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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该实验方案描述并优化了一种多重免疫组化(IHC)染色方法,主要通过优化单通道抗体孵育条件和调整抗体和通道的设置来解决临床来源的肺癌组织中的自发荧光和通道串扰问题。
肺癌是全世界恶性肿瘤相关发病率和死亡率的主要原因,复杂的肿瘤微环境被认为是肺癌患者死亡的主要原因。肿瘤微环境的复杂性需要有效的方法来了解肿瘤组织中的细胞间关系。多重免疫组化(mIHC)技术已成为推断肿瘤组织信号通路上游和下游蛋白质表达之间关系以及制定临床诊断和治疗计划的关键工具。mIHC是一种基于酪胺信号放大(TSA)技术的多标记免疫荧光染色方法,可同时检测同一组织切片样品上的多个靶分子,实现不同的蛋白质共表达和共定位分析。在该实验方案中,对临床来源的肺鳞状癌的石蜡包埋组织切片进行多重免疫组织化学染色。通过优化实验方案,实现了标记靶细胞和蛋白的多重免疫组织化学染色,解决了肺组织中的自发荧光和通道串扰问题。此外,多重免疫组化染色广泛应用于肿瘤相关、高通量测序的实验验证,包括单细胞测序、蛋白质组学和组织空间测序,提供直观、可视化的病理学验证结果。
酪胺信号扩增(TSA)已有20多年的历史,是一类利用辣根过氧化物酶(HRP)对靶抗原进行高密度原位标记的检测技术,广泛应用于酶联免疫吸附测定(ELISA)、原位杂交(ISH)、免疫组化(IHC)等生物抗原检测技术。 大幅提高检测信号的灵敏度1.基于 TSA 技术的蛋白石多色染色最近被开发出来并广泛用于多项研究 2,3,4,5。传统的免疫荧光 (IF) 染色为研究人员提供了一种简单的工具,用于检测和比较各种模式生物细胞和组织中蛋白质的分布。它基于抗体/抗原特异性结合,包括直接和间接方法6。直接免疫染色涉及使用荧光团偶联的一抗来对抗目标抗原,从而可以使用荧光显微镜进行直接荧光检测。间接免疫染色方法涉及应用荧光团偶联的二抗来对抗非偶联的一抗6,7。
传统的单标记免疫荧光染色方法只能对组织中的一种、两种或在某些情况下三种抗原进行染色,这是挖掘组织切片中包含的丰富信息的主要限制。定量结果的解释通常取决于目视观察和成像软件(如 ImageJ)的准确定量。存在技术限制,例如抗体种类限制、荧光标记信号弱和荧光染料颜色重叠(表 1)。Opal 多重 IHC (mIHC) 技术基于 TSA 衍生,允许在同一组织切片上对 7-9 种以上抗原进行多重染色和差异标记,对一抗的来源没有限制,但需要针对抗原的相应抗体具有高度特异性。染色程序与普通免疫荧光染色相似,但有两个区别:每轮染色仅使用一种抗体,并添加抗体洗脱步骤。通过非共价键与抗原结合的抗体可以通过微波洗脱去除,但通过共价键结合到抗原表面的 TSA 荧光信号被保留。
用染料标记的活化酪胺 (T) 分子在靶抗原处高度富集,从而可以有效扩增荧光信号。这允许在没有抗体干扰的情况下直接标记抗原,然后在多个染色循环后可以实现多色标记8,9,10(图1)。尽管该技术可为疾病研究提供可靠和准确的图像,但由于需要广泛的优化和设计,创建有用的多重荧光免疫组化 (mfIHC) 染色策略可能既耗时又严格。因此,该多重panel方案已在自动IHC染色机中进行了优化,其染色时间比手动方案更短。任何研究人员都可以直接应用和调整这种方法,用于人福尔马林固定和石蜡包埋 (FFPE) 组织样本的免疫肿瘤学研究11。此外,载玻片制备、抗体优化和多重设计方法将有助于获得代表准确细胞原位相互作用的可靠图像,并缩短手动分析的优化周期12。
mfIHC主要包括图像采集和数据分析。在图像采集方面,需要用专业的光谱成像设备检测多色标记的复合染色样品,以识别各种混合色信号,获得不受组织自发荧光干扰的高信噪比图像。目前的光谱成像设备主要包括光谱共聚焦显微镜和多光谱组织成像系统。多光谱组织成像系统是专为组织切片定量分析而设计的专业成像系统,其最重要的特点是获取图像光谱信息,提供生物组织样品的形态结构和光学映射信息13,14。光谱图像中的任何像素都包含完整的光谱曲线,每种染料(包括自发荧光)都有其相应的特征光谱,从而能够完整记录和准确识别混合和重叠的多标记信号。
在数据分析方面,由于组织样本的形态结构和组成细胞,多色标记样品极其复杂。普通软件无法自动识别不同的组织类型。因此,智能定量组织分析软件用于特定区域抗原表达的定量分析15,16,17,18。
最重要的是,融合多光谱成像和定量病理分析技术的多标记免疫荧光染色具有检测靶点多、染色有效、分析准确等优点,因此可以显著提高组织形态学分析的准确性,以细胞水平分辨率揭示蛋白质之间的空间关系,有助于从组织切片样本中挖掘更丰富、更可靠的信息19 (表1)。
该协议已获得中国四川大学华西医院伦理委员会的指导意见。在华西医院肺癌中心手术时采集肺癌组织样本,并征得每位患者的知情同意书。
1.组织切片准备
2. 一抗优化
注:常规IHC实验用于确定单个抗体的孵育条件,主要包括抗体浓度和抗原修复条件。请参阅抗体使用说明书中的条件。
3. mIHC染色法
