细胞外囊泡在生物医学应用方面具有巨大的前景,但目前的分离方法对于临床应用来说既耗时又不切实际。在这项研究中,我们提出了一种微流体装置,该装置能够以最少的步骤以连续的方式从大量生物流体中直接分离细胞外囊泡。
方法文章
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细胞外囊泡在生物医学应用方面具有巨大的前景,但目前的分离方法对于临床应用来说既耗时又不切实际。在这项研究中,我们提出了一种微流体装置,该装置能够以最少的步骤以连续的方式从大量生物流体中直接分离细胞外囊泡。
细胞外囊泡 (EV) 在各种生物医学应用中具有巨大的潜力,包括诊断、药物递送和再生医学。然而,目前用于隔离电动汽车的方法存在重大挑战,例如复杂性、时间消耗和对笨重设备的需求,这阻碍了它们的临床转化。为了解决这些局限性,我们旨在开发一种基于环烯烃共聚物-化学计量-硫醇-烯 (COC-OSTE) 的创新微流控系统,用于从大体积样品中连续高效分离 EV。通过利用基于尺寸和浮力的分离,与现有的尿液和细胞培养基样品方法相比,本研究中使用的技术实现了明显更窄的尺寸分布,从而能够在未来的应用中靶向特定的 EV 尺寸分数。我们创新的COC-OSTE微流控装置设计利用分叉非对称流场-流动分离技术,为大体积样品提供了一种简单、连续的EV分离方法。此外,这种微流控设备的大规模制造潜力提供了可扩展性和一致性,使得将 EV 隔离集成到常规临床诊断和工业流程中成为可能,在这些流程中,高一致性和吞吐量是基本要求。
细胞外囊泡 (EV) 是细胞衍生的膜结合颗粒,包括两种主要类型:外泌体 (30-200 nm) 和微囊泡 (200-1000 nm)1。外泌体通过多囊泡体 (MVB) 内内体膜向内出芽形成,在与质膜融合后将腔内囊泡 (ILV) 释放到细胞外空间1。相反,微囊泡是由细胞膜的向外出芽和裂变产生的2.EV 通过转运蛋白质、核酸、脂质和代谢物,在细胞间通讯中发挥至关重要的作用,反映了细胞的生理状态,包括生长、血管生成、转移、增殖和治疗耐药性3。因此,它们已成为包括癌症在内的疾病的有前途的生物标志物和治疗靶点,凸显了它们在诊断和药物递送系统中的潜力4。
为了在疾病诊断和治疗中充分利用电动汽车,从各种生物流体中有效分离至关重要5.常用方法包括超速离心 (UC)、密度梯度离心、体积排阻色谱 (SEC)、过滤和免疫分离6。UC 是一种广泛使用的技术,但可能会产生密度相似的颗粒,这些颗粒不是 EV,并且可以产生 EV 聚集体7。SEC 之所以广受欢迎,是因为它能够通过根据大小而不是密度8 排除颗粒来提供更高纯度的样品。然而,仔细选择SEC色谱柱的适当孔径和优化色谱条件对于最大限度地减少乳糜微粒和低密度脂蛋白等不需要的颗粒的共分离至关重要8。尽管它们很有效,但这两种方法都非常耗时且难以实现自动化,特别是对于细胞培养基或尿液等大体积样品,这限制了它们在工业应用中的可扩展性9。
近年来,非对称场流场分馏(A4F)已发展成为一种强大的分离技术,用于基于尺寸和浮力的微纳米级颗粒分离10。A4F的工作原理依赖于在其底部具有多孔膜的微流体通道,从而产生施加在膜上的力,称为横流10。当与系统固有的布朗运动和泊塞耶流相结合时,由于流动动力学中颗粒位置的变化,错流有助于有效的颗粒分离11。尽管有这些优点,但该方法仅限于微升范围12 内的样品体积,并且需要额外的聚焦步骤,从而延长了过程10的持续时间。
在过去十年中,微流控技术作为快速、高效和临床上可靠的 EV 分离工具而备受瞩目13。然而,大多数设计用于 EV 分离的微流控方法都针对小体积、高浓度 EV 样品进行了优化,或者依赖于复杂的分离程序14。此外,在微流控领域,聚二甲基硅氧烷 (PDMS) 因其光学透明度、生物相容性和易用性而被公认为黄金标准材料15。然而,其已知的吸收亲脂性小分子(包括 EV)的倾向可能对其在 EV 领域的应用造成问题13。
环烯烃共聚物 (COC) 由于具有生物相容性、分子吸收小和耐化学性高等优点,是微流控中常用的材料15。然而,COC器件的制造往往涉及复杂的工艺或专用设备16。另外,非化学计量巯基烯 (OSTE) 是 PDMS 的一种很有前途的替代品,因为它减少了对小分子的吸收、优异的化学稳定性、易于制造和可扩展的制造工艺17,18。然而,由于与管道的复杂连接,设备可能容易泄漏19.
