我们的详细方案概述了先进的肠芯片模型的构建与使用方法,该模型可模拟具有三维结构和多种细胞类型的肠黏膜,从而能够深入分析微生物定植引发的免疫反应和细胞功能。
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我们的详细方案概述了先进的肠芯片模型的构建与使用方法,该模型可模拟具有三维结构和多种细胞类型的肠黏膜,从而能够深入分析微生物定植引发的免疫反应和细胞功能。
一种先进的肠芯片模型已被开发出来,可重建上皮细胞三维类器官样绒毛结构和隐窝样结构。该具有免疫活性的模型包含人脐静脉内皮细胞(HUVEC)、Caco-2 肠道上皮细胞、组织驻留型巨噬细胞以及树突状细胞,这些细胞可在组织内自发形成有序结构,模拟人类肠道黏膜的特征。该平台的一个独特之处在于能够整合循环的人原代免疫细胞,从而增强其生理相关性。该模型旨在研究肠道免疫系统对细菌和真菌定植及感染的响应。由于其腔室尺寸增大,该模型可实现多种功能性检测,包括通透性测定、细胞因子释放和免疫细胞浸润,并兼容对上皮细胞层形成的三维结构进行免疫荧光检测。因此,该模型可全面揭示细胞分化与功能特征。该肠芯片平台已展现出在微生理灌注式生物芯片系统中解析活体微生物群替代物与人类宿主组织之间复杂相互作用的潜力。
器官芯片(Organ-on-Chip, OoC)系统是一种新兴的三维细胞培养技术,能够弥合传统二维细胞培养与动物模型之间的差距。OoC 平台通常包含一个或多个腔室,其中在多种支架(如膜材料或水凝胶)上培养具有组织特异性的细胞1。这些模型能够模拟一种或多种明确的器官特异性功能。通过泵系统实现细胞培养基的持续微流控灌注,以清除细胞代谢废物,提供营养物质和生长因子,促进细胞分化,并重现关键的体内(in vivo)环境条件。当整合免疫细胞后,OoC 系统可在体外(in vitro)模拟人体免疫反应2。迄今为止,已有多种器官和功能单元的模型被成功构建1,包括血管3、肺4、肝2,5和肠6模型,这些系统可用于药物测试5,7和感染机制研究6,8。
本文介绍一种集成化的人体肠芯片模型,该模型结合了形成绒毛样和隐窝样类器官三维拓扑结构的人体上皮细胞,并整合了内皮细胞层以及组织驻留型巨噬细胞。该模型在一种显微镜载片规格的微流控灌注式生物芯片中进行培养。 每块生物芯片包含两个独立的微流控腔室。每个腔室由一层多孔聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)膜分隔为上室和下室。该膜本身亦作为细胞在两侧生长的支架。膜上的孔隙可实现细胞层之间的细胞互作及细胞迁移。每个腔室均可通过两个雌性鲁尔锁接头尺寸的端口进行操作。此外,可选配一个额外的微型鲁尔锁接头尺寸端口,用于通达上室或下室(图1)。
器官芯片(OoC)平台能够从单次实验中获取多种读数。肠芯片专门设计用于结合灌注式三维细胞培养、流出液分析和荧光显微镜技术,以评估细胞标志物表达、代谢速率、免疫反应、微生物定植与感染以及屏障功能3,6,8。该模型包含组织驻留的免疫细胞,并实现了活体微生物与宿主组织的直接接触,相较于其他已发表的模型具有优势9。此外,上皮细胞可自组织形成三维结构,为活体微生物群的定植提供生理相关的界面6。
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本方案需要从健康供者获取每块生物芯片约 20 mL 的新鲜血液,以分离原代人单核细胞。所有供者均签署书面知情同意书,同意参与本研究,该研究已获得耶拿大学医院伦理委员会批准(许可编号 2018-1052-BO)。有关材料的详细信息,请参见材料表。有关所有溶液和培养基成分的详细信息,请参见表 1。
1. 生物芯片操作的一般注意事项

图 1:肠芯片模型的示意图。(A)以横截面视图展示生物芯片。(B)可见整个生物芯片以及扁平可拆卸的PET膜的尺寸。上腔室(包括雌性鲁尔锁式接口)的总体积为290 µL,下腔室为270 µL。(C)可观察到肠道生物芯片的示意图组成,包括呈现绒毛样和隐窝样结构的三维外生长上皮、分化后的免疫细胞以及黏液层。PET膜的另一侧由单层内皮细胞覆盖。请点击此处查看该图的放大版本。

图2:模型构建时间线及实验装置示意图。 本图展示了本方案的总体示意图。重要的操作步骤,例如细胞接种以及上皮层与脂多糖(LPS)的刺激,均以箭头标示。缩写:HUVECs = human umbilical venous endothelial cells;LPS = lipopolysaccharide。请点击此处查看此图的放大版本。
2. 生物芯片灭菌
