的芳香族氨基酸(AAAs),可被人体吸收用于合成新的分子,以维持正常的生物学功能1。Phe 是合成蛋白质、黑色素和酪氨酸所必需的,而 Tryp 则是合成褪黑素、5-羟色胺和烟酸所必需的2,3。然而,过量摄入这些 AAAs 可以上调雷帕霉素靶蛋白(mTOR)通路,抑制 AMP 激活的蛋白激酶,并干扰线粒体代谢,从而共同改变大分子生物合成,导致在健康细胞中产生如活性氧(ROS)等恶性前体物质4,5,6。在过量 AAAs 调控下,对代谢动态变化进行直接可视化观察,对于理解 AAAs 在促进癌症发展以及健康细胞生长中的作用至关重要7,8,9。
传统的氨基酸分析(AAA)研究依赖于气相色谱法(GC)10。其他方法,如磁共振成像(MRI),空间分辨率有限,难以对生物样本进行细胞和亚细胞水平的分析11。近年来,基质辅助激光解吸/电离(MALDI)技术已被用于阐明氨基酸在癌症增殖过程中通过非侵入性生物标志物参与脂质和蛋白质合成的作用12,13,14。然而,该技术仍存在成像深度较浅、空间分辨率差以及样品制备过程复杂等问题。在细胞水平上,可通过多同位素成像和纳米级二次离子质谱技术追踪无毒的稳定同位素(如氮-15和碳-13)在大分子中的掺入情况。但这些方法会对活体生物样本造成破坏15,16。原子力显微镜(AFM)是另一种强大的技术,可用于可视化代谢动态过程17。然而,AFM成像过程中扫描速度较慢,可能因热漂移导致图像失真。
我们开发了一种非侵入性生物正交成像方法,通过将氧化氘(D₂O)与生物正交拉曼标记相结合,实现了在活体系统中对代谢过程的高特异性、高灵敏度成像。该技术利用D₂O作为代谢标记物,在细胞内天然代谢过程中引入氘代分子,再通过受激拉曼散射(SRS)显微成像检测C-D键的特征拉曼信号,从而实现对脂质、蛋白质等生物大分子合成的可视化追踪。由于C-D键在生物样本中背景信号极低,该方法具有优异的信噪比和分子特异性。同时,D₂O无毒、分布广泛,适用于长期活体成像。我们进一步将该技术与炔烃标记的生物正交探针联用,实现了多色拉曼成像,可同时监测多种代谢通路的动态变化。本方法为研究发育、肿瘤代谢及药物响应等生物学过程提供了强有力的工具。 关键词:非侵入性成像,生物正交化学,氧化氘,受激拉曼散射显微术,代谢标记,C-D键,多色成像,活体成像2O)探测受激拉曼散射(DO-SRS)显微成像和无标记双光子激发荧光显微成像(2PEF)。该模式在对生物样本成像时具有高空间分辨率和化学特异性18,19,20,21,22,23,24本方案介绍了利用DO-SRS和2PEF技术研究癌症进展过程中脂质、蛋白质代谢动态及氧化还原比变化的应用。通过D2由于氧-18是水的一种稳定同位素形式,细胞生物分子可通过氘(D)标记,因为氘能迅速与细胞内全身体水达到平衡,并通过酶促交换形成碳-氘(C-D)键21新合成的生物大分子(包括脂质、蛋白质、DNA/RNA和碳水化合物)中的碳-氘键可在拉曼光谱的细胞静默区被检测到20,21,22,25,26,27利用两束同步的激光脉冲,可在单个细胞上显示新合成脂质和蛋白质中的碳-氘键 通过 无需提取或使用细胞毒性试剂标记的高光谱成像(HSI)。此外,受激拉曼散射(SRS)显微镜能够通过采集并组合生物样品中选定区域的一系列横截面图像,构建三维(3D)模型。22,26利用高光谱和三维体成像,DO-SRS 可获取单细胞中新合成大分子的空间分布,以及在 AAA 调控下促进癌症生长的细胞器类型。22此外,利用双光子激发荧光(2PEF)技术,我们能够以高分辨率、深穿透深度和低损伤的方式获取生物样品中黄素和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)的自发荧光信号21,23,24黄素和NADH的自发荧光信号已被用于表征癌细胞中的氧化还原稳态及脂质过氧化22,26因此,DO-SRS与2PEF的联用不仅能够以高空间分布、化学特异性信息以及最少的样品前处理,实现对癌细胞中AAA调控的代谢动态进行亚细胞水平分析,而且该方法还减少了使用有毒试剂对内源性分子进行提取或标记的需求。在本方案中,我们首先介绍D2O 和氨基酸制备,以及癌细胞培养。随后,我们展示 DO-SRS 成像和 2PEF 成像的实验方案。最后,我们呈现 SRS 和 2PEF 成像的代表性结果,这些结果展示了 AAA 调控下癌细胞中脂质和蛋白质的代谢变化,以及氧化还原比的变化。整个过程的详细图示如下所示 图1.
