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方法文章

使用 CRISPR/Cas9 系统构建着丝粒相关蛋白-E CENP-E-/- 敲除细胞系

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DOI:

10.3791/65476

2023年6月23日

本文内容

摘要

本文报道了利用CRISPR/Cas9系统构建着丝粒相关蛋白E(CENP-E)基因敲除细胞及三种基于表型的筛选策略。我们已利用CENP-E 基因敲除细胞系建立了一种新方法,用于验证CENP-E抑制剂的特异性和毒性,该方法对药物开发和生物学研究具有重要意义。

摘要

CRISPR(成簇规律间隔短回文重复序列)/Cas9 系统已成为在多种生物体中进行精确高效基因编辑的强大工具。着丝粒相关蛋白 E(CENP-E)是一种向微管正端移动的驱动蛋白,参与动粒-微管捕获、染色体排列以及纺锤体组装检验点的调控。尽管 CENP-E 蛋白的细胞功能已被广泛研究,但使用传统方法研究其直接功能仍存在困难,因为 CENP-E 的缺失通常会导致纺锤体组装检验点激活、细胞周期阻滞以及细胞死亡。在本研究中,我们利用 CRISPR/Cas9 系统在人 HeLa 细胞中完全敲除了 CENP-E 基因,并成功构建了 CENP-E-/- HeLa 细胞系。

建立了三种优化的基于表型的筛选策略,包括细胞克隆筛选、染色体排列表型以及CENP-E蛋白的荧光强度检测,这些策略显著提高了CENP-E基因敲除细胞的筛选效率和实验成功率。重要的是,CENP-E基因的缺失会导致染色体排列异常、有丝分裂检查点丝氨酸/苏氨酸激酶B(BubR1)蛋白定位异常以及有丝分裂缺陷。此外,我们利用CENP-E基因敲除的HeLa细胞模型,开发了一种针对CENP-E特异性抑制剂的鉴定方法。

本研究建立了一种验证CENP-E抑制剂特异性和毒性的有效方法。此外,本文介绍了利用CRISPR/Cas9系统进行CENP-E基因编辑的实验方案,该方法可作为研究CENP-E在细胞分裂中作用机制的有力工具。同时,CENP-E 基因敲除细胞系将有助于CENP-E抑制剂的发现与验证,对肿瘤药物研发、细胞生物学中细胞分裂机制的研究以及临床应用具有重要意义。

引言

基因组编辑技术可实现对多种细胞和生物体中基因的靶向修饰。在真核生物中,可通过使用序列特异性核酸酶诱导靶标DNA的同源重组,从而实现位点特异性突变1。近年来,已开发出多种基因组编辑技术,包括锌指核酸酶(ZFNs)2,3、转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)4,5以及归巢大核酸酶(homing meganucleases)6,7,这些技术均可在基因组特定位点进行切割,但往往需要复杂的蛋白质工程和重复的实验流程。研究表明,II型原核生物成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/Cas系统是一种高效的基因编辑技术,可在多种细胞和物种中特异性地介导RNA引导的位点特异性DNA切割8,9,10,11。CRISPR/Cas9基因敲除技术已彻底改变了基础生物学、生物技术和医学领域12

细菌和大多数古菌进化出了一种基于RNA的适应性免疫系统,该系统利用CRISPR和Cas蛋白来识别并摧毁病毒和质粒13Streptococcus pyogenes Cas9(SpCas9)核酸酶包含类RuvC的Holliday连接体解离酶(RuvC)结构域和组氨酸-天冬酰胺-组氨酸(HNH)结构域,通过提供包含CRISPR RNA(crRNA)和反式激活crRNA(tracrRNA)的合成单导向RNA(sgRNA),可高效介导序列特异性的双链断裂(DSBs)14,15,16。双链断裂可通过产生插入缺失的非同源末端连接(NHEJ)或同源定向修复(HDR)途径进行修复,从而在哺乳动物细胞中引入多种突变,包括插入、缺失或无痕的单核苷酸替换1,8。易错的NHEJ途径和高保真的HDR途径均可用于介导基因敲除,通过插入或缺失导致移码突变和提前终止密码子的产生10