注意:蛋白石 mIHC 染色是可用的 mIHC 方法之一。在这个实验性的 5 色方案中,由于每个组织样品需要用四种抗体染色,因此需要四种一抗孵育、二抗孵育和 TSA 信号放大显色孵育以及五种抗原修复体。最后,进行4'6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI)染色和抗荧光爆破剂密封。
4.设置阴性对照
5. 组织载玻片全自动扫描
注:用于光谱成像的设备是全自动多光谱组织定量分析仪,可以使用参考系统对 5 色载玻片进行成像和分析可视化(参见 材料表)。该系统使用多光谱成像对多个荧光团和组织自发荧光进行定量解混。
6.荧光分析
优化CD8一抗与荧光基团的配配方案。两组荧光结果对应于实验组中完全相同的抗体孵育条件,只是抗体匹配的荧光团发生了变化。如图2所示,CD8+ T细胞与荧光基团480和荧光基团690的通道匹配存在显著差异。荧光基团690的通道显示出极强的荧光背景——黄色圆圈内的大面积红色不规则荧光显示颜色,这对CD8+ T细胞的定位分析造成很大的干扰(图2C,D)。然而,具有荧光基团 480 的通道显示出非常特异性的 CD8 细胞膜阳性,并且没有荧光背景。因此,黄色圆圈显示了非常清晰的阳性细胞膜(图2A),这充分说明了抗体和荧光通道匹配在该方案中的重要性。
检测巨噬细胞和细胞毒性T细胞在非小细胞肺鳞癌组织中的分布,验证特征蛋白HMGCS1在肿瘤细胞和免疫细胞中的表达。如 图 3 所示,这些图像源自 QuPath 0.3.2。mIHC组为荧光基团480、520、620、690和DAPI,对应的抗体标志物为肺鳞状癌细胞标志物CK5/6;CD8,T细胞的标志物;CD68,巨噬细胞的标志物;和 HMGCS1,对血浆阳性肿瘤细胞具有特异性。巨噬细胞和CD8+ T细胞呈重浸润性,分布在鳞状癌病灶周围和内部,而HMGCS1在鳞状癌细胞血浆中广泛表达,显示出较强的肿瘤细胞阳性性。

图 1:FFPE 组织的多重免疫组织化学染色工作流程。 缩写:FFPE = 福尔马林固定和石蜡嵌入。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 2:CD8 和荧光基团匹配方案的优化。 CD8+ T细胞与荧光基团480和荧光基团690的通道匹配存在显著差异。比例尺 = 50 μm. 请点击这里查看此图的较大版本.

图 3:肺鳞状癌的多重免疫组织化学染色。 巨噬细胞和细胞毒性T细胞在非小细胞肺鳞状癌组织中的分布以及特征蛋白HMGCS1在肿瘤细胞和免疫细胞中的表达。CK5/6 是肺鳞状癌细胞的标志物;CD8 是 T 细胞的标志物;CD68是巨噬细胞的标志物;HMGCS1 对肿瘤细胞浆阳性细胞具有特异性。比例尺 = 50 μm. 请点击这里查看此图的较大版本.
| 多重免疫组化技术 | 传统免疫荧光技术 | |
| 分子靶标数量 | 无限制(一次最多 9 种染色,包括 DAPI) | 一般标记3-4种(含DAPI) |
| 图像采集 | 染色分辨率和染色特异性高,信号扩增,信号强度强,淬灭时间长,无背景效应,每个靶点的信噪比高得多。 | 亮度弱,易淬灭,各种抗体之间相互影响,背景高 |
| 数据分析 | 区域特异性、细胞分割、单细胞空间信息 | ImageJ的肉眼观察和精准定量 |
表1:蛋白石多标记免疫荧光技术与传统免疫荧光技术的比较。
所有作者声明不存在利益冲突。
该实验方案描述并优化了一种多重免疫组化(IHC)染色方法,主要通过优化单通道抗体孵育条件和调整抗体和通道的设置来解决临床来源的肺癌组织中的自发荧光和通道串扰问题。
作者要感谢华西医院临床病理研究所的成员,他们为高质量的多重免疫荧光和IHC处理提供了技术指导。该协议得到了中国国家自然科学基金(82200078)的支持。
| 试剂 | |||
| CD8 | 抗体 | ab237709 | 一抗 1/100, PH9 |
| 抗 CD68 | 抗体 | ab955 | 一抗, 1/300, PH9 |
| 抗 CK5/6 | Millipore | MAB1620 | 一抗, 1/150, PH9 |
| 抗 HMGCS1 | 抗体 | GTX112346 | 一抗,1/300, PH6 |
| 动物非免疫血清 | MXB Biotechnologies | SP KIT-B3 | 抗原阻断 |
| Fluormount-G | SouthernBiotech | 0100-01 | 抗荧光爆发 |
| 蛋白石 PolarisTM 7 色手动 IHC 试剂盒 | Akoya | NEL861001KT | 蛋白石 mIHC 染色 |
| 洗涤缓冲液 | Dako | K8000/K8002/K8007/K8023 | 洗涤组织载玻片 |
| 软件 | |||
| HALO | 智能定量组织分析软件,付费软件 | ||
| inForm | 智能定量组织分析软件,付费软件 | ||
| PerkinElmer Vectra | 多光谱组织成像系统,组织玻片全自动扫描。 | ||
| QuPath 0.3.2 | 智能定量组织分析软件,开源软件,用于本实验。 |