本文介绍了一种在基于超吸收性聚合物的自养体系中接种并观察丛枝菌根真菌的简单且低成本的技术。
本文介绍了一种在基于超吸收性聚合物的自养体系中接种并观察丛枝菌根真菌的简单且低成本的技术。
丛枝菌根(AM)真菌由于始终与植物根系共生并在根际环境中繁殖,因而难以进行操作和观察。通常,AM真菌在以下条件下培养 体内 自养寄主条件下或在盆栽培养中的情况 体外 在培养皿中利用根癌农杆菌转化根(异养寄主)进行Ri质粒转移DNA培养的条件。此外,菌根真菌在花盆培养中的生长发生在不透明且非无菌的环境中。相比之下, 体外 培养涉及在无菌且透明的环境中扩增丛枝菌根真菌。基于超吸水性聚合物的自养体系(SAP-AS)最近已被开发出来,该体系结合了现有方法的优点,同时避免了各自的局限性(如不透明性、异养宿主、无菌性问题)。本文提供了一套详细的SAP-AS体系中丛枝菌根真菌的简易制备、单孢子接种及观察的操作流程。通过对培养皿进行改造,实现了对活体样本的高分辨率摄影和视频观察,而这一点在现有常规方法中难以实现或根本无法完成。 体内 和 体外 技术。
丛枝菌根真菌(AM真菌,Glomeromycotina)是一类古老的植物根部共生体(约5亿年前出现1,2),可能在维管植物定殖陆地土壤的过程中发挥了关键作用。AM真菌与维管植物之间长期的共同进化,使丛枝菌根成为跨界互利共生的典范。AM真菌的菌丝显著增强了宿主植物从土壤中获取养分的能力3,并通过菌根网络将养分传递给新的宿主植物4。菌丝网络可改善土壤结构,而球囊霉素的产生可能有助于减少土壤侵蚀5。将部分大气碳转移至真菌根部共生体,有助于提高土壤碳封存能力6。总体而言,AM真菌能够增强植物对非生物和生物胁迫的抗性,因此在农业生态学领域受到广泛关注7。事实上,有利于AM真菌的农业管理措施有望减少作物生产中对化学投入品的依赖,并提高土壤有机碳含量。这些正是农民在实施管理措施时需要纳入考虑的重要目标,以符合国家和国际关于向可持续农业转型及应对气候变化的承诺。
然而,丛枝菌根真菌(AM真菌)是土壤中的微型真菌,由于其专性活体营养特性以及根际分布特征,对其进行研究十分困难。土壤是研究难度最大的生物栖息地之一,因其不透明性、生态位的高度多样性以及各级尺度上的多营养级相互作用。因此,AM真菌的分离、扩繁与鉴定均存在较大挑战。直至20世纪中期th 世纪,仅形成孢子果的丛枝菌根真菌物种被鉴定8然而,大多数丛枝菌根真菌(AM真菌)物种产生非子实体孢子,其直径范围约为20 μm至500 μm。土壤湿筛法的描述9 为描述这些丛枝菌根真菌物种开辟了道路,此后物种描述的速度逐渐加快。然而,与担子菌门和子囊菌门(Dikarya)相比,丛枝菌根真菌所代表的物种数量仍较少。
诱捕培养,即用含有丛枝菌根(AM)真菌孢子的孢子悬液或环境土壤样品接种装有经高压灭菌基质(如陶粒 和蛭石)及无菌宿主种子(如韭菜、车前草)的培养盆,是可在受控条件下扩繁AM真菌的一种方法10。然而,接种是否成功只能通过染色后镜检根段中是否存在菌根结构(如丛枝),或对部分样品或整盆基质进行湿筛法分离孢子来评估。通常建议在分析培养物前至少6–12周内不要扰动培养系统。该培养技术适用于大多数已知AM真菌物种的扩繁,但无法实现对真菌共生体的活体观察,且接种成功率具有不确定性,尤其是在尝试单孢子培养时更为明显。
相反, 体外 由于培养基的透明性,AM真菌的传播过程可进行实时活体监测11但该培养技术需要有转化根的存在,并且培养基中需含有碳源,才能在无菌环境中发挥作用。孢子必须经过灭菌处理,且由于与异养宿主共生的特性,大多数已知的丛枝菌根真菌种类无法通过该技术成功扩繁。
因此,尽管目前丛枝菌根真菌(AM真菌)的扩繁技术已在大多数实验室中建立并广泛应用,但在AM真菌研究方面仍存在一些局限性。Paré 等人(2022)12 开发了一种利用透明高吸水性聚合物(SAP)结合完整植株的 体内 扩繁技术。该技术被称为基于SAP的自养体系(SAP-AS),操作简便且成本低廉,兼具盆栽培养(与自养型宿主共生、非无菌条件)和 体外 培养(透明培养基、可实时监测共生发育过程)的优点。本文介绍了一种使用单孢子接种建立培养体系并利用SAP-AS对胞外菌丝进行高倍显微观察的实验方案。具体包括:双室培养皿的改造、营养液的配制、高吸水性聚合物(SAP)的准备、幼苗的准备、SAP-AS的组装与单孢子接种、孢子的预萌发处理,以及共生发育过程的活体监测方法。