本研究的目的是设计和制造一种结合 OSTE 和 COC 以及分叉 A4F 原理的微流控装置,用于从大体积样品(如尿液或细胞培养基)中分离 EV。
拉脱维亚大学生命与医学科学研究伦理委员会批准了样本采集(第N0-71-35/54号决定)
注:本研究中使用的材料包含在 材料表 文件中。
1. 三维(3D)打印模具制造
2. PDMS模具的制备
3. OSTE-COC顶部通道的制备
4. OSTE-COC底部通道及器件组装的准备
5. 设备评估
6. 设备设置
7. 使用标准化乳胶珠进行设备测试
8. 尿液样本设备测试
9. 使用调节介质进行设备测试
10. 使用超速离心分离电动汽车
11. 使用尺寸排阻色谱(SEC)分离EV
第12章 EV特性
13. 国家税务总局
14. 用于EV标志物的dsELISA
我们使用3D打印的双负模(图1)通过软光刻(图2A)制造了一种微流控装置,用于基于分叉A4F原理的高通量EV分离(图2B,C)。如图 3 所示,该装置需要一个泵和一个流通站,以便以自动化方式隔离电动汽车。首先,为了评估器件的概念验证,制备了直径为 100 nm 和 1000 nm 的聚苯乙烯珠的混合物,分别代表囊泡和细细胞碎片10。在有和没有分岔流的情况下,对珠子混合物的不同流速进行了实验,以研究线速度对分离效率的影响。在所有实验中,小珠子的回收率保持一致,高于90%10,显示了该装置回收电动汽车的潜力。
然后,我们评估并比较了 COC-OSTE 设备在以最少的预处理从复杂生物流体中分离大体积 (>1 mL) EV 的潜力。因此,使用来自10个健康供体的尿液(图4)和来自两个不同前列腺细胞系的细胞培养基(图5)作为模板,按照三种不同的程序同时分离EV:超速离心(UC),尺寸排阻色谱(SEC)和基于A4F微流体的OSTE-COC装置。分离后,使用纳米颗粒跟踪分析(NTA)评估颗粒总数及其尺寸分布。平均而言,与UC相比,OSTE-COC装置从生物流体中显示出更好的总颗粒回收率,但只有在结合来自两个端口的颗粒数时才能实现统计学意义(图4A)。为了将设备性能与其他系统进行比较,应同时考虑R&L插座。如 图 4 所示,L 和 R 出口在回收 EV 上的性能优于 UC 和 SEC。 另外,L 端口设计用于捕获较小的 EV 部分,而 R 端口旨在收集较大的 EV 部分与其他类似大小的分子。有趣的是,使用OSTE-COC器件的R-PORT的回收率略高于单独的SEC和UC(图4A)。CD63表达显示出类似的模式(图4C)。这一发现表明,OSTE-COC设备在EV总回收率方面更有效。在不同的方法之间发现了等效的粒径分布,但UC除外,其显示出更大的粒径分布(图4B)。
在细胞培养基培养物中观察到类似的结果。在这两种情况下,与SEC或UC方法相比,两个设备端口的总颗粒回收率都表现出优异的性能(如图5A,B所示)。值得注意的是,与其他实验组相比,来自 PC3 细胞的 EV 表现出明显的大小分布,L-PORT 分布具有更大的均匀性(图 5C、D)。此外,CD63 表达的分析证实了使用 COC-OSTE 设备实现的更高的 EV 回收率(如图 5E、F 所示)。表1总结了本研究中检查的不同方法的分离特性。

图 1:3DP 蛇形双负模具尺寸和等轴测视图。 请点击这里查看此图的较大版本.

