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方法文章

从健康猪新鲜粪便中分离、纯化及鉴定产杆菌肽的Bacillus licheniformis

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DOI:

10.3791/66777

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2024年5月31日

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本文内容

摘要

本方案详细描述了从健康猪粪便中分离、纯化和鉴定产杆菌肽的Bacillus licheniformis的完整且系统的过程。

摘要

Bacillus licheniformis 及杆菌肽在医药、化工、水产养殖、农业及农副产品等领域具有巨大的应用市场和价值。因此,选育高产杆菌肽的 B. licheniformis 具有重要意义。本实验方案从健康猪的新鲜粪便中分离、纯化并鉴定了高产杆菌肽的 Bacillus 菌株,同时检测了其次级代谢产物杆菌肽对 Micrococcus luteus 的抑制作用。采用薄层色谱法和高效液相色谱法对杆菌肽进行定性和定量检测。通过相关试剂盒测定 B. licheniformis 的生理生化特性。利用基因序列检测分析并构建 B. licheniformis 的系统发育关系。本方案从多个角度系统描述和介绍了从动物新鲜粪便中分离、纯化和鉴定 B. licheniformis 的标准化流程,为工厂化大规模利用 B. licheniformis 及杆菌肽提供了方法支持。

引言

Bacillus licheniformis 是厚壁菌门(Firmicutes)芽孢杆菌属(Bacillus)的一个物种,广泛分布于水体、土壤及动物肠道等多种环境中1。B. licheniformis 呈短粗杆状,独立运动2。菌落近圆形,表面 dull,中央隆起,边缘整齐,呈灰白色3。其生长与繁殖能力强,可吸收并利用多种碳源中的营养物质,如单糖、多糖、酮糖和有机酸4。在生长发育后期,B. licheniformis 可以休眠孢子形式存在,并产生杆菌肽、地衣素和表面活性素等抗菌物质,同时能够耐受营养缺乏和极端外界环境5。该菌无明显密码子偏好性,其高效的分泌系统决定了其异源蛋白分泌能力可达Bacillus subtilis的两倍6。常用于生产蛋白酶、淀粉酶和纤维素酶等酶制剂7。由于不含内源性毒素,已被欧洲食品安全局(EFSA)认证为食品安全菌株,并列入合格推定安全(QPS)名单8。因此,B. licheniformis 在水产养殖、农....

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方案

所有实验程序均经南京工业大学伦理委员会记录并批准。粪便样品来源于约2年龄的太湖母猪(见材料表),这些母猪饲养于专业且标准化的养猪场。

1. 培养基的制备

  1. LB 液体培养基:取 10 g NaCl、5 g 酵母提取物粉末和 10 g 胰蛋白胨加入锥形瓶中,加入蒸馏水至 1 L,用玻璃棒搅拌并溶解。将 100 mL 培养基转移至 500 mL 锥形瓶中,并用透气封口膜 tightly 封口。在高压灭菌锅中于 121 °C 灭菌 20 min(参见 材料表)。
  2. LB 固体培养基:取 10 g NaCl、5 g 酵母提取物粉末、10 g 胰蛋白胨和 20 g 琼脂粉加入锥形瓶中,加蒸馏水至 1 L,用玻璃棒搅拌溶解后,用透气封口膜 tightly 封口。在高压灭菌锅中于 121 °C 灭菌 20 min。当培养基冷却至 50 °C 时,向每个培养皿中倒入 20 mL 培养基,待其冷却凝固后倒置存放。
  3. 杆菌肽发酵培养基:取 8 g 豆粕、4 g 可溶性淀粉、0.1 g (NH4)2SO4、0.6 g CaCO3 和 100 mL 蒸馏水加入 500 mL 锥形瓶中,用玻璃棒搅拌至充分溶解,并用透气封口膜 tightly 封口。在高压灭菌....

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结果

本实验从健康猪的新鲜粪便中分离出48株Bacillus,编号为1001至1048。其中,15株对M. luteus具有抗菌活性。对这15株菌株采用高效液相色谱法测定其杆菌肽效价,结果如表1所示。B. licheniformis No. 1026的杆菌肽效价最高,为456.35 ± 21.75 U/mL,因此选择No. 1026用于后续实验。

薄层色谱(TLC)的鉴定结果如图2A所示。菌株1026发酵液与杆菌肽标准品的主要斑点位置相同,Rf值为0.61。高效液相色谱(HPLC)分析中,杆菌肽的标准曲线方程为 y = 50.287x - 250.55,相关系数 R2 = 0.9968(图2B)。发酵上清液的出峰时间与杆菌肽标准品一致(图2C),因此确定该抑菌物质.......

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讨论

B. licheniformis 在简单的培养条件下生长迅速且糖消耗快,成熟的发酵技术有助于降低工业生产成本13. 该技术的广泛应用 B. licheniformis 及其分泌物杆菌肽已显示出巨大的市场价值。在农业中, B. licheniformis 用作生物肥料,通过提高土壤肥力、促进根系发育以及协助有机物降解,从而改善植物生长和养分吸收15用于工业酶的生产, B. licheniformis 可产生多种酶,如蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶和脂肪酶,这决定了其在食品加工、洗涤剂制造、皮革处理和纺织工业中不可替代的市场价值16鉴于其优异的抗菌药理活性 B. licheniformis 以及杆菌肽,已在医学领域用于治疗由细菌和真菌引起的各种感染性疾病1同时,考虑到药用植物的生长以及植物中药理活性成分的积累, B. licheniformis 是一种.......

