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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该方案概述了从成年小鼠脊髓中分离纯化的星形胶质细胞和小胶质细胞,促进了后续应用,如RNA分析和细胞培养。它包括详细的细胞解离方法和程序,旨在提高分离细胞的质量和产量。
星形胶质细胞和小胶质细胞在中枢神经系统发育、损伤反应和神经退行性疾病中起着关键作用。这些高度动态的细胞表现出对环境变化的快速反应,并在形态、转录谱和功能方面表现出显着的异质性。虽然我们对神经胶质细胞在健康和疾病中的功能的理解已经有了很大的进步,但仍然需要在损伤或损伤的背景下进行 体外细胞特异性分析,以全面表征不同的细胞群。与细胞系或新生动物相比,从成年小鼠中分离细胞具有多项优势,因为它允许在病理条件下和特定时间点分析细胞。此外,专注于脊髓特异性分离(不包括脑部受累)可以研究脊髓病理学,包括实验性自身免疫性脑脊髓炎、脊髓损伤和肌萎缩侧索硬化症。该方案提供了一种从成年小鼠脊髓中分离星形胶质细胞和小胶质细胞的有效方法,有助于立即或将来的分析,并在功能,分子或蛋白质组学下游研究中具有潜在应用。
星形胶质细胞和小胶质细胞是多功能神经胶质细胞,在中枢神经系统 (CNS) 中起着至关重要的作用,包括调节神经元功能、促进中枢神经系统发育、维持血脑屏障以及参与其他关键过程等职责 1,2,3,4.除了在维持体内平衡方面的作用外,这些神经胶质细胞在损伤和修复机制中也起着关键作用。小胶质细胞以其吞噬、炎症和损伤后的迁移能力而闻名 5,6,7。疾病中的星形胶质细胞反应同样多种多样,包括炎症、神经胶质瘢痕的形成和血脑屏障的损害 8,9。尽管我们对小胶质细胞和星形胶质细胞在中枢神经系统中的有害和修复作用的理解有所增长,但它们的结构和功能固有的异质性需要强大的工具来研究它们在各种情况下。
进一步了解小胶质细胞和星形胶质细胞在健康和疾病中的作用需要 体内 和 体外 研究的综合方法。 体内 技术利用神经胶质细胞和中枢神经系统内神经元之间错综复杂的串扰,而 体外 方法在评估特定刺激下的单细胞功能或反应时被证明是有价值的。每种方法都有独特的优势; 体外 研究对于了解这些细胞类型的特定作用至关重要,而无需来自邻近细胞的直接或间接输入。此外,利用永生细胞系的 体外 检测具有某些好处,包括无限增殖的能力、成本效益和易于维护。然而,重要的是要注意,与细胞系相比,原代细胞更接近地模仿正常的生理反应。这种生理相关性在功能测定和转录组学分析中至关重要。
获得原代细胞,特别是从成年小鼠脊髓中获取原代细胞的挑战之一在于样本的数量和活力。成人脊髓比大脑小,含有大量的髓鞘,这带来了独特的困难。虽然有几种已发表的方案详细说明了从新生动物或成年小鼠大脑中分离纯、活的神经胶质细胞10,11,12,13,但这些方法可能不适合研究脊髓特异性的疾病和损伤。在该方案中,我们提供了一个全面的程序,可以有效地从成年小鼠脊髓中分离纯、活的小胶质细胞和星形胶质细胞,促进细胞培养和转录组学分析的下游应用。该方案已成功用于从10周至5个月的成年小鼠中分离这些细胞,证明了其在各种情况下的实用性,包括涉及条件敲除小鼠的研究,药物反应,发育研究和年龄相关模型。
所有动物护理和实验程序均在乔治华盛顿大学医学与健康科学学院(美国华盛顿特区;IACUC#2021-004)。该研究利用了10周至5个月的雄性和雌性C57BL / 6J野生型(WT)小鼠,这些小鼠来自商业供应商(见 材料表)并安置在乔治华盛顿大学。协议工作流程的概述如 图 1 所示。