图2:COC-OSTE微流控装置。 (A)制造OSTE-COC装置的不同主要步骤的方案。(二)装置工作原理。(C) 成品设备的图像。比例尺:15毫米。该数字经Priedols等人10 和Bajo-Santos等人20许可修改。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 3:设备的实验配置。 注射泵在左边,OSTE-COC装置在中间,恢复站在右边。该数字经Priedols等人10 和Bajo-Santos等人20许可修改。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 4:使用超速离心 (UC)、尺寸排阻色谱 (SEC) 和 COC-OSTE 设备对 10 名供体的尿液 EV 大小分布和颗粒回收率。 (A)通过纳米颗粒跟踪分析(NTA)从每种分离方法中回收的颗粒量。数据表示为平均值 +/- 标准差。用 * (p<0.05) 表示的统计显著性。(B) 箱线图显示 NTA 评估的所有尿液样品的平均粒度分布,晶须表示最小值和最大值。P值通过与UC的比较得出,****表示高统计学意义(p<0.0001)。(C) 计算所有样品的平均 CD63 量的中位数和范围,使用双夹心酶联免疫吸附测定法 (dsELISA) 评估每种分离方法。L-port:左端口;R-port:右端口。该数字已经Bajo-Santos等人许可修改20。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 5:使用不同方法表征从 PC3 和 LNCaP 电池中分离的 EV。 (A) 使用纳米颗粒跟踪分析 (NTA) 从 PC3 培养基中回收的颗粒量,用平均值+/- 标准差表示。(B) 使用 NTA 从 LNCaP 细胞培养基中回收的颗粒量,表示为平均值 +/- 标准差。(C) 来自 PC3 培养物的 EV 的中位粒径分布以及范围由 NTA 确定。(D) 从 LNCaP 培养物中分离出的 EV 的中位大小分布和范围。(E) 使用双夹心酶联免疫吸附测定 (dsELISA) 对 PC3 细胞系衍生的 EV 的每种分离方法的 CD63 表达的中位数和范围。(F) 每种分离方法的 dsELISA 对 LNCaP 衍生的 EV CD63 表达的中位数和范围。UC:超速离心;SEC:尺寸排阻色谱法;L-port:左端口;R-port:右端口。该数字已经Bajo-Santos等人许可修改20。 请点击这里查看此图的较大版本.
| UC公司 | 秒 | COC-OSTE | |
| 处理时间/样品 | ++/+++ | +++ | + |
| 吞吐量 | ++ | + | +++ |
| 成本/样品 | + | +++ | ++ |
| 纯度 | + | +++ | ++ |
| 自动化 | ++ | + | +++ |
| EV产量 | ++ | ++ | +++ |
| 尺寸选择 | + | ++ | ++ |
表 1.电动汽车与UC、SEC和COC-OSTE器件三种方法的隔离特性比较。 UC:超速离心;SEC:尺寸排阻色谱法。COC-OSTE:环烯烃共聚物-脱化学计量-硫醇-烯。+:低;++:中等;+++:高。* 取决于设备。
所提出的微流控装置为从生物体液中分离和提取 EV 提供了一种很有前途的方法,解决了现有金标准方法(如 UC 和 SEC12)的一些关键局限性。众所周知,UC 和 SEC 是劳动密集型、耗时且产量低的问题,因此不太适合需要大量电动汽车的高通量应用21,22。相比之下,所描述的微流控装置可以以最少的用户输入连续处理高达 20 mL 的大量生物液体,使其成为工业或临床环境的潜在游戏规则改变者。与涉及手动步骤的传统方法相比,这种微流控装置的主要优点之一是它能够标准化 EV 隔离并提高可重复性。通过大规模制造减少电动汽车隔离设备制造的可变性,可以更好地控制设备的性能和一致性,这对于基于电动汽车的治疗和诊断等应用至关重要。此外,该器件通过反应注射成型合适的基材与大批量生产的兼容性进一步增强了其可扩展性和更广泛采用的潜力。