驱动蛋白-7 CENP-E 在细胞分裂过程中对动粒-微管连接和染色体排列至关重要17,18,19抗体显微注射20,21,siRNA 耗竭22,23,化学抑制24,25,26,以及基因敲除27,28,29 CENP-E的缺失会导致染色体排列异常、纺锤体组装检查点激活以及有丝分裂缺陷,进而引起非整倍性和染色体不稳定性19,30在小鼠中, CENP-E 缺失会导致发育异常,并在发育的极早期阶段引发胚胎致死27,29,31基因敲除 CENP-E 通常会导致染色体错位和细胞死亡26,27,29,这阻碍了对CENP-E蛋白功能和作用机制的研究。

最近一项研究利用一种可诱导的生长素CRISPR/Cas9基因编辑方法建立了条件性CENP-E基因敲除细胞系32,可在相对较短的时间内实现CENP-E蛋白的快速降解33。然而,迄今为止尚未建立稳定的CENP-E基因敲除细胞系,这是CENP-E生物学领域尚未解决的一项技术挑战。考虑到遗传稳健性34、遗传补偿反应35,36,37以及复杂的细胞内环境,完全删除CENP-E的直接后果可能十分复杂且难以预测。因此,建立CENP-E基因敲除细胞系对于研究染色体排列机制、纺锤体组装检查点以及下游信号通路具有重要意义。

CENP-E抑制剂的发现及其应用对癌症治疗具有重要意义。迄今为止,已发现并合成了七类CENP-E抑制剂,包括GSK923295及其衍生物24,25、PF-277138,39、咪唑并[1,2-a]吡啶骨架衍生物40,41、化合物A42,43、syntelin44,45、UA6278446以及苯并[d]吡咯并[2,1-b]噻唑衍生物47。在这些抑制剂中,GSK923295是一种变构性且高效的CENP-E抑制剂,可结合于CENP-E的马达结构域,抑制CENP-E微管刺激的ATP酶活性,其Ki值为3.2 ± 0.2 nM24,25。然而,与GSK923295在培养的癌细胞中的抑制效果相比,其在临床癌症患者中的治疗效果并不理想48,49,这也引发了人们对GSK923295作用于CENP-E特异性的担忧。此外,其他CENP-E抑制剂对CENP-E蛋白的特异性及其副作用也是癌症研究中的关键问题。

本研究利用 CRISPR/Cas9 系统在 HeLa 细胞中完全敲除了 CENP-E 基因。我们建立了三种优化的基于表型的筛选策略,包括细胞克隆筛选、染色体排列表型分析以及 CENP-E 蛋白的荧光强度检测,以提高 CENP-E 基因编辑的筛选效率和成功率。此外,CENP-E 基因敲除细胞系可用于验证候选化合物对 CENP-E 的特异性。