1. 双室培养皿的改造
注意:此步骤所需的材料列在材料表中。
2. 配制1升营养液mMS-1
3. SAP 的制备
注意:此步骤所需的材料列在材料表中。
4. 幼苗的制备
注意:此步骤所需的材料列在材料表中。
SAP-AS 的组装与管理
注意:此步骤所需的材料列于材料表中。
6. 用单个孢子接种 SAP-AS
注意:此步骤所需的材料列在材料表中。
7. 在 SAP 上进行孢子萌发(可选)
注意:此步骤所需的材料列在材料表中。
8. 共生关系发育的活体监测
注意:此步骤所需的材料列在材料表中。
SAP-AS 是一种简单且低成本的技术,用于培养丛枝菌根真菌并观察菌丝体内和菌丝体外真菌结构的发育。本文提供了详细的实验方案,以帮助使用者建立 SAP-AS 系统,并介绍了相对于 SAP-AS 原始描述的两项改进。
首先,根室沿 Nitex 膜存在 SAP,有助于通过单个孢子接种系统(图 1)。

图1:SAP-AS的单孢子接种。(A)接种一个Rhizophagus irregularis孢子。(B)接种一个Funneliformis mosseae孢子。白色箭头指示接种位置。比例尺:500 µm。请点击此处查看该图的放大版本。
很容易识别出具有少量根系的区域,以便接种孢子。孢子的确切位置可以在培养皿盖表面标记,并定期检查其萌发情况以及对根系的定殖。SAP水化颗粒的存在提供了利于孢子萌发的湿润环境。在Nitex膜附近的根部进行接种,可促进共生体的快速形成,使菌丝体迅速进入胞外菌丝区并获取养分(图2)。通过观察接种点处的单个孢子是否成功萌发,还可识别并剔除未成功的培养物,以便及时更换。
其次,培养皿底部的盖玻片可实现对菌根真菌共生体的高分辨率活体成像(图2B、C),特别是对菌丝外菌丝体内的细胞质流动进行观察(图2D)。

图2:接种后的SAP-AS。(A)接种了单个Rhizophagus irregularis(DAOM 197198)孢子的SAP-AS。寄主植物为Plantago lanceolata。(B)在体视显微镜下透过盖玻片观察到的菌丝室中孢子簇。比例尺:500 µm。(C)在10倍放大倍数的光学显微镜下透过盖玻片观察到的高分辨率孢子簇图像。比例尺:100 µm。(D)在100倍放大倍数的光学显微镜下透过盖玻片观察到的高分辨率菌丝图像。比例尺:10 µm。请点击此处查看该图的放大版本。
用户可在用 mMS-1 营养液水合的 SAP 上尝试萌发丛枝菌根(AM)真菌孢子,以确保 SAP-AS 仅接种有活力的孢子(图3)。然而,该方法仅在 R. irregularis 的商业孢子中进行过测试,在 mMS-1 营养液水合的 SAP 上其他 AM 真菌物种的孢子萌发成功率可能存在显著差异。

图3:R. irregularis 孢子在12孔板中的萌发。 比例尺:500 µm。 请点击此处查看该图的放大版本。
最后,由于 SAP-AS 是一种在活体(in vivo)条件下非无菌培养 AMF 的技术,因此可在实验台面上直接操作并打开培养皿,以取样已定殖的根系、游离孢子或定殖于 SAP 颗粒上的材料(图4)。菌根内部和外部的真菌结构可采用类似于在盆栽或根器官培养中繁殖的 AMF 的染色方法进行染色(图4C)。

图 4:从 SAP-AS 中提取的胞外和胞内丛枝菌根真菌结构。(A)在根区观察到的R. irregularis游离孢子。比例尺:200 µm。(B)SAP 中染色的R. irregularis孢子。比例尺:500 µm。(C)染色的根片段,显示胞内菌丝和丛枝结构。比例尺:50 µm、100 µm。请点击此处查看该图的放大版本。
补充图1:可用于操作丛枝菌根真菌孢子的各种工具厚度比较。 请点击此处下载该文件。
补充图2:堆叠式SAP-AS。 请点击此处下载该文件。
接种是本实验方案中最关键的步骤,而拉制的玻璃巴斯德移液管被证明是精确操作丛枝菌根真菌单个孢子并保持其完整性的理想工具。使用蜡烛或本生灯的火焰可轻松塑形拉制的玻璃巴斯德移液管,并可在体视显微镜下调节其开口大小,以匹配待移取孢子的尺寸。操作孢子时必须使用与丛枝菌根真菌孢子大小相适应的工具(补充图1),并且应在宿主植物根系生长至足以接触到尼特克斯膜(Nitex膜)上所放置孢子的位置时,对SAP-AS进行接种。