3. 人脐静脉内皮细胞的收获与接种
注意:人脐静脉内皮细胞(HUVECs)的分离自脐带,方法如先前文献所述10。
4. 人血清采集及外周血单个核细胞(PBMC)来源的单核细胞分离
注意:外周血单个核细胞(PBMC)的分离方法如 Mosig 等人11所述。
5. 单核细胞接种
6. C2BBe1 细胞的收获与接种
注意:Caco-2 刷状缘表达细胞 1(C2BBe1)12 使用代数不超过第 35 代,取自融合度为 80–90% 的培养瓶。图 3C 展示了 C2BBe1 培养物的代表性明场图像。

图3:在接种到生物芯片之前,HUVECs、单核细胞和C2BBe1的细胞形态。 本图展示了在整个实验方案中所使用的不同细胞来源的代表性明场图像。图像使用倒置明场显微镜在10倍放大倍数下拍摄。所有细胞类型,(A)HUVECs、(B)单核细胞和(C)C2BBe1均按照各自特定的实验方案部分所述,在二维单层细胞培养体系中进行培养。比例尺 = 200 µm。缩写:HUVECs = 人脐静脉内皮细胞;PBMCs = 外周血单个核细胞。 请点击此处查看该图的高清版本。
7. 连接至蠕动泵与循环灌注

图4:连接至蠕动泵的生物芯片。图中展示了一个连接至蠕动泵的生物芯片示例。上皮细胞C2BBe1在下层腔室中培养(前方储液池中为红色的C2培养基),而HUVECs细胞则在上层腔室中培养(后方储液池中为淡黄色的EC条件培养基)。由于所形成的组织具有屏障功能,不同细胞培养基之间不会混合。生物芯片以特定方式连接至蠕动泵,使培养基从储液池流入腔室,再通过泵驱动经管道流回储液池。请点击此处查看该图的放大版本。
8. 上皮屏障的LPS预处理
9. 采用不同检测方法获取组织样本
10. 通过FITC-葡聚糖扩散评估通透性
注意:在断开蠕动泵后,可通过异硫氰酸荧光素标记的葡聚糖(FITC-dextran)通透性实验分析组织的屏障功能。FITC-dextran通透性评估方法参考自Deinhardt-Emmer等人的研究4。
11. 免疫荧光染色
注意:可对活体组织进行显微镜观察。为便于操作,建议将生物芯片从蠕动泵上取下,并在倒置显微镜上使用长工作距离物镜。作为终点分析,可在生物芯片内对组织进行固定,用于免疫荧光染色等实验操作。
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这些代表性结果展示了器官芯片模型中肠组织的不同层次结构。组织经免疫荧光染色处理,具体步骤见方案第11部分。图像采用落射荧光显微镜或共聚焦荧光显微镜进行z轴层扫采集,并处理为正交投影图。显微镜设备及软件的详细信息请参见材料表。图5显示了血管层,即由HUVECs和巨噬细胞构成的具有屏障功能的内皮单层。代表性细胞标志物包括内皮细胞的VE-钙黏蛋白(VE-Cadherin)和血管性血友病因子(von Willebrand factor),以及巨噬细胞的CD68,均已进行染色标记。图6和图7展示了由C2BBe1细胞构成的三维上皮层。通过E-钙黏蛋白(E-Cadherin)和ZO-1染色证实了组织完整性。所有预期组织标志物及组织极性的详细分析可参见Maurer等人的研究6。图8展示了一张缺乏肠绒毛样三维结构外凸生长的典型图像。与典型...
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本方案详细介绍了构建具有免疫活性的肠芯片模型所需的各个步骤。我们描述了具体的技术方法以及可能的检测手段,包括免疫荧光显微镜、细胞因子和代谢物分析、流式细胞术、蛋白质和基因分析,以及通透性测定。
该模型由原代人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、单核细胞来源的巨噬细胞和单核细胞来源的树突状细胞组成,并与一层三维培养的肠上皮细胞共培养,后者包含分泌黏液型、吸收型、肠内分泌型以及类似潘氏细胞的细胞群体,如先前研究所述6,14。在执行本实验方案的各个步骤时,需注意若干关键要点。在整个操作过程中,应避免微流控系统中产生气泡。因此,在操作生物芯片或管路时,始终采用反向移液法(从第二停点吸取液体,并仅释放至第一停点)。为防止对生物芯片内的细胞造成过高压力或剪切力,移液时务必轻柔操作,并在向生物芯片内加样时保持相对腔室处于封闭状态(例如,在更换上腔培养基时,应使用相应塞子封闭下腔)。该生物芯片允许在聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)膜的两侧接种细胞。因此,该模型可构建为在PET膜下方形成类...
