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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该方案描述了接种物的制备,使用结晶紫染料在微量滴定板上的生物膜定量,生物膜中的活菌计数以及 不动杆菌生物膜的可视化。
不动杆菌 会引起院内感染,其生物膜的形成有助于在医院环境等干燥表面上存活。因此,生物膜定量和可视化是评估 不动杆菌菌 株引起医院感染潜力的重要方法。在微孔板表面形成的生物膜可以根据体积和细胞数量进行量化。生物膜体积可以通过使用结晶紫染色、洗涤、使用乙醇脱色,然后使用酶标仪测量溶解染料来定量。为了量化嵌入生物膜中的细胞数量,使用细胞刮刀将生物膜刮掉,在盐水中收获,在玻璃珠存在下剧烈搅拌,并涂抹在不动杆菌琼脂上。然后,将板在30°C孵育24-42小时。孵育后,计数红色菌落以估计生物膜中的细胞数。这种可行的计数方法也可用于计数混合物种生物膜中的 不动杆菌 细胞。 不动杆菌 生物膜可以使用荧光染料进行可视化。使用设计用于显微分析的市售微孔板来形成生物膜。然后,用SYTO9和碘化丙啶染料染色底表面附着的生物膜,洗涤,然后用共聚焦激光扫描显微镜观察。
已知不动杆菌会引起医院感染,其人类感染,尤其是在医疗机构中,越来越多的报道1.它广泛存在于医院、医疗机构和食品相关环境中 2,3,4。它可以在包括医院表面(如床栏、床头柜、呼吸机表面和水槽)在内的环境中长期存活4.这种在环境表面的持久性可能是导致不动杆菌4 院内感染的重要因素之一。
生物膜是微生物生命的一种形式,是由活的微生物细胞和来自细胞的细胞外聚合物物质(EPS)组成的微生物基质5。微生物细胞嵌入基质中,通常对环境压力(如热、盐、干燥、抗生素、消毒剂和剪切力)具有很强的抵抗力6,7。
不动杆菌可以在表面上形成生物膜,这表明它可能有助于延长在环境表面(包括医院表面)的存活时间,并增强对抗生素治疗的耐药性8,9。此外,不动杆菌的生物膜形成可能与人类临床结果高度相关8。因此,不动杆菌菌株的生物膜形成性可能是预测环境生存和人类感染的指标之一8,10。
表面附着的生物膜可以被量化和可视化,以评估生物膜的形成性。为了量化表面附着的生物膜,通常用生物膜染色染料(如结晶紫)对生物膜进行染色,并将染料在溶液中洗脱并测量光密度11。生物膜的可视化是评估生物膜形成性的另一种好方法11。与其他技术(如 SEM12,13)相比,使用荧光染料的特异性共聚焦激光扫描显微镜 (CLSM) 可视化方法可能更有助于表征生物膜形态。
可以对生物膜中的活细胞进行计数,以估计生物膜中的活细胞数量11。将嵌入生物膜中的活细胞分离、稀释、铺在琼脂平板上、孵育和计数。由于较高的细胞数可能满足感染剂量,因此可以提供有关生物膜的更详细的信息,例如与细胞数相关的感染电位13,14。
本文介绍了 (1) 量化表面附着的生物膜,(2) 对生物膜中的活细胞进行计数,以及 (3) 使用 Acinetobacter 的 CLSM 可视化生物膜的分步方案。所提出的方案描述了评估 不动杆菌 分离株的生物膜形成性和表征其生物膜的方法。
1.细菌接种物的制备
2. 使用结晶紫进行生物膜定量
3. 生物膜活力计数
4. 使用共聚焦激光扫描显微镜(CLSM)进行生物膜可视化
按照该方案,最初从厨房表面分离的 不动杆菌 分离株的生物膜在聚苯乙烯96孔板上形成,用结晶紫染色,并将染料溶解在乙醇中并测量生物膜质量(图1)。生物膜的数量因菌株而异,范围从OD 0.04到1.69(图1)。根据 Stepanović 等人 16 建立的标准,除 A. bouvetii 外,所有分离株都形成了生物膜。 A.放射性抗性剂 形成弱生物膜。 朱 氏曲霉和 鲍曼 曲霉形成中等生物膜,而 皮蒂 曲霉和 乌尔辛吉曲 霉形成强生物膜。
为了对生物膜中的活细胞进行计数,使用细胞刮刀刮掉生物膜,高速涡旋,稀释并在 不动杆菌 选择性板上铺展。孵育后,计算菌落数以估计生物膜细胞的数量(图2)。除 A. bouvetii 外,所有分离株的生物膜中都具有相当于 7-8 Log CFU 的细胞。与结晶紫测定显示的生物膜非形成特性一致, 布维曲 霉在 4.4 Log CFU 时的细胞数量水平要低得多。
使用CLSM可视化底面附着的生物膜(图3)。在 黄芪、 鲍曼苜蓿和 熊芥 中发现了大量的生物膜,具有不同的生物膜形态。虽然 A. pittii 在结晶紫测定中是一种强生物膜形成者,但它在底面没有形成太多生物膜。

图 1:使用结晶紫测定法测量在聚苯乙烯 96 孔板上形成的 不动杆菌 的生物膜质量。 误差线表示与一式三份的标准偏差。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 2:在聚苯乙烯 12 孔板上形成的 不动杆 菌生物膜的活菌计数。 误差线表示与重复项的标准偏差。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 3:使用 SYTO 9 和碘化丙啶染料通过 CLSM 可视化的 96 孔板上形成的底表面附着 不动杆菌 生物膜。 比例尺:50 μm。 请点击这里查看此图的较大版本.
作者没有什么可透露的。
该方案描述了接种物的制备,使用结晶紫染料在微量滴定板上的生物膜定量,生物膜中的活菌计数以及 不动杆菌生物膜的可视化。
这项研究得到了韩国食品研究所(KFRI)的主要研究计划(E0210702-03)的支持,该计划由科学和信息通信技术部资助。
| 96 孔细胞培养板 | SPL | 30096 | 聚苯乙烯 96 孔板 |
| BHI(脑、心输液)肉汤 | Merck KGaA | 1.10493.0500 | |
| 血琼脂底板 | KisanBio | MB-B1005-P50 | 不动杆菌 |
| CHROMagar 生长培养基 不动杆菌 | CHROMagar | AC092 | 不动杆菌 |
| 结晶紫选择性板解决方案 | Sigma-Aldrich | V5265 | |
| Filmtracer LIVE/DEAD 生物膜活力套件 | Invitrogen | L10316 | SYTO9 和碘化丙啶 |
| 酶标仪 | Tecan | Infinite M200 PRO NanoQuant | 生物膜测量 |
| RBC 玻璃电镀珠 | RBC | RG001 | 玻璃珠 |
| μ-Plate 96 孔 | 黑色ibidi | 89621 | 用于 CLSM 的微孔板 |