SAP-AS 可轻松根据实验需求进行调整。可使用带有多个区域的较大培养皿,以监测亲缘关系较近的菌株之间或不同种丛枝菌根真菌(AMF)之间的相互作用,或改变化学环境(pH)或生物环境(引入 线虫、细菌、真菌)。也可选用多种菌根依赖性宿主植物,为丛枝菌根真菌提供光合产物。营养液 mMS-1 源自 Bécard 和 Fortin(1988)15 描述的最小(M)培养基配方,但去除了蔗糖、维生素和细菌琼脂,以限制碳源。然而,可根据实验目的在 SAP-AS 中添加不同的营养液。
在SAP-AS体系中扩增丛枝菌根真菌需要定期浇水。蛭石和SAP的有限体积使根系和丛枝菌根真菌暴露于湿度波动之中,尤其是在标准的双室培养皿(直径10 cm)中。随着时间推移,SAP颗粒的膨胀能力及其透明度会逐渐降低。事实上,营养液中的阳离子会逐步限制丙烯酸盐网络的膨胀,因此需要在数月后更换SAP。此外,如果培养皿未适当避光或浇水过多,可能会随时间推移生长出绿藻和霉菌。
迄今为止,已有七种丛枝菌根真菌(AM真菌)在SAP-AS体系中成功培养,这一数量远低于可在盆栽培养中繁殖的AM真菌种类。然而,SAP-AS体系中的生物和非生物条件与盆栽培养非常相似,因此其他AM真菌种类很可能也能在SAP-AS中繁殖。若使用非无菌的孢子或种子进行接种,将孢子直接接种至SAP-AS中可能更接近自然土壤根际环境,因为体系中存在根系分泌物和/或细菌。这种方法应优于使用已萌发孢子进行接种。此外,目前对AM真菌孢子萌发所依赖的条件仍了解甚少,因此用mMS-1营养液水合的SAP可能并不适合其他AM真菌种类的孢子萌发。此前在用mMS-1营养液水合的SAP上进行孢子萌发试验,目的是专门筛选具有活力的孢子,并仅使用R. irregularis接种物进行接种步骤。
在 SAP-AS 系统中,丛枝菌根(AM)共生体系的接种及发育过程监测操作简便。经改良的双室培养皿可支持不同种类 AM 真菌的培养。Paré 等人12已成功扩繁了来自六个属、三个科的七种不同 AM 真菌。双室培养皿的改造可使用廉价工具轻松完成。制备和维持 SAP-AS 所需材料(蛭石、SAP、巴斯德移液管等)和试剂(mMS-1)的成本低、用量少,因而可在最低成本下管理大量 SAP-AS 系统。SAP-AS 可堆叠的特性也显著减小了 AM 真菌培养所需的空间,相较于盆栽培养具有明显优势。例如,50 套 SAP-AS(每 10 套堆叠为一组,共 5 组)可放置于长度仅为 1 米的架子上(补充 图 2)。这些特点使 SAP-AS 成为一种简单且经济的技术,适用于在高中实验课程或大学本科阶段开展 AM 共生教学。已定殖的 SAP 颗粒可用于接种新的 SAP-AS 系统或盆栽培养。
在培养皿底部背面放置盖玻片,可实现对菌根真菌胞外菌丝结构的高分辨率拍照和录像。在接近自然条件的活体状态下,可方便地研究细胞质流动。这对于研究丛枝菌根真菌菌丝体相关功能(如养分、水分运输、土壤结构等)以及菌丝形态发生具有重要意义。
丛枝菌根真菌(AMF)在植物根部及根际环境中完成其生物生命周期。由于土壤环境本身难以直接观察,土壤微生物的研究十分复杂。SAP-AS 的主要目标是重建一个尽可能接近根际的环境,以促进丛枝菌根真菌(AM真菌)的繁殖,同时保持对其发育过程进行精细观察的能力。由于该系统涉及非无菌条件,应限制可利用碳的含量,以防止腐生微生物的过度增殖。目前对AM真菌在根际中行为的了解仍极为有限,而SAP-AS系统提供了在不同物种之间进行详细比较的可能性,包括它们在根外环境中觅食的能力、孢子产生能力以及根系定殖能力。此外,通过引入与其他土壤生物(如细菌、线虫、原生生物以及根部致病真菌)的相互作用,可进一步拓展该系统的应用,从而借助SAP-AS系统增进对土壤微生物群落相互作用的认识。
作者无任何利益冲突需要披露。
我们感谢两位匿名审稿人的建议。本研究由加拿大农业与农业食品部(AAFC)资助,项目编号为 J-002295(加拿大农业与农业食品部生物样本库的管理与提升)。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 100 x 15 mm 可叠放双层培养皿 | Kord Valmark | 1204U09 | https://www.thomassci.com/Laboratory-Supplies/Petri-Dishes/_/100-x-15-mm-Stackable-Bi-Plate |