为了确保可重复性和一致的性能,无论是生产芯片还是在实验中使用,都需要一个广泛且定义明确的方案。该芯片在设计时考虑了工业化。然而,在实验室环境中制造设备时,必须注意避免气泡的形成,确保精确和坚固的粘合,并以比实际实验中预期的更高的流速进行彻底的测试。这种预防措施对于COC-OSTE设备尤为重要,因为它们可能由于粘接不成功而容易泄漏,尤其是在较高流速下。此外,由于OSTE是一种感光材料,因此器件制造应在黄光下进行,以避免不必要的紫外线照射。由于这项技术仍处于初始阶段,研究人员应该尝试不同的流速,以确定其特定应用的最佳设置,因为这种新方法的标准化方案尚未建立,并且根据我们的结果,液体粘度会明显影响 EV 隔离效果。通过遵循这些指南并应对标准化的挑战,这种微流控设备在电动汽车隔离方面的潜力可以在各种研究领域和应用中得到充分实现。
使用微流控装置的 EV 隔离方法允许进行广泛的修改和故障排除以优化性能。为了改善颗粒分离,研究人员可以探索更长的通道、不同的膜孔隙率和孔密度以及改变的尺寸。如果小颗粒出口中有很多大颗粒,则测试更高的缓冲液入口速度可能是有益的,而如果大颗粒出口中有许多小颗粒,则建议使用更长的通道或具有较大孔隙的膜进行实验。解决颗粒吸收问题可能涉及调整流速、表面改性和 OSTE 成分或改变紫外线照射时间。对于遇到不稳定和泄漏的设备,降低流速和确保正确涂胶是关键步骤。为了最大限度地减少 EV 损坏,研究人员可以降低流速,在设备灭菌后用 PBS 更彻底地清洗,并考虑使用更小的膜孔或替代模具设计技术和材料。通过这些调整,可以对微流控装置进行微调,释放其在电动汽车研究和相关领域的各种应用潜力。此外,为了优化设备的性能,可以结合上游样品表征,包括密度和粘度测量,以调整流量参数。此外,鉴于生物流体的既定非无菌性,必须特别强调样品的性质23.因此,应适当考虑在临床应用中施用样品之前对样品进行灭菌。
尽管存在这些挑战,但微流控装置在各个研究领域都具有巨大的潜力。它能够从大量高度异质的样品中连续分离电动汽车,为自动化打开了大门,促进了高通量应用,并能够对来自不同来源的电动汽车进行更深入的分析。将这种微流控模块集成到不同的设备中,例如中空纤维细胞生物反应器小柱或高分辨率流式细胞仪,可以使电动汽车应用对行业更加友好,并推动药物输送、诊断和化妆品等领域的创新4。总体而言,这种微流控器件代表了电动汽车研究领域向前迈出的重要一步,为电动汽车隔离提供了一种高效和标准化的方法,在广泛的研究和工业环境中具有广阔的应用前景。
A.A.、G.M. 和 R.R. 是 Cellbox Labs, LLC 的创始人、董事会成员和股东
我们感谢所有参与这项研究的捐助者,感谢拉脱维亚基因组数据库的工作人员提供样本。拉脱维亚大学固体物理研究所作为卓越中心,根据项目CAMART2第739508号赠款协议,获得了欧盟地平线2020框架计划H2020-WIDESPREAD-01-2016-2017-TeamongPhase2的资助。这项工作得到了拉脱维亚科学委员会项目编号的支持。LZP-2019/1-0142 和项目编号:LZP-2022/1-0373。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 0.1 和微量;m 羧酸盐 FluoSpheres | Invitrogen | #F8803 | 储备液浓度:3.6 x 1013 个珠子/mL(取决于 LOT) |
| 0.5 mL 微量离心管 | Starstedt | 72.704 | |
| 1 mL 鲁尔锥头注射器,一次性使用,无针 | RAYS | TUB1ML | |
| 1.0 µm 聚苯乙烯 FluoSpheres | Invitrogen | #F13083 | 储备液浓度:1 x 1010 个珠子/mL(取决于 LOT) |
| 10 mL 血清移液管 | Sarstedt | 86.1254.001 | |
| 15 mL (100k) Amicon Ultra 离心过滤器 | Merck Millipore | UFC910024 | |
| 2.0 mL 蛋白 LoBind 管 | Eppendorf | 30108132 | |
| 20 mL 注射器 | BD PlastikPak | ||
| 250 和微型;m ID 聚醚醚酮管 | Darwin Microfluidics | CIL-1581 | |
