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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
为了研究对脑部疾病的免疫反应,一种常见的方法是分析免疫细胞的变化。在这里,提供了两种简单有效的方案,用于从小鼠脑组织和颅骨骨髓中分离免疫细胞。
越来越多的证据表明,由脑部疾病(例如脑缺血和自身免疫性脑脊髓炎)引发的免疫反应不仅发生在大脑中,还发生在颅骨中。分析脑损伤(例如中风)后大脑和颅骨骨髓中免疫细胞群变化的关键步骤是获得足够数量的高质量免疫细胞用于下游分析。这里提供了两种优化的方案,用于从大脑和颅骨骨髓中分离免疫细胞。这两种方案的优势都体现在它们的简单性、速度和产生大量活免疫细胞的有效性上。这些细胞可能适用于一系列下游应用,例如细胞分选、流式细胞术和转录组学分析。为了证明方案的有效性,使用流式细胞术分析对中风脑和正常脑颅骨骨髓进行了免疫表型实验,结果与已发表的研究结果一致。
大脑是神经系统的中枢,受到颅骨的保护。颅骨下方是三层结缔组织,称为脑膜——硬脑膜、蛛网膜和软脑膜。脑脊液 (CSF) 在蛛网膜基质和软脑膜之间的蛛网膜下腔循环,缓冲大脑并通过淋巴系统清除废物 1,2。总之,这种独特的架构提供了一个安全和支持性的环境,可以维持大脑的稳定性并保护它免受潜在的伤害。
长期以来,大脑一直被认为是免疫特权的。然而,这一概念已被部分放弃,因为越来越多的证据表明,除了薄壁组织中的常驻小胶质细胞外,大脑的边界,包括脉络丛和脑膜,还承载着多种免疫细胞3。这些细胞在维持体内平衡、监测大脑健康和启动对脑损伤的免疫反应方面起着关键作用。值得注意的是,最近的研究结果表明,颅骨参与脑膜免疫,并可能有助于受伤后大脑的免疫反应。2018 年,Herisson 等人开创性地发现了连接颅骨骨髓和脑膜的直接血管通道,从而建立了白细胞迁移的解剖途径 4,5。后来,Cugurra 等人证明,脑膜中的许多髓系细胞(例如单核细胞和中性粒细胞)和 B 细胞并非源自血液6。使用颅骨皮瓣移植和选择性照射方案等技术,作者提供了令人信服的证据,证明颅骨骨髓是脑膜中髓系细胞的局部来源,也是 CNS 损伤后 CNS 实质的局部来源6。此外,另一项研究表明,脑膜 B 细胞由颅骨骨髓持续供应7。最近,一种称为蛛网膜袖口出口 (ACE) 的新结构已被确定为硬脑膜和大脑之间免疫细胞运输的直接门户8。
这些令人兴奋的发现对于免疫细胞浸润到受伤大脑的起源(例如,缺血性中风后)具有重要意义。大量证据表明,中风后,许多免疫细胞会浸润大脑,导致急性脑损伤和慢性脑恢复。传统观念认为,这些细胞是血液中循环的白细胞,渗透到大脑中,这在很大程度上是由中风引起的血脑屏障损伤促成的。然而,这一观念受到了挑战。在一项研究中,小鼠颅骨和胫骨中的免疫细胞标记不同,中风后 6 小时,发现颅骨中中性粒细胞和单核细胞的减少明显更大。缺血性大脑中存在胫骨和更多颅骨衍生的中性粒细胞。这些数据表明,在急性卒中期,缺血性脑中的中性粒细胞主要起源于颅骨骨髓4。有趣的是,CSF 可能会指导这种迁移。事实上,最近的两篇报道表明,CSF 可以通过颅骨通道将来自大脑的信号线索直接传递到颅骨骨髓中,并在 CNS 损伤后指导颅骨骨髓中的细胞迁移和造血 9,10。
鉴于这些最近的发现,在研究对脑部疾病的免疫反应时,分析大脑和颅骨骨髓中免疫细胞的变化变得非常重要。在此类研究中,下游分析需要足够数量的高质量免疫细胞,例如细胞分选、流式细胞术分析和单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq)。在这里,总体目标是提出两种优化的程序,用于从脑组织和颅骨骨髓制备单细胞悬液。需要注意的是,颅骨的颅骨(额骨、枕骨和顶骨)通常用于提取骨髓,而这种骨髓在整个研究中被特称为颅骨骨髓。
该协议得到了杜克研究所动物护理和使用委员会 (IACUC) 的批准。本研究使用雄性 C57Bl/6 小鼠 (3-4 个月大;22-28 g)。材料 表中列出了试剂和所用设备的详细信息。
1. 小鼠脑单细胞悬液
注意: 图 1 说明了脑细胞分离方案的概述。
2. 小鼠颅骨骨髓单细胞悬液的制备
注意: 图 2 描述了颅骨骨髓分离程序的概述。
为了从小鼠脑组织中制备免疫细胞,该方案通常产生具有高活力的细胞 (84.1% ± 2.3% [平均值 ± SD])。这些细胞中约有 70%-80% 为 CD45 阳性。正如预期的那样,在正常小鼠大脑中,几乎所有 CD45 + 细胞都是小胶质细胞 (CD45LowCD11b+)。该方案已在实验室中用于各种应用,包括流式细胞术分析、荧光激活细胞分选 (FACS) 和 scRNA-seq 分析。例如,在卒中模型中进行了流式细胞术分析(图 3)。小鼠接受短暂性卒中模型、30 分钟细丝大脑中动脉闭塞 (MCAO) 14。中风后第 3 天,从小鼠大脑制备细胞,并用常见的免疫细胞表面标志物染色。门控策略如图 3A 所示。与之前的研究一致13,15,观察到同侧半球 CD45High 细胞显着增加(图 3B、C),表明免疫细胞浸润到大脑中。
对于颅骨骨髓方案,颅骨骨髓细胞(约 2 x 106 个细胞)的产量始终如一,并且具有出色的活力 (93.8% ± 1.8% [平均 ± SD])。正如预期的那样,这些细胞中的大多数是 CD45 阳性。为了说明该方案的实用性,进行了一项比较研究以表征幼稚小鼠股骨和颅骨骨髓中的免疫细胞组成(图 4)。如代表性图所示,股骨和颅骨骨髓之间的免疫细胞组成相似(图 4A、B)。有趣的是,股骨中中性粒细胞的频率似乎高于颅骨(图 4C)。然而,这一发现需要进一步验证,因为这项试点研究的样本量很小。