| 12 孔板 | Greiner Bio-one | 665180 | https://shop.gbo.com/en/row/products/bioscience/cell-culture-products/cellstar-cell-culture-multiwell-plates/665180.html |
| 18 mm 圆形玻璃盖玻片 | Fisher Scientific | 12-545-100 | https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-cover-glasses-circles-11/12545100#?keyword=12-545-100 |
| 20 mL 聚丙烯/聚乙烯注射器(无针头) | Millipore Sigma | Z683620-100EA | https://www.sigmaaldrich.com/CA/en/product/aldrich/z683620?utm_source=google&utm_medium= cpc&utm_campaign=20674735406 &utm_content=157607444391&gc lid=Cj0KCQiA5rGuBhCnARIsAN11 vgQOT_WPRg9WFyBEyoO4b0x1 -F7Tks4houU7VTRS5EiYM9l0F-B oL7saAmFoEALw_wcB |
| 针灸针 | Lierre | A143-LP1-3075 | https://www.lierre.ca/products/lierre-plus-acupuncture-needles-100pcs?gad _source=1&gclid=Cj0KCQiA5rGuBh CnARIsAN11vgTwupmw51UTdR k9cKr4ewi12W3dyVikenzH3sjdUB4 g41G-_KnvppoaAkbTEALw_wcB& utm_campaign=PMax-needles&utm_content=shopify_CA_ 5213169090694_35001500991622 &utm_medium=cpc&utm_source= google&variant=35001500991622 |
| 吸水纸 | FLINN | FB0678 | https://www.flinnsci.ca/blotting-paper-12-x-19-pkg.-of-10/fb0678/ |
| 商用或科研用搅拌器或手持式厨房搅拌器 | kitchenaid | KHBV53DG | https://www.kitchenaid.ca/en_ca/countertop-appliances/hand-blenders/hand-blender-products/p.variable-speed-corded-hand-blender.khbv53dg.html |
| Dremel 199 雕刻钻头 | Dremel | 2615000199 | https://www.dremel.com/ca/en/p/199-2615000199 |
| 干燥 SAP 培养基粒径 1–2 mm | HORTA-SORB MD | 00810085242789 | https://www.horticulturalalliance.com/product/horta-sorb-md-granule/ |
| 不锈钢解剖刀片(适用于解剖刀柄) | Fisher Scientific | 08-916-5B | https://www.fishersci.ca/shop/products/graham-field-stainless-steel-blades-dissecting-knife-handles-8/089165b |