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方案

1. CRISPR/Cas9 基因敲除载体的构建

  1. 选择人类基因组DNA中的目标序列 CENP-E 基因(GenBank登录号 NM_001286734.2),并使用在线CRISPR设计工具(http://crispor.tefor.net/)设计sgRNA。
  2. 输入一条基因组序列,选择“Homo sapiens人UCSC 2013年12月(hg38分析集)+单核苷酸多态性(SNPs):dbSNP148”,并选择原间隔序列邻近基序“20 bp-NGG-spCas9”。根据特异性评分选择两条引导序列,包括sgRNA-1(5'-CGGCCGCACTCGCACGCAGA-3')和sgRNA-2(5'-TTCTTTAGAGACGCGGGCTC-3')50,预测效率10,且脱靶效应最小。
  3. 订购并合成单链DNA寡核苷酸(ssODNs)。将ssODNs稀释于ddH₂O中。2O 至最终浓度 100 µM. 为了磷酸化并退火sgRNA寡核苷酸,添加 1 µL 正向引物, 1 µL 反转录引物, 0.5 µL T4 多核苷酸激酶 1 µL T4 多核苷酸激酶缓冲液,以及 6.5 µL 在聚合酶链式反应(PCR)管中加入无RNase水,并将该管置于 37 °C 30 分钟 95 °C 5 分钟;然后,逐渐降温至 25 °C 在 5 °C 分钟-1.
  4. 使用 BbsI 酶切 pX458 质粒静态平衡示意图,ΣFx=0,通过杠杆系统和力矢量演示平衡状态。 限制性内切酶。加入 1 µg pX458 质粒的 2 µL 10x 缓冲液 G 1 µL Bbs 的静态平衡图,ΣFx=0,通过杠杆系统和力矢量演示平衡。,并加入无RNase的ddH₂O2O 至 20 µL 在1.5 mL离心管中。将离心管置于指定条件下孵育 37 °C 孵育2小时。然后,按照试剂盒说明书,使用柱式DNA胶回收试剂盒纯化线性化质粒。
  5. 将sgRNA寡核苷酸连接至pX458质粒(pSpCas9(BB)-2A-绿色荧光蛋白(GFP)质粒,Addgene编号 48138)中。添加 1 µL 退火的寡核苷酸,25 ng 线性质粒, 1 µL 10x T4 DNA 连接酶缓冲液 0.5 µL T4 DNA连接酶(350 U/µL) 并定容至 10 µL 用 ddH₂O2在1.5 mL离心管中。将连接反应液于 16 °C 2小时。
  6. 孵育 10 µL 将构建的质粒与感受态DH5α细胞在冰上孵育30 min,随后进行热激处理 42 °C 45秒,然后立即置于冰上5分钟。加入 500 µL Luria-Bertani (LB) 培养基,并将细胞接种至含氨苄青霉素的 LB 平板上(100 µg/mL)。在指定条件下孵育 37 °C 孵育16小时,筛选抗性克隆。
  7. 用无菌的移液枪头挑选5-10个单菌落,转移至含有氨苄青霉素的1 mL LB培养基培养液中100 µg/mL)。将培养物置于 37 °C 以180 rpm振荡培养12-16小时。
  8. 使用质粒提取试剂盒,按照制造商提供的操作说明提取质粒DNA。通过Sanger测序对每个菌落的质粒DNA进行验证,测序引物为 U6 启动子位点,使用 U6- 正向引物 5'-GAGGGCCTATTTCCCATGATTCC-3'
  9. 使用无内毒素质粒DNA试剂盒,按照生产商提供的说明书提取和纯化质粒。

