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方法文章

利用X射线计算机断层扫描进行树木年轮分析

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DOI:

10.3791/65208

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2023年9月22日

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本文内容

摘要

本文展示了如何使用X射线计算机断层扫描工具链处理树木年轮样本。除特定目的所需的化学提取外,无需其他物理性实验室处理步骤。该工具链可用于生物量估算、最大密度/年轮宽度数据获取,以及定量木材解剖学数据的获取。

摘要

本文介绍了一种X射线计算机断层扫描(CT)工具链,可用于获取年轮宽度(TRW)、最大晚材密度(MXD)、其他密度参数以及定量木材解剖学(QWA)数据,而无需进行耗时的表面处理或任何物理样品制备。重点在于生长轮钻芯样品在60 µm至4 µm分辨率范围内的扫描流程。定义了三个观察木材的尺度:(i)年轮间尺度,(ii)年轮尺度,即年轮分析与密度测量尺度,以及(iii)解剖学尺度,后者接近传统切片的质量水平。针对每个尺度专门设计的样品支架,可实现多个生长轮钻芯的高通量扫描。为高效处理树木钻芯的三维X射线CT图像以获取TRW和密度测量数据,开发了一系列专用软件程序。本文简要阐述了CT的基本原理,以帮助正确理解本实验方案。该方案适用于一些树轮年代学中常用的已知树种。结合粗略的密度估算、TRW与MXD数据以及定量解剖学数据,有助于拓展和深化当前在气候重建、树木响应研究方面的分析,并进一步推动树轮生态学/气候学及考古学领域的发展。

引言

木材密度是一个易于测量的变量1,可反映木材的解剖学和化学特性2。在估算地上生物量时,木材密度是一个重要的加权变量3,4,5,需与树木的尺寸以及代表木材碳含量的因子相乘。木材密度与木材的力学特性密切相关6,并反映树木的生活史特征7。

细胞壁密度的测量值约为1500 kg/m³,通常被认为相对恒定8,但也应考虑年轮内细胞壁密度的变化8,9。木质细胞(针叶树中一般为管胞,阔叶树中为导管、薄壁组织和纤维)的排列方式和形态各不相同,这些细胞的细胞壁厚度和腔体大小也存在差异10。因此,木材密度在不同树木之间、同一棵树内部(轴向和横向)以及单个年轮内的短距离范围内均存在变化11,12。在许多....

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方案

1. 钻取岩心样品

  1. 使用 Pressler 钻取样器对树木进行取样。有关如何手动钻取树芯,请参考相关文献39。本技术流程适用于直径为 5.15 mm 的树芯。
  2. 将树芯不粘胶地放入 6 mm 的纸质吸管中,或放入其他无需使用胶水的容器中。切勿将树芯粘在木质支撑物上。如果树芯已固定在载片上,应根据所用胶水类型,使用解剖刀/锯子或溶剂将其拆下。
  3. 避免将树芯包裹在塑料管中,应先尝试将其干燥,以防止霉菌生长和真菌降解。
  4. 请使用铅笔在纸质吸管上书写标记,因为提取过程可能导致记号笔字迹褪色。
    注意:本技术流程同样适用于 4 mm 的树芯。已固定并打磨好的树芯也可使用,但需先将其拆下。对于考古样品或残存木材,需通过锯切或修整方式制备出与树芯尺寸相当的样品用于扫描。

扫描前岩心准备

  1. 乙醇/甲苯或乙醇或丙酮处理40 索氏提取至少24 h(图 4A,B)。这是为了确保无树脂的木材体积,从而进行准确的密度计算(树脂会衰减信号, 图 4C

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结果

如果目标是估算大量样本的生物量或树木生长增量,即年轮间尺度(图1),则使用样本架1(图5)对样本进行扫描,以获得密度分布(见步骤5.4.3)和树木生长的估算值,例如适用于具有较大年轮宽度的速生树种,此时可采用较粗的分辨率。图12展示了来自刚果盆地树种T. superba的髓心至树皮方向及轴向密度变化趋势的示例。这些图谱基于从树干不同高度位置获取的树木年轮样本芯,经110 µm分辨率扫描所得数据生成。

对于使用样品架2(图5B)扫描样本核心所针对的年轮尺度(图1),可进行树木年轮分析和最大密度(MXD)计算。一个示例如图13所示,该图绘制了来自南非赛德伯格山脉的W. cedarbergensis.......

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讨论

方案中的关键步骤
方案中的关键步骤包括正确操作生长锥以获取高质量的钻取芯样(步骤 1.1.,参见39),避免产生碎屑。接下来,必须保持芯样不固定(但参见26),这既是为了将其插入样品 holder(图5,参见21),也是为了有效提取树脂50,以及可能的后续分析。在扫描前(步骤 2.2.2.),将样品在扫描仪房间内进行平衡处理至关重要,以防止因湿度波动导致的尺寸形变。随后,当在 RingIndicator 模块中可识别年轮时,必须准确标定年轮边界和角度,因为密度峰值可能出现平坦化,类似于传统密度测定系统中标定不准确的情况13。标定对于获得准确的年轮宽度测量值也十分重要21。下一个关键步骤是通过 CoreComparison 模块进行正确的交叉定年(步骤 4.4.1.)。若某些芯样的标定.......

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披露

作者声明无利益冲突。

致谢

感谢三位匿名审稿人提供的反馈与建议。本研究由JVdB的BOF专项研究基金(BOF启动资助BOF.STG.2018.0007.01)、UGCT作为卓越中心(BOF.EXP.2017.0007)及核心设施(BOF.COR.2022.008)提供资助。作者同时感谢佛兰德研究基金会(G019521N 和 G009720N)以及根特大学工业研究基金(IOF)通过资助项目IOF.APP.2021.0005(项目FaCT F2021/IOF-Equip/021)为基础设施提供的财政支持。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
6 毫米纸质吸管 http://artstraws.com/education/product/artstraws-thick-asst-cols/钻孔取样
铝制样品芯持有器
ASTM 标准 ASTM D 1107 – 96
纸板邮寄管https://www.rajapack.co.uk/envelopes-mailing-bags/postal-tubes/1-5-2mm-brown-cardboard-postal-tubes_PDT05623.html
立式钻床
用于重建与分析的计算机硬件X射线CT扫描
冷却 
干燥箱
乙醇 
索氏提取器下方用烧瓶(2000 ml)
花泥https://www.oasisfloral.eu/样品 holder 类型 1
用于填充索氏提取器空隙体积以节省溶剂的玻璃珠
胶水
热水浴 https://www.memmert.com/products/water-baths/water-bath/#!filters=%7B%7D索氏提取
生长锥 https://haglofsweden.com/project/increment-borers/
塑料圆筒 Moonen 等,2022 样品 holder 类型 2
塑料圆筒
储液瓶
定制索氏提取装置 
甲苯 
水泵 
X射线CT扫描仪

参考文献

  1. Björklund, J., et al. The utility of bulk wood density for tree-ring research. Dendrochronologia. 69 (September), 125880(2021).
  2. Lachenbruch, B., Mcculloh, K. A. Traits, properties, and performance: How woo....

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重印与许可

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