1.脊髓的准备
2. 酶促细胞解离
3.机械细胞解离
4. 髓鞘去除
5.小胶质细胞和星形胶质细胞分离
6. 用于 体外 检测的铺板细胞
注意:如果细胞不会被接种并立即用于RNA分析,请继续执行步骤8。
7. 免疫组化
注意:最好在至少 3 天后至少更换一次培养基后进行免疫组化分析。这确保了碎片已被清除,细胞已完全粘附在盖玻片上。
8. RNA提取
注意:理想情况下,至少应该有 100,000 个细胞来提取足够的 RNA 进行分析。如有必要,可以合并来自2-3个脊髓的细胞。
该协议中概述的方法能够从成年小鼠脊髓中分离纯和活的小胶质细胞和星形胶质细胞,促进各种下游应用,包括 体外 功能或组织学测定和RNA分析。
体 外 研究的成功分离将导致数天的细胞连续增殖。与从新生动物中分离的细胞相比,成体细胞的增殖速度较慢,并且在最初几天可能存在一些碎片。到 体外 4 天 (DIV) 时,细胞应基本清除碎片,大多数细胞粘附在烧瓶底部。星形胶质细胞将开始形成更长的突起,而小胶质细胞将呈现椭圆形和较短的纺锤体(图2)。到7 DIV时,星形胶质细胞应形成连接的汇合层,小胶质细胞应显示更少和更短的过程(图3)。
纯度可以通过用 GFAP 和 O4 双标记 ACSA2 分选的细胞来评估星形胶质细胞培养物中的少突胶质细胞污染,以及用 Iba1 和 GFAP 对 CD11b 分选的细胞来评估小胶质细胞培养物中的星形胶质细胞污染(表 1)。
成功的方案还将产生具有最小降解和足够数量的高质量RNA(图4A)。从分离细胞中提取的RNA电泳图应表现出突出的18S和28S峰。细胞过度解离或灌注和细胞分选之间的时间延长可导致RNA降解(图4B)。酶和/或机械解离不足或髓鞘去除不足可导致细胞产量和RNA降低(图4C)。可以对分离的星形胶质细胞进行测序以识别炎症标志物。将健康的星形胶质细胞与炎症激活的星形胶质细胞(例如,来自实验性自身免疫性脑脊髓炎动物)进行比较,将揭示健康与炎性星形胶质细胞中炎症通路的相对抑制(图4D)。

图 1:脊髓制备、组织解离和细胞分选概述。 该图概述了脊髓制备过程,包括组织解离和细胞分选。脊髓清扫后,组织发生酶解和机械解离。去除髓磷脂,用抗ACSA2或抗CD11b抗体标记细胞,以靶向星形胶质细胞和小胶质细胞。然后,分选的细胞可用于细胞培养和RNA分析。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 2: 体外 4 天 (4DIV) 时星形胶质细胞和小胶质细胞的相差图像。 (A) 描述了具有扩展过程的 ACSA2+ 分选细胞的代表性示例。(B) CD11b+ 细胞呈椭圆形细胞体和短突。比例尺 = 50 μm。该图改编自Ahn, J. J. et al.16。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 3: 体外 8 天 (8DIV) 时星形胶质细胞和小胶质细胞的荧光图像。 (A) 用 GFAP(绿色)和 O4(红色)标记的 ACSA2+ 细胞表现出最小的 O4 染色并形成相连的星形胶质细胞汇合层。(B) 用 Iba1(绿色)和 GFAP(红色)标记的 CD11b+ 细胞显示 GFAP 的存在极少。比例尺 = 50 μm。该图改编自Ahn, J. J. et al.16。 请点击这里查看此图的较大版本.