2. 转染、分离与筛选 CENP-E 敲除的HeLa细胞

  1. 在含10%胎牛血清和1%青霉素/链霉素的杜尔贝科改良伊格尔培养基(DMEM)中培养HeLa细胞,培养条件为37°C、5% CO₂的湿润培养箱 37 °C 含5% CO₂2.
  2. 使用0.25%胰蛋白酶/乙二胺四乙酸(EDTA)孵育HeLa细胞 37 °C 轻轻吹打细胞2-3分钟使其解离,然后按1:4的传代比例将细胞接种至新的培养板中。
  3. 在12孔板中接种细胞,培养至60–70%融合度后进行转染。根据生产商说明书,使用参考试剂将pX458-sgRNA质粒转染至HeLa细胞中(参见 材料表).
    1. 轻轻混匀 1 µg 经验证的 pX458-sgRNA 质粒 50 µL 在A管中加入减量血清培养基,然后轻轻混匀 2 µL 转染试剂的 50 µL B管中加入低血清培养基。将A管和B管分别在室温下孵育5分钟。
    2. 轻柔混合A管和B管,室温孵育5分钟。将混合液加入12孔板中,孵育细胞6小时,随后更换为新鲜DMEM培养基。
  4. 在转染后24 h或48 h,使用荧光显微镜观察HeLa细胞以评估转染效率。转染48 h后,使用0.25%胰蛋白酶/EDTA将转染的HeLa细胞完全消化解离 37 °C 孵育3-5分钟,使用血细胞计数板或自动细胞计数仪对细胞进行计数,然后根据梯度稀释法,将转染后的每种细胞群体分别接种至三个独立的96孔板中10.
  5. 将细胞放回湿润的培养箱中,继续培养1-2周,每3天更换一次培养基。用于基于表型的筛选与验证 CENP-E 在24孔或12孔板中对细胞进行敲除、解离并扩增培养5-7天。
  6. 使用配备10倍和20倍物镜的倒置显微镜,筛选菌落直径较小的突变细胞。
    注意: CENP-E 突变通常会导致细胞克隆中分裂细胞数量显著增加,这可能成为筛选的关键指标之一 CENP-E 突变细胞。
  7. 使用柱式动物基因组DNA提取试剂盒,按照制造商提供的操作说明提取细胞DNA。PCR反应体系设置如下: 0.25 µL Taq 聚合酶 5 µL 10x 缓冲液(Mg2+ 加) 4 µL dNTP混合物,500 ng DNA模板, 1 µL 正向引物, 1 µL 反向引物的用量,并用ddH₂O调整2O 至 50 µL采用以下PCR程序设置进行基因扩增: 98 °C,10 秒; 98 °C,10 秒, 55 °C,30 秒, 72 °C,33个循环,每个循环60秒; 72 °C,10 分钟,然后保持在 4 °C.
    注意:用于目标位点克隆的特异性引物序列如下所列: CENP-E 靶标 F1,5'-GAGGGTCCTGGCCATTTTCCTG-3'; CENP-E 靶序列 R1,5'-AGATCTCCGATCCTCCCCTGTC-3'; CENP-E 靶标 F2,5'-TGGTAACTGCATTTTGGTGTTCTAC-3'; CENP-E 靶标 R2,5'-CCTGTTGCAACGTGAGGGAAG-3'
  8. 按照生产商的说明书将目标DNA连接至pMD18-T载体中。将连接产物转化至感受态DH5α细胞中,并进行培养以筛选克隆。
  9. 进行Sanger测序以确定类型 CENP-E 敲除。使用质粒提取试剂盒,按照生产商的说明书提取质粒DNA。使用M13正向和反向引物对每个菌落的质粒DNA进行Sanger测序。M13F引物序列:5'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3';M13R引物序列:5'-CAGGAAACAGCTATGACC-3'。
  10. 接种野生型和 CENP-E 分别将突变的HeLa细胞接种于24孔板中的12 mm玻璃盖玻片上。吸除完全DMEM培养基,于室温下用4%多聚甲醛/磷酸盐缓冲液(PBS)固定液固定细胞10分钟。
  11. 用4',6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI)溶液在室温下染色细胞核5分钟。筛选并验证 CENP-E 使用配备 Plan Fluor 40x/数值孔径(NA)0.75 物镜的荧光显微镜,根据染色体排列的表型筛选突变细胞。
  12. 使用CENP-E蛋白的免疫荧光染色与分析(见第3节)筛选并验证CENP-E基因敲除细胞。