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

本研究由国家重点研发计划(编号:2022YFC2104800)和江苏省“六大人才高峰”项目(编号:2019-NY-058)资助。

....

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
2 × Phanta Flash Master Mix中国南京诺唯赞生物科技股份有限公司,南京,中国P252-01
2kb DNA Marker中国北京博奥生物技术有限公司,中国北京BM121-01
乙腈中国上海阿拉丁生化科技有限公司,中国上海A104443
琼脂粉中国上海麦克林生化科技有限公司,中国上海A800730
琼脂糖中国上海阿拉丁生化科技股份有限公司,中国上海A104062
硫酸铵 ((NH₄)₂SO₄)4)2SO4)中国上海,国药集团化学试剂有限公司10002917
高压灭菌器中国厦门,泽瓦仪器有限公司GI36DWS
芽孢杆菌生化鉴定条中国青岛海博生物技术有限公司,中国青岛HBIG14
杆菌肽中国上海,上海源叶生物科技有限公司B65740
细菌DNA提取试剂盒中国北京,天根生化科技有限公司DP209
透气封膜北京雷博润生物科技有限公司BS-QM-01A
丁醇中国上海阿拉丁生化科技有限公司,中国上海B433378
C18 (5 μ米,4.6 × 250 mm)HPLC 柱中国日照科普诺新材料有限公司,日照,中国C1805-462510
碳酸钙(CaCO₃)3)中国上海,国药集团化学试剂有限公司10005717
离心New Brunswick Scientific Co., Inc.,英国5452
色谱缸 中国南京腾辉实验技术有限公司,中国南京P-1
锥形瓶四川树博  有限公司,中国成都18012
恒温培养箱中国天津,Taist Instrument Co., Ltd.GH4500
磷酸氢二钾(K₂HPO₄)2HPO4)中国广东,西龙化工有限公司XL0015
EDTA-2Na中国上海阿拉丁生化科技有限公司,中国上海E397526
电子天平Mettler Toledo International Co., Ltd.FA2104
乙醇中国上海阿拉丁生化科技有限公司,上海,中国E130059
Gel Midi 纯化试剂盒中国北京,天根生化科技有限公司DP302
玻璃棒成都一邦科析仪器有限公司1294
葡萄糖中国上海麦克林生化科技有限公司,中国上海D823520
革兰染色液试剂盒中国青岛海博生物技术有限公司,中国青岛HB8278
高效液相色谱仪美国加利福尼亚州,安捷伦科技有限公司1260
水平电泳装置中国北京,北京六一生物科技有限公司DYCP-31DN BIOMATE
接种环中国上海,上海慕晨生物科技有限公司3171026
磁力搅拌器Wiggens GmbH Co., Ltd.,德国WH220 PLUS
甲醇中国上海阿拉丁生化科技有限公司,上海,中国M116115
微量离心管中国上海,上海慕晨生物科技有限公司1351171
Micrococcus luteus中国苏州贝那生物样本库BNCC102589
微孔滤膜南通苏尔实验设备有限公司PES0.22
茚三酮中国上海阿拉丁生化科技有限公司,中国上海N105629
光学显微镜中国上海光学仪器厂DYS-108
猪粪便中国南京全福养猪场
聚合酶链式反应(PCR)扩增仪中国苏州,苏州东升兴业科学仪器有限公司ETC811
专业测序公司中国安徽安徽通用生物有限公司,中国安徽
吡啶中国上海阿拉丁生化科技有限公司,中国上海P111516
摇床中国太仓启朗实验设备有限公司,中国太仓HYL-C
硅胶GF254薄层板中国烟台华阳新材料有限公司,中国烟台HPT-HSGF5025023
氯化钠(NaCl)中国上海麦克林生化科技有限公司,中国上海S805275
柠檬酸钠中国上海,国药集团化学试剂有限公司C39197100001
可溶性淀粉中国上海麦克林生化科技有限公司,中国上海S817547
恒温水浴锅中国上海,上海和恒仪器设备有限公司DK-8D
胰蛋白胨中国上海阿拉丁生化科技有限公司,中国上海T139519
Ultra GelRed中国南京诺唯赞生物科技股份有限公司,南京,中国GR501-01
超纯水仪德国默克集团有限公司Milli Direct-Q8
超声波清洗机中国江苏华冠电器集团有限公司,中国江苏SB-100DT
游标卡尺 日本三丰公司N20P
酵母提取物粉末中国北京,维科生物技术有限公司LP0021

参考文献

  1. Shleeva, M. O., Kondratieva, D. A., Kaprelyants, A. S. Bacillus licheniformis: A producer of antimicrobial substances, including antimycobacterials, which are feasible for medical applications. Pharmaceutics. 15 (7), 1893(2023).
  2. Muras, A., Romero, M., Mayer, C., Otero, A.

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