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1. 培养基制备
2. 细胞样品制备
3. 自发拉曼光谱测量(图2)
4. 使用双光子激发荧光和受激拉曼散射进行成像实验
注意:有关受激拉曼散射(SRS)激光准直的详细描述可参见先前的报告28。本方案重点介绍多模态SRS与双光子激发荧光(2PEF)成像系统的操作(图2C,D)。
5. 光谱与图像分析
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在含有50% D2O的细胞培养基中添加15倍浓度的过量芳香族氨基酸(AAAs),可在HeLa细胞中产生新合成脂质和蛋白质特有的C-D拉曼谱带(图2B)。此前的实验曾使用不同浓度(如2倍和5倍)进行,尽管相关数据未予展示,但15倍浓度产生的新合成脂质和蛋白质的C-D拉曼谱带最为明显。具体而言,在研究脂滴(LDs)时,我们发现15倍苯丙氨酸(Phe)和15倍色氨酸(Tryp)分别在2,143 cm-1和2,172 cm-1处诱导出新合成脂质和蛋白质的信号。随后采用去强化拉曼散射(DO-SRS)对单个细胞中C-D信号的空间分布进行成像(图3)。使用ImageJ对单个细胞的像素强度进行手动分割和计算,如图3A中白色虚线边框所示。对照组细胞显示出中等强度的C-D脂质和蛋白质谱带,而15倍Phe和15倍Tryp处理组则显示出更强的C-D脂质和蛋白质谱带。定量分析表明,过量AAAs可能使脂质合成上调10%-1...
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DO-SRS 和 2PEF 成像已被用于研究多种体系中的代谢动态 离体 模型,包括果蝇和人类组织21,22,23,24,26,27,33本研究采用的成像技术结合了双偏振受激拉曼散射(DO-SRS)和双光子激发荧光(2PEF)显微技术,相较于其他分子特异性成像方法具有更快的成像速度,无需进行分子提取或使用细胞毒性试剂标记,且样品制备步骤极少。具体而言,DO-SRS显微技术使我们能够探测 从头合成 动物和细胞中的脂质生成与蛋白质合成及其代谢动态的可视化 原位23,
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作者无竞争性财务利益或其他利益冲突。
感谢李雅娟博士和Anthony Fung提供的技术支持,以及Fraley实验室提供的细胞系。本研究得到了加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的启动资金、美国国立卫生研究院(NIH)U54CA132378、NIH 5R01NS111039、NIH R21NS125395、NIHU54DK134301、NIHU54 HL165443以及Hellman Fellow奖的支持。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
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| 10 mL 血清移液管 | Avantor(由 VWR) | 75816-100 | https://us.vwr.com/store/product?keyword=75816-100 |
| 15 mL 圆锥形离心管 | VWR | 89039-664 | https://mms.mckesson.com/product/1001859/VWR-International-89039-664 |
| 16% 甲醛,无甲醇 | ThermoFisher Scientific | 28906 | https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/28906 |
| 24孔板 | Fisherbrand | FB0112929 | https://www.fishersci.com/shop/products/24-well-tc-multidish-100-cs/FB012929#?keyword=FB012929 |
| 25 mm 注射器滤器, 2 μm PES | Foxx Life Sciences | 381-2216-OEM | https://www.foxxlifesciences.com/collections/pes-syringe-filters/products/381-2216-oem?variant=16274336003 |
| 460 nm滤光立方体 | Olympus | OCT-ET460/50M32 | |
| AC适配器,用于LD OBIS 6激光远程电源供应 | Olympus | 为激光器供电 | |
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| BNC 50 欧姆终端器 | Mini Circuits | STRM-50 | |
| BNC 电缆 | Thorlabs | 2249-C | 同轴电缆,BNC公头/公头 |
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| 聚光镜 | Olympus | ||
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| 二向色镜支架 | Thorlabs | KM100CL | |
| 二甲基亚砜细胞培养试剂 | mpbio | 196055 | https://www.mpbio.com/0219605525-二甲基亚砜-cf |
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| FIJI ImageJ | ImageJ | 版本 1.53t 2022年8月24日 | https://imagej.net/software/fiji/downloads |