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M.R. 是 Dynamic42 GmbH 的首席执行官,并持有该公司股权。A.S.M. 是 Dynamic42 GmbH 的科学顾问,并持有该公司股权。
本工作由合作研究中心PolyTarget 1278(项目编号316213987)为V.D.W.和A.S.M.提供资金支持。A.F.和A.S.M.还感谢德国卓越战略计划下的卓越集群“"微生物组平衡"”提供的额外资金支持——卓越集群EXC 2051,项目编号690 390713860。我们感谢Astrid Tannert以及耶拿生物光子学与成像实验室(JBIL)为我们提供使用其蔡司共聚焦激光扫描显微镜ZEISS LSM980的机会。图1C 和图2使用Biorender.com制作。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 96孔板,黑色,透明底 | 赛默飞世尔科技 | 10000631 | 耗材 |
| 乙酸 | Roth | 3738.4 | 化学品 |
| Alexa Fluor 488 AffiniPure 山羊抗小鼠 IgG(H+L) | 杰克逊免疫研究公司 | 715-545-150 | 次级抗体血管染色与上皮染色 |
| Alexa Fluor 647 AffiniPure,驴抗兔IgG(H+L) | 杰克逊免疫研究公司 | 711-605-152 | 二抗上皮染色 |
| Alexa Fluor 647,驴抗兔IgG(H+L) | 赛默飞世尔科技,英坦科技 | A31573 | 二抗血管染色 |
| Axiocam ERc5s 相机 | 蔡司 | 426540-9901-000 | 技术设备 |
| 无酚红基础培养基 MV | Promocell | C-22225 | 细胞培养耗材 |
| 生物芯片 | 动态 42 | BC002 | 微流控耗材 |
| BSA 第 V 组分 | Gibco | 15260-037 | 细胞培养耗材 |
| C2BBe1(Caco-2 克隆) | ATCC | CRL-2102 | 上皮细胞来源 |
| 氯仿 | Sigma | C2432 | 化学品 |
| CO2 培养箱 | Heracell | 150i | 技术设备 |
| 人胎盘IV型胶原蛋白 | Sigma-Aldrich | C5533 | 细胞培养耗材 |
| 盖玻片(24 × 40 mm;#1.5) | Menzel-Glä血清 | 15747592 | 耗材 |
| Cy3 AffiniPure,驴抗山羊IgG(H+L) | 杰克逊免疫研究公司 | 705-165-147 | 二抗血管染色 |
| Cy3 AffiniPure,驴抗大鼠IgG(H+L) | 杰克逊免疫研究公司 | 712-165-150 | 二抗上皮染色 |
| 德科赛普特 PUR | Dr. Schuhmacher | 00-323-100 | 细胞培养耗材 |
| DMEM高糖 | Gibco | 41965-062 | 细胞培养耗材 |
| DMEM高糖无酚红培养基 | Gibco | 31053028 | 细胞培养耗材 |
| DPBS (-/-) | Gibco | 14190-169 | 细胞培养耗材 |
| DPBS (+/+) | Gibco | 14040-133 | 细胞培养耗材 |
| EDTA 溶液 | Invitrogen | 15575-038 | 细胞培养耗材 |
| 内皮细胞生长培养基 | Promocell | C-22020 | 细胞培养耗材 |
| 内皮细胞生长培养基添加剂混合物 | Promocell | C-39225 | 细胞培养耗材 |
| 乙醇 96%,未变性 | Nordbrand-Nordhausen | 410 | 化学品 |
| 胎牛血清 | invitrogen | 10270106 | 细胞培养耗材 |
| 异硫氰酸荧光素(FITC)-葡聚糖(3-5 kDa) | Sigma Aldrich | FD4-100MG | 化学品 |
| 荧光封片剂 | Dako | S3023 | 化学品 |
| 庆大霉素(10 mg/mL) | Sigma Aldrich | G1272 | 细胞培养耗材 |
| GlutaMAX 补充剂(100 倍浓缩) | Gibco | 35050061 | 细胞培养耗材 |
| Histopaque | Sigma-Aldrich | 10771 | 细胞培养耗材 |
| Hoechst(双苯并咪唑)H33342 | Sigma-Aldrich | 14533 | 上皮染色 |
| 全转铁蛋白(5 mg/mL),转铁蛋白,全型,人血浆 | 默克密理博 | 616397 | 细胞培养耗材 |