图 1:脑细胞分离方案概述。请单击此处查看此图的较大版本。

图 2:颅骨骨髓细胞分离方案。 (A) 程序概述。(B) 推荐的颅骨切割模式。 请单击此处查看此图的较大版本。

图 3:中风大脑中免疫细胞的代表性流式细胞术分析。(A) 门控策略的一个例子。这些图描绘了以下免疫细胞群:小胶质细胞(CD45低CD11b+)、NK 细胞(CD45高NK1.1+)、中性粒细胞(CD45高Ly6G+)、T 细胞(CD45高CD11b-CD3+)和 B 细胞(CD45高CD11b-CD19+)。此示例表示中风后第 3 天同侧半球脑免疫细胞的分析。(B,C)将免疫细胞浸润到中风大脑中。年轻雄性小鼠接受短暂性大脑中动脉闭塞 (MCAO)。第 3 天,收集大脑并将其分为左(对侧)和右(同侧)半球。根据所述方案制备脑细胞,然后进行流式细胞术分析。代表性图显示浸润到同侧半球的免疫细胞增加(CD45High 细胞;B). 定量数据显示在条形图 (C) 中。根据流式细胞术数据中记录的细胞计数和体积计算细胞数。数据以 SEM ±平均值表示。*p < 0.05。请单击此处查看此图的较大版本。

图 4:颅骨骨髓细胞的代表性流式细胞术分析。为了进行比较,包括对股骨骨髓细胞的分析。这些图描述了以下免疫细胞群:NK 细胞 (CD45+NK1.1+)、中性粒细胞 (CD45+CD11b+Ly6G+)、T 细胞 (CD45+CD11b-CD3+) 和 B 细胞 (CD45+CD11b-CD19+)。(A) 股骨髓的代表性图。(B) 颅骨骨髓的代表性图。(C) 股骨和颅骨骨髓免疫细胞组成的比较。数据以 SEM ±平均值表示。*p < 0.05。请单击此处查看此图的较大版本。
没有。
为了研究对脑部疾病的免疫反应,一种常见的方法是分析免疫细胞的变化。在这里,提供了两种简单有效的方案,用于从小鼠脑组织和颅骨骨髓中分离免疫细胞。
我们感谢 Kathy Gage 的出色编辑贡献。插图人物是使用 BioRender.com 创建的。这项研究得到了麻醉学系(杜克大学医学中心)和 NIH 赠款 NS099590、HL157354 和 NS127163 的资助。
| 0.5 mL 微量离心管 | VWR | 76332-066 | |
| 1.5 mL 微量离心管 | VWR | 76332-068 | |
| 15 mL 锥形管 | Thermo Fisher Scientific | 339651 | |
| 18 G x 1 in BD PrecisionGlide 针 | BD Biosciences 305195 | ||
| 1x HBSS | Gibco | 14175-095 | |
| 50 mL 锥形管 | Thermo Fisher Scientific | 339653 | |
| 96 孔 V 型底微孔板 | SARSTEDT | 82.1583 | |
| AURORA 流式细胞仪 | Cytek bioscience | ||
| BSA | Fisher | BP9706-100 | |
| CD11b-AF594 | BioLegend | 101254 | 1:500 稀释 |
| CD19-BV785 | BioLegend | 115543 | 1:500 稀释 |
| CD19-FITC | BioLegend | 115506 | 1:500 稀释 |
| CD3-APC | BioLegend | 100312 | 1:500 稀释 |
| CD3-PE | BioLegend | 100206 | 1:500 稀释 |
| CD45-Alex 700 | BioLegend | 103128 | 1:500 稀释 |
| CD45-BV421 | Biolegend | 103133 | 1:500 稀释 |
| 细胞过滤器 70 um | Avantor | 732-2758 | |
| 修料钳 | V. Mueller | NL1410 | |
| EDTA | Invitrogen | 15575-038 | |
| Fc Block | Biolegend | 101320 | 1:100 稀释 |
| 钳 | Roboz | RS-5047 | |
| LIVE/DEAD 可固定蓝色死细胞染色试剂盒 | ThermoFisher Scientific | N7167 | 1:500 稀释 |
| Ly6G-BV421 | BioLegend | 127628 | 1:500稀释度 |
| Ly6G-PerCp-cy5.5 | BioLegend | 127615 | 1:500 稀释度 |
| NK1.1-APC-cy7 | BioLegend | 108723 | 1:500 稀释度 |
| Percoll(密度梯度培养基) | Cytiva | 17089101 | |
| 磷酸盐缓冲液 (10x) | Gibco | 70011-044 | |
| RBC 裂解缓冲液 (10x) | BioLegend | 420302 | |
| 剪刀 | SKLAR | 64-1250 | |
| WHEATON Dounce 纸巾,15 mL 尺寸 | DWK 生命科学 | 357544 |