| 重水(氘代水) | Cambridge Isotope Laboratories, Inc. | 7732-18-5 | https://shop.isotope.com/productdetails.aspx?itemno=DLM-4-1L |
| HeLa 细胞 | ATCC | CCL-2 | https://www.atcc.org/products/ccl-2 |
| 血细胞计数板 | MilliporeSigma | Z359629-1EA | https://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sigma/z359629?gclid=Cj0KCQiA37KbBhDgARIsAI zce15A5FIy0WS7I6ec2KVk QPXVMEqlAnYis_bKB6P6lr SIZ-wAXOyAELIaAhhEEAL w_wcB&gclsrc=aw.ds |
| 高光密度带通滤光片 | Chroma Technology | ET890/220m | 滤除斯托克斯光束,透射泵浦光束 |
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| HyClone 胰蛋白酶 0.25% (1x) 溶液 | Cytiva | SH30042.02 | https://www.cytivalifesciences.com/en/us/shop/cell-culture-and-fermentation/reagents-and-supplements/cell-disassociation-reagents/hyclone-trypsin-protease-p-00445 |
| 集成的受激拉曼散射激光系统 | 应用物理 & Electronics, Inc. | picoEMERALD | picoEMERALD 输出波长为 1031 nm、脉宽为 6 ps、重复频率为 80 MHz 的脉冲,用作斯托克斯光束。 532 nm 的倍频光束用于同步泵浦一台皮秒光学参量振荡器(OPO),以产生脉宽为五至六皮秒的锁模脉冲序列(OPO 的闲频光束被干涉滤光片阻断)。OPO 的输出波长可在 720–950 nm,作为泵浦光束。1031 nm的斯托克斯光束通过picoEMERALD内置的电光调制器(EOM)以8 MHz频率进行正弦调制,调制深度超过90%。泵浦光束与斯托克斯光束通过picoEMERALD内部的二向色镜实现空间重叠。泵浦脉冲与斯托克斯脉冲之间的时间重叠通过内置延迟装置实现,并利用显微镜下纯D2O的受激拉曼散射(SRS)信号进行优化。 |
| 倒置激光扫描显微镜 | Olympus | FV1200MPE | |
| IX3-CBH 控制箱 | Olympus | 控制激光扫描显微镜 | |
| 运动镜架 | Thorlabs | POLARIS-K1-2AH | 2 个低剖面六角调节器 |
| L-苯丙氨酸 | Sigma | P5482-25G | https://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sigma/p5482 |
| L-色氨酸 | Sigma | T8941-25G | https://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sigma/t8941 |
| LabSpec 6 | Horiba XploRA | N/A | https://www.horiba.com/gbr/scientific/products/detail/action/show/Product/labspec-6-spectroscopy-suite-software-1843/ |
| 锁相放大器 | Zurich Instruments | N/A | https://www.zhinst.com/americas/en/products/shfli-lock-in-amplifier |
| 长通二向色镜分光器 | Semrock | Di02-R980-25x36 | 980 nm 激光 BrightLine 单边激光平面二向色镜分光器 |
| MATLAB | MathWorks | 版本:R2022b | https://www.mathworks.com/products/new_products/latest_features.html |
| 显微镜载玻片 | Fisherbrand | 12-550-003 | https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-selectfrost-microscope-slides-9/12550003#?keyword=12-550-0-03 |
| 显微成像软件 | Olympus | FluoView | |
| MPLN 100x,Olympus | Olympus | MPLAPON | https://www.olympus-ims.com/en/microscope/mplapon/#!cms[focus]=cmsContent11364 |
| 奥林巴斯 MPLN 50x | Olympus | MPLAPON | https://www.olympus-ims.com/zh-cn/microscope/mplapon/#!cms[focus]=cmsContent11363 |
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| 0.4% 台盼蓝 (0.85% NaCl) | Lonza | 17-942E | https://bioscience.lonza.com/lonza_bs/US/en/培养基与试剂/p/000000000000181876/台盼蓝,0.4% 溶液" |
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| 苏黎世仪器 LabOneQ 软件 | Zurich Instruments | 控制苏黎世锁相放大器 |
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