3. 免疫荧光染色与高分辨率共聚焦显微镜检测

  1. 在室温下用 4% 多聚甲醛/PBS 固定液固定细胞 10 分钟,并在 1× PBS 中浸洗 2 次,每次 5 分钟。
    注意:确保细胞处于良好状态,并轻柔地收集和固定细胞,以避免中期细胞脱落。
  2. 在室温下用 0.25% Triton X-100/PBS 处理细胞 10 分钟,然后在 1× PBS 中浸洗 2 次,每次 5 分钟。
  3. 在室温下用 1% BSA/PBST(含 0.1% Tween 20 的 PBS)封闭细胞 1 小时。用 1% BSA/PBST 稀释一抗,将样本在 4 °C 下孵育 12 小时。
  4. 弃去一抗溶液,在 1× PBS 中清洗细胞 3 次,每次 5 分钟,然后在室温下加入稀释的二抗孵育 2 小时。
  5. 弃去二抗溶液,在 1× PBS 中清洗细胞 3 次,每次 5 分钟。
  6. 在室温下用 DAPI 染色细胞核 5 分钟。用封片剂封片,并用指甲油密封载玻片。
  7. 使用配备 63×/NA 1.40 物镜的激光扫描共聚焦显微镜观察并记录荧光图像。

4. 染色体标本制备与核型分析

  1. 将野生型和 CENP-E-/- HeLa 细胞在含 10% 胎牛血清和 1% 青霉素/链霉素的完全 DMEM 培养基中培养 24 小时,然后用 300 nM 秋水仙素处理野生型和 CENP-E-/- HeLa 细胞 5 小时。
  2. 在 37 °C 下用 0.25% 胰蛋白酶/EDTA 孵育细胞 3 分钟,将细胞收集至 1.5 mL 离心管中。
  3. 在室温下以 1,000 × g 离心 5 分钟,弃去上清液,加入 1.2 mL 0.075 mol/L KCl 溶液,在 37 °C 下孵育 20 分钟。
  4. 在室温下以 1,000 × g 离心 5 分钟,弃去上清液,加入 0.2 mL 固定液(甲醇:冰醋酸 = 3:1)进行预固定,轻轻混匀 1 分钟。
  5. 在室温下以 1,000 × g 离心 5 分钟,收集细胞沉淀,加入 1.5 mL 室温固定液孵育 10 分钟,然后在室温下以 1,000 × g 再次离心 5 分钟。
  6. 弃去上清液,加入 0.6 mL 固定液,制备细胞悬液。从距冰上载玻片 35–40 cm 的高度滴加 3–5 滴细胞悬液。
    注意:保持细胞悬液滴加到载玻片的高度为 35–40 cm;否则染色体可能过于分散或彼此无法分离。
  7. 立即用酒精灯烘干载玻片,用 10% 吉姆萨染色液染色 7 分钟,用流水冲洗 2 分钟,然后使用配备 Plan Fluor 40x/NA 0.75 物镜的光学显微镜观察样本。

5. 细胞克隆形成实验

  1. 在6孔板中制备细胞悬液,每孔细胞密度为1,000-2,000个细胞。轻轻摇动培养板,使细胞均匀分布。
  2. 将6孔板放入CO₂培养箱中2 孵育器中孵育,2-3 周 37 °C 含5% CO2每5天更换一次培养基。使用配备10倍和20倍物镜的倒置显微镜记录图像。当克隆中出现可见的细胞集落(一个克隆内含数百个细胞)时,收获细胞。
  3. 为研究GSK923295的作用,将细胞接种于6孔板中培养24小时,随后加入终浓度分别为10、25、50、100和200 nM的GSK923295溶液,每孔2 mL。
    注意:在克隆形成的早期阶段,不要移动培养皿,以避免细胞脱落,否则可能形成新的克隆,影响转染细胞的筛选。
  4. 弃去培养基,在室温下用1% PFA固定细胞10 min。在室温下用0.1%结晶紫染色液染色集落15 min。用1× PBS冲洗样本3次。使用ImageJ软件记录细胞集落的图像并量化每个集落的直径。选择 直线 选择工具,单击 分析,选择 测量,并记录长度。
  5. 用1 mL 10%乙酸溶液冲洗菌落,持续5分钟。转移 200 µL 将上清液加入96孔板中,使用微孔板分光光度计在A波长下测定吸光度值600 nm.