| 3 kDa MWCO 离心过滤装置 | Merck Millipore,UFC200324 | ||
| 5 mL 无针医用注射器 | 安徽宏宇 五洲医用 | 159646 | |
| 50 mL 锥形管 | Sarstedt | 62.547.254 | |
| 70 Ti 固定角超速离心机转子 | Beckman Coulter | ||
| 800 和微型;m ID 聚四氟乙烯管 | Darwin 微流体 | LVF-KTU-15 | |
| 96 孔微孔板,f-底,医学结合 | Greiner Bio-One | 655001 | ELISA 板 |
| B-27 补充剂 (50x),无血清 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | |
| 牛血清白蛋白 | SigmaAldrich | A7906-100G | |
| COC Topas 显微镜载玻片平台 | 微流体芯片车间 | 10000002 | |
| COC Topas 显微镜载玻片平台 2 x 16 迷你鲁尔 | 微流体芯片车间 | 10000387 | |
| Elveflow OB1 压力控制器 | Elvesys Group | ||
| 鲁尔连接器 | 达尔文微流体 | CS-10000095 | |
| 掩模对准器 Suss MA/BA6 | SUSS MicroTec Group | ||
| 混合器 Thinky ARE-250 | Thinky Corporation | ||
| NanoSight NS300 | Malvern Panalytical | NS300 | 纳米粒子分析仪 |
| 光学显微镜 尼康 Eclipse LV150N | 尼康计量 NV | ||
| OSTE 322 晶莹剔 | Mercene Labs | ||
| PBS TABLETS.Ca/Mg 免费。Fisher 生物试剂。100 g | Fisher Scientific | BP2944-100 | |
| PC 膜(孔径 50 nm,密度 11.8%) | it4ip S.A.,比利时 | ||
| 皿 培养皿,无菌 | Sarstedt | 82.1472.001 | |
| 等离子体灰振 GIGAbatch 360 M | PVA TePla America, LLC | ||
| qEVoriginal/35 nm 色谱柱 | Izon | SP5 | SEC 色谱柱 |
| QSIL 216 有机硅弹性体套件 | PP&S | ||
| 树脂 Tough Black | Zortrax | ||
| SW40 Ti 摆动超速离心机转子 | Beckman Coulter | 331301 | |
| 注射泵 | DK Infusetek | ISPLab002 | |
| T175 悬浮瓶 | Sarstedt | 83.3912.502 | |
| TIM4-Fc 蛋白 | Adipogen LifeSciences | AG-40B-0180B-3010 | |
| TMB(3,3',5,5'-四甲基联苯胺) | SigmaAldrich | T0440-100ML | 辣根过氧化物酶底物 |
| Tween20 | SigmaAldrich | P1379-100ML | |
| 超速离心机 Optima L100XP | Beckman Coulter | ||
| 超声波清洗装置 P 60 H | Elma Schmidbauer GmbH | ||
| 通用型微孔板分光光度计 | Bio-Tek instruments | 71777-1 | |
| 收集杯,150mL,无菌 | APTACA | 2120_SG | |
| Whatman Anotop 25针头过滤器 | SigmaAldrich | 68092002 | |
| Zetasizer Nano ZS | Malvern Panalytical | 动态光散射(DLS)系统 | |
| Zortrax Inkspire | Zortrax |
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