本文展示了如何使用X射线计算机断层扫描工具链处理树木年轮样本。除特定目的所需的化学提取外,无需其他物理性实验室处理步骤。该工具链可用于生物量估算、最大密度/年轮宽度数据获取,以及定量木材解剖学数据的获取。
需要JoVE订阅才能观看此内容。 请登录或开始免费试用
本文展示了如何使用X射线计算机断层扫描工具链处理树木年轮样本。除特定目的所需的化学提取外,无需其他物理性实验室处理步骤。该工具链可用于生物量估算、最大密度/年轮宽度数据获取,以及定量木材解剖学数据的获取。
本文介绍了一种X射线计算机断层扫描(CT)工具链,可用于获取年轮宽度(TRW)、最大晚材密度(MXD)、其他密度参数以及定量木材解剖学(QWA)数据,而无需进行耗时的表面处理或任何物理样品制备。重点在于生长轮钻芯样品在60 µm至4 µm分辨率范围内的扫描流程。定义了三个观察木材的尺度:(i)年轮间尺度,(ii)年轮尺度,即年轮分析与密度测量尺度,以及(iii)解剖学尺度,后者接近传统切片的质量水平。针对每个尺度专门设计的样品支架,可实现多个生长轮钻芯的高通量扫描。为高效处理树木钻芯的三维X射线CT图像以获取TRW和密度测量数据,开发了一系列专用软件程序。本文简要阐述了CT的基本原理,以帮助正确理解本实验方案。该方案适用于一些树轮年代学中常用的已知树种。结合粗略的密度估算、TRW与MXD数据以及定量解剖学数据,有助于拓展和深化当前在气候重建、树木响应研究方面的分析,并进一步推动树轮生态学/气候学及考古学领域的发展。
木材密度是一个易于测量的变量1,可反映木材的解剖学和化学特性2。在估算地上生物量时,木材密度是一个重要的加权变量3,4,5,需与树木的尺寸以及代表木材碳含量的因子相乘。木材密度与木材的力学特性密切相关6,并反映树木的生活史特征7。
细胞壁密度的测量值约为1500 kg/m³,通常被认为相对恒定8,但也应考虑年轮内细胞壁密度的变化8,9。木质细胞(针叶树中一般为管胞,阔叶树中为导管、薄壁组织和纤维)的排列方式和形态各不相同,这些细胞的细胞壁厚度和腔体大小也存在差异10。因此,木材密度在不同树木之间、同一棵树内部(轴向和横向)以及单个年轮内的短距离范围内均存在变化11,12。在许多....
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
1. 钻取岩心样品
扫描前岩心准备
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
如果目标是估算大量样本的生物量或树木生长增量,即年轮间尺度(图1),则使用样本架1(图5)对样本进行扫描,以获得密度分布(见步骤5.4.3)和树木生长的估算值,例如适用于具有较大年轮宽度的速生树种,此时可采用较粗的分辨率。图12展示了来自刚果盆地树种T. superba的髓心至树皮方向及轴向密度变化趋势的示例。这些图谱基于从树干不同高度位置获取的树木年轮样本芯,经110 µm分辨率扫描所得数据生成。
对于使用样品架2(图5B)扫描样本核心所针对的年轮尺度(图1),可进行树木年轮分析和最大密度(MXD)计算。一个示例如图13所示,该图绘制了来自南非赛德伯格山脉的W. cedarbergensis.......
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
方案中的关键步骤
方案中的关键步骤包括正确操作生长锥以获取高质量的钻取芯样(步骤 1.1.,参见39),避免产生碎屑。接下来,必须保持芯样不固定(但参见26),这既是为了将其插入样品 holder(图5,参见21),也是为了有效提取树脂50,以及可能的后续分析。在扫描前(步骤 2.2.2.),将样品在扫描仪房间内进行平衡处理至关重要,以防止因湿度波动导致的尺寸形变。随后,当在 RingIndicator 模块中可识别年轮时,必须准确标定年轮边界和角度,因为密度峰值可能出现平坦化,类似于传统密度测定系统中标定不准确的情况13。标定对于获得准确的年轮宽度测量值也十分重要21。下一个关键步骤是通过 CoreComparison 模块进行正确的交叉定年(步骤 4.4.1.)。若某些芯样的标定.......
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
作者声明无利益冲突。
感谢三位匿名审稿人提供的反馈与建议。本研究由JVdB的BOF专项研究基金(BOF启动资助BOF.STG.2018.0007.01)、UGCT作为卓越中心(BOF.EXP.2017.0007)及核心设施(BOF.COR.2022.008)提供资助。作者同时感谢佛兰德研究基金会(G019521N 和 G009720N)以及根特大学工业研究基金(IOF)通过资助项目IOF.APP.2021.0005(项目FaCT F2021/IOF-Equip/021)为基础设施提供的财政支持。
....访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 6 毫米纸质吸管 | http://artstraws.com/education/product/artstraws-thick-asst-cols/ | 钻孔取样 | |
| 铝制样品芯持有器 | |||
| ASTM 标准 ASTM D 1107 – 96 | |||
| 纸板邮寄管 | https://www.rajapack.co.uk/envelopes-mailing-bags/postal-tubes/1-5-2mm-brown-cardboard-postal-tubes_PDT05623.html | ||
| 立式钻床 | |||
| 用于重建与分析的计算机硬件 | X射线CT扫描 | ||
| 冷却 | |||
| 干燥箱 | |||
| 乙醇 | |||
| 索氏提取器下方用烧瓶(2000 ml) | |||
| 花泥 | https://www.oasisfloral.eu/ | 样品 holder 类型 1 | |
| 用于填充索氏提取器空隙体积以节省溶剂的玻璃珠 | |||
| 胶水 | |||
| 热水浴 | https://www.memmert.com/products/water-baths/water-bath/#!filters=%7B%7D | 索氏提取 | |
| 生长锥 | https://haglofsweden.com/project/increment-borers/ | ||
| 塑料圆筒 | Moonen 等,2022 | 样品 holder 类型 2 | |
| 塑料圆筒 | |||
| 储液瓶 | |||
| 定制索氏提取装置 | |||
| 甲苯 | |||
| 水泵 | |||
| X射线CT扫描仪 |
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。