6. 细胞活力检测

  1. 将细胞接种于24孔板中,在37 °C培养48小时,使细胞密度达到80-90%。
  2. 加入100 µL含0.25%胰蛋白酶/EDTA的溶液,于37 °C孵育3分钟。
  3. 用移液枪将400 µL PBS与细胞充分混匀,取100 µL细胞悬液转移至96孔板中。
  4. 每孔加入20 µL MTS溶液,使其终浓度为317 µg/mL,按照试剂盒说明书轻轻混匀。将样品置于CO2培养箱中,37 °C孵育1-3小时。
  5. 使用酶标仪在A490 nm波长处测定各孔的吸光度值,并以A630 nm作为参比波长,扣除细胞碎片及非特异性吸收带来的背景信号(细胞活力 = A490nm - A630 nm)。

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结果

CENP-E-/- HeLa 细胞通过 CRISPR/Cas9 系统成功构建(图1)。该方法的时间线和关键实验步骤如图所示 图1首先,我们设计并合成了 CENP-E特异性的sgRNA,将sgRNA退火并连接至pX458质粒,将质粒转染入HeLa细胞,并培养48 h。转染后的细胞经消化分散,通过连续稀释法接种于96孔板中图1A)。挑取单菌落,并采用三种基于表型的策略进行筛选。突变类型及 CENP-E 敲除细胞通过PCR、Sanger测序和免疫荧光实验进行验证(图1A)。第1外显子和第13外显子的 CENP-E 基因被选为染色体4上的靶向位点(图1B)。CRISPR/Cas9 系统利用 RuvC 和 HNH 核酸内切酶结构域,在原间隔序列邻近基序(P...

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讨论

驱动蛋白-7 CENP-E 是细胞分裂过程中染色体排列和纺锤体组装检查点的关键调控因子17,19,20。CENP-E 的基因缺失通常会导致纺锤体组装检查点激活、细胞周期阻滞以及细胞死亡27,29,51,52。因此,构建稳定的 CENP-E 基因敲除细胞系是 CENP-E 生物学研究中一个尚未解决的重要问题。本研究利用 CRISPR/Cas9 系统成功构建了 CENP-E 基因敲除的 HeLa 细胞。本研究建立了三种优化的基于表型的筛选策略——细胞克隆筛选、染色体排列表型分析以及 CENP-E 蛋白荧光强度检测——显著提高了 CENP-E 基因敲除细胞的筛选效率和成...