图4:RNA样品的代表性电泳图。 (A) 成功分离细胞后,有望获得高产量、高质量的 RNA。(B) 低产量、低质量 RNA 或 (C) 在细胞死亡、解离不充分或碎片清除不充分的情况下,可能会出现低产量、高质量的 RNA。(D) 对健康星形胶质细胞与炎性星形胶质细胞中选定的炎症途径的 RNA 测序分析显示,与炎性星形胶质细胞相比,分选的健康星形胶质细胞对炎症的相对抑制。 请点击这里查看此图的较大版本.
| 细胞类型 | 细胞总数 | 排序单元格 | 已排序/总计百分比 | 平均存活率百分比 |
| ACSA2型 | 约6.3×105 | 1.7 x 105 | 27 | 92 |
| CD11b型 | 约6.3×105 | 约8.0×104 | 12.7 | 93 |
表 1:ACSA-2 和 CD11b 细胞分选后的细胞产量、纯度和活力。 此表改编自 Ahn, J. J. et al.16。
没有
该方案概述了从成年小鼠脊髓中分离纯化的星形胶质细胞和小胶质细胞,促进了后续应用,如RNA分析和细胞培养。它包括详细的细胞解离方法和程序,旨在提高分离细胞的质量和产量。
我们感谢乔治华盛顿大学基因组学核心的 Castle Raley 进行 RNA 分析,并感谢 Q2 Lab Solutions 的 RNA 测序分析。这项工作得到了美国国家神经疾病和中风研究所[资助号F31NS117085]和Vivian Gill研究基金会对Robert H. Miller博士的支持。 图 1 是使用 BioRender.com 创建的。
| 2,2,2-三溴乙醇 | Sigma Aldrich | T48402 | |
| 24 孔组织培养板 | Avantor | 10861-558 | |
| 2-甲基-2-丁醇,98% | Thermo Fisher | A18304-0F | |
| 4',6-二脒基-2-苯吲哚,二盐酸盐 | Invitrogen | D1306 | 1:1000 |
| 45% 葡萄糖溶液 | 康宁 | 25-037-CI | |
| 5 mL 加盖管 | Eppendorf | 30122305 | |
| 乙酸 | Sigma-Adlrich | A6283 | |
| 成人脑解离试剂盒 | Miltenyi | 103-107-677 | |
| 抗 ACSA2 微珠试剂盒 | Miltenyi | 130-097-679 | |
| 抗 IBA1 | Wako | 019-1974 | |
| 生物分析仪 | 安捷伦 | C57BL | /6J 野生型 (WT) 小鼠G2939BA技术 |
| Jackson Laboratories | |||
| CD11b(小胶质细胞)微珠 | Miltenyi | 130-093-634 | |
| 细胞学 30 和微量;m 过滤器 | Sysmex Partec | 04-004-2326 | |
| 计数室(血细胞计数器) | Hausser Scientific Co | 3200 | |
| 来自牛胰腺的脱氧核糖核酸酶 I | Sigma Aldrich | D4527-40KU | |
| 蒸馏水 | TMO | 15230001 | |
| DMEM/F12 | Thermo Fisher | 11320074 | |
| 用于 RNA 纯化的 DNase | Qiagen | 79254 | |
| Dulbecco 磷酸盐缓冲盐水 | Thermo Fisher | 14040117 | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher | A5209401 | |
| GFAP 抗体(小鼠) | Santa Cruz | sc-33673 | 1:500 |
| GFAP 抗体(兔) | Dako | Z0334 | 1:500 |
| 山羊抗小鼠 594 IgG | Invitrogen | a11032 | 1:500 |
| 山羊抗小鼠 594 IgM | Invitrogen | a21044 | 1:300 |
| 山羊抗兔 488 IgG | Invitrogen | a11008 | 1:500 |
| Iba1 抗体(兔) | Wako | 019-1974 | 1:500 |
| MACS 分离器 | Miltenyi | 130-042-303 | |
| Masterflex C/L 泵系统 | Thermo Fisher | 77122-22 | |
| MEM | 康宁 | 15-015-CV | |
| 甲醇 | Sigma-Adlrich | 439193 | |
| 封固剂 | Vector Laboratories | H-1000-10 | |
| MS 色谱柱 | Miltenyi | 130-042-401 | |
| O4 抗体 | R&D | MAB1326 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15070063 | |
| 塞 9 英寸玻璃巴斯德移液器 | VWR | 14672-412 | |
| RNeasy Plus 微量套件 | Qiagen | 74034 | |
| Royal-tek 手术刀刀片 10 号 | Fisher scientific | 22-079-683 | |
| 小静脉输液器,23 G x 19 mm | Kawasumi | D3K2-23G |