| 玻璃巴斯德移液管 230 mm | Kimble | RK-25554-14 | https://www.coleparmer.ca/i/dwk-life-sciences-kimble-disposable-pasteur-pipettes-plugged-end-borosilicate-glass-230-mm-1000-cs/2555414 |
| 墨水 | Sheaffer | 94321 | https://www.amazon.com/Sheaffer-Skrip-Bottled-Black-94231/dp/B002IKKKUU |
| 熔融导板:改良型油漆刮刀,2 英寸 | Mastercraft | #049-7335-8 | https://www.canadiantire.ca/en/pdp/mastercraft-carbon-steel-flexible-spackling-putty-knife-wall-paint-scraper-2-in-0497335p.0497335.html?loc=plp |
| 显微镜载玻片 | Fisher Scientific | 12-552-5 | https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-frosted-microscope-slides-4/125525 |
| Nitex 尼龙网筛滤膜 | Dynamic Aqua-Supply Ltd. | NTX30-108 | https://dynamicaquasupply.com/products/nitex-screen?_pos=1&_sid=ffc105328&_ss=r& variant=6945749106731 |
| 回形针 | Makanu | Clips-BK-41mm-24 | https://www.amazon.ca/classeur-standard-grandes-trombones-excellentes |
| Parafilm 封口膜 | Avantor/vwr | 470201-930 | https://www.avantorsciences.com/ca/en/product/8882964/parafilm |
| Plantago lanceolata 种子 | ecoumene | NA | https://www.ecoumene.com/produit/semences/herbacees/plantain-lanceole-bio/ |
| 聚乙烯醇-乳酸-甘油(PVLG) | NA | NA | https://invam.ku.edu/recipes |
| 带细尖头的电烙笔工具包 | Walnut Hollow | 483103 | https://www.walnuthollow.com/collections/creative-wood-burning/products/walnut-hollow-creative-versa-tool |
| 硅酮密封胶 | Aqueon | 100165003 | https://www.aqueon.com/products/aquariums/silicone-sealant |
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| 双速旋转工具套装 | Dremel | 200-1/21 | https://www.dremel.com/ca/en/p/200-1-21-f0130200ah |
| 蛭石 | PRO-MIX | 4981110 | https://www.canadiantire.ca/fr/pdp/vermiculite-pro-mix-9-l-0597936p.0597936.html |
| X1000 圆形盖玻片 直径 30 mm #1(0.13–0.16 mm) | Fisher Scientific | 12164692 | https://www.fishersci.fi/shop/products/x1000-cover-slip-diam-30-mm-n-1-1/12164692 |