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披露

作者声明无利益冲突。

致谢

感谢福建医科大学细胞骨架实验室所有成员的有益讨论。感谢福建医科大学公共技术服务中⼼的林俊进、黄志宏、林玲、庞丽丽、周林英、林曦和吴敏霞提供的技术支持。感谢福建医科大学基础医学实验教学中心郑思怡、林颖和柯祺给予的支持。本研究得到以下基金资助:国家自然科学基金(项目编号 82001608 和 82101678)、中国福建省自然科学基金(项目编号 2019J05071)、中国福建省科技创新增量联合资金(项目编号 2021Y9160)以及福建医科大学高层次人才科研启动基金项目(项目编号 XRCZX2017025)。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
0.25% 胰蛋白酶-EDTAGibco25200056
1.5 mL 离心管AxygenMCT-150-C
24孔板康宁3524
4S Gelred,水中10,000倍浓缩液上海桑谷生物技术有限公司A616697
50 mL 离心管康宁430828
6 cm 培养皿康宁430166
95% 乙醇国药化学试剂10009164
96孔板康宁3599
乙酸国药集团化学试剂10000218溶于 H2O 以配制10%的工作液。
琼脂糖生工生物(上海)A620014
Alexa Fluor 488 标记的山羊抗小鼠 IgG(H+L)BeyotimeA0428用于免疫荧光。用 1% BSA/PBST 溶解,按 1:500 稀释。
Alexa Fluor 488 标记的山羊抗兔 IgG(H+L)BeyotimeA0423用于免疫荧光。用 1% BSA/PBST 溶解,按 1:500 稀释。
Alexa Fluor 555 标记的驴抗小鼠 IgG(H+L)BeyotimeA0460用于免疫荧光。用 1% BSA/PBST 溶解,按 1:500 稀释。
无水乙醇国药集团化学试剂有限公司100092690
抗BubR1兔单克隆抗体Abcamab254326用于免疫荧光。用 1% BSA/PBST 溶解,按 1:100 稀释 
抗CENP-B小鼠单克隆抗体Santa Cruz Biotechnologysc-376392用于免疫荧光。用 1% BSA/PBST 溶解,按 1:50 稀释。
抗CENP-E兔单克隆抗体Abcamab133583用于免疫荧光。用 1% BSA/PBST 溶解,按 1:100 稀释。
抗荧光淬灭封片剂BeyotimeP0131减缓荧光信号的淬灭
抗-α微管蛋白小鼠单克隆抗体Abcamab7291用于免疫荧光。溶于 1% BSA/PBST 中,按 1:100 稀释。
Biotek Epoch 微孔板分光光度计Biotek InstrumentsBiotek Epoch
牛血清白蛋白(BSA)国药集团化学试剂69003435
BpiI (BbsI)赛默飞世尔科技ER1011
CellTiter 96 Aqueous 单溶液细胞增殖检测PromegaG3580
离心Eppendorf5424BK745380
秋水仙碱国药集团化学试剂61001563
共聚焦扫描显微镜LeicaLeica TCS SP8
盖玻片CITOTEST80344-1220
DAPIBeyotimeC1006
DH5α 感受态细胞上海桑谷生物技术有限公司B528413
DL2000 DNA markerTaKaRa3427A
杜尔贝科改良伊格尔培养基(DMEM)GibcoC11995500BT
无内毒素质粒小提试剂盒 <图像替代文本"公式 2" 源文本:src="/files/ftp_upload/65476/65476eq02.jpg" 样式="margin: auto;"/>OmegaD6950
Ezup柱式动物基因组DNA纯化试剂盒上海桑谷生物技术有限公司B518251
胎牛血清浙江天航生物科技11011-8611
龙胆紫国药集团化学试剂71019944用 PBS 溶解,配制 0.1% 龙胆紫/PBS 溶液。
吉姆萨染色液国药集团化学试剂有限公司71020260
GraphPad Prism 8.0 版本软件GraphPadwww.graphpad.com统计分析。
GSK923295MedChemExpressHY-10299
HeLa细胞系ATCCCCL-2
加湿培养箱Heal ForceHF90/HF240
Image J 软件美国国立卫生研究院https://imagej.nih.gov/ij/图像处理与分析
倒置显微镜南京江南永新光学XD-202
LB 琼脂粉上海桑谷生物技术有限公司A507003
Lipo6000 转染试剂BeyotimeC0526
尼康 Ti-S2 显微镜尼康Ti-S2
Opti-MEM 降低的 血清 培养基Gibco31985070
多聚甲醛国药集团化学试剂80096618用 PBS 溶解,配制 4% 多聚甲醛/PBS 溶液。
青霉素-链霉素溶液HyCloneSV30010
SanPrep 柱式 DNA 胶回收试剂盒上海桑谷生物技术有限公司B518131
SanPrep 柱 质粒 小量质粒提取 试剂盒生工生物(上海)B518191
T4 DNA连接酶TaKaRa2011A
T4多核苷酸激酶TaKaRa2021A
TaKaRa Ex TaqTaKaRaRR001A
Triton X-100国药化学试剂30188928用 PBS 溶解,配制 0.25% Triton X-100/PBS 溶液。
Tween 20国药集团化学试剂30189328用 PBS 溶解,配制 0.1% Tween 20/PBS。

参考文献

  1. Jiang, W., Bikard, D., Cox, D., Zhang, F., Marraffini, L. A. RNA-guided editing of bacterial genomes using CRISPR-Cas systems. Nature Biotechnology. 31 (3), 233-239 (2013).
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