| 人重组粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | 300-30 | 细胞培养耗材 |
| 人重组 M-CSF | Peprotech | 300-25 | 细胞培养耗材 |
| 照明装置 | Zeiss | HXP 120 C | 荧光显微镜设置 |
| 激光扫描显微镜 | Zeiss | CLSM980 | 荧光显微镜设置 |
| 盐酸利多卡因 | Sigma-Aldrich | L5647 | 细胞培养耗材 |
| 脂多糖(LPS) | Sigma | L2630 | 细胞培养耗材 |
| Loftex 湿巾 | Loftex | 1250115 | 耗材 |
| 低吸附管(聚苯乙烯,5 mL) | Falcon | 352052 | 耗材 |
| 顶部盖帽用鲁尔接头(M) | Mo Bi Tec | M3003 | 微流控耗材 |
| 雄性迷你鲁尔接头塞,四联排,聚丙烯材质,不透明 | 微流控芯片实验室 | 09-0556-0336-09 | 微流控耗材 |
| MEM非必需氨基酸溶液 | Gibco | 11140 | 细胞培养耗材 |
| 甲醇 | Roth | 8388.2 | 化学品 |
| 显微镜 | Zeiss | Axio Observer 5 | 荧光显微镜设置 |
| 显微镜载玻片 | Menzel | MZ-0002 | 耗材 |
| 单克隆小鼠抗人CD68抗体(KP1) | 赛默飞世尔科技,英坦科技 | 14-0688-82 | 初级抗体血管染色 |
| 单克隆大鼠抗人E-钙黏蛋白抗体(DECMA-1) | Sigma-Aldrich,Millipore | MABT26 | 一抗上皮染色 |
| Multiskan Go 酶标仪 | 赛默飞世尔科技 | 51119300 | 技术设备 |
| 正常驴血清 | Biozol | LIN-END9010-10 | 化学品 |
| 光学切片 | Zeiss | ApoTome | 荧光显微镜设置 |
| 青霉素-链霉素(10,000 U/mL) | Gibco | 15140-122 | 细胞培养耗材 |
| 凝胶塞 | Cole Parmer | GZ-45555-56 | 微流控耗材 |
| 多克隆山羊抗人血管内皮钙黏蛋白抗体 | R&D Systems | AF938 | 初级抗体血管染色 |
| 多克隆兔抗人血管性血友病因子抗体 | Dako | A0082 | 初级抗体血管染色 |
| 多克隆兔抗人 ZO-1 抗体 | 赛默飞世尔科技,英坦科技 | 61-7300 | 一抗上皮染色 |
| 电源显微镜 | Zeiss | Eplax Vp232 | 荧光显微镜设置 |
| Primovert 显微镜 | Zeiss | 415510-1101-000 | 技术设备 |
| Reglo ICC 蠕动泵 | Ismatec | ISM4412 | 技术设备 |
| SAHA(伏立诺他) | Sigma Aldrich | SML0061-25MG | 化学品 |
| 皂苷 | Fluka | 47036 | 化学品 |
| S-Monovette,7.5 mL Z-凝胶管 | Sarstedt | 01.1602 | 耗材 |
| S-Monovette,9.0 mL K3E | Sarstedt | 02.1066.001 | 耗材 |
| 丙酮酸钠 | Gibco | 11360-088 | 细胞培养耗材 |
| 4.5 mL 储液罐 | ChipShop | 10000079 | 微流控耗材 |
| 0.4% 台盼蓝染色液 | Invitrogen | T10282 | 细胞培养耗材 |
| 胰蛋白酶 | Gibco | 11538876 | 细胞培养耗材 |
| 导管 | 动态 42 | ST001 | 微流控耗材 |
| 镊子(PräDUMONT 弯头镊子 Inox08,5/45,0.06 mm | Roth | K343.1 | 耗材 |
| 麦胚凝集素(WGA) | 赛默飞世尔科技,英坦科技 | W32464 | 上皮染色 |
| X-VIVO 15 | Lonza | BE02-060F | 细胞培养耗材,造血细胞培养基 |
| 细胞培养多孔板,24 孔,无菌 | Greiner Bio-One | 662 160 | 耗材 |
| 细胞培养多孔板,6 孔,无菌 | Greiner Bio-One | 657 160 | 耗材 |
| Zen Blue 软件 | Zeiss | 版本 3.7 | 显微镜软件 |
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